Interactions between (4Z)-hex-4-en-1-ol and 2-methylbutyl 2-methylbutanoate with olfactory receptors using computational methods

The first step in the perception of an odor is the activation of one or more olfactory receptors (ORs) following binding of the odorant molecule to the OR. The compounds (4Z)-hex-4-en-1-ol and 2-methylbutyl 2-methylbutanoate are two important odorants molecules known as food flavor. In this research, we investigate the potential targets for this two molecules and try to interpret the type of binding with different ORs models and their relationship with the retention/release property. We used the SWISS-MODEL modelling server to predict the three-dimensional (3D) structure of the ORs. We then used the Autodock vina and Autodock tools to predict the binding site and binding energy for the ligands to these receptors. The results indicate that the molecule (4Z)-hex-4-en-1-ol has given more hydrogen bonds with the majority of these receptors and the 2-methylbutyl 2-methylbutanoate molecule mainly has given Pi bonds interaction type

Méthodologie générale d’une étude ACP : Généralités, concepts et exemples

Le développement des modèles statistiques des relations quantitatives structure-activité/propriété joue un rôle important dans la conception de nouveaux produits chimiques spécialement pharmaceutiques. La prédiction des propriétés biologiques des produits non testées passe d’abord par une analyse ACP. Il s’agit de l’analyse en composante principale : c’est une méthode basée sur des statistiques descriptives multidimensionnelles permettant de traiter simultanément un nombre quelconque de variables quantitatives. L’objectif est de visualiser et résumer l’information contenue dans les différentes données afin d’avoir une représentation permettant plus facilement l’interprétation. Dans ce papier, nous décrivons des généralités et les principaux concepts et techniques les plus pertinents pour la réalisation d’une étude ACP