Next-generation sequencing for diagnosis of thoracic aortic aneurysms and dissections: diagnostic yield, novel mutations and genotype phenotype correlations

Additional file 1. Complementary data on primer sequences, SKI amplification and survival analyses

Użytkowość mleczna a ocena typu i budowy oraz kondycji krów pierwiastek

The research was carried out on the grounds of milk performance as well as the traits related to condition, type, and build of first-calf cows from the Kujawsko-Pomorskie province. The research covered the body condition scores of 333 cows as well as build and conformation scores of 645 animals. A group of 135 cows was distinguished from the analyzed cows which met the following criteria: first-calf cows, their first calving took place in 2007, all the animals in their first lactation were scored in the area of their type and build as well as the condition up to the hundredth day of lactation. The highest productivity of milk and its components was found in cows with the highest type and build scores. A negative relation between body condition scoring and first-calf cow milk performance results as well as cow type and build scoring was found. High and positive correlations between build general scoring and partial scoring pertaining to conformation were found.Badania przeprowadzono na podstawie użytkowości mlecznej oraz cech związanych z typem i budową 645 krów pierwiastek z województwa kujawsko- -pomorskiego. Pod uwagę wzięto również wyniki oceny 333 krów. Wyodrębniono grupę 135 krów pierwiastek, których data pierwszego wycielenia przypadała na 2007 r. Najwyższą wydajnością mleka i jego składników cechowały się krowy z najwyższymi ocenami typu i budowy. Stwierdzono istnienie ujemnej zależności między oceną kondycji a wynikami użytkowości mlecznej pierwiastek, a także wysokie, dodatnie korelacje między ogólną oceną za budowę oraz ocenami za pokrój

Dobowy rozkład dojów krów w gospodarstwie wyposażonym w automatyczny system doju

The material of the study consisted of 140 cows of PHF breed, reared in the farm equipped with the automatic milking system (AMS). Cows in different lactations (from 1 to 5) were reared in the period from May 2011 to April 2013. The daily distribution of milkings (12, two-hours periods) was analyzed according to: cows’ age (primiparous and multiparous), the average milk production per milking during the whole lactation (<12.5 kg, ≥12.5 kg) and season (spring, summer, autumn, winter). The statistical analysis was conducted with the use of the χ2 independence test. It was noted that the daily distribution of milkings was statistically conditioned by all analyzed factors. The first peak of the increased milking frequency was obtained during midday hours and the next one during late night hours, i.e. during hours that are generally different from the typical milking hours in farms that do not use AMS. The lowest milking frequency was recorded during milking hours typical for farms that do not use the AMS.Badaniami objęto grupę 140 krów będących w laktacjach od 1 do 5, rasy PHF, utrzymywanych w gospodarstwie wyposażonym w automatyczny system doju. Dobowy rozkład dojów (12 dwugodzinnych okresów) analizowano w zależności od: wieku zwierząt (pierwiastki i wieloródki), przeciętnej ilości oddawanego mleka w doju w czasie całej laktacji (<12,5 kg, ≥12,5 kg) i pory roku (wiosna, lato, jesień, zima). Statystyczną analizę danych przeprowadzono za pomocą testu niezależności X2. Stwierdzono, że dobowy rozkład dojów warunkowany był statystycznie wpływem wszystkich analizowanych czynników. Pierwszy szczyt wzmożonej częstotliwości oddawania mleka przypadał na godziny południowe, zaś kolejny na późnowieczorne, tj. na godziny na ogół odmienne od typowych godziny doju w gospodarstwach niekorzystających z automatycznego systemu doju. Najmniejszą aktywność krów w zakresie częstotliwości doju rejestrowano w typowych godzinach doju gospodarstw, które nie korzystają z automatycznego systemu doju

