Avaliação de biossegurança de transgênico por DGGE: estudo de caso do feijão VMDF, evento M1-4.

O objetivo deste estudo foi avaliar possíveis efeitos da modificação genética, evento M1-4, sobre organismos não-alvos, estudando a comunidade bacteriana rizosférica

Resposta de genótipos de feijão à aplicação de nitrogênio e rizóbio.

A deficiência de N é um dos fatores que é um dos fatores que mais limitam a produção do feijoeiro no Brasil. Foi conduzido um ensaio em casa de vegetação com objetivo de avaliar respostas de genótipos de feijão a aplicação de N e inoculação com rizóbio.FERTBIO 2012

The Interacting Head Motif Structure Does Not Explain the X-Ray Diffraction Patterns in Relaxed Vertebrate (Bony Fish) Skeletal Muscle and Insect (<i>Lethocerus</i>) Flight Muscle.

Unlike electron microscopy, which can achieve very high resolution but to date can only be used to study static structures, time-resolved X-ray diffraction from contracting muscles can, in principle, be used to follow the molecular movements involved in force generation on a millisecond timescale, albeit at moderate resolution. However, previous X-ray diffraction studies of resting muscles have come up with structures for the head arrangements in resting myosin filaments that are different from the apparently ubiquitous interacting head motif (IHM) structures found by single particle analysis of electron micrographs of isolated myosin filaments from a variety of muscle types. This head organization is supposed to represent the super-relaxed state of the myosin filaments where adenosine triphosphate (ATP) usage is minimized. Here we have tested whether the interacting head motif structures will satisfactorily explain the observed low-angle X-ray diffraction patterns from resting vertebrate (bony fish) and invertebrate (insect flight) muscles. We find that the interacting head motif does not, in fact, explain what is observed. Previous X-ray models fit the observations much better. We conclude that the X-ray diffraction evidence has been well interpreted in the past and that there is more than one ordered myosin head state in resting muscle. There is, therefore, no reason to question some of the previous X-ray diffraction results on myosin filaments; time-resolved X-ray diffraction should be a reliable way to follow crossbridge action in active muscle and may be one of the few ways to visualise the molecular changes in myosin heads on a millisecond timescale as force is actually produced

Similar Endothelial Glycocalyx Structures in Microvessels from a Range of Mammalian Tissues: Evidence for a Common Filtering Mechanism?

AbstractThe glycocalyx or endocapillary layer on the luminal surface of microvessels has a major role in the exclusion of macromolecules from the underlying endothelial cells. Current structural evidence in the capillaries of frog mesentery indicates a regularity in the structure of the glycocalyx, with a center-to-center fiber spacing of 20 nm and a fiber width of 12 nm, which might explain the observed macromolecular filtering properties. In this study, we used electron micrographs of tissues prepared using perfusion fixation and tannic acid treatment. The digitized images were analyzed using autocorrelation to find common spacings and to establish whether similar structures, hence mechanisms, are present in the microvessel glycocalyces of a variety of mammalian tissues. Continuous glycocalyx layers in mammalian microvessels of choroid, renal tubules, glomerulus, and psoas muscle all showed similar lateral spacings at ∼19.5 nm (possibly in a quasitetragonal lattice) and longer spacings above 100 nm. Individual glycocalyx tufts above fenestrations in the first three of these tissues and also in stomach fundus and jejunum showed evidence for similar short-range structural regularity, but with more disorder. The fiber diameter was estimated as 18.8 (± 0.2) nm, but we believe this is an overestimate because of the staining method used. The implications of these findings are discussed

Resposta de genótipos de feijão à aplicação de nitrogênio e rizóbio em condições de campo.

Objetivou-se com esse estudo avaliar respostas de genótipos de feijão à aplicação de N e rizóbio

Estimation of kinetic parameters in a chromatographic separation model via Bayesian inference

