Pathogenic variant profile in DNA damage response genes correlates with metastatic breast cancer progression-free survival in a Mexican-mestizo population

IntroductionMetastatic breast cancer causes the most breast cancer-related deaths around the world, especially in countries where breast cancer is detected late into its development. Genetic testing for cancer susceptibility started with the BRCA 1 and 2 genes. Still, recent research has shown that variations in other members of the DNA damage response (DDR) are also associated with elevated cancer risk, opening new opportunities for enhanced genetic testing strategies.MethodsWe sequenced BRCA1/2 and twelve other DDR genes from a Mexican-mestizo population of 40 metastatic breast cancer patients through semiconductor sequencing.ResultsOverall, we found 22 variants –9 of them reported for the first time– and a strikingly high proportion of variations in ARID1A. The presence of at least one variant in the ARID1A, BRCA1, BRCA2, or FANCA genes was associated with worse progression-free survival and overall survival in our patient cohort.DiscussionOur results reflected the unique characteristics of the Mexican-mestizo population as the proportion of variants we found differed from that of other global populations. Based on these findings, we suggest routine screening for variants in ARID1A along with BRCA1/2 in breast cancer patients from the Mexican-mestizo population

HypoxamiRs Profiling Identify miR-765 as a Regulator of the Early Stages of Vasculogenic Mimicry in SKOV3 Ovarian Cancer Cells

Vasculogenic mimicry (VM) is a novel cancer hallmark in which malignant cells develop matrix-associated 3D tubular networks with a lumen under hypoxia to supply nutrients needed for tumor growth. Recent studies showed that microRNAs (miRNAs) may have a role in VM regulation. In this study, we examined the relevance of hypoxia-regulated miRNAs (hypoxamiRs) in the early stages of VM formation. Data showed that after 48 h hypoxia and 12 h incubation on matrigel SKOV3 ovarian cancer cells undergo the formation of matrix-associated intercellular connections referred hereafter as 3D channels-like structures, which arose previous to the apparition of canonical tubular structures representative of VM. Comprehensive profiling of 754 mature miRNAs at the onset of hypoxia-induced 3D channels-like structures showed that 11 hypoxamiRs were modulated (FC>1.5; p < 0.05) in SKOV3 cells (9 downregulated and 2 upregulated). Bioinformatic analysis of the set of regulated miRNAs showed that they might impact cellular pathways related with tumorigenesis. Moreover, overall survival analysis in a cohort of ovarian cancer patients (n = 485) indicated that low miR-765, miR-193b, miR-148a and high miR-138 levels were associated with worst patients outcome. In particular, miR-765 was severely downregulated after hypoxia (FC < 32.02; p < 0.05), and predicted to target a number of protein-encoding genes involved in angiogenesis and VM. Functional assays showed that ectopic restoration of miR-765 in SKOV3 cells resulted in a significant inhibition of hypoxia-induced 3D channels-like formation that was associated with a reduced number of branch points and patterned tubular-like structures. Mechanistic studies confirmed that miR-765 decreased the levels of VEGFA, AKT1 and SRC-α transducers and exerted a negative regulation of VEGFA by specific binding to its 3‘UTR. Finally, overall survival analysis of a cohort of ovarian cancer patients (n = 1435) indicates that high levels of VEGFA, AKT1 and SRC-α and low miR-765 expression were associated with worst patients outcome. In conclusion, here we reported a novel hypoxamiRs signature which constitutes a molecular guide for further clinical and functional studies on the early stages of VM. Our data also suggested that miR-765 coordinates the formation of 3D channels-like structures through modulation of VEGFA/AKT1/SRC-α axis in SKOV3 ovarian cancer cells

La conquista del cráter. Historias. Revista de la Dirección de Estudios Históricos Num. 69 (2008) enero-abril

