개 림프종 환자에서 예후 지표로서의 혈청 인터루킨-2 수용체 및 베타-2-마이크로글로불린 평가

학위논문(석사) -- 서울대학교대학원 : 수의과대학 수의학과, 2022. 8. 윤화영.Interleukin-2 receptor (IL-2R) is released from activated T cell lymphocytes and related to proliferation of B cells and T cells. Beta-2-microglobulin (B2M) is synthesized from all nucleated cells and constitutes a major histocompatibility complex class I antigen. In human medicine, high concentrations of these two factors have been found to be related to prognosis in aggressive non-Hodgkin’s lymphoma (NHL). In this pilot study, we aimed to assess the correlation between the serum concentration of IL-2R and B2M and the diagnosis and prognosis of lymphoma. This study included four healthy dogs and 17 dogs with lymphoma. To measure the serum concentration of IL-2R and B2M, a commercial enzyme-linked immunosorbent assay was used. In dogs with lymphoma, IL-2R concentrations were significantly high at the time of diagnosis, but B2M concentrations were not. In relapsed dogs, both IL-2R and B2M concentrations were significantly higher than those in the control and chemotherapy response groups. When the serum concentrations of IL-2R and B2M during chemotherapy were monitored in four relapsed dogs, B2M levels were more closely related with the relapse. This study demonstrated that serum IL-2R and B2M concentration can be a diagnostic or prognostic tool for canine lymphoma. Monitoring of serum B2M concentration seems to be useful for predicting relapse.인터루킨-2 수용체(IL-2R)는 활성화된 T 림프구에서 나오며, B 림프구와 T림프구의 증식과 관련 있다. 베타-2-마이크로글로불린(B2M)은 모든 유핵 세포에서 합성되며, 주조직적합성 복합체 클래스 I의 항원을 구성한다. 인의에서 인터루킨-2 수용체 및 베타-2-마이크로글로불린의 높은 농도가 공격적인 비호지킨 림프종의 예후와 연관이 있다는 것이 밝혀진 바 있다. 위 연구에서는 IL-2R과 B2M의 혈청 농도가 개 림프종의 진단 및 예후와 어떠한 상관관계가 있는지 평가하는 것을 목표로 하였다. 총 4 마리의 건강한 개와 림프종을 가진 환견 17마리가 연구에 포함되었으며, EILISA를 이용하여 IL-2R 및 B2M의 혈청 농도를 측정하였다. 림프종이 있는 환견의 경우, 진단 당시 IL-2R 농도가 유의적으로 높게 확인되었으며, B2M의 농도는 큰 상관관계가 확인되지 않았다. 한편, 림프종이 재발한 환견의 경우, 건강한 개체 및 항암치료에 반응이 있던 환견에 비해 IL-2R과 B2M 농도 모두 높게 확인되었다. 림프종이 재발한 4마리의 환견 4마리에서 IL-2R 및 B2M의 혈청 농도를 추적 관찰하였을 때, B2M 수치가 재발과 더 밀접하게 연관이 있었다. 위 연구는 혈청 IL-2R과 B2M 농도를 개의 림프종을 진단하거나 예후를 평가하는 데 있어 의미가 있음을 증명하였으며, 혈청 B2M 농도를 추적 관찰하는 것은 림프종의 재발을 예측하는 데 있어서 유용할 것으로 보인다.1. Introduction 1 2. Materials and Methods 3 2.1. Patients and serum samples 3 2.2. Diagnosis and treatment of lymphoma 3 2.3. Enzyme-linked immunosorbent assay (B2M and IL-2R) 4 2.4. Statistical analysis 4 3. Results 6 3.1. Patient selection 6 3.2. Serum concentration of IL-2R and B2M in healthy dogs and dogs with lymphoma 6 3.3. Differences in serum concentration of IL-2R and B2M in the response and relapse groups following chemotherapy 7 3.4. Serial changes in serum concentration of IL-2R and B2M in relapsed patients 8 4. Discussion 10 5. References 22 국문초록 26 List of Figures Figure 1. Boxplots of serum IL-2R and B2M concentrations in healthy dogs (control group) and dogs with lymphoma 14 Figure 2. Boxplots of serum IL-2R and B2M concentrations in healthy dogs (control group), dogs which responded to chemotherapy (response group), and dogs which lymphoma relapsed during or after chemotherapy (relapse group) 15 Figure 3. Changes in serum IL-2R and B2M concentrations during chemotherapy in 4 dogs (Case 1 (A), Case 2 (B), Case 3 (C), and Case 4 (D)) with multicentric B cell type lymphoma 16 Supplementary figure 1. Graph of correlation between 'serum IL-2R and B2M' and median Time to relapse (TTR) 17 List of Tables Table 1. Wisconsin-Madison CHOP protocol: 25 weeks 18 Table 2. Wisconsin-Madison CHOP protocol-based L-CHOP protocol 19 Table 3. Response evaluation for canine lymphoma 20 Table 4. Signalment and characteristics of 4 healthy dogs and 17 dogs with lymphoma 21석

