The Structure and Function of Frataxin

Frataxin, a highly conserved protein found in prokaryotes and eukaryotes, is required for efficient regulation of cellular iron homeostasis. Humans with a frataxin deficiency have the cardio- and neurodegenerative disorder Friedreich’s ataxia, commonly resulting from a GAA trinucleotide repeat expansion in the frataxin gene. While frataxin’s specific function remains a point of controversy, a general consensus is the protein assists in controlling cellular iron homeostasis by directly binding iron. This review focuses on the structural and biochemical aspects of iron binding by the frataxin orthologs and outlines molecular attributes that may help explain the protein’s role in different cellular pathways

A Regional Red List of Montane Tree Species of the Tropical Andes: Trees at the top of the world

Andean montane forests are a major global conservation priority owing to their biological richness and high level of species endemism. Botanically the Andes are very rich in species but they remain relatively unstudied. In common with montane forests elsewhere in the world, Andean forests are of great value for the provision of ecosystem services relating to water supply, regulation of regional climate and the capture and storage of carbon. The forests and their component species are however under threat. This report summarises information drawn from a wide variety of sources to provide a regional Red List of trees of Andean tropical montane forests. The species evaluation process has drawn on published national red lists of threatened species, botanical literature, specimen databases, forestry information and expert knowledge. The IUCN Red List Categories and Criteria have been used for the evaluation and a component of Natalia?s PhD study has been to evaluate their use for species with limited and dispersed data. Understanding the geographical distribution of the species is very important in conservation assessment. The maps produced for this study are a valuable starting point for the Red Listing and a baseline for monitoring impacts of climate change. In this assessment 70 species are recorded as globally threatened based on the IUCN Red List of Categories and Criteria out of 127 tree species evaluated. In addition 165 national endemic trees of the region have previously been evaluated as globally threatened based on the same IUCN process. In total therefore 235 tree species are currently considered to be threatened with extinction within the Andean montane forests.Fil: Tejedor Garavito , Natalia. Bournemouth University; Reino UnidoFil: Álvarez Dávila, Esteban. Jardín Botánico de Medellín; ColombiaFil: Caro, Sandra Arango. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: Murakami, Alejandro Araujo. Museo de Historia Natural Noel Kempff Mercado; BoliviaFil: Baldeón, Severo. Universidad Nacional Mayor de San Marcos; PerúFil: Beltrán, Hamilton. Universidad Nacional Mayor de San Marcos; PerúFil: Blundo, Cecilia Mabel. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Laboratorio de Investigaciones Ecológicas de las Yungas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; ArgentinaFil: Boza Espinoza, Tatiana Erika. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: Fuentes Claros, Alfredo. Herbario Nacional de Bolivia; BoliviaFil: Gaviria, Juan. Universidad de Los Andes; VenezuelaFil: Gutiérrez, Néstor. Universidad de Los Andes; VenezuelaFil: Khela, Sonia. Botanic Gardens Conservation International; Reino UnidoFil: León, Blanca. University of Texas at Austin; Estados UnidosFil: la Torre Cuadros, Maria De Los Angeles. Universidad Nacional Agraria; PerúFil: López Camacho, René. Universidad Distrital; ColombiaFil: Malizia, Lucio Ricardo. Universidad Nacional de Jujuy. Facultad de Ciencias Agrarias. Centro de Estudios Ambientales Territoriales y Sociales; ArgentinaFil: Millán, Betty. Universidad Nacional Mayor de San Marcos; PerúFil: Moraes R., Mónica. Herbario Nacional de Bolivia; BoliviaFil: Newton, Adrian C.. Bournemouth University; Reino UnidoFil: Pacheco, Silvia. Fundación Proyungas; ArgentinaFil: Reynel, Carlos. Universidad Nacional Agraria; PerúFil: Ulloa Ulloa, Carmen. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: Vacas Cruz,Omar. Pontificia Universidad Católica del Ecuador; Ecuado

