파노라마 영상에서 측두하악관절 골관절염 진단을 위한 인공지능 연구

학위논문(박사) -- 서울대학교대학원 : 치과대학 치의과학과, 2021.8. 박희경.Orthopantomogram (OPG) is important for primary diagnosis of temporomandibular joint osteoarthritis (TMJ OA), because of cost and the radiation associated with computed tomograms (CT). The aims of this study were to develop an artificial intelligence (AI) model and compare its TMJ OA diagnostic performance from OPGs with that of an oromaxillofacial radiology (OMFR) expert. An AI model was developed using Karas’ ResNet model and trained to classify images into three categories: normal, indeterminate OA, and definite OA. This study included 1,189 OPG images confirmed by cone-beam CT (CBCT) and evaluated the results by model (accuracy, precision, recall, and F1 score) and diagnostic performance (accuracy, sensitivity, and specificity). The model performance was unsatisfying when AI was developed with 3 categories. After the indeterminate OA images were reclassified as normal, OA, or omission, the AI diagnosed TMJ OA in a similar manner to an expert and was in most accord with CBCT when the indeterminate OA category was omitted (accuracy: 0.78, sensitivity: 0.73, and specificity: 0.82). Our deep learning model showed a sensitivity equivalent to that of an expert, with a better balance between sensitivity and specificity, which implies that AI can play an important role in primary diagnosis of TMJ OA from OPGs in most general practice clinics where OMFR experts or CT are not available.파노라마 영상은 측두하악관절 골관절염의 일차 진단에서 일반적으로 사용된다. 본 연구의 목적은 파노라마 영상을 이용하여 측두하악관절 골관절염을 진단하는 인공지능 모델을 개발하고, 그 진단 성능을 영상치의학 전문가와 비교하는 것이다. Karas’ResNet 모델을 사용하여 인공지능 모델을 개발하였다. 파노라마 영상을 no osteoarthritis, indeterminate osteoarthritis 및 definite osteoarthritis의 세 가지 범주로 분류하도록 훈련했다. 본 연구는 cone beam CT로 확인된 1,189개의 파노라마 영상을 포함하고 있으며, 모델 성능(정확도, 정밀도, 재현율 및 F1 score) 및 진단 성능(정확도, 민감도 및 특이도)을 평가했다. 인공지능 모델이 세 가지 범주를 가지고 개발되었을 때, 측두하악관절 골관절염 진단 모델의 정확도, 정밀도, 재현율, F1 score는 각각 0.51, 0.55, 0.51, 0.53의 결과값을 나타냈다. 따라서 Indeterminate for osteoarthritis 영상을 no osteoarthritis(Trial 1), osteoarthritis(Trial 2) 및 생략(Trial 3)으로 재분류하여 평가하였다. Trial 3의 경우 인공지능 모델의 정확도, 민감도, 특이도는 각각 0.78, 0.73, 0.82 였으며, 영상치의학 전문가는 각각 0.85, 0.72, 0.97이었다. 또한 McNemar's test를 이용하여 인공지능 모델과 CBCT 결과를 비교한 결과 통계적으로 유의한 차이를 보이지 않았다(p value = 0.366). 본 연구의 인공지능 모델은 측두하악관절 골관절염 진단에 있어서 전문가에 상응하는 민감도와 특이도를 보인다. 이는 영상 치의학전문의가 부재하거나 CT 촬영이 불가능한 상황에서 파노라마 영상을 기반으로 측두하악관절 골관절염의 일차 진단이 이뤄질 때, 인공지능이 중요한 역할을 할 수 있다는 것을 보여준다.I. INTRODUCTION 4 II. REVIEW OF LITERATURE 6 III. MATERIALS AND METHODS 14 IV. RESULTS 20 V. DISCUSSION 22 VI. CONCLUSIONS 30 REFERENCES 31 TABLES 41 FIGURES 47 KOREAN ABSTRACT 52박