Characterization of genomic perturbation sensitivity using 1000 genomes population

학위논문 (박사)-- 서울대학교 대학원 : 의과대학 의과학과, 2018. 2. 김주한.연구 목적: 유전자의 발현은 수많은 유전체 돌연변이에 의해서 교란되며, 이는 세포의 기능과 개체의 표현형에 큰 영향을 준다. 최근의 대규모 차세대 염기서열분석 프로젝트에서 밝혀지고 있듯, 한사람의 유전체는 적어도 300만개의 돌연변이를 가지고 있는 것으로 알려져 있다. 본 논문에서는 이러한 유전체 교란을 해석하고 교란에 민감한 유전자의 특징을 살펴보고자 전사체 교란 네트워크를 1000 유전체 프로젝트 데이터를 통해 구성해 보았다. 연구 방법: 본 연구에서는 단백질 코딩 영역 내 비 동일 변이의 시프트 점수를 종합하여 유전자 손상 정도를 평가하였다. 이를 기반으로 전사체 교란 네트워크를 구성하고, 유전자의 내향 연결 정도를 교란 민감도로 정의하였다. 유전자를 교란 민감도에 따라 분류하고 교란 민감 유전자와 교란 둔감 유전자의 진화적, 생물학적, 그리고 임상적 특징을 조사하였다. 결과: 교란 민감 유전자는 단백질 상호작용 네트워크의 변방에 위치해 있었으나 진화적으로 보존되어 있었다. 이들은 상대적으로 적은 수의 미소 전사체와 전사인자에 의해 조절되고 있으며, 세포 간의 상호작용에 중요한 역할을 하고 있었다. 전사체 교란 네트워크의 외향 연결 정도는 중요한 생물학적 의미를 가지고 있지 않았다. 치사 유전자의 경우 교란 네트워크의 말단이면서 단백질 상호작용 네트워크의 중심부에 위치해 있었다. 반면, 대부분의 질병 유전자들의 경우 교란 네트워크의 중심이면서 단백질 상호작용 네트워크의 말단에 위치해 있었다. 두 네트워크를 모두 사용하여, 질병을 분류하기 위한 연합 네트워크 도표를 그려보았다. 결론: 효모에서의 연구와 마찬가지로, 교란 민감 유전자는 유전적으로 보존되어 있고 세포 간의 상호작용에 관여하여 개체의 생존에 필수적이었다. 또한, 내향 연결정도가 외향 연결정도에 비해 유전자 교란을 해석하는데 유용하다는 것을 확인하였다. 질병 유전자는 단백질 상호작용 네트워크와 교란 네트워크를 동시에 활용하여 시각화 되고 분류될 수 있었다. 결론적으로, 교란 민감도는 유전자의 생물학적 임상적 특성을 분석하고 유전체 교란을 평가하는데 가치 있는 지표가 될 것이다.Purpose: Transcriptome is perturbed by millions of genomic variants which could alter function of cells and phenotypes of organisms. As discovered in recent large Next-Generation Sequencing (NGS) project, Individual genome has at least 3 to 4 million variants. Here, we applied perturbation network to human data from 1000 genomes project data for interpreting genetic perturbation and characterized perturbation sensitive and tolerant genes. Methods: We integrated SIFT score of non-synonymous variants to calculate gene deleteriousness score and determine whether gene is perturbed or not. Perturbation network was constructed based on gene deleteriousness score and perturbation sensitivity was defined as in-degree of perturbation network. We categorized genes based on perturbation sensitivity and investigated evolutionarily, regulatory, and clinical properties of perturbation sensitive and tolerant genes. Results: Perturbation sensitive genes were in periphery of protein interaction network but evolutionarily conserved. They were regulated by less miRNA and transcription factor and played a key role in cell-cell interaction. Out-degree of perturbation network did not show any significant biological properties. Lethal genes were in periphery of perturbation network and hub of protein interaction network. On the contrary, most disease genes were in hub of perturbation network and showed various trends in protein-interaction network. We drew joint network map and categorized disease by degree of both network. Conclusions: As in yeast perturbation network, perturbation sensitive genes were essential in survival of organism since they were evolutionarily conserved and related to interaction between cells. We confirmed that in-degree of perturbation network is better than out-degree of perturbation network for interpreting genetic perturbation. Disease genes can be categorized and visualized using both protein-interaction network and perturbation network. In conclusion, perturbation sensitivity was valuable measure for interpreting genetic perturbation and assessing gene's biological and clinical properties.1. Introduction 1 1.1. Definition of Genetic Perturbation 1 1.2. Interpretation of genetic perturbation causing variants 2 1.3. Interpretation of genetic perturbation using biological networks 3 1.4. Perturbation Network approach in Yeast 5 1.5. Purpose of study 6 2. Materials and Methods 7 2.1. Genome and transcriptome data from 1000genomes populations. 7 2.2. Calculating gene deleteriousness scores. 8 2.3. Construction of perturbation network. 9 2.4. Construction of Protein Interaction Network. 9 2.5. Retrieving biological information for gene annotation 10 2.6. Excess retention. 10 2.7. Joint network map for visualization of gene sets. 11 2.8. Clinical annotation of PSN 11 3. Results 12 3.1. Building Perturbation network 12 3.2. Biological properties of perturbation network 13 3.2.1. Correlation between perturbation network and PPI network 14 3.2.2. Relationship of perturbation network to Evolutionary feature and regulatory feature 15 3.3. Clinical implication of perturbation network against PPI network 27 3.3.1. Lethal genes versus disease genes 27 3.3.2. Disease gene classification using both Kppi and Kin 31 4. Discussion 35 5. References 38Docto