Evaluación del estado de conservación de los bosques montanos en los Andes tropicales

Los Andes tropicales constituyen una región única con una alta diversidad de hábitats, producto de complejos gradientes espaciales y ambientales. Los bosques montanos de esta región son considerados como una prioridad global de conservación, debido principalmente a su elevada riqueza biológica y de endemismos. Sin embargo su biodiversidad es de las menos conocidas de toda la región tropical, aunque se reconoce la amplia gama de servicios ambientales que prestan, incluyendo la regulación del clima regional y la captura y almacenamiento de carbono. Este artículo ofrece una perspectiva general del estado de conservación de los bosques montanos tropicales andinos y de los retos que esta implica. Asimismo, proporciona información sobre sus amenazas, identificando aquéllas que con mayor probabilidad sean responsables de aumentar el riesgo de extinción de especies. Se resalta la necesidad de disponer de más información sobre el estado de conservación de las especies para identificar las futuras prioridades de conservación en la región. La reciente iniciativa de la "Lista Roja y planeación para la conservación de especies de árboles montanos de los Andes Tropicales", formada por delegados de varios países de la región, constituirá una sólida base para el desarrollo y enfoque de políticas y respuestas de manejo dirigidas a la reducción de la deforestación y pérdida de especies en estos bosques, incluyendo acciones para promover la creación de áreas protegidas, restauración forestal y manejo forestal sostenible.The tropical Andes is a unique region with high habitat diversity, resulting from complex climatic and spatial gradients. Andean montane forests are currently a major global conservation priority owing to their high species richness and high level of endemism. Nonetheless they are considered one of the least known ecosystems in the tropics, but the breath of ecosystem services that these forests provide, including the regulation of regional climate and the capture and storage of carbon, is widely recognised. This article presents an overview of the conservation status of tropical Andean montane forests and the challenges it entails. It also provides information on threats, including the identification of those that are most likely to be responsible for increasing the extinction risk for many species. It highlights the need for acquiring more information on the conservation status of species as to identify future priorities for conservation in the region. The recent initiative "Red List and conservation planning for montane tree species of the Tropical Andes," made of delegates from several countries in the region, will provide a solid basis for developing policies and managing responses aimed at reducing deforestation and species loss in these forests, including actions to promote the creation of protected areas, forest restoration and sustainable forest management.Bournemouth UniversityBotanic Gardens Conservation InternationalBanco Santande

Computer-Based Screening of Functional Conformers of Proteins

A long-standing goal in biology is to establish the link between function, structure, and dynamics of proteins. Considering that protein function at the molecular level is understood by the ability of proteins to bind to other molecules, the limited structural data of proteins in association with other bio-molecules represents a major hurdle to understanding protein function at the structural level. Recent reports show that protein function can be linked to protein structure and dynamics through network centrality analysis, suggesting that the structures of proteins bound to natural ligands may be inferred computationally. In the present work, a new method is described to discriminate protein conformations relevant to the specific recognition of a ligand. The method relies on a scoring system that matches critical residues with central residues in different structures of a given protein. Central residues are the most traversed residues with the same frequency in networks derived from protein structures. We tested our method in a set of 24 different proteins and more than 260,000 structures of these in the absence of a ligand or bound to it. To illustrate the usefulness of our method in the study of the structure/dynamics/function relationship of proteins, we analyzed mutants of the yeast TATA-binding protein with impaired DNA binding. Our results indicate that critical residues for an interaction are preferentially found as central residues of protein structures in complex with a ligand. Thus, our scoring system effectively distinguishes protein conformations relevant to the function of interest

Indicadores metabólicos y de estrés tras el ajuste de consumo en conejas primíparas = Metabolic and stress indicators after intake adjustment in primiparous pregnant rabbit does

