Projet ANCRE-DMX2 : Indicateurs biologiques et écologiques pour une gestion durable des stocks de poissons DéMersauX profonds (100–700 m) d’intérêt halieutique à La Réunion

L'usage de la ligne à main mécanisée (moulinet électrique) s'est développé à La Réunion au cours des années 2000. Ce métier s’est développé à la suite d’une campagne de prospection des ressources halieutiques profondes (200-700m), menée conjointement par le CRPMEM et l’Ifremer en 2000. L’objectif de cette campagne par pêche au moulinet électrique visait à identifier de nouvelles ressources démersales à des fins de diversification pour la petite pêche artisanale côtière professionnelle réunionnaise. Ainsi, les premiers résultats de cette étude avaient mis en évidence l'existence de nouvelles espèces et des stocks encore peu exploités à l’époque. Leur exploitation par la pêche professionnelle mais aussi par la pêche plaisancière s’est dès lors développée rapidement, sans aucun contrôle. En l’absence de cadre juridique et de mesures de gestion appropriés, la baisse rapide des rendements et les conflits pour l’accès à ces ressources profondes limitées et réputées sensibles à l’exploitation avaient motivé un précédent projet d'étude pour caractériser l’état de ces ressources (ANCRE-DMX, nommé DMX1, Ifremer 2011). Ce premier diagnostic réalisé à peine 10 ans après le début de l’exploitation des principales espèces avait mis en évidence des premiers signes d’une exploitation non soutenable des ressources dans l'ouest et le nord de La Réunion. Il avait été alors préconisé de lever des lacunes importantes concernant la biologie et l’écologie des espèces, d’évaluer l’état de ces stocks et enfin, de définir des indicateurs biologiques et halieutiques permettant de suivre l’évolution de ces différents stocks. En effet, les stocks de poissons démersaux profonds sont connus pour leur vulnérabilité (croissance lente, maturité sexuelle tardive, recrutement aléatoire…), et ce d’autant plus que leurs habitats sont particulièrement restreints à La Réunion. Le présent projet DMX2 a donc eu pour principal objectif d’établir, à partir d’une approche « indicateur », les bases des connaissances halieutiques, biologiques et écologiques manquantes sur les 6 principales espèces ciblées par la pêcherie à la ligne mécanisée. Le plan d’échantillonnage mis en place a couvert des profondeurs comprises entre 80 et 700 mètres, intégrant pour la première fois les zones de transition plus côtières. La période d’échantillonnage s’est déroulée sur un cycle annuel complet, soit d’avril 2014 à mai 2015, avec le concours de 10 pêcheurs professionnels répartis tout autour de l’île. Ainsi, 143 marées ont permis d’échantillonner 3984 individus et plus de 60 espèces différentes. Pour les principales espèces retenues, le suivi des captures en mer et les prélèvements biologiques réalisés ont permis d’appréhender leur rendement, leur structure démographique, leurs relations biométriques, l’étude de leur croissance, leur cycle de reproduction, leur taille de première maturité, la composition relative de leur alimentation ainsi que la variabilité de leur condition corporelle selon les saisons et en fonction des secteurs géographiques de l’île. Pour certaines espèces, les paramètres biologiques et écologiques obtenus n’avaient jamais été étudiés à ce jour. A partir des indicateurs populationnels et bio-écologiques retenus dans le projet, il a été possible d’évaluer l’état de santé des principaux stocks exploités et de les confronter à la situation et à l’évolution de la pêcherie ciblant ces espèces. Sur la base d’une approche de précaution, les diagnostics rendus sont variables selon l’état de santé de chacun des stocks et de leur sensibilité à l’exploitation. L’approche « indicateur » développée dans le cadre de ce projet a été appliquée aux données historiques disponibles. Ces indicateurs seront désormais proposés dans le cadre des suivis qui devront être mis en place dans la définition d’un plan de gestion des ressources démersales profondes à La Réunion. La définition du plan de gestion devra être discutée et validée auprès des différents usagers pêcheurs ainsi que des gestionnaires scientifiques, professionnels et administratifs