José Antonio Alzate, Gacetas de Literatura de México, reimpresas en la Oficina del Hospital de San Pedro, a cargo del ciudadano Miguel Buen Abad, Puebla, 1831, en Elías Trabulse, Historia de la Ciencia en México, siglo XVII, t. III, México, Conacyt/FCE, 1992, pp. 281-286.Alexander Von Humboldt, Aspects of Nature in Different Lands and Climates, with Scientific Elucidations, de 1850, citado en Gerard Helferich, Humbodt’s Cosmos, Nueva York, Gotham Books, 2004, p. 288.Alexander Von Humboldt, Cosmos: A Sketch of a Physical Description of the Universe, vol. V, Londres, Henry Bohn, 1858, p. 458.Alma Parra, “Perfiles empresariales extranjeros en la minería mexicana”, en Vetas, año III, enero-abril, 2001Robert Aguirre, Informal Empire, Mexico and Central America in Victorian Culture, Minneapolis/Londres, University of Minnesota Press, 2005, p. 59.El Popocatépetl, segundo volcán más elevado de México y situado al oriente de la capital del país, ha sido históricamente fuente de agua, nieve y azufre para la población, origen de manifestaciones religiosas y culturales desde épocas prehispánicas que le asociaron a deidades y objeto de imágenes literarias y artísticas que incluyen las más conocidas del Dr. Atl, y de Malcom Lowry en tiempos más recientes. Su exploración, ascenso y reconocimiento, convertidas también en otras formas de actividad recreativa no puede desprenderse de los afanes claramente científicos que guiaron las más serias y complicadas expediciones a esta cumbre

Textos para la historia de la minería en Guanajuato en el siglo XIX. Historias. Revista de la Dirección de Estudios Históricos. Num. 28 (1992) abril-septiembre

En 1884, Santiago Ramírez afirmaba en Noticia histórica de la riqueza minera de México que, a diferencia de otros estados, Guanajuato contaba con una gran cantidad de información acerca de su minería, ya que tanto estadistas como científicos e historiadores habían fijado su atención en ella. Poco más de cien años después nos encontramos con que son pocos los textos publicados que hayan recogido, como el trabajo de Ramírez, toda esa información. Así hasta la fecha, además de las escasas publicaciones realizadas en las últimas décadas, la fuente de información más completa la constituyen varias monografías publicadas a instancias de organismos gubernamentales relacionados con la minería en fechas tan distantes como 1888, 1922 y 1964. El gran mérito de estas obras es recoger e integrar gran cantidad de información tanto de tipo técnico como de carácter histórico que nos orientan en la reconsideración del tema. Debe mencionarse que la minería de Guanajuato también recibió atención en varios textos contemporáneos que han resultado de gran utilidad. Entre éstos está David Brading, cuyo trabajo contribuyó notablemente al conocimiento de la minería del estado de Guanajuato en su publicación de Mineros y comerciantes en el México borbónico. Aunque su estudio abarca parcialmente el periodo colonial, proporciona ciertas líneas que permiten orientar la investigación hacia el siglo XIX. Existen también algunos trabajos aislados y fragmentarios que tratan breves periodos de la historia minera de la entidad

Capitales, compañías y manías británicas en las minas mexicanas, 1824-1914. Historias. Revista de la Dirección de Estudios Históricos Num. 71 (2008) septiembre-diciembre

