392 research outputs found

    A transmissão do poder através do processo sucessório em pequenas e médias empresas familiares brasileiras: o caso da indústria de milho Anchieta LTDA.

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    Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção.Este trabalho pesquisa a Indústria de Milho Anchieta Ltda uma empresa de médio porte, localizada em uma pequena cidade na região do Vale do Aço em Minas Gerais, Brasil. Trata-se de uma empresa tipicamente familiar que vivencia o seu primeiro processo sucessório. Uma empresa familiar é considerada, para os propósitos deste trabalho, como aquela onde um grau mínimo da propriedade se concentra nas mãos da família e que seja suficiente para assegurar a legitimidade do controle administrativo da mesma. A pesquisa objetiva o estudo da transmissão de poder através do processo sucessório. Desenvolve uma visão da empresa familiar sob uma perspectiva sistêmica, onde, empresa e família formam um sistema bastante complexo de interação, avança pelo universo cultural que procura ampliar a visão da cultura e suas interferências na estrutura familiar e empresarial, estuda as relações de poder sob uma perspectiva Weberiana, além de apresentar uma conteúdo teórico consistente. Este trabalho é um estudo de caso onde foi feita uma pesquisa do tipo descritivo e exploratório de cunho qualitativo. Como instrumentos de pesquisa foram empregadas: pesquisa documental, técnicas de observação e entrevistas semi-dirigidas. Foram entrevistados membros da família ligados à empresa, outros familiares não ligados à mesma além de uma funcionária. A fase de pesquisa se deu no período compreendido entre julho de 2000 e dezembro de 2001. A análise dos resultados aponta algumas questões importantes encontradas na estrutura das relações de poder bem como na estrutura administrativa sob a perspectiva da sua profissionalização. Além de apresentar uma leitura de fácil entendimento, mesmo àquelas pessoas que não se familiarizam com o assunto o trabalho pode ser utilizado enquanto objeto de pesquisa. Tendo alcançado o seu objetivo, o trabalho é concluído propondo soluções e abrindo possibilidades que possam dar continuidade à pesquisa

    ProGenViZ: a novel interactive tool for prokaryotic genome visualization and comparison