Guide d’utilisation de l’exécutable QrCodeGenerator

L’exécutable QrCodeGenrator permet la génération de codes de traçabilité et leur impression sur des étiquettes autocollantes. L’exécutable est conçu pour répondre en premier lieu au besoin Obsbio. A savoir un code de traçabilité unique faisant référence aux lignes de plan Imagine (https://doi.org/10.13155/86111). L’utilisation d’un code de traçabilité devient primordial dans la vie de la donnée et des échantillons biologiques. Cet outil s’inscrit totalement dans l’objectif du projet SI MORSE (Marine Oganisms and Ressources and Storage systEm) dont l’objectif est de tracer tous les échantillons biologiques non détruits (https://w3z.ifremer.fr/morse/ ). Le code de traçabilité a pour objectif de tracer tous les échantillons depuis leur prélèvement, leur traitement, jusqu’à leur archivage. Ces actions viennent compléter les dispositifs déjà en place tel que l’utilisation du module workflow dans Labcollector pour le suivi des lots de pièces calcifiées (https://archimer.ifremer.fr/doc/00116/22764/)

Guide des prélèvements de pièces calcifiées

Ce guide présente les règles de prélèvement des pièces calcifiées ayant pour objectif d’obtenir la donnée d’âge par le pôle national de sclérochronologie de l’Ifremer de Boulogne sur Mer. Cette donnée d’âge répond aux objectifs inscrits au Plan de Travail National (PTN) (https://datacollection.jrc.ec.europa.eu/wp-np-ar & https://sih.ifremer.fr/Le-SIH/Appui-auxpolitiques- publiques/Plan-de-Travail-National-francais-et-rapports-annuels). Dans ce contexte, le type de pièce calcifiée sélectionnée pour chaque espèce est en concordance avec les consignes issues des protocoles de collecte et workshops, des groupes de travail internationaux (exemple pour le bar https://doi.org/10.17895/ices.pub.9556). La pièce calcifiée utilisée est majoritairement l'otolithe (Sagittae) à l'exception de certaines espèce

Etude de la croissance des espèces profondes de l’île de la Réunion

Ces dernières années, la petite pêche réunionnaise qui ciblait traditionnellement les espèces récifales et démersales peu profondes, a évolué progressivement vers l’exploitation des stocks de poissons plus profonds (au-delà de 200 m). Ces nouvelles espèces économiquement importantes font l’objet d’une forte exploitation mais sont cependant fragiles d’un point de vue biologique (croissance lente, maturité sexuelle tardive, recrutement aléatoire, écosystème sensible, habitats restreint à La Réunion). Ainsi, il y a une nécessité de mettre en place des mesures de gestion rationnelles et durables de ces ressources. Pour répondre à cela, le projet de recherche DMX (Indicateurs biologiques et écologiques pour une gestion durable des stocks de poissons DéMersauX profonds d’intérêt halieutique à La Réunion) a été mis en œuvre pour en particulier étudier la croissance de ces 6 principales espèces profondes de l'île de la Réunion. Elles appartiennent à 3 familles que sont les Lutjanidae (Etelis carbunculus (vivaneau rubis, n=229), Etelis coruscans (vivaneau flamme, n=78), Pristipomoides multidens (gros ecal, n=133), Pristipomoides argyrogrammicus (colas orné, n=103)), les Bramidae (Eumegistus illustris (brème noire, n=74)) et les Serranidae (Epinephelus radiatus (mérou zébré, n=78)). Des tests préalables des différentes techniques (observation in toto, otolithe brûlé, otolithe cassé-brûlé, coupe fine) sur les principales pièces calcifiées (otolithes, écailles et opercules) ont été menés afin d’appliquer la méthode de traitement la mieux adaptée à chaque espèce. Les paramètres morphométriques de l’otolithe ont été mesurés (Longueur : OL, Poids : Ow, Largeur : Ola, Surface : Os et Périmètre : OP), et leur âge a été estimé pour chaque individu afin d’établir les premiers modèles de croissance pour ces espèces de grands fonds de l’île de La Réunion

Comparison between the opercular bones, the scales and the otoliths to investigate the growth of the brilliant pomfret (Eumegistus illustris) off the coast of Reunion Island (SW Indian Ocean)