Quarter milking in primiparous and multiparous cows

Krowy w pierwszej laktacji charakteryzują się najczęściej niższymi parametrami doju w stosunku do krów wieloródek. Celem przeprowadzonych badań było określenie zmian w parametrach doju krów pierwiastek i wieloródek w ćwiartkowym systemie doju. Są to badania wstępne, które w dalszym etapie mają wskazać czy pierwiastki, którym dano szansę na pełne rozdojenie w automatycznym systemie doju (AMS) w pierwszej laktacji, będą charakteryzowały się lepszymi parametrami doju jako krowy wieloródki. Dane do analiz statystycznych zebrano w trzech stadach bydła mlecznego wyposażonych w AMS firmy Lely – Astronaut A4. Łącznie przeanalizowano dane pochodzące od 718 krów (531 laktacji pierwiastek i 477 laktacji wieloródek). Dane zbierano przez okres czterech lat, od 2012 roku, tj. od momentu wdrożenia AMS. Ostatecznie, po odrzuceniu wizyt w robocie zakończonych odmową, przeanalizowano 352 708 dojów pochodzących od krów pierwiastek i 488 711 od krów wieloródek. Zebrany materiał liczbowy został opracowany za pomocą wieloczynnikowej analizy wariancji, w oparciu o model liniowy uwzględniający wpływ stada, fazy laktacji, roku i sezonu doju, a także interakcji między wcześniej wymienionymi czynnikami głównymi. W wyniku przeprowadzonego postępowania statystycznego stwierdzono wysoko istotny i istotny wpływ wszystkich komponentów modelu liniowego na kontrolowane parametry doju. W początkowej fazie laktacji (do 100. dnia) czas przebywania w robocie obu porównywanych grup krów kształtował się na bardzo zbliżonym poziomie i wynosił 396-398 sekund. W tym czasie dój pierwiastek trwał średnio ok. 268 s, a wieloródek około 280 s, natomiast średni poziom wydajności mlecznej wynosił 8,38 kg dla pierwiastek i 10,40 kg dla wieloródek. W końcowej fazie laktacji (powyżej 200. dnia) czas doju pierwiastek wynosił 214 s, a wieloródek 241 s, przy wydajności odpowiednio 7,93 i 8,77 kg mleka. Zarówno pierwiastki, jak i wieloródki dłużej przebywały w robocie, a także dłużej się doiły w sezonie wiosennym i zimowym, co można łączyć z wyższą wydajnością mleka. W obu grupach krów dłużej dojone były ćwiartki tylne wymion; w grupie pierwiastek różnice między ćwiartkami tylnymi i przednimi wynosiły ok. 25 s, w grupie wieloródek ok. 40 s.Cows in their first lactation usually have lower milking parameters than multiparous cows. The purpose of this study was to determine changes in milking parameters in primiparous and multiparous cows in a quarter milking system. This is preliminary research which at a later stage will indicate whether primiparous cows milked in an automatic milking system (AMS) throughout their first lactation will have better milking parameters as multiparous cows. The data for statistical analysis was collected from three dairy herds in which Lely Astronaut A4 automatic milking systems were used. In total, data from 718 cows were analysed (531 lactations of primiparous cows and 477 of multiparous cows). The data was collected over a period of four years beginning in 2012, when the automatic milking system was implemented. After eliminating visits to the milking robot which ended in refusal, we analysed 352,708 milking sessions from primiparous cows and 488,711 from multiparous cows. Multifactorial analysis of variance of the numerical data was performed using a linear model taking into account the effect of herd, lactation stage, milking year and season, and the interaction of these factors. The statistical procedure showed that all linear model components had a highly significant or significant impact on the milking parameters considered. During initial stage of lactation the duration of the stay in the milking robot in the two groups was very similar—396-398 s. During this stage the milking time was about 268 s for the primiparous cows and 280 for the multiparous cows, and the average milk yield was 8.38 kg for the former and 10.40 kg for the latter. During the final stage of lactation (after 200 days) the milking time was 214 s in the primiparous cows and 241 in the multiparous cows, with yield of 7.93 and 8.77 kg of milk, respectively. Both primiparous and multiparous cows stayed longer in the milking robot and were milked longer in the spring and winter, which can be linked to higher milk yield. In both groups of cows it took longer to milk the rear quarters; these differences amounted to about 25 s in the primiparous group and about 40 s in the multiparous group