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    Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2014Everyday new sequencing data and draft microbial genomes are obtained by high-throughput sequencing (HTS) and made publicly available at NCBI Sequence Read Archive (www.ncbi.nlm.nih.gov/sra) and EBI European Nucleotide Archive (http://www.ebi.ac.uk/ena). It is now perceived that the limiting factor is not obtaining the sequence data but the current capacity of the existing analysis methods to extract relevant information from data. This procedure is still often dependent on the use of expensive software or open-source freely available software that commonly has a high level of complexity to operate. The combination of this factors are currently leading to large amounts of data in public databases, but its analysis are usually limited in nature. The visual representation of data has a very important role in the perception of complex information. When used in combination with methods for comparison and querying of genomic data, different visualization methods can be used to facilitate and guide the identification of interesting features. In Microbiology, the ability to visualize and compare genomes can be applied in the development of genomic epidemiology studies, as well as to identify and characterize microorganisms by determining lineages associated to antibiotic resistance, pathogenicity and virulence. These methods can assist in the detection and prevention of infectious diseases. However, this is a recent area of research that is still missing visualization tools to compare prokaryotic genomes in terms of gene content variation that offer interactive ways to explore data. Here, we present ProGenViZ, a user-friendly web-application that gives options to visualize and explore several prokaryotic genomes and their annotations, also providing features to compare specific genomic regions. Moreover, it provides additional features such as the re-annotation of genes, ordering of draft genome sequences against a reference genome and subsequent annotation by annotation transfer from one or more references. ProGenViZ is available at http://darwin.phyloviz.net/ProGenViZ.Todos os dias, novos dados de genomas de vários organismos são obtidos através de sequenciação de alto débito (high-throughput sequencing ou HTS) e são tornados públicos no NCBI Sequence Read Archive (www.ncbi.nlm.nih.gov/sra) e no EBI European Nucleotide Archive (http://www.ebi.ac.uk/ena). Actualmente, o factor limitante não é a obtenção dos dados genómicos mas sim a capacidade actual dos métodos de análise para extrair informação relevante deles. Este processo é ainda muitas vezes dependente do uso de software de custo considerável ou, no caso de ser gratuito, apresenta um nível elevado de complexidade. A combinação destes factores estão a contribuir para a acumulação de dados nas bases de dados públicas mas que têm a sua capacidade de análise limitada. A representação visual de dados complexos é bastante importante na percepção e apreenção de informação contida nos dados. Quando usada em combinação com métodos de comparação e exploração de dados genómicos, diferentes métodos de visualização podem ser usados para facilitar a identificação de caracteristicas relevantes em diversos estudos. Em Microbiologia, a capacidade de visualizar e comparar genomas pode ser aplicada em estudos epidemiológicos, bem como na identificação e caracterização de organismos através da determinação de linhagens associadas a resistência a antibióticos, patogenecidade e virulência, que podem assistir na detecção e prevenção de doenças infecciosas. No entanto, esta é ainda uma área de pesquisa recente onde faltam ferramentas de visualização que permitam comparar genomas de procariotas em termos de variação genómica em várias escalas e que ofereçam formas interactivas para explorar os dados. Nesta tese foi desenvolvido o ProGenViZ, uma aplicação web que oferece opções para visualizar e explorar simultaneamente múltiplos genomas de procariotas e suas anotações, fornecendo também funcionalidades para comparar regiões genómicas específicas. Além disso, a aplicação fornece capacidades adicionais como a re-anotação de genes, ordenação de sequências de genomas parciais contra contra um genoma de referência e subsequente anotação por transferência de uma ou mais sequências de referência. ProGenViZ está disponível em http://darwin.phyloviz.net/ProGenViZ. Para o desenvolvimento da estrutura básica da aplicação web foi utilizado o Bootstrap framework. A área de trabalho foi dividida em duas partes, uma com vários menus interactivos que permitem ao utilizador realizar várias análises aos dados carregados e outra com a representação visual das sequências genéticas e suas anotações. A aplicação aceita como input ficheiros no formato GenBank/EMBL, General Feature Format (GFF) e FASTA, bem como ficheiros com sequências múltiplas (multi-FASTA), tipicamente provenientes de genomas parciais. O ProGenViZ apresenta uma nova abordagem para conseguir visualizar vários genomas de procariotas numa única imagem. Utiliza uma representação abstracta onde as sequências genómicas são divididas de acordo com as suas anotações em regiões para reduzir a complexidade da visualização. As regiões são depois divididas em várias porções de 500 pares de bases de acordo com o seu tamanho e apresentadas numa de duas representações visuais baseada em grafos - hive plot ou numa representação