Temperature dependence of the optical properties of liquid crystal cells in the Fabry-Perot structure

Thesis (master`s)--서울대학교 대학원 :전기·컴퓨터공학부,2004.Maste

Web resource preloading optimized for User Experience

학위논문(석사)--서울대학교 대학원 :공과대학 전기·정보공학부,2020. 2. 문수묵.웹 앱 및 페이지에서 로딩에 걸리는 시간인 로딩 타임은 사용자 경험에 영향을 준다. 로딩 타임에서 큰 비중을 차지하는 것은 중 하나는 리소스 로딩이다. 특히, 스마트 TV와 같은 환경에서 콘텐츠와 관련된 많은 리소스들을 가져와야 하기 때문에 리소스 로딩이 큰 비중을 차지한다. 따라서 로딩 타임을 단축하고자 리소스 프리로딩이라는 방법이 제안되었다. 리소스 프리로딩은 사용 예정인 리소스를 식별하고 프리로딩 순서를 정하기 위해 profile을 기반으로 하는 기법을 사용한다. 그러나 기존의 리소스 프리로딩 방식은 전체 웹 로딩 시간을 단축시키지만 사용자가 실제로 느끼는 타임에는 고려하지 않았다. 본 논문에서는 사용자 경험을 향상시킬 수 있는 리소스 프리로딩 방식을 제안한다. 이는 웹 로딩 과정에서 사용자 경험을 향상시킬 수 있는 파라미터들을 비교하여 사람들의 시선이 주로 향하는 리소스들을 빠르게 가져오는 방식으로 리소스 프리로딩 순서를 계산하였다. 이 방식을 기존의 프리로딩 시스템에 구현하여 실제 스마트 TV 웹 앱과 SNS, 쇼핑의 웹 사이트에서 로딩 시간을 측정하였다. 사용자 경험을 나타내는 매트릭스인 AFT에서 최대 18%, SI에서 최대 20%의 성능 효과가 나타났다.Loading time affects the user experience in web apps and pages. One of the biggest factors in load time is resource loading. Resource preloading which uses a profile-based techniques to identify resources has been proposed to shorten the loading time. However, the existing researches shorten the overall web loading time, but do not take into account the time which related to the user. In this paper, we propose a resource preloading to improve the user experience. It calculates the resource preloading order by comparing parameters that can improve the user experience during the web loading process. A matrix representing the user experience showed up to 18% of performance in AFT and up to 20% in SI.1. 서론 1 1. 사용자 경험의 최적화 필요성 1 2. 배경 지식 4 1. 사용자 경험을 반영한 메트릭 4 2. 기존 프리로딩 시스템 및 문제점 5 3. 제안하는 사용자 경험 휴리스틱 7 1. Eye-catching 프로세스 7 2. Eye-catching 프로세스 예시 및 비교 8 4. 실험 결과 및 분석 10 1. 실험 환경 10 2. 실험 결과 10 5. 결론 15 참고 문헌 16 Abstract 18Maste

