DNA 이중 가닥 절단에 대한 세포 반응에서 RECQL4의 putative PAR binding motif의 역할

학위논문(석사) -- 서울대학교대학원 : 사범대학 과학교육과(생물전공), 2023. 8. 이준규.RECQL4 protein belongs to the RecQ helicase family and plays crucial roles in genome maintenance. RECQL4 is particularly important for ATM activation and HR repair at DNA double-strand break (DSB) sites. Previous research has shown that RECQL4 is recruited to DSB sites in a manner dependent on poly ADP-ribosylation (PARylation). Notably, the amino acid residues 360- 437 region of RECQL4 have been identified as responsible for recruiting RECQL4 to DSB sites in a PARylation-dependent manner, and this region directly interacts with PAR. This suggests the presence of a PAR binding motif (PBM) in the amino acid residues 360-437 region of RECQL4. However, the significance of the putative PBM region in RECQL4 for its recruitment to DSB sites and whether PARylation-dependent recruitment of RECQL4 plays critical roles in the DSB response remain unknown. In this study, I replaced the putative PBM of RECQL4 protein with a well-known PBM and its mutant variant. Using these modified RECQL4 proteins, I examined the recruitment of RECQL4 at DSB sites and its role in the cellular response to DSB. The results indicated that the putative PBM region of RECQL4 is crucial for its PARylation-dependent recruitment to DSB sites and for facilitating ATM activation, MRN stability, and HR repair. These findings suggest the importance of the interaction between RECQL4 and PAR through PBM in the DSB response.RECQL4 단백질은 RecQ 헬리케이즈 계열에 속하며 유전체 안정성 유지에 중요한 역할을 한다. 특히, RECQL4 단백질은 DNA 이중 가닥 절단 발생 시 ATM을 활성화시켜 DNA 손상 반응이 일어나게 하고, MRN의 안정성 유지를 통해 상동 재조합 수선이 잘 일어나도록 한다. 이전 연구를 통해 RECQL4는 폴리 ADP 라이보실화 (PARylation) 의존적인 방식으로 DNA 이중 가닥 절단 부위에 모집된다고 알려졌다. 최근 연구는 RECQL4의 아미노산 360-437 영역만으로도 PARylation 의존적인 방식으로 DNA 이중 가닥 절단 부위에 모집될 수 있고, 이 영역이 in vitro에서 폴리 ADP 라이보스 (PAR)와 직접적으로 상호작용한다는 것을 보여 주었다. 이는 RECQL4의 아미노산 360-437 영역에 PAR 결합 모티프 (PBM)가 있을 가능성을 암시한다. 하지만 RECQL4의 PBM으로 추정되는 영역이 실제 DNA 이중 가닥 절단 부위로의 모집에 중요한지, 이러한 PARylation 의존적 모집이 DNA 이중 가닥 절단 반응에서 중요한 역할을 하는지는 여부는 아직 알려지지 않았다. 본 연구에서 RECQL4의 PBM으로 추정되는 아미노산 부위를 잘 알려진 hnRNP A2의 PBM과 그것의 돌연변이형으로 교체한 RECQL4 변이 단백질을 이용하여 DNA 이중 가닥 절단 부위로의 모집과 DNA 이중 가닥 절단이 대한 세포 반응에 PAR와의 상호작용이 중요한지 확인하는 실험을 진행하였다. 그 결과 RECQL4의 PBM으로 추정되는 영역이 PARylation 의존적으로 DNA 이중 가닥 절단 부위에 모집되는데 중요하고, ATM 활성화, MRN 안정성 유지, HR repair가 진행되도록 하는데 관여한다는 것을 확인하였다. 이는 PBM을 통한 RECQL4와 PAR와의 결합이 DNA 이중 가닥 절단 반응에 중요한 역할을 한다는 것을 밝혀냈다는 점에서 의의가 있다.Chapter 1. Introduction 1 1.1 Cellular response to DNA double-strand breaks in mammalian cells 1 1.2 Homologous recombination repair 2 1.3 Poly(ADP-ribosyl)ation in DSB repair 3 1.4 PAR binding modules 5 1.5 RECQL4 in DSB response 7 1.6 Purpose of Research 9 Chapter 2. Methods 10 2.1 Plasmid constructions and Primer 10 2.2 Cell culture 12 2.3 Small-interfering RNA transfection 12 2.4 Laser micro-irradiation and real-time imaging of fluorescent proteins 12 2.5 Immunoblotting 13 2.6 Immunofluorescence 13 2.7 WST-1 assay for cell viability 14 Chapter 3. Result 16 3.1 Generation of protein by replacing the putative PAR binding motif of RECQL4 with the well-characterized hnRNP A2 PBM and its mutant PBM 16 3.2 The putative PAR binding motif of RECQL4 is important for the recruitment of RECQL4 to DSB sites 20 3.3 The putative PAR binding motif of RECQL4 is important for the DSB response 22 Chapter 4. Discussion 28 References 31 Abstract in Korean 38석

A Study on the Churn Analysis of Pharmaceutical Company using Data Mining.

