Semantic Similarity To Improve Question Understanding in a Virtual Patient

In medicine, a communicating virtual patient or doctor allows students to train in medical diagnosis and develop skills to conduct a medical consultation. In this paper, we describe a conversational virtual standardized patient system to allow medical students to simulate a diagnosis strategy of an abdominal surgical emergency. We exploited the semantic properties captured by distributed word representations to search for similar questions in the virtual patient dialogue system. We created two dialogue systems that were evaluated on datasets collected during tests with students. The first system based on hand-crafted rules obtains $92.29\%$ as $F1$-score on the studied clinical case while the second system that combines rules and semantic similarity achieves $94.88\%$. It represents an error reduction of $9.70\%$ as compared to the rules-only-based system

Existe-t-il des facteurs prédictifs de l hépatotoxicité de la chimiothérapie ?

PARIS7-Xavier Bichat (751182101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Cancer colorectal (identification des patients avec un syndrome de Lynch; phénotype méthylateur : fréquence, caractéristiques cliniques, pathélogiques et moléculaires)

Ce travail portant sur le cancer colorectal (CCR) est orienté selon 2 axes: 1) amélioration de l identification des sujets atteints du syndrome de Lynch, forme la plus fréquente de CCR héréditaire (3-4% des CCR). Deux stratégies ont été comparées dans une série de 214 CCR consécutifs, l une basée sur une présélection des patients à risque (utilisation de critères clinico-pathologiques ou modèles prédictifs), la seconde (stratégie moléculaire) basée sur la recherche du phénotype d instabilité des microsatellites (MSI) dans tous les CCR suivi de l exclusion des CCR MSI sporadiques (mutation de BRAF, méthylation du promoteur de MLH1). La première stratégie n a pas permis de détecter 25% des patients avec un syndrome de Lynch. Notre travail montre que la stratégie moléculaire améliore le dépistage de ce syndrome. 2) identification de sous-groupes de CCR présentant un phénotype méthylateur (CIMP). Dans notre série, 3 sous-groupes CIMP ont été individualisés : un sous-groupe CIMP-High (22/214) composé de tous les CCR MSI sporadiques (4,7%) (associés au sexe féminin, à un âge élevé au diagnostic, une localisation proximale et aux mutations de BRAF) et de 12 (5,6%) CCR microsatellites stables (MSS) (associés au sexe masculin et mutations de KRAS ou BRAF), un sous-groupe CIMP-Intermédiaire (14/214) composé de CCR MSS et associé aux mutations de KRAS, un sous-groupe (178/214) ne présentant pas de méthylation (CIMP-Négatif). Les tumeurs de Lynch sont retrouvées dans les groupes CIMP-Intermédiaire et Négatif. La caractérisation de ces sous groupes CIMP doit permettre de mieux comprendre la carcinogenèse et de guider le développement de nouvelles stratégies de diagnostic et traitement.cThis work focused on two distinct aspects of colorectal cancer (CRC): 1) Improvement of detection of Lynch syndrome, which is the most common form of hereditary CRC (3-4% of CRCs). Two different strategies have been evaluated and compared in a consecutive series of 214 CCR patients. The first approach was based on selection of high-risk patients using clinical criteria or predictive models, the second (molecular approach) used MSI (microsatellite instability) testing in all patients, followed by exclusion of MSI-positive sporadic cases from genetic mutational testing by the application of molecular criteria (BRAF mutation screening, followed by MLH1 promoter methylation analysis in tumors lacking BRAF mutations). This study showed that the first approach misdiagnosed 25% of Lynch patients whereas the molecular approach identified all Lynch patients. 2) CpG Island Methylator Phenotype (CIMP) in CRC. We defined 3 CIMP subgroups in our CRC series: CIMP-High (22/214) including all sporadic MSI CRCs (4.7%) (associated with female gender, older age at diagnosis, ascending colon, and BRAF mutation) and 12 microsatellite stable (MSS) CCR (associated with male gender and KRAS or BRAF mutation), CIMP-Intermediate (14/214) including MSS CCR exhibiting frequent KRAS mutation, CIMP-Low/Negative (178/214). All Lynch tumors displayed CIMP-Low/Negative or Intermediate phenotype. Characterize the clinicopathologic and molecular features of CIMP subtypes in CRC is important to understand mechanisms underlying tumorigenesis but also to guide development of epigenetically based diagnostics and treatments.VERSAILLES-BU Sciences et IUT (786462101) / SudocSudocFranceF

