Gastric emptying time in patients with functional dyspepsia

의학과/석사[한글] 동위원소를 이용한 위배출의 측정은 위장운동 지표의 하나로 소화기 증상과 위장 운동과의 연관성에 대한 객관적인 평가를 하는데에 이용되어 왔다. 소화불량 환자에서 위배출에 대한 보고가 많으나, 위장의 기질적 이상이나 이차성 소화불량의 원인이 없는 기능성 소화불량 환자에 대한 연구는 미흡한 실정이다. 본 연구는 기능성 소화불량 환자에서 위배출시간의 변화가 있는지를 알아보기 위해 기능성 소화불량 환자 28명과 정상 대조군 12명을 대상으로, ImCi의 Tc-99m sulfur colloid를 계란에 섞어 고체상태의 시험식으로 사용하여 위배출 주사법을 시행하여 다음의 결과를 얻었다. 1. 기능성 소화불량 환자군은 위배출시간(Tl/2)이 105.0±23.2분(mean±SD)이고 대조군은 평균 72.1±11.1분으로 기능성 소화불량 환자군에서 위배출시간이 유의하게 지연되었고(p<0.005), 대조군과 환자군에서 나이와 위배출시간은 상관 관계가 없었다. 2. 성별에 따른 위배출시간(Tl/2)은 대조군에서 남자가 평균 65.5±7.6분(mean±SD), 여자가 78.7±10.4분으로 유의한 차이를 보였고(p=0.031), 환자군에서는 남자가 90.8±19.5분, 여자가 109.7±22.8분으로 유의한 차이가 없었다(p>0.05). 3. 환자군과 데조군에서 위배출율을 볼때. 위배출검사 60분과 120분에 위에 남아있는 등위원소의 양은 대조군에서 각각 61%, 30% 였고, 환자군에서 73%, 44%로 60분에서는 통계적으로 유의한 차이가 얼었으나(p=0.064) 120분에서는 두 군간에 유의한 차이(p=.007)를 보였다. 이상의 결과로서 기능성 소화불량 환자에서 Tc-99m을 이용한 고령식의 위배출 측정에서 위배출시간이 유의하게 지연되어 있었고, 위배출시간이 지연되어 있는 경우(Mean+2SD이상)가 정상 대조군에서 1명인데 반하여 환자군에서는 28명중 22명(78%)으로써 기능성 소 화불량이 위의 기능적 운동장애임을 시사하였다. Gastric emptying time in patients functional dyspepsis Woo Chang Choi, M.D, Department of Medical Sience The Graduate School, Yonsei University (Directed by Professor Young Myoung Moon ) The difference in gastric emptying time(GET) between functional dyspepsia and normal control was evaluated using radionuclide isotope technique. Twenty-eight patients with functional dyspepsia were compared to 12 normal controls. Gastric emptying of solids was determined after ingestion of a standardized meal with 99mTc-sulfur colloid scrambled eggs as the solid phase marker. Basal gastric emptying of sol ids was significantly delayed in functional dyspeptic patients. The results were as follows: 1. The GETs were 105.0±:23.2(mean±SD)minutes in the patients group and 72.17± 11.1 minutes in normal controls. GETs were significantly delayed in the patients group (p<0.005), and had no correlationship with age in both groups. 2. GET according to sex showed significant difference in the control group where the mean GET was 65.5±7.6(mean±SD)minutes in male and 78.7±10.4minutes in female(p=0.031), But in the patient group there was no statisti caly significant difference between each sex. 3. When comparing gastric emptying rate, the remaining amounts of radioisotope in stomach were 61%, 73% at 60 minutes and 30%, 44% at 120minutes in control and patient group respectively, which showed statistically significant difference in GER at 120 minutes between control and patient group but no significant di florence was found at 60 minutes In conclusion, gastric emptyings of a solid meal in patients with functional dyspepsia were significantly delayed, which suggested that functional dyspepsia was probably due to functional motor dysturbance of stomach. [영문] The difference in gastric emptying time(GET) between functional dyspepsia and normal control was evaluated using radionuclide isotope technique. Twenty-eight patients with functional dyspepsia were compared to 12 normal controls. Gastric emptying of solids was determined after ingestion of a standardized meal with 99mTc-sulfur colloid scrambled eggs as the solid phase marker. Basal gastric emptying of sol ids was significantly delayed in functional dyspeptic patients. The results were as follows: 1. The GETs were 105.0±:23.2(mean±SD)minutes in the patients group and 72.17± 11.1 minutes in normal controls. GETs were significantly delayed in the patients group (p<0.005), and had no correlationship with age in both groups. 2. GET according to sex showed significant difference in the control group where the mean GET was 65.5±7.6(mean±SD)minutes in male and 78.7±10.4minutes in female(p=0.031), But in the patient group there was no statisti caly significant difference between each sex. 3. When comparing gastric emptying rate, the remaining amounts of radioisotope in stomach were 61%, 73% at 60 minutes and 30%, 44% at 120minutes in control and patient group respectively, which showed statistically significant difference in GER at 120 minutes between control and patient group but no significant di florence was found at 60 minutes In conclusion, gastric emptyings of a solid meal in patients with functional dyspepsia were significantly delayed, which suggested that functional dyspepsia was probably due to functional motor dysturbance of stomach.restrictio