A modelagem de processos de adsorção tem sido empregada com frequência nas indústrias químicas, petroquímicas e refinarias, por exemplo para separação e purificação de misturas em unidade de Leito Móvel Simulado (LMS). Na representação matemática do modelo, a determinação de parâmetros é um passo importante para o projeto de condições cromatográficas para a separação contínua, em processos do tipo LMS. Este trabalho tem por objetivo a análise de estimativa de parâmetros em processos de adsorção, usando um sistema cromatográfico com uma coluna, para a separação das substâncias Glicose e Frutose. Investiga-se o uso da abordagem Bayesiana, através de métodos de Monte Carlo via Cadeias de Markov (MCMC), assim como o uso da abordagem da máxima verossimilhança, utilizando duas técnicas estocásticas diferentes, o Algoritmo de Colisão de Partículas (PCA - Particle Collision Algorithm), e o Algoritmo de Otimização por Enxame de Partículas (PSO - Particle Swarm Optimization) para executar a tarefa de minimização da função objetivo. Diferentes casos são apresentados com o objetivo de analisar a significância estatística das estimativas obtidas para os parâmetros, fazendo-se uma comparação crítica entre a solução via inferência Bayesiana e via minimização da função objetivo com métodos estocásticos. Os resultados obtidos demonstram que o uso da abordagem Bayesiana fornece uma proposta vantajosa para a estimativa de parâmetros em transferência de massa, oferecendo resultados com maior riqueza de informação estatística.The modeling of adsorption processes appears quite frequently in the chemical industry, petrochemical plants and refineries, for example for separation and purification of mixtures in Simulated Moving Bed (SMB) units. In the mathematical formulation, the accurate determination of the model parameters is an important step for the design of chromatographic conditions for continuous separation in SMB processes. This work is aimed at the estimation of the model parameters in adsorption processes, using a chromatographic column for the separation of glucose and fructose. The Bayesian framework for inverse problems is investigated through the implementation of Markov Chain Monte Carlo methods (MCMC) and a critical comparison against the classical Maximum Likelihood approach, with the minimization of the objective function via two different stochastic techniques, namely the Particle Collision Algorithm (PCA), and the Particle Swarm Optimization (PSO) is performed. Different cases are presented in order to investigate the statistical significance of the estimates obtained, and perform comparisons between the solution via Bayesian inference and via the minimization of the objective function with the stochastic methods. The results demonstrate that the Bayesian approach employs less computational effort to achieve estimates with comparable statistical information.Peer Reviewe

Resposta de genótipos de feijão preto à inoculação com Rhizobium tropici.

Esse trabalho faz parte de um Ensaio Preliminar de Linhagens para o feijão preto, onde foram avaliados aspectos relativos à resposta de diferentes genótipos em função da inoculação com estirpes de Rhizobium tropici.CONAFE

Avaliação de indicadores biológicos de qualidade do solo em unidades piloto de produção integrada de feijoeiro comum.

Os indicadores biológicos de qualidade do solo têm desempenhado um papel importante na determinação dos impactos ambientais causados pelas atividades agrícolas sobre diferentes sistemas de produção e permitem o acompanhamento das alterações do solo em resposta às estratégias de manejo. Este trabalho teve como objetivo quantificar o carbono e o nitrogênio da biomassa microbiana, respiração basal, atividade enzimática total, &#946;-glicosidase e fosfatase ácida de solos sob sistema de produção integrada comparados com o sistema de produção convencional. A produção convencional foi caracterizada por manejo convencional do solo e da cultura e a produção integrada por manejo do solo sob plantio direto e práticas menos impactantes para a cultura. Os resultados do primeiro ciclo de cultivo permitiram a detecção de pequenas diferenças, para os indicadores biológicos, entre os sistemas de manejo estudados. Não obstante, a soma destes efeitos ao longo do tempo pode resultar da influência da adoção da produção integrada sobre esses indicadores, o que poderia ser detectado através de estudos de longo prazo.bitstream/item/36047/1/bolpesq-35.pd

Fixação biológica de nitrogênio em germoplasma silvestre de feijoeiro comum.

A fixação biológica de nitrogênio é uma tecnologia capaz de fornecer parte o N necessário ao desenvolvimento das plantas, assim como de contribuir para a redução de impactos ambientais, tais como a contaminação do solo e redução da emissão de gases do efeito estufa. Contudo, na cultura do feijão esta tecnologia ainda é muito pouco explorada, principalmente em função da baixa eficiência apresentada. A avaliação desta característica em genótipos silvestres pode fornecer materiais com alta eficiência, podendo ser utilizados em programas de melhoramento da cultura. Dos 75 genótipos silvestres avaliados neste trabalho, 15% e 7% deles apresentaram maior número de nódulos e massa específica de nódulos que as testemunhas. Além disso, 7% dos genótipos apresentaram a mesma quantidade de N-Total acumulado na parte aérea