El objetivo principal de este trabajo fue determinar si aplicando un ajuste en el consumo de alimento durante la gestación en conejas primíparas, se ven afectados indicadores metabólicos y de estrés. Para ello, se utilizaron conejas primíparas, inseminadas después del destete que se dividieron en 4 grupos: Control (consumo od Iibitum toda la gestación, n=30), y restringidas al 60% de su consumo voluntario (1 OSg/d) la primera semana (RO?; n=31), la segunda y la tercera semana (R721; n=31) y las 3 primeras semanas (R021; n=30) de la gestación. En la cuarta y última semana de gestación todas disponían de pienso od libitum. Se tomaron muestras de sangre el día de la inseminación y tras el diagnóstico de gestación, se muestrearon animales gestantes de los 4 grupos en 3 puntos de la gestación el día 14 (n=20), 21 (n= 20) y 28 (n=20). Tras el parto, las hembras se re-inseminaron el día 14 post-parto y se tomaron muestras en otros 3 puntos de la lactación: día? (n=13), día 14 (n=13) y día 30 (n=41). En estas muestras se analizaron mediante enzimoinmunoanálisis: tri-iodotironina y tiroxina libres, y corticosterona. El ajuste del consumo de alimento durante la gestación aplicado en conejas primíparas afectó levemente a la homeostasis energética de los animales pero su estado de bienestar no se vio comprometido

Indicadores metabólicos y de estrés tras el ajuste de consumo en conejas primíparas = Metabolic and stress indicators after intake adjustment in primiparous pregnant rabbit does

El objetivo principal de este trabajo fue determinar si aplicando un ajuste en el consumo de alimento durante la gestación en conejas primíparas, se ven afectados indicadores metabólicos y de estrés. Para ello, se utilizaron conejas primíparas, inseminadas después del destete que se dividieron en 4 grupos: Control (consumo od Iibitum toda la gestación, n=30), y restringidas al 60% de su consumo voluntario (1 OSg/d) la primera semana (RO?; n=31), la segunda y la tercera semana (R721; n=31) y las 3 primeras semanas (R021; n=30) de la gestación. En la cuarta y última semana de gestación todas disponían de pienso od libitum. Se tomaron muestras de sangre el día de la inseminación y tras el diagnóstico de gestación, se muestrearon animales gestantes de los 4 grupos en 3 puntos de la gestación el día 14 (n=20), 21 (n= 20) y 28 (n=20). Tras el parto, las hembras se re-inseminaron el día 14 post-parto y se tomaron muestras en otros 3 puntos de la lactación: día? (n=13), día 14 (n=13) y día 30 (n=41). En estas muestras se analizaron mediante enzimoinmunoanálisis: tri-iodotironina y tiroxina libres, y corticosterona. El ajuste del consumo de alimento durante la gestación aplicado en conejas primíparas afectó levemente a la homeostasis energética de los animales pero su estado de bienestar no se vio comprometido

Evaluación del estado de conservación de los bosques montanos en los Andes tropicales

The tropical Andes is a unique region with high habitat diversity, resulting from complex climatic and spatial gradients. Andean montane forests are currently a major global conservation priority owing to their high species richness and high level of endemism. Nonetheless they are considered one of the least known ecosystems in the tropics, but the breath of ecosystem services that these forests provide, including the regulation of regional climate and the capture and storage of carbon, is widely recognised. This article presents an overview of the conservation status of tropical Andean montane forests and the challenges it entails. It also provides information on threats, including the identification of those that are most likely to be responsible for increasing the extinction risk for many species. It highlights the need for acquiring more information on the conservation status of species as to identify future priorities for conservation in the region. The recent initiative "Red List and conservation planning for montane tree species of the Tropical Andes," made of delegates from several countries in the region, will provide a solid basis for developing policies and managing responses aimed at reducing deforestation and species loss in these forests, including actions to promote the creation of protected areas, forest restoration and sustainable forest management.</p