Molecular cloning of rat ATP-citrate lyase gene and determination of its restruction map

의학과/박사[한글] ATP-citrate lyase는 지방 및 콜레스테롤 합성과정에 acetyl CoA를 공급해주는 효소이다. 포유동물에서 이 효소는 음식물 섭취상태나 호르몬 작용에 의하여 다른 지방합성 효소(lipogenic enzyme)들과 유사한 형태로 조절을 받는다. 지방산 생합성 정도에 따라 변화되는 이 효소의 활성 변화는 효소의 생합성 정도에 의하여 결정되며, 이와 같은 효소의 양적 변화는 이 효소의 mRNA의 양적 변화 및 핵내에서 ATP-citrate lyase 유전자의 전사속도 변화와 밀접한 관계를 가지고 있음이 보고된 바 있다. 이와 같은 증거들은 이 효소의 조절이 유전자 전사 단계에서 주로 이루어짐을 시사하고 있다. 본 연구에서는 이 효소가 유전자 전사단계에서 어떠한 기전으로 조절이 이루어지는지에 관한 연구의 첫단계로서 ATP-citrate lyase 유전자의 promoter 부위를 cloning하고자 실험을 시도하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 백서의 gDNA library를 선별하여 ATP-citrate lyase 유전자의 5'인접부위와 처음 일곱개의 exon을 함유하는 ACL8 clone을 얻어 전장에 걸쳐 염기서열을 결정하였다. Primer extension 분석을 통하여 ATP-citrate lyase mRNA의 전사시작위치가 단백질 합성 시작부위에서 5'쪽으로 4407 nucleotide 앞쪽에 위치함을 밝혔다. Primer extension 분석과 중합효소 연쇄반응으로 증폭시킨 ATP-citrate lyase cDNA의 염기서열을 결정한 결과 유선, 폐, 간장, 뇌, 신장등의 장기에서 전사에 사용하는 promoter는 모두 동일하였다. Southernblot hybridization을 통한 정성 및 정량 분석 결과 ATP-citrate lyase 유전자는 단일 종류로서 haploid genome당 1개 존재하였다. ACL 8 clone내 ATP-citrate lyase 유전자에는 846bp에 해당하는 exon 1에서 부터 exon 7까지 위치하였으며, 이들의 염기서열은 116번째 codon을 제외하고는 모두 발표된 ATP-citrate lyase cDNA 염기서열(Elshourbagy 등,1990)과 일치하였다. 이미 발표된 116번째 codon의 염기서열은 GCG(Ala)인데 반하여 본 실험에서는 GTG(Val)로서 차이가 있었다. 중합효소 연쇄반응을 통하여 116번째 codon을 포함하는 부위의 gDNA와 cDNA를 증폭합성하여 얻은 실험에서도 116번째 codon의 염기서열은 GTG로서 valine codon 이었다. Exon 1의 5'쪽의 염기서열에는 promoter element로 알려진 여러 보존된 염기서열이 존재하였다. 즉 CAAT box 및 다수의 Spl 결합부위가 존재하였다. 그러나 TATA box는 찾을 수 없었다. 또한 이 유전자의 5'쪽으로 인접한 2.4kb 염기서열내에 여러 호르몬에 의하여 조절될 것으로 추정되는 보존된 염기서열과 유전자 발현의 조직 특이성과 관련된 여러 염기서열이 존재하였다. [영문] Citrate transported from mitochondria to cytosol is cleaved into acetyl CoA and oxaloace-tate by ATP-citrate lyase for several important biosynthetic pathways, including lipogenesis and cholesterogenesis. In mammals, the activity of ATP-citrate is regulated by diets and hormones in a manner similar to that of other lipogenic enzymes. Generally, these regulations of enzyme activities according to the state of de novo lipogenesis are considered to be due to the alteration in the rate of enzyme biosynthesis. It was reported that changes in ATP-citratelyase concentration correlate to changes of its mRNA concentration and transcription rate. These findings strong1y suggest that ATP-citrate lyase is regulated at the level of transcription. This study was intended to determined the structure of the ATP-citrate lyase genomic promoter, as an initial step toward answering how the regulation of ATP-citrate lyase occurs at the level of transcription, and then the following results were obtained. A genomic clone, encompassing the 5' flanking region and the first seven exons of rat ATP-citrate lyase gene was isolated from rat genomic library and sequenced. The Primer ex-tension analysis showed that mRNA is transcribed at 4,407 nucleotides upstream from the translation start site. The primer extension analysis and the direct sequencing of ATP-citrate lyase cDNA amplified by polymerase chain reaction showed that the promoter used for transcription is identical in various tissues, such as mammary gland, lung, liver, brain, and kidney. Southern blot analysis showed that the ATP-citrate lyase gene exists as a single copy. The sequences of the first seven exons encompassing the 846 bp of 5' region of ATP-citrate lyase cDNA were identical to those of ts cDNA reported by Elsourbagy et. al.(1990) except codon 116. The sequences reported previously for the codon 116 were GCG(Ala), but the sequence data from ACL8 clone revealed it to be GTG(Val). It was verified that the sequences of the codon 116 on both genomic and complementary DNA amplified by polymerase chain reaction is GTG(Val). The 5' flanking region contains several consensus sequences defined as promoter elements. These include a CAAT box and Spl binding sites. However a TATA box is lacking in this promoter. The 5' flanking region also contains several sequence elements(TRE, GRE, CRE, FSE, HNF-1 ) which may be involved in the transcriptional regulation of the gene.restrictio

