Post-acquisition image based compensation for thickness variation in microscopy section series

Serial section Microscopy is an established method for volumetric anatomy reconstruction. Section series imaged with Electron Microscopy are currently vital for the reconstruction of the synaptic connectivity of entire animal brains such as that of Drosophila melanogaster. The process of removing ultrathin layers from a solid block containing the specimen, however, is a fragile procedure and has limited precision with respect to section thickness. We have developed a method to estimate the relative z-position of each individual section as a function of signal change across the section series. First experiments show promising results on both serial section Transmission Electron Microscopy (ssTEM) data and Focused Ion Beam Scanning Electron Microscopy (FIB-SEM) series. We made our solution available as Open Source plugins for the TrakEM2 software and the ImageJ distribution Fiji

Robust Registration of Calcium Images by Learned Contrast Synthesis

Multi-modal image registration is a challenging task that is vital to fuse complementary signals for subsequent analyses. Despite much research into cost functions addressing this challenge, there exist cases in which these are ineffective. In this work, we show that (1) this is true for the registration of in-vivo Drosophila brain volumes visualizing genetically encoded calcium indicators to an nc82 atlas and (2) that machine learning based contrast synthesis can yield improvements. More specifically, the number of subjects for which the registration outright failed was greatly reduced (from 40% to 15%) by using a synthesized image

Learned versus Hand-Designed Feature Representations for 3d Agglomeration

For image recognition and labeling tasks, recent results suggest that machine learning methods that rely on manually specified feature representations may be outperformed by methods that automatically derive feature representations based on the data. Yet for problems that involve analysis of 3d objects, such as mesh segmentation, shape retrieval, or neuron fragment agglomeration, there remains a strong reliance on hand-designed feature descriptors. In this paper, we evaluate a large set of hand-designed 3d feature descriptors alongside features learned from the raw data using both end-to-end and unsupervised learning techniques, in the context of agglomeration of 3d neuron fragments. By combining unsupervised learning techniques with a novel dynamic pooling scheme, we show how pure learning-based methods are for the first time competitive with hand-designed 3d shape descriptors. We investigate data augmentation strategies for dramatically increasing the size of the training set, and show how combining both learned and hand-designed features leads to the highest accuracy

On-line Locating of Generator Trips in Large Power Systems

Power system is a giant dynamic system. It consists of numerous generation units, transmission lines and loads. Each sudden change influences both voltage and frequency conditions. Impact intensity of such events depends on power-system operating conditions at that time and specifics of an involved power-system element. Normally the most critical event represents an unscheduled outage of a major element following a fault. It is of crucial importance for a system operator to detect and evaluate the “danger” of such events as soon as possible in order to keep the operational security of a power system at a high level by taking suitable emergency actions. One of the most important information for the operator is the location of an event origin and in case of cascaded events the corresponding time sequence of all other events that follow.This paper describes different methods for on-line locating of generator trips in large power systems. The first and most significant step for on-line locating of generator trips is detection of it. The next step is time delay detection, observed from frequency, for which several different approaches can be used. The last step is locating of generator. In this paper two different methods are presented, the first method is multilateration and the second method is gradient search method. Their applications are demonstrated on a real case from ENTSO-E network. Results of both methods are compared

Das Senjer Gymnasium von seinem Anfang bis zum Tod des Bischofs Mirko Ožegovic (1725-1869).