Evaluation of the conservation status of montane forest in the tropical Andes

Los Andes tropicales constituyen una región única con una alta diversidad de hábitats, producto de complejos gradientes espaciales y ambientales. Los bosques montanos de esta región son considerados como una prioridad global de conservación, debido principalmente a su elevada riqueza biológica y de endemismos. Sin embargo su biodiversidad es de las menos conocidas de toda la región tropical, aunque se reconoce la amplia gama de servicios ambientales que prestan, incluyendo la regulación del clima regional y la captura y almacenamiento de carbono. Este artículo ofrece una perspectiva general del estado de conservación de los bosques montanos tropicales andinos y de los retos que esta implica. Asimismo, proporciona información sobre sus amenazas, identificando aquéllas que con mayor probabilidad sean responsables de aumentar el riesgo de extinción de especies. Se resalta la necesidad de disponer de más información sobre el estado de conservación de las especies para identificar las futuras prioridades de conservación en la región. La reciente iniciativa de la "Lista Roja y planeación para la conservación de especies de árboles montanos de los Andes Tropicales", formada por delegados de varios países de la región, constituirá una sólida base para el desarrollo y enfoque de políticas y respuestas de manejo dirigidas a la reducción de la deforestación y pérdida de especies en estos bosques, incluyendo acciones para promover la creación de áreas protegidas, restauración forestal y manejo forestal sostenible.The tropical Andes is a unique region with high habitat diversity, resulting from complex climatic and spatial gradients. Andean montane forests are currently a major global conservation priority owing to their high species richness and high level of endemism. Nonetheless they are considered one of the least known ecosystems in the tropics, but the breath of ecosystem services that these forests provide, including the regulation of regional climate and the capture and storage of carbon, is widely recognised. This article presents an overview of the conservation status of tropical Andean montane forests and the challenges it entails. It also provides information on threats, including the identification of those that are most likely to be responsible for increasing the extinction risk for many species. It highlights the need for acquiring more information on the conservation status of species as to identify future priorities for conservation in the region. The recent initiative "Red List and conservation planning for montane tree species of the Tropical Andes," made of delegates from several countries in the region, will provide a solid basis for developing policies and managing responses aimed at reducing deforestation and species loss in these forests, including actions to promote the creation of protected areas, forest restoration and sustainable forest management.Fil: Tejedor Garavito, N. Bournemouth University; Reino UnidoFil: Álvarez, E.. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt; Colombia. Jardín Botánico de Medellín; ColombiaFil: Arango Caro, S.. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: Araujo Murakami, A.. Universidad Autónoma Gabriel Rene Moreno; BoliviaFil: Blundo, Cecilia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; Argentina. Fundación Pro Yungas. Tucumán; ArgentinaFil: Boza Espinoza, T. E.. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: La Torre Cuadros, M. A.. Universidad Nacional Agraria La Molina; Perú. World Agroforestry Centre; PerúFil: Gavira, J.. Universidad de los Andes; VenezuelaFil: Gutiérrez, N.. Universidad de los Andes; VenezuelaFil: Jørgensen, P. M.. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: León, B.. University of Texas at Austin; Estados Unidos. Universidad Nacional Mayor de San Marcos; PerúFil: López Camacho, R.. Universidad Distrital Francisco José de Caldas; ColombiaFil: Malizia, Lucio Ricardo. Universidad Nacional de Jujuy. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Fundación ProYungas; ArgentinaFil: Millán, B.. Universidad Nacional Mayor de San Marcos,; BoliviaFil: Moraes, M.. Universidad Mayor de San Andrés; BoliviaFil: Pacheco, S.. Fundación ProYungas; ArgentinaFil: Rey Benayas, J. M.. Universidad de Alcalá; EspañaFil: Reynel, C.. Universidad Nacional Agraria La Molina; PerúFil: Timaná de la Flor, M.. Pontificia Universidad Católica de Perú; PerúFil: Ulloa Ulloa, C.. Missouri Botanical Garden; Estados UnidosFil: Vacas Cruz, O.. Pontificia Universidad Católica del Ecuador; EcuadorFil: Newton, A. C.. Bournemouth University; Reino Unid