Geostationary Ocean Color Imager (GOCI) Data Reprocessing System (GDRS) Using the Virtualization and the Parallel Processing

천리안 해양관측위성(Geostationary Ocean Color Imager GOCI)은 지난 2010년 발사된 이후부터 지속적으로 동북아시아 근해를 매시간 하루 8회 관측해 오고 있다. GOCI의 주관 운영기관인 한국해양과학기술원 해양위성센터는 지난 5년간 GOCI 자료로부터 유도한 엽록소 농도, 부유물질 농도 등의 2차 해색 자료들을 모두 보유하고 있으며, 이 자료들을 대국민 서비스하고 있다. 이러한 상황에서 해색 자료를 유추하는 알고리즘이 개선될 경우 그 동안 보유해 왔던 모든 해색 자료들을 다시 업데이트 해야할 필요성이 발생하며, 그 용량은 수십 테라바이트에 달한다. 이 연구는 이와 같은 대용량 GOCI 자료를 빠르게 재처리하기 위해 가상화 및 병렬처리 기술을 도입한 시스템을 개발하는데 중점을 맞추고 있으며, 이 시스템을 GOCI 자료 재처리 시스템(GOCI Data Reprocessing System GDRS)이라 부른다. 성능 평가 결과 GDRS를 이용하여 GOCI 자료를 재처리 하는 경우 하드웨어의 자원 효율성을 높임과 동시에 작업 처리 속도를 대폭 개선시킬 수 있다는 것을 확인하였다.도한 엽록소 농도, 부유물질 농도 등의 2차 해색 자료들을 모두 보유하고 있으며, 이 자료들을 대국민 서비스하고 있다. 이러한 상황에서 해색 자료를 유추하는 알고리즘이 개선될 경우 그 동안 보유해 왔던 모든 해색 자료들을 다시 업데이트 해야할 필요성이 발생하며, 그 용량은 수십 테라바이트에 달한다. 이 연구는 이와 같은 대용량 GOCI 자료를 빠르게 재처리하기 위해 가상화 및 병렬처리 기술을 도입한 시스템을 개발하는데 중점을 맞추고 있으며, 이 시스템을 GOCI 자료 재처리 시스템(GOCI Data Reprocessing System GDRS)이라 부른다. 성능 평가 결과 GDRS를 이용하여 GOCI 자료를 재처리 하는 경우 하드웨어의 자원 효율성을 높임과 동시에 작업 처리 속도를 대폭 개선시킬 수 있다는 것을 확인하였다.2

