Les microcodiums. Milieux et modes de développement

The word "microcodium" was first time used in 1912 by H. Glück to designate the cristallisations of calcite found in the marine Miocene of Bade (Germany) and alloted to some Algae belonging to the Siphonae family. Further, research works brought their authors to wonder what was the organic or mineral origin of these cristallisations and their environment of growth. The present study shows that the existence of microcodiums in the rocks is closely linked to the existence of a paleosoil ; their evolution is due to a dichotomy ; this way of development is recognized as that of the three types of disposition distinguished and corresponding to a same structure ; prisms of calcite attached to an axis of development along which can be seen the dichotomies proving their organic origin. The phenomenon of litholyse which can be imputed to the ramified fibres observed in the prisms does not seem cause any change in the chemical structure ; it is expressed by a modification in the texture involving a segregation between the carbonate of calcium and the insoluble materials. Modifications in the argillaceous phase only are significant of a mineralogie evolution of normal rocks and microcodiums. These changes are probably linked to pedogenese ; their importance is confirmed by the analysis of the stable isotopes of carbone and oxygen which also reveal that the microcodiums metabolise all the carbonate. At last, the comparison which the present process of biocorrosion due to the microorganisms of the soil shows the particularity of the microcodium system ensuring by itself the couple biocorrosion-biosynthesis. Therefore, if the fibres described can be potentially compared with the Actinomycetes, the origine of microcodiums seems to have to be considered in the joining of at least two organisms.Le terme microcodium a été créé en 1912 par H. Glück pour désigner des cristallisations de calcite récoltées dans le Miocène marin de Bade et attribuées à des Algues de la famille des Siphonées. Plusieurs découvertes ultérieures ont amené les auteurs à rechercher l'origine minérale ou organique de ces cristallisations ainsi que leur milieu de développement. Les travaux entrepris par l'auteur montrent que les microcodiums sont en liaison très étroite avec les paléosols (encroûtements calcaires discontinus et continus, paléosols hydromorphes). Toutes les observations de terrain offrent une remarquable convergence : les microcodiums ont proliféré dans les sols ou bien à l'intérieur de substratums carbonatés très variés situés sous des sols. Quel que soit le type d'agencement reconnu (lamines ou épi de mais), les prismes apparaissent comme greffés sur un axe de progression dont la croissance est dichotome. L'action de litholyse du CO3Ca imputable aux filaments observés à l'intérieur des prismes ne semble provoquer aucun changement dans la composition chimique de la roche originelle. Par contre, cette action conduit, au niveau de la texture, à une ségrégation entre le carbonate de calcium et le reste des matériaux, systématiquement rejetés hors des prismes. Seules des modifications ont été observées dans la phase argileuse, mais elles peuvent être imputées à la pédogenèse. Les analyses des isotopes stables du carbone et de l'oxygène matérialisent un milieu de développement confiné et montrent que tout le carbone des prismes de microcodium a été métabolisé. Cette "charge organique", d'origine photosynthétique, a vraisemblablement été acheminée depuis la surface du sol jusqu'aux microcodiums par l'intermédiaire de relais biologiques. Enfin, la comparaison avec des processus actuels de biocorrosion dus aux microorganismes du sol démontre l'originalité du "système microcodium" qui assure à lui seul le couple biocorrosion-biosynthèse. Par conséquent, si les filaments décrits dans les prismes peuvent selon toute vraisemblance être rattachés aux Actinomycètes, il semble qu'une association d'au moins deux organismes soit nécessaire pour expliquer l'action des microcodiums.Bodergat Anne-Marie. Les microcodiums. Milieux et modes de développement. In: Documents des Laboratoires de Géologie de la Faculté des Sciences de Lyon, n°62, 1974. Notes et mémoires. pp. 137-255

Les ostracodes, témoins de leur environnement : approche chimique et écologie en milieu lagunaire et océanique

