Core mutations, IL28B polymorphisms and response to peginterferon/ribavirin treatment in Swedish patients with hepatitis C virus genotype 1 infection

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Patients infected with hepatitis C virus (HCV) genotype 1 respond poorly to standard treatment with 50% or less achieving sustained virologic response. Predicting outcome is essential and could help avoid unnecessary treatment and reduce health cost. Recently, an association of amino acid substitutions in the core region and treatment outcome was observed in Japanese patients. In the present study, the impact of these mutations on response kinetics and treatment outcome was explored in Caucasian patients.</p> <p>Methods</p> <p>The core region of HCV pre-treatment samples obtained from 50 patients treated with peginterferon/ribavirin in a previous Swedish clinical trial with genotype 1 infection were sequenced. The alleles at rs12979860, a single nucleotide polymorphism (SNP), were assessed in order to identify any co-association with this strong response predictor.</p> <p>Results</p> <p>No association between treatment response and substitutions of core residue 91 was found. In contrast, substitutions of core residue 70 were observed in 6/21 (29%) non-responders, but only in one of 29 responders (p = 0.03), and were more common in subgenotype 1b (R70Q in 6 of 13 strains) than in 1a (R70P in 1 of 37 strains, p = 0.004). The rs12979860 SNP upstream of the IL28B gene was overall the strongest response predictor (p = 0.0001). Core 70 substitutions were associated with poorer response kinetics in patients carrying the CT genotype at rs12979860.</p> <p>Conclusions</p> <p>The results indicate that substitutions of core residue 70 are related to treatment response in Caucasian patients with HCV-1b infection, but are of less importance than IL28B polymorphism.</p

Mätning av aromatiska kolväten med DOAS. En studie av tillförlitlighets- och interferensproblem.

DOAS-tekniken är en optisk fjärranalysmetod för mätning av luftföroreningar. I det projekt som här avrapporterats har tekniken utvärderats m a p mätning av lätta aromatiska kolväten. Projektet har omfattat såväl litteratur, labb och fältstudier av absorptionsegenskaper som interferenseffekter. Resultaten visar att de lätta aromatiska kolväten har ett gemensamt absorptionsband i nära UV (250-280 mm ) som med fördel kan användas i en DOAS-tillämpning. Utnyttjande detta band, kan flera av aromaterna mätas med en detektionsgräns på några µg/m3. Dock föreligger kraftiga interferenseffekter mellan i synnerhet komponenter med likartad kemisk struktur. Detta problem kan i vissa fall hanteras m h a multipel regressions analys. En förutsättning för detta är dock att inga 'okända' interferande ämnen (lös aromater) förekommer i mätsituationen.DOAS-tekniken är en optisk fjärranalysmetod för mätning av luftföroreningar. I det projekt som här avrapporterats har tekniken utvärderats m a p mätning av lätta aromatiska kolväten. Projektet har omfattat såväl litteratur, labb och fältstudier av absorptionsegenskaper som interferenseffekter. Resultaten visar att de lätta aromatiska kolväten har ett gemensamt absorptionsband i nära UV (250-280 mm ) som med fördel kan användas i en DOAS-tillämpning. Utnyttjande detta band, kan flera av aromaterna mätas med en detektionsgräns på några µg/m3. Dock föreligger kraftiga interferenseffekter mellan i synnerhet komponenter med likartad kemisk struktur. Detta problem kan i vissa fall hanteras m h a multipel regressions analys. En förutsättning för detta är dock att inga 'okända' interferande ämnen (lös aromater) förekommer i mätsituationen

Mätning av aromatiska kolväten med DOAS. En studie av tillförlitlighets- och interferensproblem.

