4 research outputs found
Relaxation mode analysis and Markov state relaxation mode analysis for chignolin in aqueous solution near a transition temperature
- Publication venue
- 'AIP Publishing'
- Publication date
- Field of study
Size-Dependent Phase Changes in Water Clusters
- Author
- Adeagbo W. A.
- Aguado A.
- Ayori Mitsutake
- Berg B. A.
- Berg B. A.
- Berry R. S.
- Breaux G. A.
- Breaux G. A.
- Bulusu S.
- Cruzan J. D.
- Ferrenberg A. M.
- Frantsuzov P. A.
- Gregory J. K.
- Han S.
- Hansmann U. H. E.
- Hock C.
- Jorgensen W. L.
- Kazachenko S.
- Kenji Yasuoka
- Keutsch F. N.
- Koga K.
- Kumar S.
- Labastie P.
- Langley S. F.
- Laria D.
- Liu K.
- Mitsutake A.
- Nakajima N.
- Nauta K.
- Nishio K.
- Pedulla J. M.
- Rodriguez J.
- Schmidt M.
- Shin S.
- Takuma Akimoto
- Tharrington A. N.
- Toshihiro Kaneko
- Tsai C. J.
- Wales D. J.
- Wales D. J.
- Wales D. J.
- Xiao Cheng Zeng
- Yoo S.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study
Relaxation mode analysis for molecular dynamics simulations of proteins
- Author
- A Amadei
- A Kitao
- A Kitao
- A Mitsutake
- A Mitsutake
- A Suenaga
- AD McLachlan
- AE Garcia
- Ayori Mitsutake
- B Brooks
- B Lindner
- C Eckart
- C Schütte
- CR Schwantes
- CR Schwantes
- D Satoh
- DA Case
- DM Zuckerman
- F Noé
- F Noé
- F Noé
- F Tama
- F Tama
- G Lamm
- G Pérez-Hernández
- H Hirao
- H Okumura
- H Risken
- H Takano
- H Wu
- Hiroshi Takano
- I Baher
- J Kottalam
- J Prinz
- J Xia
- JD Chodera
- JD Chodera
- JD Chodera
- K Hagita
- K Lindorff-Larsen
- K Lindorff-Larsen
- K Moritsugu
- M Doi
- M Kamada
- M Levitt
- MM Tirion
- N Buchete
- N Go
- N Iwaoka
- N Karasawa
- N Singhal
- O Miyashita
- OF Lange
- P Kührova
- PG Gennes de
- PL Freddolino
- R Abagyan
- R Harada
- R Zwanzig
- RM Levy
- RO Dror
- S Hayward
- S Honda
- S Koseki
- S Natori
- S Saka
- S Sakuraba
- T Ichiye
- T Komatsuzaki
- T Mori
- T Mori
- T Nagai
- TJ Lane
- WC Swope
- Y Matsunaga
- Y Naritomi
- Y Naritomi
- Y Zheng
- Publication venue
- 'Springer Science and Business Media LLC'
- Publication date
- Field of study
Theoretical Methods for the Description of the Solvent Effect in Biomolecular Systems
- Author
- Abagyan R.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham M. H.
- Abraham R. J.
- Adolf M.
- Aguilar M. A.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Alagona G.
- Aleman C.
- Aleman C.
- Alemán C.
- Alemán C.
- Alemán C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alhambra C.
- Alkorta I.
- Allen M. P.
- Allinger N. L.
- Allinson S. A.
- Amara P.
- Amos A. T.
- Amovilli C.
- Andersen H. C.
- Anderson C. F.
- Andzelm J.
- Angyan J. G.
- Angyan J. G.
- Antes I.
- Antonczak S.
- Antosiewicz J.
- Applequist J.
- Applequist J.
- Aqvist J.
- Arad D.
- Aranud R.
- Assfeld X.
- Auffinger P.
- Augspurger J. D.
- Ayori M.
- Bachs M.
- Badawi H. M.
- Bakowies D.
- Bakowies D.
- Baldwin R. L.
- Banks J. L.
- Barone V.
- Barone V.
