An?lisis de variabilidad gen?tica en Moniliophthora roreri con AP-PCR y RAPD en Antioquia, Colombia

6 ilus. 8 tab. 39 ref

Caracterización genética del patosistema Phytophthora infestans Solanum tuberosum y su relación con polimorfismos moleculares (fase II)

IP 1118-12-154-99v.1. Informe tecnico final -- v.2. Late blight: managing the global threat/ Lizarraga Charlotte.de la resistencia al tizon tardio y compatibilidad al patogenoPhytophthora infestans de gentoios de la;coleccion central colombiana de papa. / J.L. Zapata, Ofelia Trillos. -- En: Congreso Ascolfi. (21 : 2000,;ago.30-sep.1 : Palmira) -- [s.l.] : Ascolfi, 2000 -- p. 46--Razas Fisiologicas y tipo de apareamiento de;Phytophthora infestans (Mont.) de Barry en diferentes pisos termicos y hospedantes, en el oriente antioqueño.;/ S. Jaramillo, J. Zapata. -- En: Congreso Ascolfi. (21 :2000,ago.30-sep.1 : Palmira) -- s.l : Ascolfi, 2000;cm.;PONENCIA(S) EN CONGRESO: Caracterizacion del hongo Phytophthorainfestansen Colombia / Sonia Jaramillo V.;on Phytophthora infestans in Colombia: Host-Pathogen Coevolutionin the Andean Mountains / J.G. Morales ...;[et al.] -- En: Late blight: managing the global threat. Proceedings of the Global Initiative on Late Blight;Conference, 11-13 July 2002, Hamburg, Germany / Gilb'02 Conference Late Blight Managing the Global Threat ;editor Charlotte Lizarraga (2002 Jul. 11-13 : Hamburg, Germany).'-- Hamburg : 181-- p. ; 28 cm. -- Evaluacion;... [et al.] -- p. 46-47. -- En: La Biotecnologia en el desarrollo del pais / Congreso colombiano de;Biotecnologia (1 : 2002 jun. 26-28 : Bogotá) -- Bogotá : Universidad Nacional de Colombia, 2002. ; 28 cm. --;Caracterizacion de aislamientos de Phytophthora infestansportecnicas basadas en pcr y por resistencia a;fungicidas en Colombia / Jaramillo S. ... [et al.] -- En:Memorias ALAP /Congreso de la asociacion;latinoamericana de la papa. (19 : 2000 feb. 28 - mar. 3 :Ciudadde la Habana) -- Ciudad de la Habana, Cuba,;2000. -- p. ; 28 cm. -- Evaluacion de aislamientos colombianosde Phytophthora infestans por tipo de;apareamiento / Jaramillo S., Gilchrist, E., Afanador, L. -'- p.48. -- En:Nuevas tendencias en Fitopatologia /;Congreso ASCOLFI (23 : 2002 jul. : Bogotá). -- Bogotá : Universidad Nacional de Colombia, 2002. -- p. ; 28 cm.;'-- evaluacion de La diversidad genetica y patogenica de Las poblaciones del hongo Phytophthora infestans;(Mont.) de Bary en Antioquia / Gilchrist, E. ... [et al.]'-- en:Salud publica para los vegetales / Congreso;de la asociacion colombiana de fitopatologia y ciencias afines.(22 : 2001jul. 11-13 : Medellin). -- Medellin;: Universidad Nacional de Colombia, 2001. -- p. ; 28 cm. -'- Razas fisiologicas y tipo de apareamiento de;Phytophthora infestans (Mont.) de Bary en diferentes pisostermicos y hospedantes en el oriente antioqueño /;Marin M. ... [et al.] -- En: Patologia de la postcosecha en flores, frutales, hortalizas, semillas, raices y;tuberculos / Congreso de la asociacion colombiana de fitopatologia y ciencias afines. (21 : 2000 ago. 30 -;sep. 1 : Palmira) -- Palmira : Centro internacional de agricultura tropical, 2000. -- p. ; 28 cm. -- Researc

Diversidade fenotípica e patogênica de Colletotrichum, agente causal da antracnose em mangueira, e identificação de espécie