Alma Parra, “Perfiles empresariales extranjeros en la minería mexicana”, en Vetas, año III, núm. 7, enero-abril 2001.Jenks Leland, The Migration of British Capital to 1875, Londres, Nelson University Paperbacks, 1971, p. 5.María Eugenia Romero Sotelo, Minería y guerra. La economía de la Nueva España, 1810-1821, México, El Colegio de México/ UNAMHira de Gortari Rabiela, “La minería durante la guerra de Independencia y los primeros años del México independiente”, en Jaime Rodríguez (ed.), The Independence of Mexico and the Creation of a New Nation, Los Angeles, UCLA [Latin American Center Publications], 1989, pp. 129-162.Frank Griffifith Dawson, The First Latin American Debt Crisis. The City of London and the 1822-25 Loan Bubble, New Heaven/Londres, Yale University Press, 1990, p. 89.Henry English, A., General Guide to the Companies Formed for Working Foreign Mines, Londres, Boosey and Sons, 1825.R. Burt, John Taylor, Mining Entrepreneur and Engineer, 1779-1863, Buxton, Mitchell & Co./Stock-on-Trent, 1977. p. 9.Robert Blake, Disraeli, Nueva York, St. Martin Press, 1967, p. 25.The Correspondence of Henry Fox Talbot, U. Of Leicester & U. of Glasgow, Correspondence Hammersley & Co., y Talbot, 19 de abril 1922-5 marzo 1929.Benjamin Disraeli, An Inquiry into the Plans, Progress and Policy of the American Mining Companies, Londres, John Murray, 1825, p. 131.Alma Parra, “La conquista del cráter, el diario de viaje de dos mineros británicos al Popocatépetl”, en Historias, núm. 69, enero-abril, 2008, pp. 133-141.Alma Parra, “Control estatal vs. control privado. La casa de moneda de Guanajuato en el siglo xix”, en José Antonio Bátiz y José Enrique Covarrubias (coords.), La moneda en México, 1750-1920, México, Instituto Mora/El Colegio de México/UNAM, 1998The Economist, 23 de mayo de 1874, p. 633; The Times, 19 de julio de 1875. Luis N.D’Olwer, “Las inversiones extranjeras”, en Daniel Cosío Villegas, Historia moderna de México. El Porfiriato. La vida económica, vol. VII, t. II, pp. 1134-1135.Marvin Bernstein, The Mexican Mining Industry, 1890-1950, Nueva York, State University of Nueva York Press, 1964, pp. 51-65.Palmarejo Gold Fields, New Parral Co, London Mexican Syndicate, Gladys Proprietary Gold, Cherokee Mexican Gold, San Francisco del Oro.La minería latinoamericana constituyó durante el siglo XIX y las primeras décadas del XX una fuente atractiva e importante para la inversión extranjera, predominantemente británica, que propició que cientos de empresas se organizaran para operar en la región. En este marco, México, debido a su dotación de recursos mineros —en especial, aunque no únicamente, de plata—, fue el destino principal de esta inversión, tanto en número de empresas como en tamaño de los capitales. Este ensayo se centra en el análisis de las inversiones británicas en la minería mexicana en el periodo que va desde el arribo de las primeras empresas en la segunda década del siglo XIX, hasta la retirada de muchas de ellas a lo largo del siglo y finalmente debido al conflicto armado de la Revolución de 1910. Esto ha permitido, a diferencia de los estudios que hasta ahora se conocen, abarcar un periodo de casi un siglo para obtener una visión de más largo plazo, contribuyendo así a establecer un perfil más fiel de la posición británica como inversionista en México.This is a study of the British investments in Mexican mining since the second decade of the nineteenth century, when the first companies were established, until the beginnings of the twentieth century. It constitutes a first major effort to gather and organize quantitative and qualitative archive and bibliographical information which allows for an assessment of the impact of these investments in the long run. The central objective is to analyze the patterns and tendencies of investments at the time. It also provides a chronology which mirrors the international scenario, where London stands as the international financial leader and Mexico, thanks to its important endowments of mineral resources, as one of the most important silver producers.</p

El fundidor Williams en su trayecto hacia las minas mexicanas. Historias. Revista de la Dirección de Estudios Históricos Num. 82 (2012) mayo-agosto

Alejandro de Humboldt, Ensayo político sobre el reino de la Nueva España, México, Porrúa, 1984.Alma Parra y Paolo Riguzzi, “Capitales, compañías y manías británicas en las minas mexicanas”, en Historias, núm. 71, 2009; Alma Parra, “Perfiles empresariales extranjeros en la minería mexicana”, en Vetas, año III, núm. 7, enero-abril, 2001.H. G. Ward, Mexico in 1827, 2 vols., Londres, S. and R. Bentley, 1828.George Francis Lyon, Journal of a Residence and tour in the Republic of Mexico in the Year 1826 with some Accounts of the Mines of the Country, 2 vols., Londres, John Murray, 1828