Aplicação de tecnologias genômicas baseadas em marcadores microssatélites para discriminação de cultivares e análise de pureza genética em feijoeiro comum.

A Embrapa Arroz e Feijão está atuando na condução de ações de pesquisa voltadas para o desenvolvimento e implementação de práticas de genotipagem molecular que possibilitem consolidar estratégias mais eficientes de proteção de cultivares e seus derivados. Novos sistemas de genotipagem utilizando análise multiplex e detecção semi-automatizada encontram-se em fase avançada de desenvolvimento, integrando locos microssatélites com elevado conteúdo informativo e poder de discriminação.bitstream/CNPAF/26008/1/comt_132.pd

Utilização de marcadores moleculares em programas de ampliação da base genética de espécies cultivadas.

Introdução; Utilização de germoplasma em programas de melhoramento genético; Determinação da variabilidade genética em acessos do banco de germoplasma; Cruzamentos amplos; Marcadores moleculares no melhoramento de plantas; Obtenção de mapas moleculares; Mapeamento de QTLs; Análise de AB-QTLs; Seleção assistida por marcadores; Considerações finais.bitstream/CNPAF/21787/1/doc_155.pd

Construção de mapa genético e análise comparativa entre cruzamentos interespecíficos de Oryza glumaepatula x Oryza sativa utilizando marcadores microssatélites.

Este trabalho objetivou: 1) desenvolver um mapa genético baseado em marcadores SSR para o cruzamento interespecífico Oryza sativa (Cica 8) x Oryza glumaepatula (RS-16); 2) avaliar a conservação da ligação e ordem dos locos SSR entre dois mapas interespecíficos, os quais possuem o parental RS-16 em comum; 3) genotipar 118 famílias na geração RC2F1 obtida a partir do cruzamento interespecífico entre Oryza sativa (Cica 8) e Oryza glumaepatula (RS-16)

Busca por sequências gênicas expressas relacionadas a características de interesse agronômico em arroz.

Este trabalho teve como objetivos: 1) Fazer uma busca por ESTs com funções relacionadas à produção e qualidade de grãos nos diversos bancos de dados de sequências genômicas expressas que contenham informações sobre gramíneas e outras espécies vegetais; 2) Desenhar pares de primers para a amplificação de regiões correspondentes aos genes de interesse identificados nos bancos de dados para posterior construção de um mapa genético transcricional para o arroz

Determination of genetic variability of traditional varieties of Brazilian rice using microsatellite markers.

The rice (Oryza sativa) breeding program of the Rice and Bean research center of the Brazilian agricultural company Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) is well established and provides new cultivars every year to attend the demand for improved high yielding varieties with tolerance to biotic and abiotic stresses. However, the elite genitors used to compose new populations for selection are closely related, contributing to the yield plateau reached in the last 20 years. To overcome this limit, it is necessary to broaden the genetic basis of the cultivars using diverse germplasm such as wild relatives or traditional varieties, with the latter being more practical because they are more easily crossed with elite germplasm to accelerate the recovery of modern plant types in the breeding lines. The objective of our study was to characterize the allelic diversity of 192 traditional varieties of Brazilian rice using 12 simple sequence repeat (SSR or microsatellite) markers. The germplasm was divided into 39 groups by common name similarity. A total of 176 alleles were detected, 30 of which (from 23 accessions) were exclusive. The number of alleles per marker ranged from 6 to 22, with an average of 14.6 alleles per locus. We identified 16 accessions as a mixture of pure lines or heterozygous plants. Dendrogram analysis identified six clusters of identical accessions with different common names and just one cluster with identical accessions with the same common name, indicating that SSR markers are fundamental to determining the genetic relationship between landraces. A subset of 24 landraces, representatives of the 13 similarity groups plus the 11 accessions not grouped, was the most variable set of genotypes analyzed. These accessions can be used as genitors to increase the genetic variability available to rice breeding programs

Selection of rice genotypes with greater seedling vigor under controlled conditions.

This study aimed to identify allele sources for seedling vigour in 65 rice genotypes, using the slantboard test in a germination chamber, and to determine the best parameter for evaluating seedling vigour. The experiment was arranged in the randomized block design with three replicate blocks. Root and primary leaf length data were collected from seedlings grown in the dark at 18 degrees C, 15 days after sowing and at 25 degrees C, ten days after sowing. The best performing genotypes for seedling vigour were included in Group 2, which contained red rice accessions. The vigour was best evaluated under controlled conditions (grown at 18 degrees C, 15 days after sowing) through measurements of roots and primary leaves.

Development of rice lines with gene introgression from the wild Oryza glumaepatula by the AB-QTL methodology.

Wild rice of the species Oryza glumaepatula is found Brazil and has been used to broaden the genetic basis of irrigated rice populations in Embrapa breeding programmes. The objective of this study was to demonstrate and discuss approaches used in the development of Oryza sativa lines containing genes transferred from Oryza glumaepatula, resulting in introgression lines with a broader genetic basis and high yield. First of all, genes were transferred from the wild species to cultivated rice by the AB-QTL methodology. Eighteen families were selected using QTL analysis and agronomical performance data. After the heterosis test, the families CNAi 9020 and CNAi 9024 were selected and submitted to microsatellite marker-assisted selection. Thirty-five lines were then selected with high plant vigour, high tiller and panicle number per plant, high grain yield of the main crop, and a strong regrowth capacity which makes the use of ratoons a feasible alternative

Caracterização molecular de linhagens de introgressão do cruzamento interespecífico Oryza sativa x O. glumaepatula por marcadores SSR fluorescentes.

Este trabalho teve como objetivo realizar a caracterização molecular de 114 linhagens de Introgressão RC2F9 derivadas do cruzamento O. sativa Cica-8 x O. glumaepatula RS-16

Desenvolvimento e avaliação de marcadores SNPs de genes relacionados a proteínas de reserva de arroz.

O objetivo deste trabalho foi o de identificar associação entre polimorfismos do tipo SNP com o teor de proteína total em acessos de arroz