9 research outputs found
TabAttention: Learning Attention Conditionally on Tabular Data
Medical data analysis often combines both imaging and tabular data processing
using machine learning algorithms. While previous studies have investigated the
impact of attention mechanisms on deep learning models, few have explored
integrating attention modules and tabular data. In this paper, we introduce
TabAttention, a novel module that enhances the performance of Convolutional
Neural Networks (CNNs) with an attention mechanism that is trained
conditionally on tabular data. Specifically, we extend the Convolutional Block
Attention Module to 3D by adding a Temporal Attention Module that uses
multi-head self-attention to learn attention maps. Furthermore, we enhance all
attention modules by integrating tabular data embeddings. Our approach is
demonstrated on the fetal birth weight (FBW) estimation task, using 92 fetal
abdominal ultrasound video scans and fetal biometry measurements. Our results
indicate that TabAttention outperforms clinicians and existing methods that
rely on tabular and/or imaging data for FBW prediction. This novel approach has
the potential to improve computer-aided diagnosis in various clinical workflows
where imaging and tabular data are combined. We provide a source code for
integrating TabAttention in CNNs at
https://github.com/SanoScience/Tab-Attention.Comment: Accepted for the 26th International Conference on Medical Image
Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI) 202
Interwencyjne zabiegi kardiologiczne u płodów – czy jesteśmy do nich przygotowani?
Objective: The aim of the study was to analyze types and methods of intrauterine fetal cardiac interventions
performed between June 2011 and December 2013, and to assess the perinatal management of the neonates.
Methods: The program was developed after analysis of the available literature, practical individual training in Linz,
Austria, and simulation of the procedure in a dissecting-room. The rules for anesthesia in pregnant women and their
fetuses were developed. The interventions were performed in fetuses with critical cardiac defects, in the operating
room, under ultrasonographic control. The protocol was approved by the Local Bioethics Committee at the Centre
of Postgraduate Medical Education.
Material: We included fetuses with critical aortic stenosis (n=29), critical pulmonary stenosis (n=2), and closed or
extremely restricted foramen ovale (n=7). Between June 2011 and December 2013, the team comprised of JD,
MD and AK conducted 42 interventions in 35 fetuses, including 32 balloon aortic valvuloplasties (in 29 fetuses), 2
pulmonary valvuloplasties, 4 balloon atrial septostomies and 4 atrial septal stent placement. Three fetuses required
both, aortic valvuloplasty and fenestration of the atrial septum.
Results: Out of the 42 procedures, 41 (97%) were technically successful. We recorded 3 cases of fetal demise
associated with the intervention. We modulated the protocol of anesthesia given to pregnant women, switching
from general to local anesthesia with intravenous sedation. We always provided additional fetal anesthesia with
fentanyl and atracurium via the umbilical vein.
Conclusions: Based on our 2.5-year experience, it seems safe to conclude that all types of fetal cardiac interventions
may be successfully conducted at Polish centers. The procedures are safe for the pregnant women and
improve fetal status. Most of the neonates treatedCel pracy: Analiza rodzajów i sposobu wykonania wewnątrzmacicznych zabiegów kardiologicznych u płodów
oraz postępowania w okresie okołoporodowym między czerwcem 2011 i grudniem 2013 roku.
Metodyka: Program interwencji kardiologicznych u płodów zaplanowano po przeanalizowaniu dostępnego
piśmiennictwa, odbyciu indywidualnego szkolenia praktycznego w Linz w Austrii oraz po przeprowadzeniu symulacji
zabiegów w prosektorium. Opracowane zostały zasady znieczulenia pacjentek i płodów. Zabiegi wykonywano
w wybranych grupach płodów z krytycznymi wadami serca, w warunkach bloku operacyjnego, pod kontrolą
ultrasonograficzną. Uzyskano zgodę komisji bioetycznej CMKP.
