First case report of bloodstream infection due to a Candida species closely related to the novel species Candida pseudorugosa

Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Isla, Guillermina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Fernández, Norma. Hospital de Clínicas José de San Martín. División Infectología. Sección Micología; Argentina.Fil: García, Susana. Hospital de Clínicas José de San Martín. Departamento de Bioquímica Clínica. División Bacteriología; Argentina.Fil: Mazza, Mariana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Murisengo, Omar Alejandro. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Szusz, Wanda. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Tiraboschi, Iris Nora. Hospital de Clínicas José de San Martín. División Infectología. Sección Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Candida pseudorugosa is a novel species closely related to Candida rugosa for which only one case has been reported. We report the first case of a bloodstream infection in humans caused by a Candida sp. closely related to C. pseudorugosa. We contribute evidence to show this organism as a potential human pathogen that may be misidentified by conventional methods, also pointing out its lower sensitivity to azoles and other antifungal agents

Actividad in vitro de anidulafungina frente a aislamientos clínicos de Candida spp

Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Isla, Guillermina. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.El tratamiento de la candidiasis sistémica y del torrente sanguíneo es con anfotericina B o fluconazol. El continuo uso de estos antifúngicos posibilitó la selección de nuevas especies menos susceptibles, principalmente a los azoles. La anidulafungina, una nueva equinocandina, tiene potente actividad in vitro frente a un amplio rango de levaduras emergentes potencialmente patógenas

Actividad in vitro de anidulafungina frente a aislamientos clínicos de Candida spp

Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Isla, Guillermina. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr. C. G. Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (INEI). Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.El tratamiento de la candidiasis sistémica y del torrente sanguíneo es con anfotericina B o fluconazol. El continuo uso de estos antifúngicos posibilitó la selección de nuevas especies menos susceptibles, principalmente a los azoles. La anidulafungina, una nueva equinocandina, tiene potente actividad in vitro frente a un amplio rango de levaduras emergentes potencialmente patógenas

Concordancia entre características fenotípicas y PCR-REA en la identificación de especies de Malassezia

Fil: Canteros, Cristina Elena. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Rivas, María Cristina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Lee, William. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Perrotta, Diego. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.El género Malassezia ha sido revisado recientemente y, hasta el momento, se acepta que incluye 11 especies, que no siempre pueden ser diferenciadas mediante pruebas fisiológicas y morfológicas. En este trabajo se investigó la concordancia entre las pruebas fenotípicas y un método molecular rápido en la identificación de especies de ese género. Se analizaron 92 aislamientos clínicos de Malassezia spp. obtenidos de pacientes argentinos entre 2001 y 2005 y tres cepas de referencia (Malassezia furfur CBS-7019, Malassezia sympodialis CBS-7222 y Malassezia slooffiae CBS-7956). El método molecular, basado en amplificación del ADN por PCR y su digestión con tres diferentes endonucleasas (PCR-REA), permitió identificar inequívocamente los 92 aislamientos clínicos (63 M. sympodialis, 18 M. furfur, 10 Malassezia globosa y una Malassezia obtusa) y las tres cepas de referencia. Mediante las pruebas fenotípicas se logró tipificar 85 aislamientos y dos de las cepas de referencia (concordancia total > 91%). Para las especies más frecuentemente involucradas en patología humana, tales como M. sympodialis, M. furfur y M. globosa, la concordancia osciló entre 84-96%, lo que indicaría que los estudios fenotípicos son útiles para la identificación presuntiva de estos miembros del género en laboratorios que aún no tienen acceso a la metodología molecular

Frequency and geographical distribution of genotypes and mating types of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes in Argentina

Fil: Taverna, CG. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, ME. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Mazza, M. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Vivot, ME. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Canteros, Cristina Elena. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina.The aim of this work was to know the frequency and geographical distribution of genotypes and mating types of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes isolated from human infections in Argentina during the period from April 2009 to April 2011. A multicenter study was conducted, in which 372 isolates were obtained from 61 laboratories throughout the country. Of those, 98.8% of the isolates belonged to the C. neoformans species complex and 1.1% to the C. gattii species complex. Genotype VNI (MATα) was the most frequently isolated (n=326, 87.6%), followed by VNII (MATα) (n=22, 5.9%), the recently described VNII-VNIV (aADα) hybrid (n=14, 3.8%), VNIV (MATα) (n=4, 1.1%), VNIII (αADa) hybrid (n=1, 0.3%), and VNIII (αADα) hybrid (n=1, 0.3%). The Argentine Central region showed the greatest number of cases and genotype diversity. Interestingly, a relative high frequency was observed in genotype VNII (MATα) in the Cuyo, Northeast and Northwest regions and, also in VNII-VNIV (aADα) hybrids in the Northwest region. C. gattii species complex was isolated at a low rate; 3 VGI (MATα) and 1 VGII (MATα) isolates were obtained from the Northwest and Central regions. In conclusion, this study shows that genotype frequencies seem to vary among regions in Argentina and reveals a relatively high frequency of rare hybrids in the Northwest region. Further regional clinical and environmental studies may help to elucidate if those variations in frequencies are associated with the existence of regional ecological niches or any other regional factors.Genotipificación; Genotyping; Hybrids; Híbridos; Mating type; Tipo sexua

Amino acid substitution in Cryptococcus neoformans lanosterol 14-α-demethylase involved in fluconazole resistance in clinical isolates