linear – que foram desenvolvidas utilizando o a biblioteca de JavaScript D3. Foram também produzidas várias formas de interação entre as duas representação visuais e o utilizador através de zoom em regiões específicas, mas também através da disposição de informações sobre cada região e de menus que fornecem funcionalidades adicionais que permitem explorar e comparar os ficheiros carregados. Foi também desenvolvido um sistema de pesquisas que o utilizador pode realizar aos dados. É possível aceder a informação global sobre os ficheiros ou fazer pesquisas sobre regiões específicas. No caso do acesso a informação global sobre os ficheiros, o utilizador pode aceder a dados como o tamanho total das sequências e a percentagem que está anotada, ou a estatísticas associadas com a distribuição do tamanho das diferentes regiões e dos seus produtos. As distribuições do tamanho e dos produtos das regiões são representados graficamente na forma de um gráfico de barras e de um gráfico circular interactivos, que dão a capacidade ao utilizador de filtrar os dados que são mostrados. Procuras por regiões específicas e comparações podem também ser feitas através das anotações – por nome ou por produto - ou através do uso de sequências internas ou externas para determinar regiões com homologia de sequência utilizando BLAST. Os resultados de todas as procuras e relações entre regiões são apresentados numa tabela de resultados e através de modificações específicas na representação visual. Quando são estabelecidas relações entre regiões, essas relações são mostradas nas representações visuais através de ligações entre as regiões envolvidas, o que permite visualizar a sintenia entre as regiões de diferentes sequências genómicas. Além dos resultados do BLAST serem mostrados em forma de texto na tabela de resultados e através de modificações na imagem, foi também criada uma forma de visualizar os alinhamentos ao nível da sequência nucleotídica. Adicionalmente são ainda detectados single nucleotide polymorphisms (SNPs) através da utilização de uma funcionalidade do software MUMmer que detecta os SNPs existentes entre duas sequências Como actualmente as tecnologias de HTS permitem obter rapidamente informação sobre genomas parciais, no ProGenViZ foi também incorporada a possibilidade de visualizar e analisar ficheiros com múltiplas sequências provenientes de sequenciação destes genomas (contigs). Além de ser possivel aceder tanto às informações globais como realizar qualquer uma das procuras referidas anteriormente, foi também desenvolvida uma funcionalidade para ordenar os contigs contra um genoma de referência, o que fornece uma perspetiva global de quais e de que forma os contigs estão distribuídos ao longo da sequência de referência. Além disso, como normalmente as sequências parciais após serem geradas não têm qualquer anotação, foi também criada uma abordagem para anotá-las através de transferência de anotações de um genoma anotado de referência através da combinação dos resultados dos software Prodigal e BLAST. O Prodigal, um software de previsão de genes em procariotas, é utilizado para prever coding sites (CDS) nos contigs enquanto que o BLAST é utilizado para determinar se alguma região do genoma de referência tem similaridade com o gene previsto pelo Prodigal. Ao terem sido criadas maneiras de estabelecer relações entre regiões de diferentes ficheiros foi fornecida ao mesmo tempo uma forma de monitorizar a qualidade das anotações através de similaridade de sequência. Como algumas anotações pré-existentes podem estar erradas, foi desenvolvida uma funcionalidade para re-anotar o nome e o produto das diferentes regiões. Criámos também uma série de funcionalidades para exportar dados da aplicação. Podem ser exportados os resultados apresentados nas tabelas, imagens, sequências genómicas específicas, bem como toda a informação existente de regiões e sequências genómicas associadas a cada um dos ficheiros carregados na aplicação. Para demonstrar as diferentes capacidades da aplicação são também mostrados três casos de uso. No primeiro caso de uso são procurados os genes pertencentes ao esquema MLST de Streptococcus pneumoniae em dois genomas anotados para focar as capacidades do programa de realizar procuras por genes através do seu nome, produto e sequência. Esta análise demonstra os actuais problemas das anotações automáticas onde nem sequer os genes essenciais para manter funções básicas da célula estão bem anotados. Foi também possível determinar a existência de inversões na localização de dois dos genes após análise da representação visual. No segundo caso de uso são procurados os genes regulatórios inseridos no locus da biosíntese da cápsula do serotipo 1 de Streptococcus pneumoniae num ficheiro de contigs para ilustrar as capacidades da aplicação para encontrar regiões de interesse em contigs. Nesta. análise é possível encontrar todos os genes regulatórios bem como outros pertencentes ao mesmo locus num único contig. Finalmente, no último caso de uso, dois ficheiros com sequências parciais obtidas depois de sequenciar dois organismos da estirpe Streptococcus pneumoniae OXC141 e um genoma anotado da mesma estirpe são utilizados para mostrar as capacidades do programa para ordenar e anotar todos os contigs de um ficheiro contra uma referência. Com esta abordagem de transferência de anotação por homologia foi possível transferir de uma media de 87% de anotações da referência para os ficheiros de contigs