The brilliant pomfret (Eumegistus illustris) occurs in the western part of the Indian Ocean and the western and central Pacific Ocean. To date, the biology of E. illustris has never been documented. The aim of the present study was to investigate age and growth of E. illustris along the coasts of Reunion Island, based on calcified structures analysis. One hundred thirty five individuals were sampled in the landings of the French local artisanal fisheries from March 2014 to March 2015. The relationships between two types of body length (Total and Standard lengths, cm) and Total weight (g) were significant (P<0.05). Total length-weight relationship was described by the following parameters: a=0.012 and b=3.015 without significant effect of sexual dimorphism. The oblong shape of the scales and the otoliths could explain the difficulty in using these calcified structures for ageing E. illustris. Consequently, the opercular bone is a good alternative calcified structure when the otoliths and scales are unsuitable especially for slowly growing fish

Projet DMX2 - Volet Croissance

Cette étude correspond au volet « croissance » du projet ANCRE-DMX2. Six espèces ciblées parmi les principales espèces démersales débarquées par la petite pêche réunionnaise ont été étudiées afin d’établir leur modèle de croissance, dont certaines pour la première fois. Ce travail présente les résultats de la croissance, acquis à partir de pièces calcifiées (otolithe, écaille, opercule). Des tests préalables des différentes techniques (observation in toto, otolithe brûlé, otolithe cassé-brûlé, coupe fine) sur les principales pièces calcifiées (otolithes, écailles et opercules) ont été menés, afin d’appliquer la méthode de traitement la mieux adaptée à chaque espèce. Les paramètres morphométriques de l’otolithe ont été mesurés (Poids : Ow, Longueur : OLong, Largeur : Olarg, Surface : Osurf). Pour chaque individu des 6 espèces de grands fonds retenues, l’appartenance à un groupe d’âge a été estimée pour établir les premiers modèles de croissance. Les paramètres de croissance (L¥ et k) ont été estimés selon le modèle de Von Bertalanffy (1938). L’indice de performance de croissance (F ; Pauly & Munro 1984) est utilisé pour comparer la croissance entre les différentes populations selon les zones géographiques, d’une part, d'une même espèce, et d’autre part, entre plusieurs espèces

Reproduction of fish in Reunion Island (Indian Ocean)

This poster presents the reproductive cycle during the 12 months of the year (with the fish proportions : during peak reproduction, able to reproduce and the sexual rest). Total length and Age at the first sexual maturity of the main demersal species exploited around Reunion Island (Indian Ocean) are identified. These data were carried out and analysed during the European research project IPERDMX (2019-2022) which aims to specify the state of the exploited populations in the different habitats around the Reunion Island (Indian Ocean), and thus contribute to the stock assessment of demersal fish. These biological data are presented for 17 species: Deep-water red snapper (Etelis carbunculus), Bluestriped snapper (Lutjanus notatus), Goldbanded snapper (Pristipomoides multidens), Oblique-banded grouper (Epinephelus radiatus), Common bluestripe snapper (Lutjanus kasmira), Rusty jobfish (Aphareus rutilans), Brilliant pomfret (Eumegistus illustris), Alfonsino (Beryx decadactylus), Crimson jobfish (Pristipomoides filamentosus), Bluefin trevally (Caranx melampygus), Yellow-edged lyretail (Variola louti), White-edged lyretail (Variola albimarginata), Green Jobfish (Aprio virescens), Blacktip grouper (Epinephelus fasciatus), Golden hind (Cephalopholis aurantia), Spotcheek emperor (Lethrinus rubrioperculatus) and Ornate jobfish (Pristipomoides argyrogrammicus).Ce poster présente les périodes de reproduction et les caractéristiques du poisson (taille et âge moyens) lors de la première maturité sexuelle des principales espèces démersales exploitées autour de l'Ile de La Réunion. Ces données ont été acquises et analysées lors du projet européen de recherche IPERDMX (2019-2022) qui vise à préciser l’état des peuplements exploités dans les différents habitats à l’échelle de la pêcherie de l'Ile de La Réunion (Océan Indien), et ainsi contribuer à l'évaluation des stocks de poissons démersaux. Ces données biologiques sont présentées pour 17 espèces : Vivaneau rubis (Etelis carbunculus), Vivaneau à raies blueus (Lutjanus notatus), Vivaneau à bande dorée (Pristipomoides multidens), Mérou zébré (Epinephelus radiatus), Vivaneau à raies bleues (Lutjanus kasmira), Vivaneau argenté (Aphareus rutilans), Brème noire (Eumegistus illustris), Beryx commun (Beryx decadactylus), Colas fil (Pristipomoides filamentosus), Carangue aile bleue (Caranx melampygus), Croissant queue jaune (Variola louti), Croissant queue blanche (Variola albimarginata), Vivaneau job (Aprio virescens), Mérou oriflamme (Epinephelus fasciatus), Vieille dorée (Cephalopholis aurantia), Empereur honteux (Lethrinus rubrioperculatus) et Colas orné (Pristipomoides argyrogrammicus).  