- Barril X.
- Barron L. D.
- Barrows S. E.
- Bash P. A.
- Bash P. A.
- Bash P. A.
- Bashford
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bashford D.
- Bask S. C.
- Bayliss N. S.
- Bayliss N. S.
- Baysal C.
- Bell R. L.
- Bell R. P.
- Ben-Naim A.
- Ben-Naim A.
- Benjamin I.
- Bentzien J.
- Berendsen H. J. C.
- Berendsen H. J. C.
- Bergethon P. R.
- Berman H. M.
- Beroza P.
- Beroza P.
- Bersuker I. B.
- Besley N. A.
- Besley N. A.
- Best S. A.
- Beveridge D. L.
- Beveridge D. L.
- Binder K.
- Biswas R.
- Blaney J. M.
- Bodor N.
- Bonaccorsi R.
- Bonaccorsi R.
- Bonaccorsi R.
- Bonaccorsi R.
- Born M.
- Bowie J. U.
- Brilliantov N. V.
- Broo A.
- Brooks B. R.
- Brooks C. L.
- Bryce R. A.
- Bryce R. A.
- Bräuer M.
- Buchwold P.
- Burgi T.
- Böttcher C. J.
- Cabani S.
- Caldwell J.
- Calladine C. R.
- Calvo-Losada S.
- Cammi R.
- Cammi R.
- Cao X.
- Car R.
- Carlson H.
- Carlson H. A.
- Carrea G.
- Cartier A.
- Casari G.
- Castejon H.
- Catalan J.
- Chambers C. C.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandler D.
- Chandra A.
- Chang
- Chang T. M.
- Chang T. M.
- Cheng H. P.
- Cheng Y.-K.
- Chipot C.
- Chipot C.
- Chothia C.
- Chudinov G. E.
- Cieplak P.
- Cieplak P.
- Claverie
- Coitiño E. L.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colominas C.
- Colonna-Cesari F.
- Combined Quantum Mechanical
- Computer Simulation
- Constanciel R.
- Constanciel R.
- Contreras R.
- Convard T.
- Cornell W. D.
- Cossi M.
- Cossio F. P.
- Coulson C. A.
- Coutinho K.
- Cox C.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cramer C. J.
- Cubero E.
- Cubero E.
- Cubero E.
- Cukier R. I.
- Cummings P. J.
- Cummings P. J.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Cummins P. L.
- Curtiss L. A.
- Dagget V.
- Daggett V.
- Daleare D.
- Dang L. X.
- Dao-Pin X.
- Darden T. A.
- Dauber-Osguthorpe P.
- Daura X.
- Davis M. E.
- Davis M. E.
- Davis M. E.
- Davis M. E.
- Day P. N.
- De Bolt E.
- De Vries A. H.
- de Winter H.
- DeBolt S. E.
- den Otter W. K.
- Dewar M. J. S.
- Dickerson R. E.
- Dill K. A.
- Dillet V.
- Dillet V.
- Dimitrova Y.
- Dinner A. R.
- Diraison M.
- Dobson C. M.
- Dobson C. M.
- Doig A. J.
- Domingo L. R.
- Dominy B. N.
- Dong C. F.
- Drummond M. L.
- Drummond M. L.
- Duan Y.
- Edinger S.
- Edmonds D. T.
- Eisenberg D.
- Eksterowicz J. E.
- El-Nahas A. M.
- Elcock A. H.
- Elcock A. H.
- Essex J. W.
- Essmann U.
- Eurenius K. P.
- Fauchere J.
- Fawcet W. R.
- Ferenczy G. G.
- Fersht A. R.
- Field M.
- Field M. J.
- Fischer M.
- Fixman M.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Florian J.
- Floris F.
- Floris F.
- Floris F. M.
- Foloppe N.
- Ford G. P.
- Forés M.
- Fraczhiewicz R.
- Francl M. M.
- Frecer V.
- Freindorf M.
- Friederichs M.
- Friedman H. L.
- Fujita T.
- Fuoss R.
- Furlani T. R.
- Furuki T.
- Gallego J.
