A multimeric matrix-associated lectin (RapD) affects proper exopolysaccharide processing in Rhizobium leguminosarum

Rhizobium leguminosarum synthesizes an acidic polysaccharide formed by the polymerization of octasaccharide repeating units containing glucose (Glc), glucuronic acid (GlcA) and galactose (Gal) in a 5:2:1 ratio with particular substitutions; most of it is secreted to the extracellular medium (EPS) and part of it is retained on the bacterial surface as a capsular polysaccharide (CPS). Rap proteins, substrates of the PrsDE type I secretion system (TISS) share at least one Ra/CDHL (cadherin-like) domain and are involved in biofilm and matrix development either by cleaving the polysaccharide (Ply glycanases) or by altering the bacterial adhesive properties. Previous studies have shown that RapA2 is a monomeric calcium-binding lectin capable of binding specifically the R. leguminosarum CPS through a Ra/CDHL domain. It was shown that the absence or excess of RapA2 in the extracellular medium alters the biofilm matrix's properties. In this work we identified a new Rap protein (RapD), which comprises an N-terminal Ra/CDHL domain and a C-terminal domain of unknown function. By Western blot analysis using specific polyclonal antibodies we showed that in planktonic cultures RapD is co-secreted with the other Rap proteins in a PrsDE-dependent manner. Furthermore, under conditions that favor EPS production, a prominent RapD secretion was observed. In addition, colony blot assays indicated that RapD is associated with the biofilm matrix. Interestingly, size exclusion chromatography of the EPS produced by the ΔrapA2 ΔrapD double mutant showed differences in the EPS profiles compared with those of the single mutants and the wild type strain, thus suggesting a functional interaction between the RapA2 and RapD proteins.Biophysical studies showed that calcium triggers proper folding and multimerization of recombinant RapD. Besides, further RapD conformation changes were observed in the presence of EPS. ELISA and BIA (binding inhibition assay) assays showed that in the presence of calcium, RapD specifically binds the EPS and that galactose residues would be involved in this interaction. In conclusion, RapD is a multimeric calcium-dependent EPS lectin that is co-secreted with the other Rap proteins via TISS PrsDE. Unlike RapA2, RapD is not retained on the bacterial surface but would rather interact with the released EPS. Finally, our results suggest that the interaction of RapA2 and RapD with the CPS or the EPS somehow affects the polysaccharide processing and therefore the biofilm matrix.Fil: Tarsitano, Julián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Russo, Daniela Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Zorreguieta, Ángeles. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaProceedings of the Biofilms 9 online conferenceKarslruheAlemaniaKarlsruhe Institute of Technolog

Influence of ceramic materials on solar storage collector used to preheat water in agro-industrial processes

El uso de materiales cerámicos en colectores para uso de energía solar térmica se ha incrementado últimamente. Se determinaron las diferencias presentadas entre diferentes cerámicas fabricadas a 3626 y 5222 psi instaladas en dos colectores de área efectiva de 0,36 m2. El objetivo este tipo de colectores es lograr eficiencia energética para empresas agroindustriales que usan agua a temperatura cercana a su punto de ebullición a presión atmosférica. El colector está constituido por una matriz de cerámica que cumple la función de absorber la energía solar y un contenedor de acero inoxidable aislado donde el agua es almacenada. Los experimentos fueron a nivel de laboratorio a 400, 500, y 750 W/m2 en un simulador de radiación solar. Un completo análisis desde la perspectiva va de la segunda y la primera ley de la termodinámica fue hecho para calcular la eficiencia del colector solar. Los resultados mostraron que la eficiencia global del colector solar de matriz cerámica fue de 59% a 400 W/m2 con cerámica compactada a 5222 psi.The uses of ceramic materials in solar collectors for passive application of solar energy have been increasing lately. This paper deals with an experimental study of an inexpensive solar storage collector to provide hot water. The purpose of using this type of collector is to achieve energy efficiency for agribusinesses that need water at temperatures near its boiling point at atmospheric pressure. The solar collector is constituted by two different ceramic absorber matrix manufactured at 3626 and 5222 psi pressing pressures, which perform the function of absorb and store the solar thermal energy. The second element in the collector is an isolated stainless steel container where water is stored. The experiments were carried out within an indoor environment at 400, 500 and 750 W/m2 in a solar radiation simulator. An energy and exergy analysis were done to calculate efficiency of the solar collectors. The results show that the overall efficiency of the solar collector is 59% at the lowest radiation and ceramic compacted at 5222 psi