데이터 마이닝을 이용한 고객이탈분석은 다양한 비즈니스 분야에서 유용하게 이용되고 있는 분석이다. 이 분석을 통해서 이탈고객의 성향을 파악할 수 있고 이를 기초로 이탈이 예상되는 고객을 찾아낼 수 있다. 이렇게 찾아진 고객들에게 특별한 캠페인을 벌임으로써 기업은 고객을 이탈로부터 막을 수 있다. 이 논문은 다양한 비즈니스 분야 중에서 제약회사를 중심으로 고객이탈분석을 시행하였다. 이 논문에는 먼저 왜 우리가 고객이탈분석을 해야 하는지를 설명하였으며, 2004년도 실제 제약회사의 이탈, 유지 고객 데이터를 이용한 고객이탈분석 과정을 설명하였다.;Churn Analysis is a very useful and reasonable data mining application in various business field. We can find churning pattern of customers by Churn Analysis and recognize customers who could churn. Then we can make a special campaign to prevent customers from churning. This paper has focused on Churn Analysis in Pharmaceutical Company. In this research, we have tried to introduce why we have to do Churn Analysis and process of the Churn Analysis with real data of Pharmaceutical Company in 2004.목차 論文槪要 = 1 Ⅰ. 서론 = 2 A. 연구 배경 및 목적 = 2 B. 연구 범위 및 구성 = 5 C. 연구 방법 = 6 Ⅱ. 이론적 배경 = 7 A. 이탈고객 분석모형으로서의 고객관계관리의 데이터 마이닝 = 7 B. 데이터 마이닝의 등장배경 = 9 C. 데이터 마이닝의 정의 = 10 D. 데이터 마이닝의 절차 = 12 E. 데이터 마이닝의 역할 = 14 F. 데이터 마이닝의 기법 = 16 1. 의사결정나무(Decision Tree) = 17 가. 의사결정나무(Decision Tree) 분석 = 17 나. 의사결정나무 구성 = 19 다. 의사결정나무의 알고리즘 = 20 (1) CHAID(Chi-squared Automatic Interaction Detection) = 21 (2) CART(Classification and Regression Tree) = 23 (3) QUEST(Quick Unbiased Effective Statistical Tree) = 26 (4) C5.0 = 27 2. 신경망분석(Neural Network) = 27 가. MLP(Multi Layer Perceptron) 신경망 = 30 나. RBF(Radial Basis Function) 신경망 = 32 다. EBF(Elliptical Basis Function) 신경망 = 35 3. 로지스틱 회귀분석(Logistic Regression Analysis) = 35 4. 연관규칙과 패턴분석(Association rules & Temporal Pattern) = 37 5. 군집분석(Clustering) = 39 Ⅲ. 실험 설계 = 40 A. 표준기업 및 변수선정 = 41 B. 모형구축 = 44 1. CART를 이용한 분석 모형 = 44 2. C5.0을 이용한 분석 모형 = 45 3. 신경망 모형을 이용한 분석 모형 = 46 4. 로지스틱 회귀분석을 이용한 분석 모형 = 47 5. 전체 모형의 예측 결과 비교와 고객이탈분석 최종모형 선택 = 48 Ⅳ. 결론 및 향후 연구 방향 = 53 참고문헌 = 55 ABSTRACT = 5

성긴 주성분 분석에 관한 연구

Thesis(masters) --서울대학교 대학원 :통계학과, 2009.2.Maste

구아신트리포스페이트 감지를 위한 형광공명에너지전달계 개발에 관한 연구

Thesis(master`s)--서울대학교 대학원 :화학부 유기화학전공,2006.Maste

A Study on Carferry Ship Characteristics and Residential Space Composition - Focusing on Carferry Built with the Coastal Ferry Modernization Fund -