Fil: Bosco-Borgeat, María E. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Mazza, Mariana. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Murisengo, Omar A. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr. C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.The molecular basis of fluconazole resistance in Cryptococcus neoformans has been poorly studied. A common azole resistance mechanism in Candida species is the acquisition of point mutations in the ERG11 gene encoding the enzyme lanosterol 14-α-demethylase, target of the azole class of drugs. In C. neoformans only two mutations were described in this gene. In order to evaluate other mutations that could be implicated in fluconazole resistance in C. neoformans we studied the genomic sequence of the ERG11 gene in 11 clinical isolates with minimal inhibitory concentration (MIC) values to fluconazole of ≥16μg/ml. The sequencing revealed the G1855A mutation in 3 isolates, resulting in the enzyme amino acid substitution G484S. These strains were isolated from two fluconazole-treated patients. This mutation would not intervene in the susceptibility to itraconazole and voriconazole

First case of Fungemia due to Pseudozyma aphidis in a pediatric patient with Osteosarcoma in Latin America

Fil: Orecchini, Luisa Alejandra. Hospital de niños de la Santísima Trinidad; Argentina.Fil: Olmos, Eugenia. Hospital de niños de la Santísima Trinidad; Argentina.Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Murisengo, Omar Alejandro. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Szuzs, Wanda. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento Micología; Argentina.Fil: Montanaro, Patricia Cristina. Hospital de niños de la Santísima Trinidad; Argentina.We report the first case of blood infection due to Pseudozyma aphidis in Latin America. We contribute evidence showing this organism to be a potential human pathogen, and we provide new data about its identification, drug susceptibility, and treatment outcome

Reidentification and antifungal susceptibility profile of Candida guilliermondii and Candida famata clinical isolates from a culture collection in Argentina

Fil: Taverna, Constanza Giselle. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Córdoba, Susana. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Vivot, Matias Ezequiel. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Szusz, Wanda. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Vivot, Walter. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Bosco-Borgeat, María Eugenia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.Fil: Davel, Graciela Odelsia. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Micología; Argentina.The aim of this work was to reidentify strains previously identified as Candida guilliermondii and Candida famata by conventional phenotypic methods conserved in a culture collection from Argentina using ribosomal DNA sequencing, ACT1 gene sequencing, and matrix-assisted laser desorption ionization - time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). In addition, we performed antifungal susceptibility tests of eight antifungal drugs commonly used in clinical treatment. We identified 68 isolates belonging to the Candida guilliermondii species complex (59 C. guilliermondii, 8 C. fermentati, and 1 Candida carpophila), 16 isolates belonging to the Candida famata species complex (8 C. famata, 6 Debaryomyces nepalensis, 1 Debaryomyces fabryi, and 1 Debaryomyces tyrocola). Although sequencing of ITS region was able to identify C. guilliermondii and D. nepalensis isolates, sequencing of ACT1 gene seems to be the most appropriate technique for differentiation between C. fermentati and C. carpophila and between members of the C. famata species complex others than D. nepalensis. MALDI-TOF MS has a good potential for the identification of these yeasts, particularly in clinical laboratories since is a rapid and easy to perform technique. Here, we report the first isolation of D. tyrocola from a human patient and the first isolation of D. nepalensis from lungs and blood of human patients. Finally, correct identification and determination of antifungal susceptibility of those closely related species could be a useful tool for clinicians to choose the most effective antifungal treatment

Comparative analyses of classical phenotypic method and ribosomal RNA gene sequencing for identification of medically relevant Candida species

Made available in DSpace on 2015-09-21T17:25:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) mariana_boité_etal_IOC_2013.pdf: 754087 bytes, checksum: d93393de1339222992ebb04d972b71f6 (MD5) Previous issue date: 2013Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas Dr Carlos G Malbrán. Departamento Micología. Buenos Aires, Argentina.Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas Dr Carlos G Malbrán. Departamento Micología. Buenos Aires, Argentina.Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas Dr Carlos G Malbrán. Departamento Micología. Buenos Aires, Argentina.Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas Dr Carlos G Malbrán. Departamento Micología. Buenos Aires, Argentina.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmaniose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmaniose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas Dr Carlos G Malbrán. Departamento Micología. Buenos Aires, Argentina.As the distribution of Candida species and their susceptibility to antifungal agents have changed, a new means of accurately and rapidly identifying these species is necessary for the successful early resolution of infection and the subsequent reduction of morbidity and mortality. The current work aimed to evaluate ribosomal RNA gene sequencing for the identification of medically relevant Candida species in comparison with a standard phenotypic method. Eighteen reference strains (RSs), 69 phenotypically identified isolates and 20 inconclusively identified isolates were examined. Internal transcribed spaces (ITSs) and D1/D2 of the 26S ribosomal RNA gene regions were used as targets for sequencing. Additionally, the sequences of the ITS regions were used to establish evolutionary relationships. The sequencing of the ITS regions was successful for 88% (94/107) of the RS and isolates, whereas 100% of the remaining 12% (13/107) of the samples were successfully analysed by sequencing the D1/D2 region. Similarly, genotypic analysis identified all of the RS and isolates, including the 20 isolates that were not phenotypically identified. Phenotypic analysis, however, misidentified 10% (7/69) of the isolates. Phylogenetic analysis allowed the confirmation of the relationships between evolutionarily close species. Currently, the use of genotypic methods is necessary for the correct identification of Candida species