RapD Is a Multimeric Calcium-Binding Protein That Interacts With the Rhizobium leguminosarum Biofilm Exopolysaccharide, Influencing the Polymer Lengths

Rhizobium leguminosarum synthesizes an acidic polysaccharide mostly secreted to the extracellular medium, known as exopolysaccharide (EPS) and partially retained on the bacterial surface as a capsular polysaccharide (CPS). Rap proteins, extracellular protein substrates of the PrsDE type I secretion system (TISS), share at least one Ra/CHDL (cadherin-like) domain and are involved in biofilm matrix development either through cleaving the polysaccharide by Ply glycanases or by altering the bacterial adhesive properties. It was shown that the absence or excess of extracellular RapA2 (a monomeric CPS calcium-binding lectin) alters the biofilm matrix’s properties. Here, we show evidence of the role of a new Rap protein, RapD, which comprises an N-terminal Ra/CHDL domain and a C-terminal region of unknown function. RapD was completely released to the extracellular medium and co-secreted with the other Rap proteins in a PrsDE-dependent manner. Furthermore, high levels of RapD secretion were found in biofilms under conditions that favor EPS production. Interestingly, size exclusion chromatography of the EPS produced by the ΔrapA2ΔrapD double mutant showed a profile of EPS molecules of smaller sizes than those of the single mutants and the wild type strain, suggesting that both RapA2 and RapD proteins influence EPS processing on the cell surface. Biophysical studies showed that calcium triggers proper folding and multimerization of recombinant RapD. Besides, further conformational changes were observed in the presence of EPS. Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA) and Binding Inhibition Assays (BIA) indicated that RapD specifically binds the EPS and that galactose residues would be involved in this interaction. Taken together, these observations indicate that RapD is a biofilm matrix-associated multimeric protein that influences the properties of the EPS, the main structural component of the rhizobial biofilm.Fil: Tarsitano, Julián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Ramis, Lila Yanina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Russo, Daniela Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Zorreguieta, Ángeles. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentin

Development of a second generation prophylactic vaccine against human papillomavirus

Human papillomaviruses (HPV) are the etiologic agent for cervical cancer (CC), the second cause of cancer death in women worldwide. It is estimated that half a million new cases are diagnosed each year, mostly in developing countries due to the lack of massive programs for early detection of the virus. Recently, two prophylactic vaccines against the main oncogenic HPV types 16 and 18 (responsible for 80% of CC) have been introduced into market. Both of these vaccines, obtained as recombinants, have been shown to be safe and effective; however, their high cost works against its immediate impact in the incidence of HPV infection in developing and low-income countries. There is a need to have in hand second generation, low cost vaccines of massive use that will decrease CC cases in a large extent. With this in mind, we have developed a recombinant expression platform that allows us to obtain virus-like particles (VLPs) to formulate both effective and accessible vaccines against HPV infection.Human papillomaviruses (HPV) are the etiologic agent for cervical cancer (CC), the second cause of cancer death in women worldwide. It is estimated that half a million new cases are diagnosed each year, mostly in developing countries due to the lack of massive programs for early detection of the virus. Recently, two prophylactic vaccines against the main oncogenic HPV types 16 and 18 (responsible for 80% of CC) have been introduced into market. Both of these vaccines, obtained as recombinants, have been shown to be safe and effective; however, their high cost works against its immediate impact in the incidence of HPV infection in developing and low-income countries. There is a need to have in hand second generation, low cost vaccines of massive use that will decrease CC cases in a large extent. With this in mind, we have developed a recombinant expression platform that allows us to obtain virus-like particles (VLPs) to formulate both effective and accessible vaccines against HPV infection.Fil: Alonso, Leonardo Gabriel. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Xbio S.a; ArgentinaFil: Cerutti, Maria Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Xbio S.a; ArgentinaFil: Risso, Marikena Guadalupe. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Xbio S.a; ArgentinaFil: González, Mariángeles. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentina. Xbio S.a; ArgentinaFil: Camporeale, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; ArgentinaFil: de Prat Gay, Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquimicas de Buenos Aires; Argentina. Fundación Instituto Leloir; Argentin