Growth of the oblique-banded grouper (Epinephelus radiatus) on the coasts of Reunion Island (SW Indian Ocean)

The oblique-banded grouper, Epinephelus radiatus (Day, 1968), occurred within the whole Indo- West Pacific where it is harvested by small-scale coastal fisheries. The aim of this study was to estimate the growth of this species at Reunion Island (South-West Indian Ocean) since no study investigated this topic so far. Fifty-seven individuals were sampled in the landings of the French local artisanal fisheries from March 2014 to March 2015. The relationships between two types of body length (total and standard lengths, cm) and total weight (g) were significant (p < 0.05). Total length-weight relationship was described by the following parameters: a = 0.01 and b = 3.098. For each individual, morphometry of the whole otolith was described with several parameters (OL: otolith length; OWI: otolith width; OA: otolith area; Ow: otolith weight). Age was determined on a transversal section of otolith. Among the morphometric parameters of otoliths, only the weight (p = 0.002) was significantly correlated with the age of E. radiatus, with no difference between left and right otolith (p = 0.67). Von Bertalanffy growth equations were TLt = 65.99(1 – e–0.20(t)) and Wt = 4526.44(1 – e–0.20(t))3.Le mérou zébré, Epinephelus radiatus (Day, 1868), est présent dans l’océan Indien et l’ouest de l’océan Pacifique, où il est capturé par la petite pêche côtière artisanale. Le but de cette étude est d’estimer la croissance du mérou zébré sur les côtes de l’île de la Réunion (sud-ouest de l’océan Indien) pour lequel aucune donnée publiée n’est disponible. Au total, 57 individus ont été échantillonnés à partir des débarquements de la petite pêche artisanale locale, de mars 2014 à mars 2015. Les relations entre les deux types de longueur (longueurs totale et standard, en cm) et la masse totale (en g) sont toutes significatives (p < 0,05). La relation entre la longueur totale (LT) et la masse (WT) est décrite par les paramètres suivants : a = 0,01 et b = 3,098. Pour chaque individu, la morphométrie des otolithes entiers a été décrite par plusieurs paramètres (OL : longueur ; OWI : largeur ; OA : surface ; Ow : poids) puis l’âge a été déterminé à partir de coupes fines transversales de l’otolithe sagital. Parmi tous les paramètres morphométriques de l’otolithe, seul le poids (p = 0,002) présente une relation significative avec l’âge du mérou zébré, sans effet du côté de la tête où l’otolithe est présent (p = 0,67). Les équations de Von Bertalanffy ont été estimées à LT = 65,99 (1 – e–0.20(t)) et WT = 4526,44 (1 – e–0.20(t))3

Relationship between somatic growth and otolith growth: a case study of the ornate jobfish Pristipomoides argyrogrammicus from the coast of Réunion (SW Indian Ocean)

