Cruzamentos em dialelo de genótipos de arroz irrigado de base genética ampla.

Este trabalho visa dar continuidade aos estudos conduzidos com a Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa (CNAE). O ensaio foi um dialelo, envolvendo dezesseis genitores, que compõem uma Mine amostra da CNAE. Buscou-se a distância genética entre os genitores e a correlação com a heterose obtida nas variáveis medidas nos híbridos. Além da busca de combinações promissoras para o programa de melhoramento, visou-se também o entendimento do comportamento de cruzamentos de genótipos de base genética ampla. Procurou-se também encontrar combinações que sirva para estudos, nas diversas áreas acopladas ao melhoramento

Seleção de acessos de feijoeiro comum para a composição da coleção nuclear da Embrapa Arroz e Feijão através de técnicas moleculares.

O trabalho realizado permitiu caracterizar genotipicamente dois grupos de acessos de feijoeiro comum do banco ativo de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão: um grupo proveniente de coletas realizadas no Brasil e um grupo de materiais introduzidos de outros países

Bayesian factorial design as a tool in the identification of rice blast resistance sources.

Rice germplasm banks have many promising sources of resistance to pathogens. However, identification of resistant genotypes is often arduous, notably when the host-pathogen relationship is complex as in rice blast. In addition, selection of representative Magnaporthe oryzae isolates to adequately identify sources of broad-spectrum resistance is challenging. To overcome these obstacles, data from pathogenicity assays were analyzed as a factorial design, where the pairwise combination comprised rice genotypes and blast isolates. Using this methodology, we aimed to access information about host resistance

Caracterização molecular de linhagens de arroz componentes do ensaio de vcu do ano 2010/2011.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética de linhagens e cultivares de arroz componentes do ensaio de VCU de terras altas do ano agrícola 2010/2011, pertencentes do programa de melhoramento da Embrapa Arroz e Feijão

Polimorfismo de marcadores SNPs e SSRs em plataformas automatizadas de genotipagem para o arroz.

Este trabalho teve como objetivo avaliar e comparar o polimorfismo de um conjunto de marcadores microssátelites (SSRs) e SNPs desenvolvidos para o arroz visando o mapeamento de QTLs relacionados ao déficit hídrico

Estrutura genética espacial intrapopulacional em Annona crassiflora Mart. (Annonaceae).

O objetivo desse estudo foi estimar o nível de diversidade genética e a estrutura genética espacial dentro de uma população de A. crassiflora.Conpeex 2010

Análise univariada de modelos lineares mistos para população de mapeamento de QTL em arroz.

O experimento para avaliação da progênie segregante de 224 famílias (F2:4) foi conduzido no delineamento de blocos aumentados de Federer com três repetições e quatro testemunhas para dois ambientes (déficit hídrico e condições normais de irrigação). O ensaio foi analisado por meio de análise univariada de modelos lineares mistos através do software R

Análise de diversidade genética em acessos de variedades asiáticas de arroz (Oryza sativa L.) do banco ativo de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão.

O objetivo deste trabalho foi o de caracterizar acessos asiáticos de arroz do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão para o aperfeiçoamento da CNAE (Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa)

Determination of genetic variability of traditional varieties of Brazilian rice using microsatellite markers.

The rice (Oryza sativa) breeding program of the Rice and Bean research center of the Brazilian agricultural company Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) is well established and provides new cultivars every year to attend the demand for improved high yielding varieties with tolerance to biotic and abiotic stresses. However, the elite genitors used to compose new populations for selection are closely related, contributing to the yield plateau reached in the last 20 years. To overcome this limit, it is necessary to broaden the genetic basis of the cultivars using diverse germplasm such as wild relatives or traditional varieties, with the latter being more practical because they are more easily crossed with elite germplasm to accelerate the recovery of modern plant types in the breeding lines. The objective of our study was to characterize the allelic diversity of 192 traditional varieties of Brazilian rice using 12 simple sequence repeat (SSR or microsatellite) markers. The germplasm was divided into 39 groups by common name similarity. A total of 176 alleles were detected, 30 of which (from 23 accessions) were exclusive. The number of alleles per marker ranged from 6 to 22, with an average of 14.6 alleles per locus. We identified 16 accessions as a mixture of pure lines or heterozygous plants. Dendrogram analysis identified six clusters of identical accessions with different common names and just one cluster with identical accessions with the same common name, indicating that SSR markers are fundamental to determining the genetic relationship between landraces. A subset of 24 landraces, representatives of the 13 similarity groups plus the 11 accessions not grouped, was the most variable set of genotypes analyzed. These accessions can be used as genitors to increase the genetic variability available to rice breeding programs

Evaluation of the number and information content of fluorescent-labeled SSR markers for rice germplasm characterization.

The use of fluorescent-labelled simple sequence repeat (SSR) markers allows the simultaneous analysis of diverse loci in multiplex series, providing an enhanced precision of the determination of the allele size when a large number of genotypes is used. Twenty-five fluorescent-labelled SSR markers were used to genotype 242 accessions of the Brazilian Rice Core Collection. Based on the Polymorphism Information Content (PIC) values of each marker, groups with 5, 10, 15 and 20 markers were formed. The average PIC values varied from 0.67 to 0.89 and the number of alleles sampled per group, from 70 to 377. In the case of rice, which has a narrow genetic base, the conclusion was drawn that it is of fundamental importance that the genotypes must be evaluated by the highest possible number of regularly spaced SSR markers in the genome, and that these, preferentially, should offer a high information content