Chaperone holdase activity of human papillomavirus E7 oncoprotein

E7 oncoprotein is the major transforming activity in human papillomavirus and shares sequence and functional properties with adenovirus E1A and SV40 T-antigen, in particular by targeting the pRb tumor suppressor. HPV 16 E7 forms spherical oligomers that display chaperone activity in thermal denaturation and chemical refolding assays of two model polypeptide substrates, citrate synthase and luciferase, and it does so at substoichiometric concentrations. We show that the E7 chaperone can stably bind model polypeptides and hold them in a state with significant tertiary structure, but does not bind the fully native proteins. The E7 oligomers bind native in vitro translated pRb without the requirement of it being unfolded, since the N-terminal domain of E7 containing the LXCXE binding motif is exposed. The N-terminal domain of E7 can interfere with pRb binding but not with the chaperone activity, which requires the C-terminal domain, as in most reported E7 activities. The ability to bind up to ∼72 molecules of pRb by the oligomeric E7 form could be important either for sequestering pRb from Rb-E2F complexes or for targeting it for proteasome degradation. Thus, both the dimeric and oligomeric chaperone forms of E7 can bind Rb and various potential targets. We do not know at present if the chaperone activity of E7 plays an essential role in the viral life cycle; however, a chaperone activity may explain the large number of cellular targets reported for this oncoprotein.Fil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Smal, Clara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Garcia Alai, Maria M.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Chemes, Lucia Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Salame, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: de Prat Gay, Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentin

Conformational Isomerization Involving Conserved Proline Residues Modulates Oligomerization of the NS1 Interferon Response Inhibitor from the Syncytial Respiratory Virus

Interferon response suppression by the respiratory syncytial virus relies on two unique nonstructural proteins, NS1 and NS2, that interact with cellular partners through high-order complexes. We hypothesized that two conserved proline residues, P81 and P67, participate in the conformational change leading to oligomerization. We found that the molecular dynamics of NS1 show a highly mobile C-terminal helix, which becomes rigid upon in silico replacement of P81. A soluble oligomerization pathway into regular spherical structures at low ionic strengths competes with an aggregation pathway at high ionic strengths with an increase in temperature. P81A requires higher temperatures to oligomerize and has a small positive effect on aggregation, while P67A is largely prone to aggregation. Chemical denaturation shows a first transition, involving a high fluorescence and ellipticity change corresponding to both a conformational change and substantial effects on the environment of its single tryptophan, that is strongly destabilized by P67A but stabilized by P81A. The subsequent global cooperative unfolding corresponding to the main β-sheet core is not affected by the proline mutations. Thus, a clear link exists between the effect of P81 and P67 on the stability of the first transition and oligomerization/aggregation. Interestingly, both P67 and P81 are located far away in space and sequence from the C-terminal helix, indicating a marked global structural dynamics. This provides a mechanism for modulating the oligomerization of NS1 by unfolding of a weak helix that exposes hydrophobic surfaces, linked to the participation of NS1 in multiprotein complexes.Fil: Conci, Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Álvarez Paggi, Damián Jorge. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: de Oliveira, Guilherme A. P.. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Pagani, Talita Duarte. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Esperante, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Borkosky, Silvina Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Aran, Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Mohana Borges, Ronaldo. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: de Prat Gay, Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentin

The catalytic domain of insulin-degrading enzyme forms a denaturant-resistant complex with amyloid β peptide: Implications for Alzheimer disease pathogenesis