Autor utvrđuje početak Senjske gimnazije i prikazuje period kada su je vodili redovnici pavlini. Potom iznosi teškoće koje je imala gimnazija nakon ukinuća pavlina, sve dok nije i sama zatvorena. Posebno obraduje rad biskupa Mirka Ožegovića na obnovi gimnazije 1839. Koristeći se do sada neiskorištenim spisima iz Biskupskog arhiva u Senju, uspješno nadopunjuje i proširuje naše poznavanje prošlosti Senjske gimnazije i uopće školstva u Senju.Das Senjer Gymnasium hat Kaiser Karl der Sechste auf Anregung des ehemaligen Senjer-Modrušer Bischofs Pohmajević errichtet. Es wurde dann den Pavlinern aus dem Senjer Kloster des hi. Nicolaus iibergeben, und sie haben es bis zur Aufhebung des Ordens 1786 geleitet. Danach haben an dieser Schule die ehemaligen Pavliner sowie Franziskaner bis 1802 unterrichtet. Durch diese Zeit hatte dieselbe nich immer sechs Klassen. Wegen des Missverständnisses mit den Franziskanern wurde das Gymnasium 1802 geschlossen. 1808 wurde es wieder geöffnet und von da an haben an dem Senjer Gymnasium die bischöflichen Geistlichen belehrt. Wegen finanzieller Grunden und ungeeigneter Lehrer haben die Behorden 1820 das Gymnasium wieder geschlossen, aber es wirkte weiterhin als ein privat- d.h. Bischofsgymnasium bis 1827, Nach diesem Jahr hatte Senj wieder kein Gymnasium bis 1839, als der Bischof Mirko Ožegovic diese Schule wiederhergestellte. In erste vier Jahren wirkte dieses Gymnasium als eine private Schule. Erst 1843 wurde es in eine öffentliche Lehranstalt umgewandelt, und bekam ständige Staatsunterhaltung. Nach der Reformierung des Schulwesens 1849 wurde das Gymnasium mit der philosophischen Lehranstalt zu einem vollständigen Gymnasium vereinigt, und hatte 8 Klassen (Untei\u27gymnasium mit 4 Klassen und Obergymnasium mit 4 Klassen). Von 1808 an bestand in Senj (mit Unterbrechungen) ein philosophisches Lyzeum mit 2 Klassen, welches die Schiiler in erster Reihe zur Einschreibung an die theologische Fakultät bereitete. Dieses Lyzeum war bis 1843 eine private Anstalt, dann bekam es den Status der öffentlichen Schule und konnte den Schiilern die Einschreibung in alle höheren Schule

Das Senjer Gymnasium von seinem Anfang bis zum Tod des Bischofs Mirko Ožegovic (1725-1869).

Autor utvrđuje početak Senjske gimnazije i prikazuje period kada su je vodili redovnici pavlini. Potom iznosi teškoće koje je imala gimnazija nakon ukinuća pavlina, sve dok nije i sama zatvorena. Posebno obraduje rad biskupa Mirka Ožegovića na obnovi gimnazije 1839. Koristeći se do sada neiskorištenim spisima iz Biskupskog arhiva u Senju, uspješno nadopunjuje i proširuje naše poznavanje prošlosti Senjske gimnazije i uopće školstva u Senju.Das Senjer Gymnasium hat Kaiser Karl der Sechste auf Anregung des ehemaligen Senjer-Modrušer Bischofs Pohmajević errichtet. Es wurde dann den Pavlinern aus dem Senjer Kloster des hi. Nicolaus iibergeben, und sie haben es bis zur Aufhebung des Ordens 1786 geleitet. Danach haben an dieser Schule die ehemaligen Pavliner sowie Franziskaner bis 1802 unterrichtet. Durch diese Zeit hatte dieselbe nich immer sechs Klassen. Wegen des Missverständnisses mit den Franziskanern wurde das Gymnasium 1802 geschlossen. 1808 wurde es wieder geöffnet und von da an haben an dem Senjer Gymnasium die bischöflichen Geistlichen belehrt. Wegen finanzieller Grunden und ungeeigneter Lehrer haben die Behorden 1820 das Gymnasium wieder geschlossen, aber es wirkte weiterhin als ein privat- d.h. Bischofsgymnasium bis 1827, Nach diesem Jahr hatte Senj wieder kein Gymnasium bis 1839, als der Bischof Mirko Ožegovic diese Schule wiederhergestellte. In erste vier Jahren wirkte dieses Gymnasium als eine private Schule. Erst 1843 wurde es in eine öffentliche Lehranstalt umgewandelt, und bekam ständige Staatsunterhaltung. Nach der Reformierung des Schulwesens 1849 wurde das Gymnasium mit der philosophischen Lehranstalt zu einem vollständigen Gymnasium vereinigt, und hatte 8 Klassen (Untei\u27gymnasium mit 4 Klassen und Obergymnasium mit 4 Klassen). Von 1808 an bestand in Senj (mit Unterbrechungen) ein philosophisches Lyzeum mit 2 Klassen, welches die Schiiler in erster Reihe zur Einschreibung an die theologische Fakultät bereitete. Dieses Lyzeum war bis 1843 eine private Anstalt, dann bekam es den Status der öffentlichen Schule und konnte den Schiilern die Einschreibung in alle höheren Schule