- Gao
- Gao D.
- Gao D.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Gao J.
- Ghose A. K.
- Gibson K. D.
- Giesen D. J.
- Giesen D. J.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Gilson M. K.
- Godzik
- Goldman S.
- Gong X.
- Gonzalez C.
- Goodsell D. S.
- Goodsell D. S.
- Gorb L. B.
- Gratias R.
- Greengard L.
- Gregoire F.
- Gregory J. K.
- Griffiths-Jones S. R.
- Grochowski P.
- Grote R. F.
- Grozema F. C.
- Gu J.
- Gueron M.
- Guven A.
- Halgren T. A.
- Hansch C.
- Hansch C.
- Hansch C.
- Hansen J. P.
- Hansson T.
- Harrison M. J.
- Harvey S. C.
- Hashimoto K.
- Hawkins G. D.
- Hawkins G. D.
- Hawkins G. D.
- Hawkins G. D.
- Head M. S.
- Hehre W. J.
- Heller H.
- Hendsch Z. S.
- Hermans J.
- Hernández B.
- Hernández B.
- Hingerty B.
- Hirata F.
- Hirata F.
- Hirata F.
- Ho L. L.
- Hobza P.
- Hobza P.
- Hockney R. W.
- Hodes Z. I.
- Hoffner E.
- Honig B.
- Honig B.
- Honig B.
- Hopfinger A.
- Horvath A. L.
- Hoshi H.
- Hoshi H.
- Howard A.
- Hulten J.
- Humphreys D. D.
- Huron M. J.
- Huron M. J.
- Huron M. J.
- Hutter M. C.
- Huuskonen J. J.
- Hwang J.-K.
- Hwang J.-K.
- Hwang J.-K.
- Hynes J. T.
- Hünenberger P. H.
- Hünenberger P. H.
- Ilich P.
- Ishida T.
- Ishiki H. M.
- Jackson J. D.
- Janssen R. H. C.
- Janssen R. H. C.
- Jarayam B.
- Jayaram B.
- Jayaram B.
- Jayaram B.
- Jayaram B.
- Jayaram J.
- Jean-Charles A.
- Jeffrey G. A.
- Jenson C.
- Jhon J. S.
- Jolibois F.
- Jones-Hertzog B. K.
- Jorgensen W.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Jorgensen W. L.
- Juwajima S.
- Kallies B.
- Kaminski G. A.
- Kamlet M. J.
- Kamlet M. J.
- Kang Y. K.
- Kang Y. K.
- Karplus M.
- Karplus M.
- Karplus M.
- Kawata M.
- Kawata M.
- Kawata M.
- Kikuchi O.
- Kim H.
- Kim Y.
- King G.
- King G.
- Kinoshita M.
- Kinoshita M.
- Kinoshita M.
- Kirkwood J.
- Kirkwood J. G.
- Kirkwood J. G.
- Klamt A.
- Klamt A.
- Klamt A.
- Klapper I.
- Klibanov A. M.
- Klopman G.
- Koehl P.
- Kollman P. A.
- Kollman P. A.
- Kollman P. A.
- Kollman P. A.
- Koneshan S.
- Kopka M. L.
- Kovalenko A.
- Kozaki T.
- Kozaki T.
- Kumar S.
- Kuntz I. D.
- Kuntz I. D.
- Kuntz I. D.
- Kurnikova M. G.
- Lagalante A. F.
- Lagalante A. F.
- Lamb M.
- Lapinski L.
- Lau K. F.
- Laughlan G.
- Laughton C.
- Laurence C.
- Lazaridis T.
- Lazaridis T.
- Lazaridis T.
- Lee F. S.
- Lee I.
- Lee S.
- Leo A.
- Levinthal C.
- Li A.
- Li G.
- Li J.
- Li J.
- Lias S. G.
- Lim J. H.
- Linder B.
- Liotard D. A.
- Liu H.
- Liu H.
- Liu K.
- Liu Q.
- Liu Y.-P.
- Loncharich R. J.
- Lopez X.
- Lovas F. J.
- Luo R.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luque F. J.