Insulin-degrading enzyme (IDE) is central to the turnover of insulin and degrades amyloid β (Aβ) in the mammalian brain. Biochemical and genetic data support the notion that IDE may play a role in late onset Alzheimer disease (AD), and recent studies suggest an association between AD and diabetes mellitus type 2. Here we show that a natively folded recombinant IDE was capable of forming a stable complex with Aβ that resisted dissociation after treatment with strong denaturants. This interaction was also observed with rat brain IDE and detected in an SDS-soluble fraction from AD cortical tissue. Aβ sequence 17-27, known to be crucial in amyloid assembly, was sufficient to form a stable complex with IDE. Monomeric as opposed to aggregated Aβ was competent to associate irreversibly with IDE following a very slow kinetics (t1/2 ∼ 45 min). Partial denaturation of IDE as well as preincubation with a 10-fold molar excess of insulin prevented complex formation, suggesting that the irreversible interaction of Aβ takes place with at least part of the substrate binding site of the protease. Limited proteolysis showed that Aβ remained bound to a ∼25-kDa N-terminal fragment of IDE in an SDS-resistant manner. Mass spectrometry after in gel digestion of the IDE·Aβ complex showed that peptides derived from the region that includes the catalytic site of IDE were recovered with Aβ. Taken together, these results are suggestive of an unprecedented mechanism of conformation-dependent substrate binding that may perturb Aβ clearance, insulin turnover, and promote AD pathogenesis.Fil: Llovera, Ramiro Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: de Tullio, Matias Blas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Leissring, Malcolm A.. The Scripps Research Institute; Estados UnidosFil: Kaufman, Sergio Benjamín. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Biológica; ArgentinaFil: Roher, Alex E.. Banner Sun Health Research Institute; Estados UnidosFil: de Prat Gay, Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Morelli, Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Castaño, Eduardo Miguel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentin

Improved Expression of SARS-CoV-2 Spike RBD Using the Insect Cell-Baculovirus System

Insect cell-baculovirus expression vector system is one of the most established platforms to produce biological products, and it plays a fundamental role in the context of COVID-19 emergency, providing recombinant proteins for treatment, diagnosis, and prevention. SARS-CoV-2 infection is mediated by the interaction of the spike glycoprotein trimer via its receptor-binding domain (RBD) with the host’s cellular receptor. As RBD is required for many applications, in the context of pandemic it is important to meet the challenge of producing a high amount of recombinant RBD (rRBD). For this reason, in the present study, we developed a process based on Sf9 insect cells to improve rRBD yield. rRBD was recovered from the supernatant of infected cells and easily purified by metal ion affinity chromatography, with a yield of 82% and purity higher than 95%. Expressed under a novel chimeric promoter (polh-pSeL), the yield of rRBD after purification was 21.1 ± 3.7 mg/L, which is the highest performance described in Sf9 cell lines. Finally, rRBD was successfully used in an assay to detect specific antibodies in COVID-19 serum samples. The efficient strategy herein described has the potential to produce high-quality rRBD in Sf9 cell line for diagnostic purpose.Fil: Poodts, Joaquín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Smith, Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Birenbaum, Joaquín Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Rodriguez, María Sol. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Montero, Luciano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Wolman, Federico Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Marfía, Juan Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Valdez, Silvina Noemi. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Estudios de la Inmunidad Humoral Prof. Ricardo A. Margni; ArgentinaFil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Targovnik, Alexandra Marisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; ArgentinaFil: Miranda, Maria Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; Argentin

Triggers for displaced decays of long-lived neutral particles in the ATLAS detector