Overview of Geostationary Ocean Color Imager (GOCI) data distribution service

The Korea Ocean Satellite Center (KOSC) of Korea Institute of Ocean Science & Technology (KIOST) is the main operating institutue of the Geostationary Ocean Color Imager (GOCI) which was launched in 2010. The distribution of GOCI data was started in April, 2011. Since then the KOSC provides radiometric/geometric calibrated (Level-1B) data and ocean products (Level-2) data to public users through our web site and off line. Recently, demand for the operational application of GOCI data explosively increased. Therefore, the concept of operation for GOCI data service was changed from support the research to operational application service. Using the FTP service, the KOSC effectively support the related organizations by providing services for the operational application of GOCI on various national issues such as red tide, green tide, brown algae, low salinity water, sea fog, sea ice, coastal upwelling, and so on. These efforts are stretched even to the application on land/atmospheric phenomena such as typhoon, forest fire, aerosol, and so on. The service has helped the many local governments to mitigate the damage from various phenomena. As a result, the number of GOCI data download was increased rapidly from 70,000 (2014~2015) to 1,000,000 (2016~2018) per year. The number of related organizations increased to 33. There is a continuing request from the unincluded organizations.1

Introduction to the Construction Method of Self-Assembly Storage Unit for Storing GOCI Data

The Korea Ocean Satellite Center (KOSC) receives ocean color data obtained by the Geostationary Ocean Color Imager (GOCI) and it has a role to process them. Since 2010, KOSC has been stored 117 gigabytes of GOCI data a day thus it retains all of GOCI and the size of the retained data reaches up to about 254 terabytes. In the case of developing new ocean color algorithms, all of data should be reprocessed by these algorithms and stored also. In order to store efficiently these massive data, we have constructed self-assembly storage units. The operating system (OS) for the storage is CentOS 7 and we configured the raid 6 with 45 hard disks, to guarantee the robustness. We also employed a compression function of the Zetta File System (ZFS) to improve the storage efficiency. For future work, we will configure the distribute file system (DFS) to reduce the store time of self-assembly storage units.ll of GOCI and the size of the retained data reaches up to about 254 terabytes. In the case of developing new ocean color algorithms, all of data should be reprocessed by these algorithms and stored also. In order to store efficiently these massive data, we have constructed self-assembly storage units. The operating system (OS) for the storage is CentOS 7 and we configured the raid 6 with 45 hard disks, to guarantee the robustness. We also employed a compression function of the Zetta File System (ZFS) to improve the storage efficiency. For future work, we will configure the distribute file system (DFS) to reduce the store time of self-assembly storage units.2

Service Operation Environment(SOE) for ocean observations plan by Geostationary Ocean Color Imager-II (GOCI-II)