차세대 에너지 저장장치를 위한 고안정성 리튬메탈 배터리 설계

MasterSince Paris agreement in 2015, environmental regulation on fossil fuel energy has been reinforced, resulting more attention to renewable energy and storage devices for such energy. Especially, the electric vehicle (EV) market would be estimated to grow more than 100 times bigger than present. However, batteries, key components of EV, is still far away for commercial popularization. Therefore, the demands for high energy density batteries to realize long distance driving have been increased for long-distance driving EV. There are several candidates for high energy density such as Si, Ge, Sn and Li for anodes materials. Especially, lithium metal batteries (LMBs) which utilized metallic Li for anode instead of intercalation graphite is taken much attention due to the high theoretical capacity (3860 mAh g-1) and lowest electrochemical potential (-3.04 V vs SHE). However, Li dendrite growths caused by uneven Li plating due to the heterogenous solid electrolyte interphase (SEI) result in low Coulombic efficiency, increase of concentration polarization and eventually short-circuit, and finally impeding practical application of LMBs. Here in, we introduce two strategies for effective Li dendrite control. Firstly, we prepared covalently bonded inorganic filler combined gel-polymer electrolyte for enhanced mechanical properties. We synthesized vinyl group modified silica nanoparticles and direct covalent bond between vinyl modified silica and acrylate monomer (ETPTA) constructs mechanically enhanced polymer network. Because we adopted gel-polymer electrolyte system, relatively sufficient basic electrochemical properties such as ionic conductivity and Li-ion transference numbers. Not only this, in-situ crosslinking also improved compatibility between electrodes and gel-polymer electrolyte. Furthermore, we observed effective suppression by SEM analysis and it finally resulted in improved cyclability of Li/Li symmetric and Li/NCM811 full-cells Secondly, ferroelectric ceramic/polymer combined artificial layer was established on Cu substrate. The goals of this artificial layer were developing Li-ion migration favorable conditions by ferroelectric BaTiO3 and adopting volume change during consecutive cycling. This artificial layer was prepared by spin coating and physical rubbing, and fairly uniform BaTiO3 monolayer was observed by SEM analysis. Considering voltage profiles and asymmetric cycle results of series of samples demonstrated the effect of BaTiO3 but the higher overpotential still accelerate degradation of the cell performance The morphology of this artificial layer after cycling was most superior compared with pristine and SIS only coated Cu. Thus, it is considered that the BaTiO3 is helpful to improving performances but additional analysis and further studies are required to maximize effect of BaTiO3

물체 정보와 멀티 모달 센서를 이용한 물체 자세 추정

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 전기및전자공학과, 2014.2, [ 53 p. ]As robotic systems advance, it has been issued to manipulate various types of objects in various environment scenarios using the same robotic platform. To do that, estimating poses of objects is the pose important problem. However, robust object pose estimation in various types of environment is challenging problem. In the present thesis, I suggest robust pose estimation methods for different types of objects by using a multi-modal sensor system, an integration of RGB camera and 3D scanner. More specifically, pose estimation methods for door handles, debris, and rigid body objects are suggested. The suggested methods employed minimal human interaction in multimodal data space as well as objects priors. In addition, the 2D/3D calibration method is suggested to integrate the two sensors. The results of the experiments demonstrate the robustness of the proposed methods. Moreover, as a real-world application the suggested methods is employed as the vision system of a complete full size humanoid robot. The practical demos further validate the robustness and performance of the proposed methods.한국과학기술원 : 전기및전자공학과