- Luty B. A.
- Luzhkov V.
- Luzhkov V.
- Lyne P. D.
- Ma B.
- MacKerell A. D.
- MacKerell A. D.
- Madan B.
- Madura J. D.
- Majeux N.
- Mannhold R.
- Manning G. S.
- Marcus Y.
- Marcus Y.
- Marcus Y.
- Marcus Y.
- Marrone T. J.
- Martin M. G.
- Martin M. G.
- Martin Y. C.
- MartÃnez J. M.
- MartÃnez J. M.
- Masamura M.
- Maseras F.
- Massova I.
- Masuda T.
- Matsuoka O.
- Matthew J. B.
- Mavri J.
- Maw S. A.
- McCammon J. A.
- McCammon J. A.
- McCammon J. A.
- McCammon J. A.
- Mehler E. L.
- Mendoza M. L. S.
- Meng E. C.
- Mennucci B.
- Mente S.
- Meot-Ner M.
- Mestres J.
- Metropolis N.
- Meylan W. M.
- Mezei M.
- Miertus S.
- Miertus S.
- Miertus S.
- Miertus S.
- Miller K. J.
- Mills S. G.
- Misra V. K.
- Misra V. K.
- Moliner V.
- Moliner V.
- Momany F. A.
- Monard G.
- Monard G.
- Montagnani R.
- Montagnani R.
- Morao I.
- Morris G. M.
- Morris G. M.
- Moult J.
- Muegge I.
- Muller R. P.
- Nagan M. N.
- Nakamura E.
- Nandi P. K.
- Neuman M.
- Ni X.
- Nicholls A.
- Nilsson L.
- Nora-DÃez N.
- Northrip S. H.
- Novak M.
- Novoa J. J.
- Nozaki Y.
- Nyss G. C.
- Okuno Y.
- Olivares del Valle F. J.
- Olivares del Valle F. J.
- Onsager L.
- Ooi T.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orozco M.
- Orttung W. H.
- Orttung W. H.
- Orttung W. H.
- Orttung W. H.
- Palmer K. A.
- Pang Y. P.
- Parrinello M.
- Parsons D. F.
- Paulsen M.
- Pearson R. G.
- Perakyla M.
- Perkyns J. S.
- Perkyns J. S.
- Pettitt B. M.
- Pettitt B. M.
- Phillipe
- Pickersgill R. W.
- Pierotti R. A.
- Pierotti R. A.
- Pitarch J.
- Pitarch J.
- Pomelli C. S.
- Postman J. P. M.
- Prabhu N. V.
- Pranovo H. D.
- Pratt L. R.
- Price D. J.
- Purisima E. O.
- Purisima E. O.
- Qiu D.
- Quantitative Treatments
- Rablen P. R.
- Rablen P. R.
- Rajsekaran E.
- Rak J.
- Ramstein J.
- RamÃrez F. J.
- Rees D.
- Reichardt C.
- Reichardt C.
- Reiss H.
- Rekker R. F.
- Richard J. P.
- Rick S. W.
- Rick S. W.
- Rick S. W.
- Ridder L.
- Rinaldi D.
- Rivail J. L.
- Rivail J. L.
- Rivail J. L.
- Rockwell G. D.
- Rogers N. K.
- Rogers N. K.
- Romano S.
- Ross W. S.
- Rossky P. J.
- Rubin Y. V.
- Ruelle P.
- Ruelle P.
- Ruiz-López M. F.
- Rullman J. A. C.
- Rullmann A.C.
- Rupley J. A.
- Russell S. T.
- Russell S. T.
- RÃos M. A.
- Safi B.
- Sagui C.
- Salvatella L.
- Sanchez M. L.
- Sato H.
- Sato H.
- Scarsi M.
- Schaefer M.
- Schaefer M.
- Scheraga H. A.
- Schlitter J.
- Scholes G. D.
- Schüürmann
- Schüürmann G.
- Schüürmann G.
- Scott W. R. P.
- Scrocco E.
- Scrocco E.
- Scrocco E.
- Searle M. S.
- Searle M. S.
- Shao L.