O presente trabalho teve como objetivo estudar a diversidade fenotípica e patogênica de 40 isolados de Colletotrichum obtidos de mangueira no Nordeste do Brasil e identificar diferentes espécies desse fitopatógeno, agente causal de antracnose, através da análise da seqüência da região ITS do rDNA. Quanto à caracterização morfológica e cultural, as colônias dos isolados apresentaram diversidade em relação à cor e aspecto, sendo mais comum à cor branco-cinza, característica de Colletotrichum gloeosporioides. Não foram observadas variações expressivas na morfologia dos 40 isolados. Os conídios apresentaram-se, predominantemente, hialinos e unicelulares, com formato variando de bastonete para cilíndrico. Todos os isolados produziram apressórios variados em formato e quantidade e apenas 10 isolados apresentaram setas. Para efeito do crescimento micelial e taxa de crescimento foi possível classificar os isolados em sete grupos. Vinte e dois isolados exibiram taxa de crescimento >10mm/dia, considerada típica da espécie C. gloeosporioides. Os isolados foram patogênicos em folhas destacadas de mangueira, induzindo sintomas de antracnose, na forma de manchas escuras levemente deprimidas, e apresentando variações quanto à agressividade. Na identificação específica, baseada na análise da seqüência ITS do DNA ribossomal, 36 isolados amplificaram com o oligonucleotídeos CgInt, específico para C. gloeosporioides e o ITS4, Os isolados CM1, CM4, CM5 e CM10, não amplificaram produtos para nenhum dos oligonucleotídeos específicos, sendo identificados como Colletotrichum spp. Os resultados desse trabalho demonstraram que isolados de Colletotrichum, obtidos de mangueira, apresentam ampla variabilidade morfofisiológica e patogênica. E que, possivelmente, existe mais de uma espécie de Colletotrichum que causa antracnose em mangueira no Nordeste do Brasil

Domain II hairpin structure in ITS1 sequences as an aid in differentiating recently evolved animal and plant pathogenic fungi

The hypothesis that ITS structural features can be used to define fungal groups, where sequence analysis is unsatisfactory, was examined in plant and animal pathogenic fungi. Structural models of ITS1 regions were predicted for presumed closely related species in Colletotrichum and Trichophyton anamorphs of Arthroderma species. Structural alignment of models and comparison with ITS sequence analysis identified a variable region in a conserved hairpin formed from a common inverted repeat. Thirteen different hairpin structure models were obtained for Colletotrichum species and five different models were obtained for Trichophyton species. The different structure types could be matched to individual species and species complexes as defined by ITS sequence analysis

<title language="por">Amplification of the cap20 pathogenicity gene and genetic characterization using different markers molecular in Colletotrichum gloeosporioides isolates

Studies were performed to analyze the genetic characterization using RFLP-ITS and Intron (primer EI1) markers and the amplification of the cap20 pathogenicity gene by PCR in Colletotrichum gloeosporioides isolates of different hosts plant. The genetic variability was accessed using RFLP-ITS and Intron markers and grouping by UPGMA method. Primers to cap20 gene were constructed using selected sequences of the GenBank (National Center of Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) with the Primer 3 program. The dendrograms analysis showed that the RFLP-ITS marker was more informative to separate the Colletotrichum sp, and that primer EI1 demonstrated greater genetic diversity. The amplification of the DNA of the Colletotrichum isolates to the cap20 gene with primers P1 and P2 indicated that this gene could present variations into C. gloeosporioides related with the host, and also that it was present in other Colletotrichum sp.<br>Estudos foram realizados para analisar a caracterização genética usando marcadores de RFLP-ITS e ISSP e a amplicação do gene de patogenicidade cap20 por PCR em isolados de Colletotrichum gloeosporioides de diferentes hospedeiros. Primers para o gene cap20 foram construídos a partir de seqüências selecionadas do GenBank (National Center of Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) com o programa Primer 3. A análise dos dendrogramas revelou que o marcador RFLP-ITS foi mais informativo em separar as espécies de Colletotrichum, e que o primer EI1 evidenciou maior diversidade genética. A amplificação do DNA dos isolados de Colletotrichum para o gene cap20 com os primers P1 e P2 indicou que este gene pode apresentar variações dentro de C. gloeosporioides relacionada ao hospedeiro, e que também está presente em outras espécies de Colletotrichum