Materiał: Do zabiegów kwalifikowano płody z krytycznym zwężeniem zastawki aortalnej (29), krytycznym zwężeniem
zastawki płucnej (2) oraz z zamkniętym lub skrajnie restrykcyjnym otworem owalnym (7). W okresie od
czerwca 2011 do grudnia 2013 roku zespół w składzie: JD, MD, AK przeprowadził 42 zabiegi u 35 płodów, w tym:
32 balonowe plastyki zastawki aortalnej (u 29 płodów), 2 plastyki zastawki płucnej, 4 atrioseptostomie balonowe
i 4 założenia stentów do przegrody międzyprzedsionowej. U trzech płodów konieczne było poszerzenie zastawki
aortalnej i wytworzenie połączenia na poziomie przegrody międzyprzedsionkowej.
Wyniki: Wykonano 41 z 42 zaplanowanych zabiegów (97%). W 3 przypadkach doszło do zgonu płodu związanego
z zabiegiem. Zmodyfikowano sposób znieczulenia ciężarnych z ogólnego na miejscowe z dożylną sedacją.
Zawsze dodatkowo znieczulano i unieruchamiano płód podaniem fentantylu i atracurium do żyły pępowinowej.
Wnioski: Na podstawie 2,5 letnich doświadczeń uważamy, że wszystkie rodzaje prenatalnych interwencji kardiologicznych
mogą być skutecznie przeprowadzane w Polsce. Są one bezpieczne dla matek i poprawiają stan płodu.
Większość noworodków leczonych prenatalnie została przekazana w dobrym stanie do referencyjnego ośrodka
kardiologii i kardiochirurgii dziecięcej
Fetal Cardiac Interventions—Are They Safe for the Mothers?
The aim of fetal cardiac interventions (FCI), as other prenatal therapeutic procedures, is to bring benefit to the fetus. However, the safety of the mother is of utmost importance. The objective of our study was to evaluate the impact of FCI on maternal condition, course of pregnancy, and delivery. 113 mothers underwent intrauterine treatment of their fetuses with critical heart defects. 128 percutaneous ultrasound-guided FCI were performed and analyzed. The patients were divided into four groups according to the type of FCI: balloon aortic valvuloplasty (fBAV), balloon pulmonary valvuloplasty (fBPV), interatrial stent placement (IAS), and balloon atrioseptoplasty (BAS). Various factors: maternal parameters, perioperative data, and pregnancy complications, were analyzed. There was only one major complication—procedure-related placental abruption (without need for blood products transfusion). There were no cases of: procedure-related preterm prelabor rupture of membranes (pPROM), chorioamnionitis, wound infection, and anesthesia associated complications. Tocolysis was only necessary only in two cases, and it was effective in both. None of the patients required intensive care unit admission. The procedure was effective in treating polyhydramnios associated with fetal heart failure in six out of nine cases. Deliveries occurred at term in 89%, 54% were vaginal. The results showed that FCI had a negligible impact on a further course of pregnancy and delivery
Wyrok ważny dla każdego lekarza
W artykule wskazano, że orzecznictwo sądowe istotnie wpływa na wykonywanie zawodu lekarza o specjalnościginekologia i położnictwo. W prezentowanym orzeczeniu wskazano kilka kwestii, które każdy ginekolog-położnikpowinien wziąć pod uwagę. Przede wszystkim wyeksponowano dwa wątki: funkcjonowania w Polsce różnych standardówzawodowych, które w razie sporu sądowego mają kluczowe znaczenie, oraz przesłanek, którymi powinienkierować się lekarz, rozważając decyzję o sposobie ukończenia porodu
Interwencje kardiologiczne u płodów ― state of the art