- Sharp K.
- Sherer E. C.
- Shields G.
- Shields G.
- Shire S. J.
- Simonson T.
- Simonson T.
- Sines J. J.
- Singer S. J.
- Singh U. C.
- Singh U. C.
- Sinha R.
- Sitkoff D.
- Sitkoff D.
- Skolnick
- Smith B. J.
- Smith J.
- Smith M. A.
- Smith P. E.
- Smith P. E.
- Smith P. E.
- Smith R. H.
- Soliva R.
- Soliva R.
- Solntsev K. M.
- Spackova N.
- Spackova N.
- Sponer J.
- Sponer J.
- Sponer J.
- Srinavasan J.
- Srinivasa A.
- Srinivasan J.
- Srinivasan J.
- Staib A.
- Stanton R. V.
- Stanton R. V.
- Stanton R. V.
- Stefanovich J. B.
- Stern H. A.
- Stern H. A.
- Stewart J. J. P.
- Stewart J. J. P.
- Stewart J. J. P.
- Still W. C.
- Stillinger F.H.
- Stillinger F.H.
- Stofer E.
- Stone A.
- Stone A.
- Storer J. W.
- Straatsma T. P.
- Strajbl M.
- Strnad M.
- Stuart S. J.
- Sundaralingham M.
- Suzuki Y.
- Suárez D.
- Svensson M.
- Swiss K. A.
- Takano M.
- Takasu R.
- Takeuchi Y.
- Tanford C.
- Tanford C.
- Tanford C.
- Tanford C.
- Tanford G.
- Tapia
- Tapia
- Tapia O.
- Tapia O.
- Tapia O.
- Tara S.
- Tawa G. J.
- Tember B. L.
- Ten
- Ten
- Thole B. T.
- Thompson M. A.
- Thompson M. A.
- Thompson M. A.
- Thompson W. H.
- Théry V.
- Tirado-Rives J.
- Tirado-Rives J.
- Tirado-Rives J.
- Toba S.
- Toba S.
- Tomasi
- Tomasi J.
- Tomasi J.
- Tomasi J.
- Tongraar A.
- Tongraar A.
- Topol I. A.
- Tran V.
- Trout B. L.
- Truhlar D. G.
- Truhlar D. G.
- Truong T. N.
- Truong T. N.
- Truong T. N.
- Truong T. N.
- Tsantili-Kakoulidou A.
- Tsentalovich Y. P.
- Tu Y.
- Tuckerman B. J.
- Tuñón I.
- Tuñón I.
- van Belle D.
- van Belle D.
- van der Spoolel D.
- van der Waterbeemd H.
- van Duijnen P.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W. F.
- van Gunsteren W.F.
- van Hoorn W. P.
- van Mourik T.
- Varnek A. A.
- Vasylyev V. V.
- Venkateswarlu D.
- Via J.
- Vincent M. A.
- Viswadadhan V. N.
- Voth G. A.
- Wang B.
- Wang L.
- Wang R.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warshel A.
- Warwicker J.
- Webb S. P.
- Wei D.
- Weiner S. J.
- Weiser J.
- Weiser J.
- Weiser J.
- Wesolowski T.
- Wesolowski T.
- Wesolowski T.
- Westheimer H. F. H.
- Westhof E.
- Whitlow M.
- Williams D. E.
- Wlodek S. T.
- Wolfenden R.
- Wolynes P. G.
- Yadav A.
- Yang A. S.
- Yang A. S.
- Yang A. S.
- You T. J.
- Young M. A.
- Yu H. A.
- Yu H. A.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zauhar R. J.
- Zhang Y.
- Zhanpeisov N. U.
- Zhanpeisov N. U.
- Zhanpeisov N. U.
- Zheng C.
- Zhou R.
- Zhou Y.
- Zichi D. A.
- Zienkiewicz O.C.
- Zipse H.
- Zou X.
- Zwanzig R. W.
- Ã…qvist J.
- Ã…qvist J.
- Ã…qvist J.
- Publication venue
- 'American Chemical Society (ACS)'
- Publication date
- Field of study