2020년 2월 발사한 천리안 해양위성 2호(이하 GOCI-I)는 1시간 간격마다 한반도 중심 동북아 지역의 해양 환경을 실시간 모니터링하는 세계 최초의 정지궤도 해색 위성인 천리안 해양위성(이하 GOCI)의 임무를 계승하고 발전시킨 후속 해양관측 위성이다. GOCI-I 공간 해상도는 1호의 50m 급에서 250m 급으로 향상 되었고, 05:15~19:45(KST)동안 매시 15분부터 45분까지 30분간 관측하도록 확장되었다. GOCI는 일 8회 관측이었던 것에 비해, GOCI-I는 지역관측(Local Area)으로 한반도 주변 2,50km x 2,50km 영역에 대하여 일 10회 관측하고, 전구 관측(Ful Disk)으로 12,80km x 12,80km 이상의 영역을 일 1회 관측한다. 지역관측은 12개 슬롯 이미지를 관측한다. 전구관측은 235개의 지역 슬롯 중 원하는 슬롯 이미지를 관측하기 위하여 태양의 위치에 따른 해수면 태양광 반사(sun-glint)를 피하고, 태양 고도각이 높은 시간대를 예측하여 관측시간과 순서를 계산한다. 천리안 해양위성 2호 지상국시스템 중 하나인 시스템 운영 환경에서 촬영 계획을 수립한다. 수립된 미션은 한국항공우주연구원의 임무 계획 서브시스템(Mision Planning Subsystem, 이하 MPS)으로 전송하여 실시간 운영 서브시스템(Real-Time Operation Subsystem, 이하 ROS)에서 천리안 해양위성 2호로 명령을 전송한다.2

Preliminary Result of Operation Test for Geostationary Ocean Color Imager-II (GOCI-II) Ground Segment

GPU 기반 위성영상 병렬분산처리와 병렬파일시스템으로 구성된 정지궤도해양위성 2호 지상시스템은 2020년 2월 19일 발사된 천리안 해양위성 2호의 자료를 수신하여 자료처리 후 배포까지 자동으로 수행하는 기능을 가지고 있다. 위성신호의 수신이 가능하게 된 이후 수신 서브시스템의 기능을 점검하였고, 일부 개선사항을 조치하였다. 자료보정 서브시스템의 각종 파라미터를 최적화하는 과정을 통해 정상적인 영상자료를 생산하는 것을 확인하였다. 해양자료처리 서브시스템의 실시간 자료처리 기능은 정상 작동하는 것을 확인하였으며, 해당 알고리즘의 정확도에 대한 분석이 추후 이루어질 예정이다. 천리안 해양위성 2호의 정규 운영 전 장기 자료에 대한 재처리 기능을 점검하고, 시스템 안정성에 대한 검토를 마칠 예정이며, 도출된 개선점은 추후 유지보수/개선 과정을 통해 반영될 것이다.2

GOCI Products Re-processing System (GPRS) Using Server Virtualization and Distributed Processing

Recent advance in the satellite-based remote sensing technology demands abilities to efficiently processthe massive satellite data. In thisstudy, we focused on developing GOCI Products Reprocessing System (GPRS) based on server virtualization and distributed processing in order to efficiently reprocess massive GOCI data. Experimental results revealed that GPRS allows raising the usage rates of memory and central processing unit (CPU) up to about 100% and 75%, respectively. This meansthat the proposed system enables us to save the hardware resources and increase the work process speed at the same time when we process massive satellite data. 최근 위성 기반 윈격 탐사 기술의 발전과 더불어 대용량 위성 자료를 효율적으로 처리하기 위한 능력이 요구되고 있다. 이 연구에서는 대용량 GOCI 산출물을 효율적으로 재처리하기 위해 서버가상화와 분산처리를 기반으로 한 GOCI 산출물 재처리 시스템(GOCI Products Re-processing System; GPRS)을 개발하는데 집중하였다. 실험 결과 GPRS를 이용하여 메모리 및 CPU의 사용률을 각각 약 100%, 75%까지 올릴 수 있었다. 이는 제안 시스템을 통해 하드웨어 자원을 절약함과 동시에 작업 처리 속도를 향상시킬 수 있다는 것을 의미한다.22Nkc

Operational application service of Geostationary Ocean Color Imager (GOCI)

The Korea Ocean Satellite Center (KOSC) of the Korea Institute of Ocean Science & Technology (KIOST) is main data managing center of Geostationary Ocean Color Imager (GOCI), launched in 2010. The distribution of GOCI data was started in April, 2011 after a number of careful tests and practical exercises by KOSC. Since then the KOSC provides radiometric/geometric calibrated Level-1B data and oceanographic factors’ Level 2 data to public users through web site. Furthermore, using FTP system, the KOSC provides regularly the near-real time data to the related organizations such as government agencies and research institutes for their operational public services and researches. As a part of government’s policies, the KOSC encourages people to use the GOCI data more actively and more easily through training courses and on-line practices providing also the results of application on various national issues such as red tides, green tides, brown algal blooms, sea fog, sea ice, coastal upwelling etc…. These efforts are stretched even to the application on land/atmospheric phenomena such as typhoon, forest fire, aerosol, yellow dust etc…. In order to accelerate the on-site practical use of GOCI data, the Consultative Panel on Operational Application of GOCI data was composed inviting key persons from the user agencies and related organizations. Through this panel, a connecting network system among the user gr1

