Finishing the euchromatic sequence of the human genome

The sequence of the human genome encodes the genetic instructions for human physiology, as well as rich information about human evolution. In 2001, the International Human Genome Sequencing Consortium reported a draft sequence of the euchromatic portion of the human genome. Since then, the international collaboration has worked to convert this draft into a genome sequence with high accuracy and nearly complete coverage. Here, we report the result of this finishing process. The current genome sequence (Build 35) contains 2.85 billion nucleotides interrupted by only 341 gaps. It covers ∼99% of the euchromatic genome and is accurate to an error rate of ∼1 event per 100,000 bases. Many of the remaining euchromatic gaps are associated with segmental duplications and will require focused work with new methods. The near-complete sequence, the first for a vertebrate, greatly improves the precision of biological analyses of the human genome including studies of gene number, birth and death. Notably, the human enome seems to encode only 20,000-25,000 protein-coding genes. The genome sequence reported here should serve as a firm foundation for biomedical research in the decades ahead

Centralized Rescheduling Approach against Autonomous Control Approach in Dynamic Flexible Flow Shop in the Presence of Machine Breakdowns

Summary: In the current paper, we study the concept of dynamic scheduling in flexible flow Shop with limited carrier under stochastic machine breakdowns and processing time. In most flexible flow shop scheduling methods reported in the literature consider a determinist environment, where all data of the problem are known in advance. Most of these works focused on the development of methods to produce a feasible schedule of good quality in short time computing. However, real systems are stochastic and dynamic such that the initial generated schedule must deal with the presence of a variety of unexpected disruptions that may occur dynamically and cause deviations from the initial schedule. To cope with machine breakdowns and stochastic processing time, a centralized heuristic based on local search simulated annealing algorithm is used to implement the reactive scheduling for the dynamic scheduling problem. This centralized heuristic method will be compared with a decentralized autonomous approach. In order to evaluate the performance of the both developed approaches two performance measures, namely the average flow time and the makespan, were be used. Keywords: Meta-Heuristic, Autonomous Control, Flexible Flow Shop Scheduling, Simulation. General In recent years, scheduling problems have become the subjects of many studies about tasks allocation. Depending on availability of jobs prior to a schedule creation, scheduling systems can be classified into static and dynamic ones. In static scheduling, all jobs' specifications are identified before creating the respective schedule and the production sequence does not change during processing. In dynamic scheduling, dynamic events like random job arrivals and machine breakdowns can be appeared, so that they affect the normal execution of the initially generated schedule. Therefore, a rescheduling is necessary to adapt the predefined schedule Dynamic Scheduling Dynamic scheduling in conventional centralized approach The problem of dealing with uncertainty and stochastic events is addressed in literature by dynamic scheduling. Three general approaches of scheduling in consideration o

Numerical Model Related to Impact Fluid / Solid Under the action of an Electric Field

The electrowetting is an area of significant interest. Many experimental studies have been conducted to find the relationship that binds the physical parameters of said phenomenon: the percentage of the white area inside the pixels of different sizes depending on the applied voltage etc. Our study is to develop a CFD model to validate the experimental results for the behavior of fluids (oil colored) within the reflector screens under the action of electric field

Impact du rejet des eaux usées sur la qualité microbiologique des plages de la baie d'agadir (Maroc)

Le milieu marin joue un rôle socio-économique de grande importance dans la région d'Agadir (sud-ouest du Maroc) mais il est le siège de plusieurs sources de pollution. L'objectif de ce travail est d'étudier l'impact du rejet des eaux usées sur la qualité microbiologique des plages dans ce secteur. Des échantillons d'eau de mer et de sable ont été prélevés entre avril et octobre 1997 sur quatre plages de la baie d'Agadir (Agadir, Amadil, Anza et Taghazout) afin d'y rechercher les concentrations en coliformes (CF) et en streptocoques fécaux (SF). Sur les plages Agadir, Amadil et Taghazout, les concentrations moyennes de ces bactéries dans l'eau de mer sont respectivement de 12,7 CF et de 7,5 SF/100 ml pour le premier site, de 26,0 CF et de 5,5 SF/100 ml pour le second, et de 30,0 CF et de 10,7 SF/100 ml pour le troisième. En revanche, sur la plage d'Anza, les concentrations moyennes sont de 8.104 CF et de 7,9.103 SF/100 ml : ces valeurs très élevées peuvent s'expliquer par la présence de plusieurs émissaires d'eaux usées au voisinage immédiat de cette plage. Malgré de légères variations dans les concentrations des CF et SF, les résultats relatifs au sable sont similaires à ceux obtenus avec l'eau de mer. Les valeurs des CF et des SF dans les quatre sites ont été traitées par une méthode de probabilité lognormale afin de déterminer les paramètres de qualité suivants : CF80, CF95 et SF90. Ces dernières valeurs sont au-dessous des normes européennes guides, ce qui permet de classer les plages Agadir, Amadil et Taghazout dans la catégorie A (bonne qualité des eaux pour la baignade). Même si les valeurs obtenues correspondent à des échantillons prélevés lors de la haute saison touristique, il est nécessaire de renouveler chaque année ce type de prélèvement afin de suivre l'évolution de la pollution dans la baie d'Agadir

Évaluation de la contamination métallique dans deux lagunes marocaines: Khnifiss et Oualidia

L’objectif de la présente étude est d’évaluer la contamination métallique dans deux lagunes marocaines : Oualidia (située au centre du Maroc, dans une zone très urbanisée et industrialisée) et Khnifiss (située au sud du Royaume et loin de toute influence anthropique). Pour ce faire, les concentrations des métaux traces sont mesurées mensuellement durant un cycle annuel (décembre 2004 - janvier 2006) dans le sédiment des deux lagunes et chez Nereis diversicolor, annélide détritivore vivant dans le sédiment. La comparaison des teneurs métalliques dans le sédiment des deux écosystèmes lagunaires montre des niveaux relativement élevés en Ag, Cd et Zn dans la lagune de Oualidia. Ces teneurs sont probablement consécutives aux rejets urbains et industriels auxquels s’ajoutent ceux provenant des usines de transformation du minerai de phosphate (Safi et Jorf Lasfar situés respectivement au sud et au nord de ce site). Les teneurs des métaux analysées chez Nereis diversicolor montrent des variations saisonnières. Elles sont généralement élevées en hiver et au printemps ; ceci est probablement en relation avec le cycle de reproduction de l’animal. Concernant la comparaison des teneurs en métaux traces chez les annélides des deux lagunes, les concentrations chez les animaux à Khnifiss semblent plus élevées, suggérant une plus grande biodisponibilité de ces éléments dans cet écosystème peu contaminé

The reliability of fusible gates in ice-affected environments

Studies have recently been conducted in Canada and Russia to test the behaviour of Hydroplus fusegates in extreme winter conditions. This paper presents the scope of this research, and summarizes the main results of the model tests at both laboratories.Peer reviewed: YesNRC publication: Ye