Genomic Diversity of the Ostreid Herpesvirus Type 1 Across Time and Location and Among Host Species

The mechanisms underlying virus emergence are rarely well understood, making the appearance of outbreaks largely unpredictable. This is particularly true for pathogens with low per-site mutation rates, such as DNA viruses, that do not exhibit a large amount of evolutionary change among genetic sequences sampled at different time points. However, whole-genome sequencing can reveal the accumulation of novel genetic variation between samples, promising to render most, if not all, microbial pathogens measurably evolving and suitable for analytical techniques derived from population genetic theory. Here, we aim to assess the measurability of evolution on epidemiological time scales of the Ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), a double stranded DNA virus of which a new variant, OsHV-1 μVar, emerged in France in 2008, spreading across Europe and causing dramatic economic and ecological damage. We performed phylogenetic analyses of heterochronous (n = 21) OsHV-1 genomes sampled worldwide. Results show sufficient temporal signal in the viral sequences to proceed with phylogenetic molecular clock analyses and they indicate that the genetic diversity seen in these OsHV-1 isolates has arisen within the past three decades. OsHV-1 samples from France and New Zealand did not cluster together suggesting a spatial structuration of the viral populations. The genome-wide study of simple and complex polymorphisms shows that specific genomic regions are deleted in several isolates or accumulate a high number of substitutions. These contrasting and non-random patterns of polymorphism suggest that some genomic regions are affected by strong selective pressures. Interestingly, we also found variant genotypes within all infected individuals. Altogether, these results provide baseline evidence that whole genome sequencing could be used to study population dynamic processes of OsHV-1, and more broadly herpesviruses

"Persistent Memory". Conservation de la mémoire numérique à Pyramiden, archipel du Svalbard (Norvège)

“Persistent Memory” est un projet d’archive de données numériques individuelles sur le long terme. Il prend place à Pyramiden, une ancienne cité minière soviétique aujourd’hui abandonnée. Cette ville se situe dans l’archipel du Svalbard, proche du pôle Nord. Ses qualités géopolitique, sismique et géographique en font le lieu idéal pour la conservation de biens sensibles. Tout au long de leur vie, les utilisateurs importent leurs data dans l’intranet des serveurs de ”Persistent Memory”, installés dans les anciens immeubles de logement minier de la ville. L’énergie que développent ces nouveaux “habitants” suffit à maintenir le patrimoine de Pyramiden et à réactiver la ville dans son ensemble. A la mort de l’utilisateur, son profil numérique est trié, transformé et stocké dans une urne funéraire. Cet objet est une version pérenne et analogique de sa mémoire numérique. Un funiculaire circulant dans la montagne conduit au niveau de l’ancienne mine où les urnes sont entreposées. Une sphère taillée au cœur des galeries accueille familles et chercheurs qui désirent consulter ces témoignages de l’histoire. Le projet d’architecture questionne la persistance de la mémoire numérique et physique. Il y répond par des objets aux formes pures et par une approche sensible et matérielle de ces données

L’infrastructure comme support, seuil et cadre

Si elles jouissent actuellement d’un regain d’intérêt, les infrastructures de mobilité doivent être repensées. Soumises à des logiques de mutualisation des potentiels, des investissements et des risques, elles tendent à se combiner avec d’autres types de programmes – habitat, travail, loisirs, équipements publics –, et apparaissent comme de puissants leviers de transformation urbaine et de rééquilibrage territorial. Dès lors, comment relever le pari de concevoir de nouveaux types d’«architectures infrastructurelles» complexes et contextualisées, capables d’intégrer d’autres fonctions que la mobilité, mais aussi un environnement climatique, social, urbain et paysager spécifique? Le développement d’une nouvelle culture de l’infrastructure de transport implique en premier lieu de réexaminer les définitions relativement ouvertes que les dictionnaires courants1 et spécialisés2 donnent du terme « infrastructure » en général. Les trois métaphores architectoniques du support, du seuil et du cadre, dont la première partie de ce livre pourra suggérer plusieurs interprétations complémentaires, illustrent la démarche développée au cours des dernières années par le Laboratoire d’Architecture et de Mobilité Urbaine

Une gestion des ressources humaines bénévoles est-elle concevable dans l’association à but non lucratif ?

International audienc

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