A set of three dedicated triggers designed to detect long-lived neutral particles decaying throughout the ATLAS detector to a pair of hadronic jets is described. The efficiencies of the triggers for selecting displaced decays as a function of the decay position are presented for simulated events. The effect of pile-up interactions on the trigger efficiencies and the dependence of the trigger rate on instantaneous luminosity during the 2012 data-taking period at the LHC are discussedFil: Aad, G.. Albert Ludwigs Universität; AlemaniaFil: Abajyan, T.. Universitaet Bonn; AlemaniaFil: Abbott, B.. University of Oklahoma; Estados UnidosFil: Abdallah, J.. Universitat Autònoma de Barcelona; EspañaFil: Abdel Khalek, S.. Universite Paris Sud; FranciaFil: Alconada Verzini, María Josefina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Alonso, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Anduaga, Xabier Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Dova, Maria Teresa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: González Silva, María Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Monticelli, Fernando Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Otero y Garzon, Gustavo Javier. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Piegaia, Ricardo Nestor. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Romeo, Gaston Leonardo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Tripiana, Martin Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física La Plata. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física La Plata; ArgentinaFil: Zhuang, X.. Ludwig Maximilians Universitat; AlemaniaFil: Zhuravlov, V.. Max-Planck Institut für Physik; AlemaniaFil: Zieminska, D.. Indiana University; Estados UnidosFil: Zimin, N. I.. Joint Institute for Nuclear Research; RusiaFil: Zimmermann, R.. Universitaet Bonn; AlemaniaFil: Zimmermann, S.. Universitaet Bonn; AlemaniaFil: Zimmermann, S.. Albert Ludwigs Universität; AlemaniaFil: Ziolkowski, M.. Universität Siegen; AlemaniaFil: Zitoun, R.. Université de Savoie; FranciaFil: Živković, L.. Columbia University; Estados UnidosFil: Zmouchko, V. V.. State Research Center Institute for High Energy Physics; RusiaFil: Zobernig, G.. University of Wisconsin; Estados UnidosFil: Zoccoli, A.. Università di Bologna; ItaliaFil: zur Nedden, M.. Humboldt University; AlemaniaFil: Zutshi, V.. Northern Illinois University; Estados Unido

Deamidation drives molecular aging of the SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding motif

The spike protein is the main protein component of the SARS-CoV-2 virion surface. The spike receptor-binding motif mediates recognition of the human angiotensin-converting enzyme 2 (hACE2) receptor, a critical step in infection, and is the preferential target for spikeneutralizing antibodies. Post-translational modifications of the spike receptor-binding motif have been shown to modulate viral infectivity and host immune response, but these modifications are still being explored. Here we studied asparagine deamidation of the spike protein, a spontaneous event that leads to the appearance of aspartic and isoaspartic residues, which affect both the protein backbone and its charge. We used computational prediction and biochemical experiments to identify five deamidation hotspots in the SARS-CoV-2 spike protein. Asparagine residues 481 and 501 in the receptor-binding motif deamidate with a half-life of 16.5 and 123 days at 37°C, respectively. Deamidation is significantly slowed at 4°C, indicating a strong dependence of spike protein molecular aging on environmental conditions. Deamidation of the spike receptor-binding motif decreases the equilibrium constant for binding to the hACE2 receptor more than 3.5-fold, yet its high conservation pattern suggests some positive effect on viral fitness. We propose a model for deamidation of the full SARS-CoV-2 virion illustrating how deamidation of the spike receptor-binding motif could lead to the accumulation on the virion surface of a nonnegligible chemically diverse spike population in a timescale of days. Our findings provide a potential mechanism for molecular aging of the spike protein with significant consequences for understanding virus infectivity and vaccine development.Fil: Lorenzo Lopez, Juan Ramiro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Defelipe, Lucas Alfredo. European Molecular Biology Laboratory; Alemania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Aliperti Car, Lucio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Niebling, Stephan. European Molecular Biology Laboratory; Alemania. Centre for Structural Systems Biology; AlemaniaFil: Custódio, Tânia F.. European Molecular Biology Laboratory; Alemania. Centre for Structural Systems Biology; AlemaniaFil: Löw, Christian. European Molecular Biology Laboratory; Alemania. Centre for Structural Systems Biology; AlemaniaFil: Schwarz, Jennifer J.. European Molecular Biology Laboratory; AlemaniaFil: Remans, Kim. European Molecular Biology Laboratory; AlemaniaFil: Craig, Patricio Oliver. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Otero, Lisandro Horacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Klinke, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: García Alai, María. European Molecular Biology Laboratory; Alemania. Centre for Structural Systems Biology; AlemaniaFil: Sánchez Miguel, Ignacio Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Alonso, Leonardo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Nanobiotecnología. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Nanobiotecnología; Argentin