Expanding Research Capacity in Sub-Saharan Africa Through Informatics, Bioinformatics, and Data Science Training Programs in Mali

Bioinformatics and data science research have boundless potential across Africa due to its high levels of genetic diversity and disproportionate burden of infectious diseases, including malaria, tuberculosis, HIV and AIDS, Ebola virus disease, and Lassa fever. This work lays out an incremental approach for reaching underserved countries in bioinformatics and data science research through a progression of capacity building, training, and research efforts. Two global health informatics training programs sponsored by the Fogarty International Center (FIC) were carried out at the University of Sciences, Techniques and Technologies of Bamako, Mali (USTTB) between 1999 and 2011. Together with capacity building efforts through the West Africa International Centers of Excellence in Malaria Research (ICEMR), this progress laid the groundwork for a bioinformatics and data science training program launched at USTTB as part of the Human Heredity and Health in Africa (H3Africa) initiative. Prior to the global health informatics training, its trainees published first or second authorship and third or higher authorship manuscripts at rates of 0.40 and 0.10 per year, respectively. Following the training, these rates increased to 0.70 and 1.23 per year, respectively, which was a statistically significant increase (p < 0.001). The bioinformatics and data science training program at USTTB commenced in 2017 focusing on student, faculty, and curriculum tiers of enhancement. The program’s sustainable measures included institutional support for core elements, university tuition and fees, resource sharing and coordination with local research projects and companion training programs, increased student and faculty publication rates, and increased research proposal submissions. Challenges reliance of high-speed bandwidth availability on short-term funding, lack of a discounted software portal for basic software applications, protracted application processes for United States visas, lack of industry job positions, and low publication rates in the areas of bioinformatics and data science. Long-term, incremental processes are necessary for engaging historically underserved countries in bioinformatics and data science research. The multi-tiered enhancement approach laid out here provides a platform for generating bioinformatics and data science technicians, teachers, researchers, and program managers. Increased literature on bioinformatics and data science training approaches and progress is needed to provide a framework for establishing benchmarks on the topics

Appropriation et vulgarisation d'outils d'aide à la décision dans la co-gestion du périmètre irrigué de la Vallée du Kou (sud-ouest du Burkina Faso)

Dans le cadre d’un programme national de sécurité alimentaire datant des années 60, un périmètre rizicole irrigué de 1.200 ha, appelé la Vallée du Kou, a été établi dans le Sud-ouest du Burkina Faso (Bama). Long temps conjointement géré par l’Etat et toute une série d’agences d’aide au développement, tout appui s’est brutalement arrêté en 1993 laissant les agriculteurs à peine préparé pour assumer la relève de la gestion. Le résultat : un ancien beau périmètre succombe dans un théâtre typique de gestion anarchique. Différentes structures de coopératives ont tenté depuis, de gérer leur petite part du périmètre passant outre aux règles et sans aucun respect pour leurs voisins. Les travaux de maintenance avaient disparu, les récoltes étaient en baisses et l’eau disponible ne satisfaisaient plus aux besoins laissant presque un quart des champs en jachères. Observant l’état de plus en plus dégradé du périmètre et conscient de leurs faibles capacités de gestion, l’Union des Coopératives Rizicole de Bama (UCRB) s’est finalement adressée à un opérateur externe (AEDE), expérimenté dans le domaine de l’eau et de l’agriculture, pour obtenir un appui. Cette assistance est déployée à deux niveaux. Premièrement, l’installation d’un conseiller permanent en irrigation sur le périmètre intervenant comme appui technique auprès des agriculteurs et chargé d’établir un inventaire technique et objectif sur l’état du périmètre et de sa gestion. Deuxièmement, des études plus techniques ont été établies afin de quantifier les problèmes de gestion et de proposer des solutions en termes d’occupations des parcelles et de distribution d’eau plus durables. Ceci a notamment nécessité la mise en place et l’application de l’outil de gestion de périmètre irrigué SIMIS. A travers les différentes étapes, des réunions participatives ont été organisées au niveau de l’union des coopératives ainsi qu’au niveau des différentes coopératives. Les producteurs ont été écoutés, et des plans et solutions proposés et discutés. Si nécessaire, des compromis étaient cherchés et représentés pour approbation. Quelques mois seulement après la mise en place de cet appui-conseil, une augmentation de l’occupation des parcelles dans le périmètre a été constatée et une distribution en eau plus équitable enregistrée. Côté producteurs, une satisfaction générale a été notée et ils souhaitent à présent s’engager davantage dans cette gestion externe du périmètre. D’autres périmètres ont également manifesté leur intérêt

MOESM1 of Impact of I/D polymorphism of angiotensin-converting enzyme (ACE) gene on myocardial infarction susceptibility among young Moroccan patients

Additional file 1: Table S1. Hardy–Weinberg equilibrium (HWE) among cases and control. Table 2. Traditional risk factors vs I/D ACE genotypes distribution among < 45 years of age MI patients. Figure S1. Cytogenetic Location of ACE gene