“Tipificación molecular de Escherichia coli Enterotoxigénica, Enterohemorrágica y Enteroagregativa en Michoacán”

Las infecciones intestinales son la principal causa de muerte en niños de edad preescolar en México111, siendo Escherichia coli patógena el principal agente bacteriano causante de infecciones diarreicas. Sin embargo un alto porcentaje de estas cepas patógenas pasan inadvertidas como etiología de la diarrea infantil debido a la dificultad de diferenciarlas de las cepas de biota normal. Como una solución altamente específica y sensible a este problema, los ensayos de PCR permiten la identificación rápida y confiable de los distintos patotipos. Objetivos. Patotipificación molecular de Escherichia coli enterotoxigénica, enterohemorrágica y enteroagregativa. Materiales y Métodos. Se realizó la identificación bioquímica y resistencia a antibióticos de cepas de Escherichia coli, posteriormente se extrajo material genético de 100 aislados provenientes del Hospital Infantil de Morelia Eva Sámano de López Mateos y del Laboratorio Estatal de Salud Pública del Estado de Michoacán (LESP), se realizo PCR en tiempo real de dichas muestras buscando genes que codifican para factores de patogenicidad. Resultados. Se logro la identificación de 44% de muestras correspondientes a algún grupo patógeno, el 50% de estas fueron Escherichia coli enterotoxigénica (ETEC), el 41% corresponde a Escherichia coli enteroagregativa EAEC, mientras que para el caso de Escherichia coli enterohemorrágica (EHEC) no se encontró la presencia de ninguna cepa, el 9% restante corresponde a otros patotipos de Escherichia coli. También se encontró que las cepas aisladas presentan una considerable resistencia a los antibióticos de primera elección

Drug resistance phenotypes and genotypes in Mexico in representative gram-negative species: Results from the infivar network.

AimThis report presents phenotypic and genetic data on the prevalence and characteristics of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) and representative carbapenemases-producing Gram-negative species in Mexico.Material and methodsA total of 52 centers participated, 43 hospital-based laboratories and 9 external laboratories. The distribution of antimicrobial resistance data for Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae complex, Acinetobacter baumannii complex, and Pseudomonas aeruginosa in selected clinical specimens from January 1 to March 31, 2020 was analyzed using the WHONET 5.6 platform. The following clinical isolates recovered from selected specimens were included: carbapenem-resistant Enterobacteriaceae, ESBL or carbapenem-resistant E. coli, and K. pneumoniae, carbapenem-resistant A. baumannii complex, and P. aeruginosa. Strains were genotyped to detect ESBL and/or carbapenemase-encoding genes.ResultsAmong blood isolates, A. baumannii complex showed more than 68% resistance for all antibiotics tested, and among Enterobacteria, E. cloacae complex showed higher resistance to carbapenems. A. baumannii complex showed a higher resistance pattern for respiratory specimens, with only amikacin having a resistance lower than 70%. Among K. pneumoniae isolates, blaTEM, blaSHV, and blaCTX were detected in 68.79%, 72.3%, and 91.9% of isolates, respectively. Among E. coli isolates, blaTEM, blaSHV, and blaCTX were detected in 20.8%, 4.53%, and 85.7% isolates, respectively. For both species, the most frequent genotype was blaCTX-M-15. Among Enterobacteriaceae, the most frequently detected carbapenemase-encoding gene was blaNDM-1 (81.5%), followed by blaOXA-232 (14.8%) and blaoxa-181(7.4%), in A. baumannii was blaOXA-24 (76%) and in P. aeruginosa, was blaIMP (25.3%), followed by blaGES and blaVIM (13.1% each).ConclusionOur study reports that NDM-1 is the most frequent carbapenemase-encoding gene in Mexico in Enterobacteriaceae with the circulation of the oxacillinase genes 181 and 232. KPC, in contrast to other countries in Latin America and the USA, is a rare occurrence. Additionally, a high circulation of ESBL blaCTX-M-15 exists in both E. coli and K. pneumoniae