천리안 해양관측위성을 이용한 현업지원 서비스

한국해양과학기술원 해양위성센터는 2010년 발사된 천리안 해양관측위성을 주관운영하고 있으며, 2011년 04월부터 정규운영 및 서비스를 시작하였다. 생산된 자료 중 복사보정과 기하보정이 완료된 Level 1B 자료와 해양산출물인 Level 2 자료를 일반 사용자에게 웹사이트로 제공하고 있으며, 정부 및 연구기관 등 정기적으로 위성자료가 필요한 유관기관들에게는 준실시간으로 FTP 자료서비스를 제공하고 있다. 또한, 정부 3.0 대국민 서비스의 일환으로 국내 대형 포털사이트를 통해 주요 위성 자료를 일반 국민들이 접근하기 쉽도록 지원하고 있다.약 5년간의 위성운영을 통해 적조, 녹조, 갈조, 저염분수, 해무, 해빙, 연안용승, 해사채취 해양분야뿐만 아니라, 태풍, 산불 등 육상/대기 분야에서의 다양한 국가 주요 현안들을 관측하였고, 필요 시 담당 현업 기관에 분석 정보를 제공하였다. 천리안 해양관측위성 자료의 실질적인 현업 활용 증대를 위해 2014년에 위성 운영기관 및 국내 현업기관을 대상으로 ‘정지궤도 해양위성 활용실무협의체’를 구성하였다. 그 결과 수산업, 기상, 군 등 현업기관과의 연계망을 구축하여, 위성운영 기관은 천리안 해양관측위성 분석자료를 현업기관에 제공하고 현업기관은 분석된 위성자료를 현안대응 참고자료로 활용하고 있다.향후 현업기관들에게만 제한적으로 제공되었던 과거의 주요 현안 발생 시기 및 지역 정보를 일반사용자가 웹사이트에서 검색할 수 있도록 서비스를 개선하고, 국가 주요현안 대응 지원 확대를 위해 주요 이슈에 대한 분석정보를 현업기관 전용 자료공유 웹사이트를 마련할 계획이다.에게 웹사이트로 제공하고 있으며, 정부 및 연구기관 등 정기적으로 위성자료가 필요한 유관기관들에게는 준실시간으로 FTP 자료서비스를 제공하고 있다. 또한, 정부 3.0 대국민 서비스의 일환으로 국내 대형 포털사이트를 통해 주요 위성 자료를 일반 국민들이 접근하기 쉽도록 지원하고 있다.약 5년간의 위성운영을 통해 적조, 녹조, 갈조, 저염분수, 해무, 해빙, 연안용승, 해사채취 해양분야뿐만 아니라, 태풍, 산불 등 육상/대기 분야에서의 다양한 국가 주요 현안들을 관측하였고, 필요 시 담당 현업 기관에 분석 정보를 제공하였다. 천리안 해양관측위성 자료의 실질적인 현업 활용 증대를 위해 2014년에 위성 운영기관 및 국내 현업기관을 대상으로 ‘정지궤도 해양위성 활용실무협의체’를 구성하였다. 그 결과 수산업, 기상, 군 등 현업기관과의 연계망을 구축하여, 위성운영 기관은 천리안 해양관측위성 분석자료를 현업기관에 제공하고 현업기관은 분석된 위성자료를 현안대응 참고자료로 활용하고 있다.향후 현업기관들에게만 제한적으로 제공되었던 과거의 주요 현안 발생 시기 및 지역 정보를 일반사용자가 웹사이트에서 검색할 수 있도록 서비스를 개선하고, 국가 주요현안 대응 지원 확대를 위해 주요 이슈에 대한 분석정보를 현업기관 전용 자료공유 웹사이트를 마련할 계획이다.2