Interwencje kardiologiczne u płodów są dynamicznie rozwijającą się dziedziną terapii prenatalnej. Wykonuje się je w coraz większej liczbie ośrodków na świecie. Celem zabiegów jest zmiana naturalnego przebiegu choroby płodu i zwiększenie szansy na skuteczniejsze leczenie dziecka po porodzie. Obecnie na świecie wykonuje się cztery rodzaje kardiologicznych zabiegów interwencyjnych u płodów: 1) balonową plastykę zastawki aortalnej; 2) balonową plastykę zastawki płucnej; 3) implantację stentu do przegrody międzyprzedsionkowej oraz 4) balonową plastykę przegrody międzyprzedsionkowej. Do zabiegów kwalifikuje się najcięższe rodzaje wad, w których z dużym prawdopodobieństwem dojdzie do znacznego uszkodzenia komory i/lub powstania serca jednokomorowego w przypadku stenoz i/lub rozwoju nadciśnienia płucnego w przypadku restrykcji otworu owalnego. Interwencji prenatalnych nie wykonuje się w przypadku łagodnych postaci wad, w których odroczenie leczenia do okresu postnatalnego nie będzie miało negatywnego wpływu na rokowanie dla dziecka. Kryteria kwalifikacji do prenatalnych interwencji kardiologicznych są nieustannie ewaluowane i podlegają ciągłej modyfikacji w ramach międzynarodowych baz danych i programów prospektywnych i retrospektywnych. Skuteczność techniczna balonowych plastyk aortalnych wynosi 78–94%, balonowych plastyk płucnych 63–80%, a zabiegów w obrębie przegrody międzyprzedsionkowej 65–90%. Odsetek zgonów wewnątrzmacicznych związanych z kardiologicznymi zabiegami interwencyjnymi u płodów w najbardziej doświadczonych ośrodkach to około 10–11%. W większości przypadków przeprowadzone prenatalnie zabiegi nie mają negatywnego wpływu na dalszy przebieg ciąży i poród. Nie stanowią również wskazania do cięcia cesarskiego ani do wcześniejszego zakończenia ciąży. Odsetek serc dwukomorowych po technicznie skutecznych interwencjach w wiodących ośrodkach wynosi obecnie około 45–66% w przypadku balonowej plastyki zastawki aortalnej i 71–87% w przypadku balonowej plastyki zastawki płucnej. Zabiegi w obrębie przegrody międzyprzedsionkowej wydają się poprawiać przeżywalność dzieci, jednak dane te są trudne do jednoznacznej interpretacji, gdyż rokowanie zależy nie tylko od obecności zmian w krążeniu płucnym, ale również od rodzaju wady serca i możliwości jej leczenia po porodzie.
W niektórych przypadkach wad serca możliwe jest przeprowadzenie terapii prenatalnej, która ma na celu zahamowanie progresji wady, a tym samym zwiększenie szans na przeżycie noworodka i skuteczne leczenie po porodzie. Warunkiem powodzenia terapii jest wczesne wykrycie wady, odpowiednia kwalifikacja pacjentów i współpraca między zespołem odpowiedzialnym za leczenie prenatalne a specjalistami zajmującymi się dzieckiem po urodzeniu
sFlt-1/PlGF Ratio Is Not a Good Predictor of Severe COVID-19 nor of Adverse Outcome in Pregnant Women with SARS-CoV-2 Infection—A Case-Control Study
Background: Elevated serum levels of sFlt-1 were found in non-pregnant severe COVID-19 patients. The aim was to investigate sFlt-1/PlGF ratio as a predictor of severe disease and adverse outcome in pregnant women with COVID-19. Methods: A single-center case-control study was conducted in pregnant women with SARS-CoV-2 infection. SARS-CoV-2-negative pregnant women served as controls. Serum sFlt-1/PlGF ratio was assessed. The primary outcome was severe COVID-19 and the secondary outcome comprised adverse outcomes including severe COVID-19, intensive care unit admission, maternal multiple organ failure, preterm delivery, fetal demise, preeclampsia or hypertension diagnosed after COVID-19, maternal death. Results: 138 women with SARS-CoV-2 infection and 140 controls were included. sFlt-1/PlGF ratio was higher in infected patients (11.2 vs. 24; p < 0.01) and in women with severe disease (50.8 vs. 16.2; p < 0.01). However, it was similar in women with adverse and non-adverse outcome (29.8 vs. 20; p = 0.2). The AUC of sFlt-1/PlGF ratio was 0.66 (95% CI 0.56–0.76) for the prediction of severe COVID-19, and 0.72 (95% CI 0.63–0.79) for the prediction of adverse outcome. Conclusions: sFlt-1 and sFlt-1/PlGF ratio are related to SARS-CoV-2 infection and the severity of COVID-19 during pregnancy. However, sFlt-1/PlGF ratio is not a good predictor of severe COVID-19 or adverse outcome
Fetal Cardiac Interventions—Are They Safe for the Mothers?