    PlaCoR: plataforma para a computação orientada ao recurso

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    Dissertação de mestrado integrado em Engenharia InformáticaA Plataforma para a Computação orientada ao Recurso (PlaCoR) foi desenhada como um ambiente de programação e execução de aplicações baseadas no modelo da computação orientada ao recurso (CoR), especificado em CoRes, integralmente escrito em C++ Moderno. A escolha do C++ trouxe enormes vantagens, no suporte à: i) programação orientada aos objetos, através da herança múltipla (na construção dos recursos); ii) programação genérica (permitindo abstrair na API as diferentes classes de recursos); iii) programação concorrente (para tirar partido de fios de execução e estruturas de sincronização nativas ao C++). A plataforma possui facilidades para: i) comunicação inter-domínios, ii) passagem de mensagens entre recursos comunicantes, iii) memória partilhada distribuída (DSM), iv) ativação remota de fios de execução (RPC), v) criação e gestão de recursos e vi) gestão da consistência entre todas as réplicas de um recurso. Atualmente, o desenho de aplicações CoR assenta nos recursos domínio, grupo, clausura, agente, proto-agente, dado, barreira, guarda e guarda para leituras/escritas. Os domínios estabelecem o primeiro nível de concorrência/paralelismo, quer sejam criados no início da aplicação ou lançados dinamicamente. Os agentes, pelo seu lado, estão associados ao grão fino de paralelismo e de comunicação por passagem de mensagens. O domínio, o grupo e a clausura são recursos estruturados que disponibilizam operações de adesão/saída de recursos; distingue-os o facto dos dois primeiros serem dinâmicos enquanto a clausura é estática, na medida em que as operações de adesão/saída são coletivas e o número total de membros é fixado inicialmente - características necessárias para o arranque paralelo de aplicações do tipo SPMD e a passagem de mensagens intra-clausura. A guarda é usada para a criação de zonas de exclusão mútua distribuídas (leituras/escritas), a barreira para a sincronização entre agentes, enquanto o dado contempla os mecanismos de memória partilhada distribuída, usado para disponibilizar os dados do utilizador num ambiente de domínios distribuídos. A avaliação da plataforma tomou como exemplo de aplicação a leitura e processamento de eventos registados em TTree, recorrentemente usados na experiência ATLAS. As várias versões desenvolvidas justificaram a criação de um módulo específico, a unidade Pool, que realiza o modelo fork-join. O experimento confirmou a viabilidade da orientação ao recurso como paradigma de programação híbrido que integra múltiplos fios de execução e sincronização distribuída, com facilidades de comunicação de grão fino para a passagem de mensagens e de comunicação em contextos seguros, o acesso remoto a memória e a ativação remota de agentes.The Resource-Oriented Computing Platform (PlaCoR) was designed as an application programming and execution environment based on the resource-oriented computing (CoR) model, specified in CoRes, fully written in Modern C++. The choice of C++ brought enormous advantages, in support to: i) object-oriented programming through multiple inheritance (in the construction of resources); ii) generic programming (allowing to abstract in the API the different classes of resources); iii) concurrent programming (to take advantage of run-time threads and synchronization structures native to C++). The platform has facilities for: i) inter-domain communication, ii) message passing between communicating resources, iii) distributed shared memory (DSM), iv) remote activation of execution threads (RPC), v) creation and management of resources and vi) consistency management among all replicas of a resource. Currently, the design of CoR applications relies on the resources domain, group, closure, agent, proto-agent, data, barrier, guard and read/write guard. The domains establish the first level of concurrency/parallelism, whether created at the beginning of the application or dynamically launched. Agents, for their part, are associated with the fine grain of parallelism and communication by message passing. The domain, the group and the closure are structured resources that provide join/leave operations of resources; the first two are dynamic while the closure is static, the later meaning that the join/leave operations are collective and the total number of members is fixed initially - characteristics necessary for the parallel start of SPMD-type applications and intraclosure message passing. The guard is used to create distributed mutual exclusion zones (read/write), the barrier for agent synchronization, while the data comprises distributed shared memory mechanisms, used to make the user’s data available in a distributed domain environment. The evaluation of the platform took as an application example the reading and processing of events registered in TTree, recurrently used in the ATLAS experience. The various versions developed justified the creation of a specific module, the Pool unit, which performs the fork-join model. The experiment confirmed the feasibility of resource orientation as a hybrid programming paradigm that integrates multiple threads of execution and distributed synchronization, with fine grain communication facilities for message passing and communication in secure contexts, remote access to memory and remote activation of agents.Este trabalho foi financiado pelo LIP, Laboratório de Instrumentação e Física Experimental de Partículas, através da bolsa de investigação com a referência LIP/BI-16/2018 FCT, COMPETE2020-Portugal2020, FEDER, POCI-01-0145-FEDER-007334, no âmbito do projeto BigData POCI/01-0145-FEDER-029147 PTDC/FIS-PAR/29147/2017, financiado por fundos OE/FCT, Lisboa2020, Compete2020, Portugal 2020, FEDER

    Attacking profiles of the best ranked teams from elite futsal leagues

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    This study aimed to (i) explore the discriminatory power of the task-related variables and the context in establishing differences in the elite futsal leagues of Portugal, Spain, and Russia and (ii) understand how these variables vary according to the match outcome. Methodological issues concerning efficiency (goals and shots), offensive organisation (positional attack, counterattack, set pieces, or 5vs4+Goalkeeper), 1st goal scored during matches (home or away team), match type (balanced or unbalanced), and match outcome (winner, loser, or drawer) were discussed. Archival data were obtained from the 2017-2018 season of Portuguese, Spanish, and Russian professional futsal leagues for all play-off matches. Crosstabs analysis was conducted to establish the significance relationship between the elite futsal leagues and the situational variables. Afterward, discriminant analysis was used to identify the task-related variables that maximise mean differences between different league teams for defining offensive profile, and the variations found when the condition of the winner, loser, or drawer is taken into account. The results allowed to understand that the Portuguese and Russian teams used the positional attacks more, and less the counterattacks and set pieces than the Spaniards, who present a more balanced offensive profile. Overall, winners were better discriminated by goals scored, whereas 5vs4+Goalkeeper strategy discriminated loser teams. Coaches should be aware of these different offensive profiles in order to increase control over the match planning and decrease predictability against opposing teams.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Renormalization-Group Theory of 1D quasiperiodic lattice models with commensurate approximants

