The role of miRNA genes participating in VHL-HIF1α in clear cell renal cell carcinoma

Introduction. Much attention in ccRCC development is paid to VHL-HIF1α pathway genes. Numerous genes involved in the pathogenesis of ccRCC are targets for miRNA. Alteration in the nature of interaction with miRNA binding site as a result of a single nucleotide substitution may promote change the expression of target genes involved in the genesis and development of tumors.Purpose of research. Analysis of the role of polymorphic variants in the miRNA binding sites of the VHL-HIF1α gene pathways in ccRCC development.Materials and methods. We used 225 DNA samples isolated from the venous blood of ccRCC patients who are hospitalized to the Clinic of the Bashkir State Medical University, and 298 healthy individuals. The genotyping of miRNA binding site polymorphisms in VHL-HIFα-dependent pathway genes (rs10982724 of the DEC1 gene, rs406271 of the TFRC gene, rs10491534 of the TSC1 gene, rs1642742 of the VHL gene, rs3025033 of the VEGFA gene) was performed using Taq-man assays.Results. The frequency distribution of alleles and genotypes of rs1642742 of the VHL gene showed that rs1642742 *GG is a marker of the increased risk for ccRCC. In addition, rs10491534 * C allele was found to be the marker for severe ccRCC (p = 0.044; OR = 1.72 (CI = 1.012-2.911)), and rs10491534 * TT genotype (p = 0.044; OR = 0.55; (95% CI = 0.31–0.98)) of the TSC1 gene was shown to be a protective marker for ccRCC of severe duration.Conclusions. The study indicated the association of miRNA binding sites polymorphisms with the risk of ccRCC development and severity of disease. However, further studies of the genes are needed to establish their functional significance and role in the pathogenesis of ccRCC

Targeted next-generation sequencing of 21 candidate genes in hereditary ovarian cancer patients from the Republic of Bashkortostan

Abstract About 5–10% of all ovarian cancer cases show familial clustering, and some 15–25% of familial ovarian cancer cases are mediated by high-penetrance mutations in the BRCA1 and BRCA2 genes. Only few other genes have been identified for familial ovarian cancer. We conducted targeted next-generation sequencing of the protein coding region of 21 candidate genes, including UTR regions, in genomic DNA samples of 48 patients with familial ovarian cancer from the Republic of Bashkortostan. We identified deleterious variants in BRCA1, BRCA2, CHEK2, MSH6 and NBN in a total of 16 patients (33%). The NBN truncating variant, p.W143X, had not previously been reported. Seven patients (15%) were carriers of the c.5266dupC variant in BRCA1, supporting a Russian origin of this founder allele. An additional 15 variants of uncertain clinical significance were observed. We conclude that our gene panel explains about one-third of familial ovarian cancer risk in the Republic of Bashkortostan

Психогенетика пространственных способностей человека

Introduction. This scientific review aims to understand the etiology of human spatial abilities. Spatial thinking is a complex combination of cognitive abilities related to recognizing, transforming, and storing information about objects and predicting the transformation of interactions among them under the influence of other factors. In this work we tend to provide the most complete description of spatial abilities as a specific type of mental activity that underlies practical and theoretical problem-solving in the framework of psychology and genetics to emphasize the importance of synthesizing the experimental data and psychological foundations of spatial intelligence. Theoretical Basis. This review presents the results of genetically informative studies of human spatial abilities. Since the ability to orientate in space is an integral characteristic of all living organisms, spatial abilities are of evolutionary and adaptive importance. In cognitive psychology, spatial skills are understood as the ability to operate with mental spatial images, schemes, and models of reality. Moreover, these abilities vary widely among individuals. The analysis of the etiology of these individual differences showed a significant contribution (69 %) of hereditary factors in the formation of spatial abilities. The results of twin studies indicate the need for searching specific polymorphic variants in genes involved in the development of spatial skills. Large-scale longitudinal studies have shown that spatial abilities are a reliable predictor of individuals’ achievements in science, technology, engineering, and mathematics (STEM). Therefore, studying their molecular-genetic mechanisms merits special attention. Results and Discussion. Various experimental studies on the psychogenetics of human spatial abilities first reported very interesting findings confirming their hereditary nature. Thus, spatial intelligence is a moderately heritable trait, which development involves a wide range of genetic factors causing the activation of various signaling pathways of the metabolism of the human organism.Введение. Представленный научный обзор направлен на понимание этиологии пространственных способностей человека. Пространственное мышление – сложный комплекс когнитивных способностей, позволяющих распознавать, преобразовывать и сохранять информацию об объектах, прогнозировать трансформацию взаимодействий между ними под влиянием прочих факторов. Настоящая работа направлена на получение наиболее полного описания пространственных способностей как специфического вида умственной деятельности, лежащего в основе выполнения практических и теоретических задач, решаемых индивидом, с позиции психологии и генетики, чтобы подчеркнуть важность синтеза накопленных экспериментальных данных и психологических основ пространственного интеллекта в общем. Теоретическое обоснование. Представлен обзор результатов генетически информативных исследований пространственных способностей человека. Так как умение ориентироваться в пространстве является неотъемлемой чертой всех живых организмов, пространственные способности имеют эволюционно-адаптивное значение и также важны для индивида. В когнитивной психологии под пространственными навыками понимаются способности оперировать мысленными пространственными образами, схемами, моделями реальности, причем эти способности существенно различаются между людьми. Анализ этиологии этих индивидуальных различий выявил значительный вклад (69 %) наследственных факторов в формирование пространственных способностей. Результаты близнецовых исследований ставят задачу поиска конкретных полиморфных вариантов в генах, вовлеченных в развитие пространственных навыков. В целом ряде масштабных лонгитюдных исследований показано, что пространственные способности являются надежным предиктором достижений человека в области естественных наук, технологий, инженерии и математики (STEM), поэтому изучение их молекулярно-генетических механизмов представляется важной и актуальной задачей. Результаты и их обсуждение. В ходе проведения различного рода экспериментальных работ по психогенетике пространственных способностей человека были впервые получены весьма интересные данные, подтверждающие их наследственную природу. Выявлено, что пространственный интеллект является умеренно наследуемым признаком, в развитии которого задействован широкий спектр генетических факторов, обуславливающих активацию различных сигнальных путей метаболизма организма человека