Some fossil and contemporany ostracods shells are studied by means of chemical analysis. The qualitative analysis of the shells of different species - chosen from same sampling - shows a distinctive chemical composition according to the species. Specimens shells of the same species which come from different places have not the same chemical composition. Each species adjusts in its own specific chemical way to the local environmental factors. The analysis focuses more precisily on Cyprideis torosa - euryhaline ostracod - collected from a contemporany salty multifarious environment and Krithe C and D - eurybathial ostracods - selected from a cenozoïcal sediment in a deep sea environment. The study of the ostracofauna in a salty multifarious environment gives us information about the presence or lack of plants and shows the influence of salinity on species association. The chemical analysis of Cyprideis torosa shells informs us about the presence of metabolical processes occuring in the absorption of the chemical elements about what each season brings to the environment, about the soils general caracteristics and about the sedimentary processes. The composition of the deep sea species associations reflects the fluctuations occuring at the heart of the ecosystem and enables us to follow especially the bathymetric variation of the locations studied. The chemical analysis reveals the influence of the chemical parameters of the sediment on the composition of the shells and the importance of the pole's association P-Si and the pole's association Al-K of the water's chemical composition in the shells chemical composition. The ornamentation and the different parameters of the shells are not only linked to a particular chemical element but to the association of several elements showing the general conditions of the environment. At the level of its chemical composition, a carbonated shell records the ecosystem fluctuations.L'analyse chimique de carapaces d'ostracodes actuels et fossiles est réalisée à l'aide de la microsonde électronique, d'un système dispersif en énergie (Tracor NS 857) et de l'analyse multi-élémentaire en spectrométrie de masse à étincelle. L'analyse qualitative de carapaces appartenant à des espèces distinctes mais choisies dans un même prélèvement met en évidence une composition chimique différente selon l'appartenance taxonomique. Des individus d'une même espèce mais de provenances différentes n'ont pas la même composition chimique. Chaque espèce donne une réponse qui lui est propre aux facteurs locaux d'environnement. L'analyse est focalisée plus précisément sur Cyprideis torosa, ostracode euryhalin collecté dans le milieu à salinité variée actuel et sur Krithe C et D, ostracodes eurybathes, prélevés dans les sédiments d'âge cénozoïque du milieu océanique profond. L'étude de l'ostracofaune du milieu à salinité variée renseigne sur la présence ou l'absence de végétation et met en évidence l'influence de la salinité sur les associations spécifiques. L'analyse chimique des carapaces de Cyprideis torosa informe sur l'existence de processus métaboliques intervenant dans l'absorption des éléments chimiques, sur les apports saisonniers dans le milieu, sur la nature du support édaphique et sur les processus de sédimentation. La composition des associations spécifiques du milieu profond reflète les fluctuations survenant au sein de l'écosystème et permet de suivre en particulier l'évolution bathymétrique des sites étudiés. L'analyse chimique montre l'influence des caractéristiques chimiques du sédiment et la part prise par le pôle thalassophile et le pôle lithophile de la composition chimique de l'eau sur la composition chimique des tests. L'ornementation et les différentes caractéristiques des tests sont liées non pas à un seul élément chimique mais à l'association de plusieurs éléments chimiques traduisant les conditions générales du milieu. Un exosquelette carbonaté enregistre, au niveau de sa composition chimique, les fluctuations de l'écosystème.Bodergat Anne-Marie. Les ostracodes, témoins de leur environnement : approche chimique et écologie en milieu lagunaire et océanique. In: Documents des Laboratoires de Géologie, Lyon, n°88, 1983. Les ostracodes, témoins de leur environnement : approche chimique et écologie en milieu lagunaire et océanique. pp. 3-246

Un marqueur instantané de la pollution en cérium dans la zone de Cortiou (rade sud de Marseille, Bouches-du-Rhône) : Aurila speyeri Brady, 1868 (Ostracoda, Podocopida)

