La diversité génétique dans le complexe Acacia senegal

A la suite des prospections réalisées sur l'aire de répartition d'Acacia senegal au Sénégal, l'analyse de la diversité génétique de cette espèce a été étudiée par les marqueurs isoenzymatiques révélés par électrophorèse sur 15 provenances. Une interprétation génétique de 10 systèmes enzymatiques est proposé. A. senegal montre une diversité génétique faible (H=0,175) et une variabilité intrapopulation importante. La diversité observée sur A. senegal est comparée à celle d'A. dudgeoni, A. laeta, A. mellifera et A. gourmaensis qui appartiennent au même complexe d'espèces. Les relations taxonomiques entre ces espèces sont discutée

Allozyme variation among populations of the groundnut seed-beetle, Caryedon serratus (Ol.) in Senegal

L'électrophorèse sur gel d'amidon a permis de comparer huit loci appartenant à six systèmes enzymatiques chez dix-sept échantillons de bruche de l'arachide provenant de cinq plantes hôtes différentes : #Arachis hypogaea, #Bauhinia rufescens, #Cassis sieberiana, #Piliostigma reticulatum et #Tamarindus indica$. Le taux de polymorphisme est de 44,8$ et à l'arachide sont génétiquement très proches, alors que les autres échantillons se regroupent en fonction de leur espèce hôte. Les distances géographiques inférieures à 400 km ne sont pas déterminantes dans la structuration génétique des échantillons d'une plante hôte donnée. (Résumé d'auteur

L'acacia au Sénégal

#Acacia tortilis ssp. #raddiana est l'unique représentant de l'espèce en Afrique de l'Ouest. Utilisé pour des besoins domestiques, cet arbre fourrager est essentiel au maintien du pastoralisme dans le Sahel. Au Sénégal, l'étude de sa diversité génétique a porté sur cinq systèmes enzymatiques (six locus et 20 allèles) et une quinzaine de sites répartis dans la région sahélienne du pays. Les zymogrammes obtenus montrent un grand nombre d'allèles et des différences d'intensité de bandes caractéristiques d'une hérédité tétrasomique des espèces tétraploïdes. Comme chez de nombreuses espèces arborées, la diversité intra-site est élevée avec une différenciation inter-site faible. Toutefois, le niveau de diversité est nuancé en fonction des conditions écologiques locales. Il est d'autant plus élevé que le peuplement se trouve à proximité d'un point d'eau accueillant les troupeaux pendant la saison sèche. Les résultats sont discutés en fonction de la polyploïdie de l'espèce, de la pression humaine et animalière, et du mode de dispersion des graines. La région de Podor semble, de par sa richesse allélique, être une priorité pour la conservation de la variabilité de cette espèce. (Résumé d'auteur

Comparative proteomics reveal new HrpX-regulated proteins of Xanthomonas oryzae pv. oryzae

Pathogenicity of the rice pathogenic bacterium Xanthomonas oryzae pv. oryzae depends on a Hrp (hypersensitive response and pathogenicity) type III secretion system; the expression of which is induced in planta. Expression of the hrp operons is under transcriptional control of two key regulatory proteins, HrpG and HrpX. To identify new proteins that are co-regulated with the type III secretion system, we employed comparative proteomics. Cells of X. oryzae pv. oryzae ectopically expressing hrpX were compared to wild-type cells grown in vitro. Twenty protein spots with different abundances in both samples were identified by 2D-DIGE and LC-MS/MS. Seven spots could be unambiguously identified, corresponding to the HrpB1 protein, two different peptidyl-prolyl cis-trans isomerases, a component of an ATP binding cassette (ABC) transport system, an adenylate kinase, and a secreted protein of unknown function. Interestingly, the isoelectric point of the adenylate kinase was found to be under control of HrpX, most likely due to post-translational modification. Indeed, two glutamate residues of the adenylate kinase were found to be methylated but this modification did not account for the shift in electrophoretic mobility. In summary, we identified new HrpX-regulated proteins of X. oryzae pv. oryzae that might be important for pathogenicity. This article is part of a Special Issue entitled: Trends in microbial proteomics. Biological significance We use 2D-DIGE to compare the proteomes of rice-pathogenic xanthomonads. We identify seven proteins that are co-regulated with the type III secretion system. We find posttranslational glutamate methylation of a bacterial adenylate cyclase. The newly identified HrpX-regulated proteins might be important for pathogenicity