Chemotherapy and Its Effect on Liver Hypertrophy: Implications for Portal Vein Embolization and Resection

Liver resection remains the gold standard treatment for colorectal liver metastases (CRLM). The improvement of the efficacy of chemotherapy has resulted in an increase of CRLM candidates for curative resection, including a significant proposition of patients initially deemed unresectable. The safety of liver resection has increased by taking advantage of regenerative capacities of the liver with preoperative portal vein embolization (PVE) and two-stage strategies. However, chemotherapy regimens including new drugs such as oxaliplatin and irinotecan may induce pathologic changes of the nontumorous liver parenchyma that could increase the risk of liver resection, and the impact of chemotherapy on the nontumorous liver parenchyma may limit tolerance of these resections. Preoperative portal obstruction, including PVE, which aimed to hypertrophy the future remnant liver, can be adversely affected by this chemotherapy. The aim of this article is to describe the impact of chemotherapy on nontumorous liver parenchyma and to evaluate the impact of chemotherapy on the regenerative capacities of the liver, especially after PVE

Multidisciplinary Treatment of Hepatocellular Carcinoma

X, 262 p.online resource

Hybridation d'un agent conversationnel avec des plongements lexicaux pour la formation au diagnostic médical

International audienceDans le contexte médical, un patient ou médecin virtuel dialoguant permet de former les apprenants au diagnostic médical via la simulation de manière autonome. Dans ce travail, nous avons exploité les propriétés sémantiques capturées par les représentations distribuées de mots pour la recherche de questions similaires dans le système de dialogues d'un agent conversationnel médical. Deux systèmes de dialogues ont été créés et évalués sur des jeux de données collectées lors des tests avec les apprenants. Le premier système fondé sur la correspondance de règles de dialogue créées à la main présente une performance globale de 92\% comme taux de réponses cohérentes sur le cas clinique étudié tandis que le second système qui combine les règles de dialogue et la similarité sémantique réalise une performance de 97\% de réponses cohérentes en réduisant de 7\% les erreurs de compréhension par rapport au système de correspondance de règles

A French medical conversations corpus annotated for a virtual patient dialogue system

Conférence annuléeInternational audienceData-driven approaches for creating virtual patient dialogue systems require the availability of large data specific to the language,domain and clinical cases studied. Based on the lack of dialogue corpora in French for medical education, we propose an annotatedcorpus of dialogues including medical consultation interactions between doctor and patient. In this work, we detail the building processof the proposed dialogue corpus, describe the annotation guidelines and also present the statistics of its contents. We then conducted aquestion categorization task to evaluate the benefits of the proposed corpus that is made publicly available

Hybridation d’un agent conversationnel avec des plongements lexicaux pour la formation au diagnostic médical

Dans le contexte médical, un patient ou médecin virtuel dialoguant permet de former les apprenants au diagnostic médical via la simulation de manière autonome. Dans ce travail, nous avons exploité les propriétés sémantiques capturées par les représentations distribuées de mots pour la recherche de questions similaires dans le système de dialogues d’un agent conversationnel médical. Deux systèmes de dialogues ont été créés et évalués sur des jeux de données collectées lors des tests avec les apprenants. Le premier système fondé sur la correspondance de règles de dialogue créées à la main présente une performance globale de 92% comme taux de réponses cohérentes sur le cas clinique étudié tandis que le second système qui combine les règles de dialogue et la similarité sémantique réalise une performance de 97% de réponses cohérentes en réduisant de 7% les erreurs de compréhension par rapport au système de correspondance de règles