The aim of fetal cardiac interventions (FCI), as other prenatal therapeutic procedures, is to bring benefit to the fetus. However, the safety of the mother is of utmost importance. The objective of our study was to evaluate the impact of FCI on maternal condition, course of pregnancy, and delivery. 113 mothers underwent intrauterine treatment of their fetuses with critical heart defects. 128 percutaneous ultrasound-guided FCI were performed and analyzed. The patients were divided into four groups according to the type of FCI: balloon aortic valvuloplasty (fBAV), balloon pulmonary valvuloplasty (fBPV), interatrial stent placement (IAS), and balloon atrioseptoplasty (BAS). Various factors: maternal parameters, perioperative data, and pregnancy complications, were analyzed. There was only one major complication—procedure-related placental abruption (without need for blood products transfusion). There were no cases of: procedure-related preterm prelabor rupture of membranes (pPROM), chorioamnionitis, wound infection, and anesthesia associated complications. Tocolysis was only necessary only in two cases, and it was effective in both. None of the patients required intensive care unit admission. The procedure was effective in treating polyhydramnios associated with fetal heart failure in six out of nine cases. Deliveries occurred at term in 89%, 54% were vaginal. The results showed that FCI had a negligible impact on a further course of pregnancy and delivery
Fetal Cardiac Interventions—Polish Experience from “Zero” to the Third World Largest Program
This article presents the technical aspects of the Polish fetal cardiac interventions (FCI) program, including preparation of the team and modifications in the technique of the procedure that aim to increase its safety for the mother and the fetus. Over 9 years, 128 FCI in 113 fetuses have been performed: 94 balloon aortic valvuloplasties (fBAV), 14 balloon atrioseptoplasties (fBAS) with stent (BAS+), 5 balloon atrioseptoplasties without stent placement (BAS−), and 15 fetal pulmonary valvuloplasties (fBPS). The technical success rate ranged from 80% (BAS−) to 89% (fBAV), while the procedure-related death rate (defined as death within 72 hours following the procedure) ranged from 7% (fBAV and fBPV) to 20% (BAS). There were 98 live births after all FCI (3 pregnancies continue). Median gestational age at delivery was 39 weeks in our center and 38 weeks in other centers
Emergency cerclage using double-level versus single-level suture in the management of cervical insufficiency (Cervical Occlusion double-level Stitch Application, COSA): study protocol for a multicentre, non-blinded, randomised controlled trial
Introduction Cervical insufficiency accounts for 15% of recurrent pregnancy losses between 16 and 28 weeks of gestation. The aim of the study is to verify the effectiveness of emergency double-level cerclage with vaginal progesterone in cervical insufficiency treatment in terms of the prevention of preterm delivery before 34 weeks of gestation.Methods and analysis This trial is a multicentre, non-blinded, randomised study with 1:1 allocation ratio. The study is conducted at tertiary perinatal care departments in Poland. It will include patients with cervical insufficiency with the fetal membranes visible in the open cervical canal or protruding into the vagina between 16+0 and 23+6 weeks of pregnancy. They will be randomised into two arms: emergency single-level cerclage with vaginal progesterone or double-level cerclage with vaginal progesterone. All will be administered antibiotics and indomethacin. The primary outcome is the rate of deliveries below 34+0 weeks of gestation, while secondary outcomes include gestational age at delivery, neonatal outcomes, maternal outcomes according to the Core Outcome Set for Evaluation of Interventions to Prevent Preterm Birth and cerclage procedure complications. The planned number of participants according to the power analysis is 78.Ethics and dissemination The study protocol was written in accordance with the Standard Protocol Items: Recommendations for Interventional Trials statement. It was created according to the requirements of the Declaration of Helsinki for Medical Research involving Human Subject. Ethical approval was obtained from the Ethics Committee of the Centre of Postgraduate Medical Education (no. 1/2022). The study protocol was approved and published by ClinicalTrials.gov (posted on 24 February 2022). All participants gave a written informed consent. After completion of the study its results will be published in a peer-reviewed English language journal.Trial registration NCT05268640