The ornate jobfish Pristipomoides argyrogrammicus Valenciennes 1832 occurs in the Indo-West Pacific Ocean, where it is harvested by small-scale coastal fisheries. Management of this species is hindered by lack of adequate biological data. We sampled a total of 113 individuals from the landings of local artisanal fishers on the island of Réunion (southwestern Indian Ocean), from March 2014 to March 2015. The relationships between two types of body length (total and standard length, cm) and total weight (g) were shown to be significant (p < 0.05). The length–weight relationship was described by a power function, with the scaling factor estimated to be 0.008 and the exponent 3.146. Age was determined using whole otoliths. The von Bertalanffy growth equation was estimated to be TLt = 30.68(1 – e–0.52(t)). Otolith morphometry variables (length, width and area) were significantly correlated with age estimates (p < 0.05). No significant difference in age estimates was observed between left and right otoliths used as predictors. Readings from observed age and the estimates from modelled age indicated relatively good agreement, suggesting the potential to use whole otoliths for age estimation

Projet Accobiom. Acquisition de connaissances sur les paramètres biologiques des ressources marines exploitées en Outre-mer. Guide d’observations individuelles

As part of the monitoring of commercial species targeted by fisheries in the outermost regions, Ifremer has developed the Accobiom project (ACquisition de COnnaissances sur les paramètres Biologiques des ressources marines exploitées en Outre-Mer) in order to improve knowledge of fish stocks in the overseas territories. In the future, once sufficient in quantitative and temporal terms, these data will make it possible to reconstitute life history traits on the scale of the total population (size-weight relationship, size-age relationship, ogive of sexual maturity, size and age of first sexual maturity, reproduction period) and to make a diagnosis of the stocks. Financed by the French Development Agency (AFD) and implemented by Ifremer between 2021 and 2022 in four overseas departments (Guadeloupe, Martinique, French Guiana and Reunion Island), this project involved the drafting of a sampling protocol and the associated data collection, the analysis of the biological data collected (size, weight, age, sex, sexual maturity phase) as well as methodological developments allowing the integration of these new data into the assessment models of the main fish stocks of the DOMs, identified under the Data Collection Framework (DCF) regulation (EU) n°2017/10041. This document is therefore the methodological guide concerning the acquisition, validation, logistics and banking of the associated data. It builds on several documents already produced in the context of other sampling (Badts & Bertrand, 2012; Elleboode, Badts, Telliez, et al., 2022; Elleboode, Telliez, Aumond, et al., 2022; Elleboode, Badts, Prigent, et al., 2022; Garren et al., 2019; Scientific, Technical and Economic Committee for Fisheries (STECF), 2020)Dans le cadre du suivi des espèces commerciales ciblées par la pêche dans les RUP (régions ultrapériphériques), l’Ifremer a élaboré le projet Accobiom (ACquisition de COnnaissances sur les paramètres Biologiques des ressources marines exploitées en Outre-Mer) afin de renforcer les connaissances sur les stocks halieutiques en Outre-mer. A l’avenir, une fois suffisantes en termes quantitatifs et temporels, ces données permettront de reconstituer les traits d’histoire de vie à l’échelle de la population totale (relation taille-poids, relation taille-âge, ogive de maturité sexuelle, taille et âge de première maturité sexuelle, période de reproduction) et de porter un diagnostic sur les stocks. Financé par l’Agence Française de Développement (AFD) et mis en œuvre par l’Ifremer entre 2021 et 2022 dans quatre départements d’Outre-Mer (DOM) (Guadeloupe, Martinique, Guyane et La Réunion), ce projet prévoyait la rédaction d’un protocole d’échantillonnage et la collecte de données associée, l’analyse des données biologiques collectées (tailles, poids, âge, sexe, phase de maturité sexuelle) ainsi que des développements méthodologiques permettant d’intégrer ces nouvelles données aux modèles d’évaluation des principaux stocks de poissons des DOM, identifiés au titre du règlement Data Collection Framework (DCF) (UE) n°2017/10041. Ce présent document est donc le guide méthodologique concernant l’acquisition, la validation, la logistique et la bancarisation des données associées. Il s’appuie sur plusieurs documents déjà réalisés dans le cadre d’autres échantillonnages (Badts & Bertrand, 2012; Elleboode, Badts, Telliez, et al., 2022; Elleboode, Telliez, Aumond, et al., 2022; Elleboode, Badts, Prigent, et al., 2022; Garren et al., 2019; Scientific, Technical and Economic Committee for Fisheries (STECF), 2020)