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    We develop a renormalization group (RG) description of the localization properties of onedimensional (1D) quasiperiodic lattice models. The RG flow is induced by increasing the unit cell of subsequent commensurate approximants. Phases of quasiperiodic systems are characterized by RG fixed points associated with renormalized single-band models. We identify fixed-points that include many previously reported exactly solvable quasiperiodic models. By classifying relevant and irrelevant perturbations, we show that phase boundaries of more generic models can be determined with exponential accuracy in the approximant's unit cell size, and in some cases analytically. Our findings provide a unified understanding of widely different classes of 1D quasiperiodic systems

    Exploring the effects of interchange rotations on high-intensity activities of elite futsal players

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    The literature lacks an understanding of the physical demands of team sports with unlimited substitutions (player interchange rotations). Because of this characteristic of the game, it is necessary to analyze the physical requirements through player rotation rather than analyzing global averages. The objective of this research is to investigate the relationship between high-intensity activities (HIA; sum of accelerations, decelerations, and high-speed running actions) performed per interchange rotations and match time variables (playtime, rest time, and work–rest ratio) in elite futsal players. A retrospective observational design was used. Twelve matches from an elite male team competing in the Premier Spanish Futsal League were analyzed using a local positioning system, yielding a total sample of 17 players. The number of HIA performed per interchange rotation varies between players and allows the identification of three distinct activity profiles—lower HIA (10 HIA), medium HIA (28 HIA), and higher HIA (38 HIA). Furthermore, these profiles were found to be stable alongside the existing interchange rotations throughout the match. Playtime (F = 40.9, p < .001) and work–rest ratio (F = 15.6, p < .001) are the time variables that best differentiate match activity profiles. Players with more playing time (4.6 ± 1.0 min) and a work–rest ratio equal to or greater than 1 (1.1 ± 0.6 a.u.) have a greater ability to repeat HIA per rotation.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

    Incommensurability-Induced Enhancement of Superconductivity in One Dimensional Critical Systems

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    We show that incommensurability can enhance superconductivity in one dimensional quasiperiodic systems with s-wave pairing. As a parent model, we use a generalized Aubry-Andr\'e model that includes quasiperiodic modulations both in the potential and in the hoppings. In the absence of interactions, the model contains extended, critical and localized phases for incommensurate modulations. Our results reveal that in a substantial region inside the parent critical phase, there is a significant increase of the superconducting critical temperature compared to the extended phase and the uniform limit without quasiperiodic modulations. We also analyse the results for commensurate modulations with period close to the selected incommensurate one. We find that while in the commensurate case, the scaling of the critical temperature with interaction strength follows the exponentially small weak-coupling BCS prediction for a large enough system size, it scales algebraically in the incommensurate case within the critical and localized parent phases. These qualitatively distinct behaviors lead to a significant incommensurability-induced enhancement of the critical temperature in the weak and intermediate coupling regimes, accompanied by an increase in the superconducting order parameter at zero temperature.Comment: 8 pages, 4 figure

    Short-range interactions are irrelevant at the quasiperiodic-driven Luttinger Liquid to Anderson Glass transition

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    We show that short-range interactions are irrelevant around gapless ground-state delocalization-localization transitions driven by quasiperiodicity in interacting fermionic chains. In the presence of interactions, these transitions separate Luttinger Liquid and Anderson glass phases. Remarkably, close to criticality, we find that excitations become effectively non-interacting. By formulating a many-body generalization of a recently developed method to obtain single-particle localization phase diagrams, we carry out precise calculations of critical points between Luttinger Liquid and Anderson glass phases and find that the correlation length critical exponent takes the value ν=1.001±0.007\nu = 1.001 \pm 0.007, compatible with ν=1\nu=1 known exactly at the non-interacting critical point. We also show that other critical exponents, such as the dynamical exponent zz and a many-body analog of the fractal dimension are compatible with the exponents obtained at the non-interacting critical point. Noteworthy, we find that the transitions are accompanied by the emergence of a many-body generalization of previously found single-particle hidden dualities. Finally, we show that in the limit of vanishing interaction strength, all finite range interactions are irrelevant at the non-interacting critical point
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