시공간을 초월하는 바다로 나아가다: 셰익스피어의 <페리클레스> 공연평

윌리엄 셰익스피어의 1607년작 『페리클레스』(Pericles)의 초기 공연사 기록은 당대에 이 극이 가졌던 폭발적인 대중성을 입증한다.1) 비록 오늘날 셰익스피어의 4대 로맨스를 이루는 다른 작품들[『태풍』(The Tempest), 『겨울이야기』(The Winters Tale), 『심벌린』 (Cymbeline)]에 비해 비교적 덜 알려져 있기는 하나, 『페리클레스』는 엘리자베스-제임스 조 시대에 『리처드 3세』, 『로미오와 줄리엣』, 『햄릿』 등과 함께 가장 인기 있는 셰익스피 어 레퍼토리(Dunton-Downer 403)에 포함되었었다. 또한 이는 크롬웰의 청교도 정권 하에서 폐쇄됐던 극장이 20년 뒤 왕정복고기에 재 개장되었을 때, 가장 먼저 공연된 셰 익스피어 극 작품 중의 하나(Tompkins 315)였으나 18~20세기 동안 긴 공백기를 가지 고 최근에야 재조명을 받은 비운의 극이기도 하다. 『페리클레스』는 최근에야 비로소 한 국 초연의 빛을 보게 되었는데, 바로 근 20년 동안 셰익스피어 극을 전문으로 해온 극 단 화동 연우회가 2010년 12월 4일에서 12월 12일까지 이를 공연하였다. 이인수·박준 근 각색, 김광림 연출의 는 로맨스적 판타지와 사회비판적 사실주의의 결 합이라는 이중적 구조를 보여주었으며, 한국의 전통극적 요소와 셰익스피어적 공연 문 법의 융합을 통해 현대인에게 사랑과 재회, 그리고 재생의 주제를 표현하고자 시도하였 다. 공연 는 대학로 예술극장 대극장의 무대 규모를 잘 활용하였다. 무대의 높이는 앞 좌석 관객의 눈높이에 맞추어 낮은 편이었으나, 무대 안쪽은 여러 개의 깊은 층으로 이루어져 각 캐릭터의 등장/퇴장 장면에서 유용한 공간 활용을 유도하였다. 무 대는 액자 틀을 연상시키는 심플한 배경을 기본으로 하였지만 후반으로 갈수록 섬,그 리고 바다의 배경에 알맞게 입체적으로 활용되어, 무대의 다각적인 변신을 볼 수 있게 끔 해주었다. 무대 위에는 커튼 대신 원작의 영문명 Pericles, Prince of Tyre(티레의 왕자 페리클레스)을 기입한 커다란 지도가 막-장을 나누는 역할을 할 뿐 아니라 여러 형상 의 윤곽만을 이용한 이른바 실루엣 애니메이션(Silhouette Animation) 이 투사되는 스크린의 역할도 병행하였다. 시시각각 변하는 여러 배경들에 앞서 미리 해당 섬이나 도 시에 핀 조명을 비추어 관객을 배려한 것도 참신한 스크린 활용법에 속하였다. 각종 시 도들로 인해 이 커튼은 극의 보조 소품에 머물지 않고 역사적인 요소와 지리적인 요소 를 결합시켜 연극의 묘미를 더욱 살려주었으며, 드넓은 시공간을 아우르는 장면들의 틈 들을 메꾸어 긴 극의 흐름이 지루하지 않도록 해주었다

구강 내 불편감을 가진 환자에서 캔디다 감염에 대한 후향적 연구

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 치의과학과, 2015. 8. 박희경.The aims of the study were to evaluate the value of DentocultⓇ CA compared to Sabouraud dextrose agar (SDA) culture, to compare the candida culture positive rate, symptom improved rate after antifungal therapy among the patients with oral discomfort retrospectively, and to provide a clinical guideline for diagnosis and treatment in oral candidal infection. The 328 dental records of patients who complained various oral discomforts at Seoul National University Dental Hospital from January 2012 to September 2013 were reviewed. Candida culture data were obtained from both Dentocult®CA and SDA and analyzed with McNemer test. Based on initial clinical diagnosis, patients records were categorized as group 1 (glossodynia without objective sign, 58 patients), group 2 (oral mucosal lesion, 101 patients), group 3 (hyposalivation, 31 patients) and group 4 (oral candidiasis, 38 patients). 100 patients were excluded because of inconsistency with initial diagnosis (e.g., squamous cell carcinoma, epithelial dysplasia, leukoplakia) and failure to follow-up after initial examination or antifungal therapy. Candida culture positive percents were compared with Chi-square test among group 1, 2, and 3. The correlation between Candida culture positive and systemic diseases was analyzed with Chi-square and Fishers extract test. After antifungal therapy, the mean Candida colony count was compared between symptom-improved and symptom-sustained with Students t-test. The result suggested that the relative validity of Dentocult®CA approximately equals that of SDA (p=0.066). Dentocult®CA showed 89.1% sensitivity and 85.3% specificity. Candida culture positive was found in 21 patients (43.1%), 40 patients (39.6%) and 22 patients (72.0%) in three groups, respectively. There was a significant difference among three groups (p=0.003). In addition, gastrointestinal disease (p=0.030) and genitourinary disease (p=0.012) had significant correlations with the Candida culture positive rate. Mean Candida colony count showed no significant differences between symptom-improved and symptom-sustained group. Oral Candida carriage is significantly related to hyposalivation. Antifungal medication can be considered initially or in the process of main symptom treatment, especially in hyposalivation group.I. INTRODUCTION II. MATERIALS AND METHODS III. RESULTS IV. DISCUSSION V. CONCLUSIONS VI. REFERENCES TABLES KOREAN ABSTRACTMaste