Working with the microprobe, cerium has been found in one ostracoda shell : Aurila speyeri Brady picking up between the Small Cougloué and the Big Cougloué (in the South road of Marseille) not far from the big main sewer of Cortiou. It results of an eventfull discharge occuring during the moult of that ostracoda. It is the reason why, for the first time, the ostracoda can serve as proofs of an industrial pollution and so that showing an eventfull feature.À l'aide de la microsonde électronique, la présence de cérium a été décelée dans une carapace d'ostracode : Aurila speyeri Brady, prélevée entre le Petit et le Grand Cougloué (rade sud de Marseille) non loin du grand collecteur d'égout de Cortiou. Elle est attribuée à une décharge accidentelle survenue lors de la mue de cet individu : il apparaît pour la première fois que les ostracodes peuvent être utilisés comme les témoins d'une pollution d'origine industrielle à caractère accidentel.Bodergat Anne-Marie. Un marqueur instantané de la pollution en cérium dans la zone de Cortiou (rade sud de Marseille, Bouches-du-Rhône) : Aurila speyeri Brady, 1868 (Ostracoda, Podocopida). In: Documents des Laboratoires de Géologie de la Faculté des Sciences de Lyon. Hors série n°4, 1978. Les sédiments, leur histoire, leur environnement et leur devenir. Livre jubilaire Jacques Flandrin. pp. 71-85

Espèces du groupe de Candona candida, Candona neglecta et quelques Candona à l'aspect morphologique problématique (Candonidae, Ostracoda) du Bassin de Turiec (Miocène supérieur, Slovaquie)

International audienceChez les ostracodes, la sous-famille Candoninae (Ostracoda) est le groupe le plus diversifié dans les dépôts d'eau douce du Miocène supérieur du Bassin de Turiec (Slovaquie). La découverte d'espèces de Candoninae proches du point de vue morphologique d'espèces actuelles mais aussi d'espèces propres à la Paratéthys Centrale fait apparaître un problème de nomenclature. La détermination des espèces de Candonidae a été effectuée en se référant à la taxonomie actuelle zoologique. Pour distinguer les espèces, l'accent a été mis sur les détails morphologiques des carapaces. Trois nouveaux groupes (Candona candida, C. neglecta et Candona de groupe indet) sont définis et sept espèces nouvelles – Candona densa, C. mocki, C. imaginaria, C. margueritae, C. singularis, C. sirveni et C. vahica sont décrites. Trois espèces sont laissées en nomenclature ouverte

The Candona clivosa-group, a new group of Candoninae (Crustacea, Ostracoda) and its diversification in the Upper Miocene of the Turiec Basin (Slovakia)

International audienceThe Candona clivosa-group, a new group of Candoninae – is erected on the base of the folded inner lamella observed on the postero-ventral border of the female valve. The elongated sub-triangular and rectangular valves of this group are described from the Miocene and Quaternary deposits of Europe. A folded inner lamella is also observed in 11 species of Candona from the Upper Miocene of the Turiec Basin of which 8 are new – Candona fatrica nov. sp., C. tatrica nov. sp., C. lacustris nov. sp., C. palustris nov. sp., C. stagnosa nov. sp., C. laterisimilis nov. sp., C. jiriceki nov. sp. and C. incurva nov. sp. They show a higher variability of the outline, calcification of the valves and width of the zone of concrescence. The extrinsic and intrinsic aspects of this morphological diversification in the Turiec Basin are discussed

Les ostracodes d'un lac ancien et ses paléobiotopes au Miocène supérieur (le bassin de Turiec (Slovaquie))