DOAS-tekniken är en optisk fjärranalysmetod för mätning av luftföroreningar. I det projekt som här avrapporterats har tekniken utvärderats m a p mätning av lätta aromatiska kolväten. Projektet har omfattat såväl litteratur, labb och fältstudier av absorptionsegenskaper som interferenseffekter. Resultaten visar att de lätta aromatiska kolväten har ett gemensamt absorptionsband i nära UV (250-280 mm ) som med fördel kan användas i en DOAS-tillämpning. Utnyttjande detta band, kan flera av aromaterna mätas med en detektionsgräns på några µg/m3. Dock föreligger kraftiga interferenseffekter mellan i synnerhet komponenter med likartad kemisk struktur. Detta problem kan i vissa fall hanteras m h a multipel regressions analys. En förutsättning för detta är dock att inga 'okända' interferande ämnen (lös aromater) förekommer i mätsituationen.DOAS-tekniken är en optisk fjärranalysmetod för mätning av luftföroreningar. I det projekt som här avrapporterats har tekniken utvärderats m a p mätning av lätta aromatiska kolväten. Projektet har omfattat såväl litteratur, labb och fältstudier av absorptionsegenskaper som interferenseffekter. Resultaten visar att de lätta aromatiska kolväten har ett gemensamt absorptionsband i nära UV (250-280 mm ) som med fördel kan användas i en DOAS-tillämpning. Utnyttjande detta band, kan flera av aromaterna mätas med en detektionsgräns på några µg/m3. Dock föreligger kraftiga interferenseffekter mellan i synnerhet komponenter med likartad kemisk struktur. Detta problem kan i vissa fall hanteras m h a multipel regressions analys. En förutsättning för detta är dock att inga 'okända' interferande ämnen (lös aromater) förekommer i mätsituationen

IL28B polymorphisms determine early viral kinetics and treatment outcome in patients receiving peginterferon/ribavirin for chronic hepatitis C genotype 1

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) upstream of IL28B predict the outcome of treatment in chronic hepatitis C virus (HCV) infection, but their impact on viral kinetics and relation to other predictors are not well known. Here, two SNPs, rs12979860 and rs8099917, were analysed and related to early viral kinetics during treatment in 110 patients with HCV genotype 1 infection. The reduction of HCV RNA after 7 days of therapy was more pronounced (P < 0.0001) in patients with CC(rs12979860) or TT(rs8099917) than in patients carrying TT(rs12979860) or GG(rs8099917), respectively. The two SNPs were in linkage disequilibrium (d' = 1, r2 = 0.44), but CC(rs12979860) was less common (43% vs. 71%) than TT(rs8099917). Patients carrying both CC(rs12979860) and TT(rs8099917) genotypes achieved lower levels of HCV RNA at week 4 than those with CT or TT at rs12979860 and TT(rs8099917) (P = 0.0004). The viral elimination was significantly influenced by rs12979860 independently of baseline viral load, age or fibrosis. This translated into high rates of sustained viral response (SVR) among patients carrying CC(rs12979860) despite the presence of high viral load at baseline (SVR 74%), high age (SVR 79%) or severe liver fibrosis (SVR 83%). We conclude that the IL28B variability influences the antiviral efficiency of interferon/ribavirin therapy and has a strong impact on SVR, independently of traditional response predictors. A combined assessment of these SNPs in conjunction with other response predictors may better predict outcome in difficult-to-treat patients

Management of hepatitis B virus infection, updated Swedish guidelines

Despite access to effective antiviral drugs and vaccines, hepatitis B virus (HBV) infection remains a major health issue worldwide. HBV is highly infectious and may cause chronic infection, progressive liver damage, hepatocellular cancer (HCC) and death. Early diagnosis, proper management and timing of treatment are crucial. The Swedish Reference group for Antiviral Treatment (RAV) here provides updated evidence-based guidelines for treatment and management of HBV infection which may be applicable also in other countries. Tenofovir alafenamide (TAF) has been introduced as a novel treatment option and new principles regarding indication and duration of treatment and characterization of hepatitis B have been gradually introduced which justifies an update of the previous guidelines from 2007. Updated guidelines on HCC surveillance in HBV-infected patients, treatment and prophylaxis for patients undergoing liver transplantation as well as management of pregnant women and children with HBV infection are also provided