Study on the representation of inner sense of solitude

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 동양화과, 2011.2. 김성희.Maste

담배에 자가세포사멸을 유도하는 고추 NLR 유전자들의 N-말단 도메인 동정

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 협동과정농생명유전체학전공, 2017. 2. 최도일.식물의 Nucleotide-binding site Leucine-rich repeat (NLRs)은 병원균의 침입 시 유도되는 면역반응에 관여하는 세포질 내 단백질로, N-말단 도메인, NBARC 도메인 그리고 C-말단 도메인으로 이루어져 있다. 또한 NLRs은 강력한 면역반응의 하나로 흔히 국지적 세포사멸을 유도하기도 한다. Arabidopsis의 RPS4와 벼의 Orin1과 같이 NLRs이 과발현 되었을 때 자가 세포 사멸을 유도한다는 보고가 있다. 뿐만 아니라, 아마의 L6와 밀의 Sr33처럼 NLR의 N-말단 도메인이 식물체에 과발현 되었을 때 자가 세포 사멸을 유도한다는 선행 연구가 있다. 따라서 본 연구에서 고추에 존재하는 NLRs을 과발현 시켜 세포사멸을 유도하는지 확인하고자 하였다. 고추 Capsicum annuum CM334에 존재하는 755개 NLRs 가운데 415개의 NLRs이 동정되었고 Nicotiana benthamiana를 포함한 Solanaceae 식물 종에서 15개의 NLRs이 자가 세포 사멸을 유도하는 것이 확인되었다. 또한, 101개 NLRs의 N-말단 도메인 중 21개가 과발현 되었을 때 자가 세포 사멸이 유도됨을 확인하였다. 세포사멸과 관련된 유전자들의 발현양상과 Virus induced gene silencing 실험을 수행한 결과, 각각의 NLRs이 서로 다른 신호전달 단백질을 경유하고 N-말단에 의한 세포 사멸 신호 경로에 Salicylic acid가 관여되어 있음을 확인하였다. 따라서, 고추의 NLR 과 N- 말단은 식물의 면역반응에서 나타나는 세포사멸의 기작을 이해하는데 도움이 될 후보 유전자가 될 수 있을 것이다.Nucleotide binding-site Leucine rich Repeat (NLR) is a plant resistance protein that mediates immune response to pathogens. NLR recognize effector secreted from pathogen in plant cytosol and often causes rapid hypersensitive response (HR) cell death. Among known NLRs, Arabidopsis RPS4 and rice Orin1 were reported as induce auto-active cell death as effector-independent manner when they were over-expressed in plant. Auto-active cell death induced by the N-terminal domains of known NLR proteins such as flax L6 and wheat Sr33 have been also reported. To identify whether pepper (Capsicum annnuum CM334) NLRs have potential to induce auto-active cell death, 415 full type pepper NLRs were transiently over-expressed in Nicotiana benthamiana. As a result, over-expressions of 15 pepper NLRs triggered auto-active cell death with different strength in N. benthamiana. To verify over-expression of N-terminal domain fragments of pepper NLRs induce auto-active cell death, we first justified the N-terminal domain using COILS and SMART program and selected 101 N-terminal domain fragments of pepper NLRs. Over-expression of 21 N-terminal domain fragments induced auto-active cell death in N. benthamiana. Among them, pepper NLRs including 16 N-terminal domain fragments belong to specific group, CNL-G10. In addition, to investigate signaling component related to auto-cell death we performed qRT-PCR and virus induces gene silencing (VIGS) known components including ICS1, SGT1, EDS1. Taken together, our results suggest that pepper NLRs probably have auto-activity leading to cell death and pepper NLRs of certain group (CNL-G10) may have specific functions in plant immunity. Consequently, pepper NLRs and N-terminal domain fragments of pepper NLRs will provide important tool for understanding the cell death mechanism in plant immunity.INTRODUCTION 1 LITERATURE REVIEWS 5 NLRs in plant 5 Auto-active cell death induced by plant NLRs 7 Signaling components related to NLRs in cell death responses 8 MATERIAL AND METHODS 11 Plant materials 11 DNA and RNA isolation 21 Cloning of N-terminal domain fragments of pepepr NLRs by ligase-independent cloning 12 In planta expression assay 13 Virus-induced gene silencing (VIGS) in N. benthamiana 14 Semi-quantitative RT-PCR analysis 16 Ion conductivity measurement 18 RESULTS 19 Over-expression of pepper NLR genes induces auto-active cell death in Nicotiana benthamiana. 19 Over-expression of the N-terminal domain fragments of the pepper NLRs induces auto-active cell death in N. benthamiana. 27 Over-expression of N-terminal domain fragments of the pepper NLRs induces auto-active cell death in other Nicotiana species and C. annuum ECW-30R. 35 Various signaling components are involved in auto-active cell death. 39 DISCUSSION 46 REFERENCES 50 ABSTRACT IN KOREAN 55Maste