Antimicrob Agents Chemother

A strain of the opportunistic pathogenic yeast was genetically modified for use as a cellular model for assessing by allele replacement the impact of lanosterol C14α-demethylase mutations on azole resistance. was chosen because it is susceptible to azole antifungals, it belongs to the CTG clade of yeast, which includes most of the species pathogenic for humans, and it is haploid and easily amenable to genetic transformation and molecular modeling. In this work, allelic replacement is targeted at the locus by the reconstitution of a functional auxotrophic marker in the 3' intergenic region of Homologous and heterologous alleles are expressed from the resident promoter of , allowing accurate comparison of the phenotypic change in azole susceptibility. As a proof of concept, we successfully expressed in different alleles, either bearing or not bearing mutations retrieved from a clinical context, from two phylogenetically distant yeasts, and constitutes a high-fidelity expression system, giving specific Erg11p-dependent fluconazole MICs very close to those observed with the donor strain. This work led us to characterize the phenotypic effect of two kinds of mutation: mutation conferring decreased fluconazole susceptibility in a species-specific manner and mutation conferring fluconazole resistance in several yeast species. In particular, a missense mutation affecting amino acid K143 of Erg11p in species, and the equivalent position K151 in , plays a critical role in fluconazole resistance

Toxoplasmosis in transplant recipients, Europe, 2010-2014

Transplantation activity is increasing, leading to a growing number of patients at risk for toxoplasmosis. We reviewed toxoplasmosis prevention practices, prevalence, and outcomes for hematopoietic stem cell transplant (HSCT) and solid organ transplant (SOT; heart, kidney, or liver) patients in Europe. We collected electronic data on the transplant population and prevention guidelines/regulations and clinical data on toxoplasmosis cases diagnosed during 2010-2014. Serologic pretransplant screening of allo-hematopoietic stem cell donors was performed in 80% of countries, screening of organ donors in 100%. SOT recipients were systematically screened in 6 countries. Targeted anti-Toxoplasma chemoprophylaxis was heterogeneous. A total of 87 toxoplasmosis cases were recorded (58 allo-HSCTs, 29 SOTs). The 6-month survival rate was lower among Toxoplasma-seropositive recipients and among allo-hematopoietic stem cell and liver recipients. Chemoprophylaxis improved outcomes for SOT recipients. Toxoplasmosis remains associated with high mortality rates among transplant recipients. Guidelines are urgently needed to standardize prophylactic regimens and optimize patient management

Role de la b-oxydation des acides gras dans la virulence des Candida non Albicans (caractérisation fonctionnelle de deux gènes impliqués dans le métabolisme peroxysomal chez Candida Lusitaniae)

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Antifongiques : cibles cellulaires et mécanismes de résistance

Les antifongiques systémiques utilisés pour traiter les infections fongiques disséminées ou profondes se répartissent en quatre familles chimiques principales et possèdent globalement trois cibles cellulaires chez le champignon : les pyrimidines fluorées agissent sur la réplication de l'acide désoxyribonucléique (ADN) et la synthèse des protéines ; les polyènes et les azolés ont pour cible l'ergostérol et sa voie de biosynthèse ; les lipopeptides inhibent la biosynthèse de glucanes pariétaux. Les mécanismes de résistance mis en place par certaines souches de champignons sont maintenant mieux connus, en particulier chez les levures du genre Candida. Dans la majorité des cas, ces mécanismes reposent soit sur des mutations qui ont pour effet de modifier la cible de l'antifongique ou d'en bloquer l'accès, soit sur la surexpression de gènes codant pour la cible ou pour des transporteurs membranaires impliqués dans un rejet actif de l'antifongique

Protocole n1902 Mucofong ("évaluation et prise en charge du risque fongique chez le patient atteint de mucoviscidose en France : étude multicentrique prospective")

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[Antifungals cellular targets and mechanisms of resistance]

International audienceAntifungals of systemic use for the treatment of invasive fungal infections belong to four main chemical families which have globally three cellular targets in fungal cells: fluorinated pyrimidines act on deoxyribonucleic acid (DNA) replication and protein synthesis; polyenes and azoles are toxic for ergosterol and its biosynthetic pathway; lipopeptides inhibit the synthesis of cell wall beta glucans. The resistance mechanisms that are developed by some fungi begin to be well understood particularly in Candida yeasts. The underlying bases of these mechanisms are either mutations that modify the antifungal target, or that block access to the target, and, on the other hand, the overexpression of genes encoding the target, or some membrane proteins involved in the active efflux of antifungal drugs

Intérêts de la détection de pneumocystis jiroveci par PCR en temps réel chez les patients immunodéprimés non infectés par le VIH (enquête rétrospective de 2006 à 2009 au CHU de Bordeaux, cas particulier de la réanimation médicale)

Pneumocystis jiroveci (Pj) est un agent fongique ubiquitaire opportuniste se développant dans les poumons des patients immunodéprimés. Rétrospectivement de 2006 à 2009 tous les patients hospitalisés au CHU de Bordeaux ayant bénéficié d'un prélèvement respiratoire avec recherche de Pj (2126) ont été identifiés. Les données cliniques, radiologiques et biologiques des patients avec un examen direct négatif et une PCRj positive ont été analysées. 65 patients dans la population générale et 36 en réanimation ont été inclus. 91 % étaient non VIH, 47 % présentaient une hémopathie, 25 % une tumeur solide, 23 % une maladie systémique et 30 % une pathologie respiratoire chronique. 70 % recevaient un traitement immunosuppresseur. La PCR ciblant le gène de la b-tubuline est aussi sensible sur LBA (64 %) que sur crachats et aspirations (36 %) avec, dans la population générale, un cycle seuil (Ct) de PCR plus bas sur les prélèvements non invasifs (30 vs 34 ; p = 0,04). Dans la population générale, 67,7 % des patients ont été définis comme INFECTES (au moins 2 signes cliniques et un infiltrat radiologique) et présentaient un Ct inférieur (31 vs 34,8 ; p = 0,03). 88 % d'entre eux ont été traités et 20 % sont décédés. Les patients de réanimation se distinguaient par un taux de CD4 plus bas. Ils ont été moins souvent traités (p = 0,02), la mortalité globale à J30 était de 52,8 % (p <0,001) et le Ct chez les décédés plus élevé (34,5 vs 32,5). Les INFECTES (58,3 %) avaient reçu plus souvent une corticothérapie au long cours (p = 0,03) et le Ct de 33 était identique à celui des non infectés. Sur 6 mois, la recherche systématique de Pj n'a pas montré de circulation du micro-organisme. Chez les patients immunodéprimés non infectés par le VIH, la PCR est corrélée aux signes cliniques et radiologiques de pneumocytose pulmonaire. Sa sensibilité est équivalente dans les crachats et les LBA. En réanimation, plus qu'ailleurs, il semble important de considérer un traitement curatif dès que la PCR est positive.BORDEAUX2-BU Santé (330632101) / SudocSudocFranceF

Candidoses invasives (épidémiologie des candidémies au CHU de Bordeaux de 2005 à 2008 et étude de l'expression du facteur d'élongation TEF3 chez Candida Lusitaniae)

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Détection et différenciation d'Entamoeba Histolytica et d'Entamoeba Dispar dans les selles par une technique de PCR

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