Du fait de l'escarpement des Carpathes occidentales, des mouvements tectoniques importants au Miocène sont à l'origine des bassins intramontagneux de Slovaquie, et, en particulier du bassin de Turiec. Dans ce dernier, l'épaisseur des dépôts atteint jusqu'à 1250 m dans sa partie centrale. Sur le bord du bassin, le remplissage argileux alterne avec des sables et des graviers. Dans le nord, des calcaires et des lignites sont présents. Les dépôts livrent une riche macroflore mais aussi une faune endémique de bivalves et de gastéropodes. L'étude de coupes et forages répartis sur tout le territoire du bassin de Turiec montre la présence d'une ostracofaune très diversifiée. Au total, 85 espèces relevant de 19 genres ont été reconnues. Cinquante espèces sont nouvelles, douze sont connues de la littérature et vingt-trois restent en nomenclature ouverte. Cinq assemblages d'ostracode ont été identifiés. Le degrès de similarité obtenu à partir de l'indice de Jaccard est très faible entre ces differents assemblages. L'étude de la distribution spatiale et verticale des assemblages dans les affleurements et les forages montre l'existence de biotopes différents dans le bassin de Turiec. En effet, l'assemblage à Candona robusta-jiriceki se rencontre dans le nord du bassin, celui à C. aculeata-armata-stagnosa-nubila-simplaria dans sa partie centrale et méridionale. Les autres assemblages sont distribués uniquements sur les bords du bassin. L'assemblage à C. clivosa se rencontre sur le bord nord-est, ceux à C. eminens-laterisimilis et à Cypria lenticulata et à Herpetocypris denticulata sur le bord occidental. Les travaux réalisés sur les forages montrent que tous ces assemblages sont contemporains. Ils se seraient mis au Miocène supèrieur. Des différences morphologiques importantes sont enregistrées chez les espèces de la sous-famille Candoninae, la plus représentée dans le bassin. Des espèces à valves trapézoïdales, triangualires et rectangulaires à bord postéro-ventral pointu se rencontrent surtout dan l'assemblage à Candona aculeata-armata-stagnosa-nubila-simplaria et dans l'assemblage à C. eminens-latersimilis. Des espèces de la région holarctique et paléarctique sont observées dans l'assemblage à C. clivosa et à C. jireceki-robusta. La présence de biotopes differents dans le bassin influe la distribution des Candoninae dont les différentes espèces présentent des différences morpholiogiques en relation avec les conditions environnementales. Le milieux marécageux, avec des faibles courants, est indiqué dans la partie septentrionale du bassin. Il se situe dans la zone littorale à sublittorale. Des étangs temporaires et des rivières sont indiqués vers l'intérieur des terres. La partie centrale et meridionale livre des formes de Candoninae habitant des milieux stables qui correspondent à une zone sublittorale à profonde. La présence d'espèces psychosphèriques témoigne de l'existence de sources froide et de grottes à proximité du bassin de Turiec. Un milieu à faible salinité a pu exister au début du Miocène supérieur après que la connexion du bassin avec la Paratéthys Centrale ait été établie. Ensuite, l'isolement du bassin a conduit à des conditions dulçaquicoles. La comparaison de l'ostracofaune du bassin de Turiec avec les autres bassins d'eau douce et saumâtre du Miocène d'Europe indique l'existence d'une faune endémique. Les caractères biologiques et physiques reconnus attribuent ce bassins aux lacs anciens.LYON1-BU.Sciences (692662101) / SudocSudocFranceF

Géologie 1983 (rapport annuel)

Ballesio Roland, Bodergat Anne-Marie, Alméras Yves. Géologie 1983 (rapport annuel). In: Documents des Laboratoires de Géologie, Lyon, n°91, 1983. Géologie 1983 (rapport annuel) pp. 3-133

Candoninae trapézoïdales (Crustacea, Ostracoda) du Bassin de Turiec(Slovaquie) du Miocène supérieur : systématique, écologie et évolution

Deux groupes de Candoninae trapézoïdales—groupe de Candona sitari et groupe de C. aculeata—du Bassin de Turiec en Slovaquie montrent des particularités qui contrastent fortement avec celles des Candoninae actuelles de l'Europe centrale. Ces particularités concernent la calcification, la zone de fusion, le recouvrement et la présence de protubérances, du dorsum et de tubercules sur les valves. Dans le groupe de Candona sitari, ces caractères évoluent simultanément avec l'évolution rapide du contour de subtrapézoïdal à trapézoïdal. Les espèces de ce groupe acquièrent un contour semblable a` celui des Candoninae trapézoïdales du lac Pannon et à celui de la faune actuelle des lacs à longue durée. Les Candoninae trapeézoïdales du Bassin de Turiec sont associées à des Candoninae triangulaires et rectangulaires au bord postéroventral pointu, ce qui suggère un milieu stable à fluctuations environnementales faibles. Elles sont rares dans les faciès littoraux situés au nord et sur les bords du Bassin de Turiec mais très nombreuses au centre et au sud. Il est plausible qu'elles aient vécu dans le milieu profond et que leur évolution ait été favorisée par la reproduction sexuée et la vie benthique. Les deux groupes comportent 18 espèces dont 15 sont nouvelles. Ces dernières sont décrites dans cet article