본 연구에서는 ‘연안여객선 현대화 펀드’ 지원사업으로 건조된 6척의 카페리를 대상으로 운항노선을 기준으로 기본적인 선체의 규모와 일반적인 특성을 파악하였다. 그리고 선박별 승객 거주구의 공간구성을 승객이 숙박하는 객실공간과 다양한 선상 활동을 지원하는 공용공간으로 분류하고 각 공간의 유형과 특성을 분석하여 카페리의 거주구 공간구성 특성을 밝히려고 하였다. 거주구 공간유형은 다양한 등급의 객실공간과 식사공간, 휴게공간, 레저공간, 반려동물공간과 같은 공용공간으로 분류하였다. 연구대상 카페리는 선박이 본격적인 운항을 시작한선박의 진수 연도를 기준으로 진행하였다. 연구자료는 각 선사의 홈페이지에 소개된 Deck Plan과 연구자가 직접 승선하여 조사한 자료를 중심으로 하였다. 연구결과는 다음과 같다. 첫째, 국내 연안 카페리로 적합한 선체의 규모는 160m(L)x25m(W), 21,000Ton으로, 보편적으로 7개의 Deck으로 구성되고, 거주구는 승객들을 위한 2개의 Deck과 선원 및 승무원을 위한 1개의 Deck으로 구성된다. 이를 기준으로 항로의 특성과 운영방안에 따라규모가 증감하고 있다. 둘째, 우리 문화와 생활 특성을 반영하고 신규 여행객 창출을 위한 다양한 객실 유형과 공용시설이 제공되었다. 특히 승객의 프라이버시 보호와 쾌적성을 위해 파티션다인실, 리클라인의자실, 벙커형 1인 침대와 같은 다양한 프라이버시형 객실 공간이 제공되었다. 셋째, 이동의 불편을 해소하기 위해, 에스컬레이터, 엘리베이터, 무장애객실과 같은 시설과 공간을 제공하여, 카페리 이용의 보편성을 제공하였다. 넷째, 현대인의 생활양식을 반영하여 반려동물들이 함께 여행할 수 있게 반려동물 동반객실과 펫룸 등이제공되었다. 이는 장거리 여행 시 항공기보다 차별화된 장점이 될 수 있다. 다섯째, 골드스텔라호의 VIP실, 1등 실과 같이 오션뷰를 가진 객실에는 테라스를 설치하여, 선상 여행의 특별한 체험을 할 수 있게 할 필요가 있다. 여섯째, 선박별 거주구 공간구성의 차별성은 크지않은 것으로 나타난다. 다양한 여행수요 창출과 해상 여행경험을 높이기 위해서는 운항거리 및 항로의 특성을 반영하여 선박별로 차별화된 콘텐츠와 프로그램 그리고 이를 반영한 거주구 공간구성 방안이 필요하다. In this study, the size and general characteristics of the basic hull were identified based on the route of operation for six ferries built as a support project for the Coastal Passenger Ship Modernization Fund. In addition, the spatial composition of each ship's passenger residence was classified into a cabin space where passengers stay and a public space that supports various onboard activities, and the types and characteristics of each space were analyzed to reveal the spatial composition of the ferry. Residential space types were classified into shared spaces such as room spaces of various grades, dining spaces, rest spaces, leisure spaces, and pet spaces. The ferry subject to the study was conducted based on the launch year of the ship when the ship began full-fledged operation. The research data focused on the Deck Plan introduced on each shipping company's website and the data directly investigated by the researcher. The results of the study are as follows. First, the size of the hull suitable for a domestic coastal ferry is 160m(L)x25m(W) and 21,000Ton, which generally consists of seven decks, and the residence consists of two decks for passengers and one deck for crew and crew. Based on this, the size is increasing or decreasing according to the characteristics of the route and the operation plan. Second, various room types and public facilities were provided to reflect our culture and life characteristics and create new travelers. In particular, various privacy-type room spaces such as partition multi-person rooms, recline bedrooms, and bunker-type single-person beds were provided to protect passengers' privacy and comfort of passengers. Third, in order to solve the inconvenience of movement, facilities and spaces such as escalators, elevators, and barrier-free rooms were provided to provide the universality of using the ferry. Fourth, pet rooms and pet rooms were provided to reflect the lifestyle of modern people so that pets could travel together. This can be a differentiated advantage over aircraft when traveling long distances. Fifth, it is necessary to install terraces in rooms with ocean views, such as the VIP room and the first class room of the Gold Stella, so that you can have a special experience of ship travel. Sixth, the difference in the spatial composition of the residence by ship does not appear to be significant. In order to create various travel demand and increase the experience of sea travel, differentiated contents and programs for each ship reflecting the characteristics of the distance and route, and a plan to organize residential spaces reflecting them are needed

Cultural effects on translation

학위논문(석사)--서울대학교 대학원 :언어학과 언어학전공,2000.Maste

대학생의 내면화된 수치심 및 자기수용이 사회불안에 미치는 영향

학위논문(석사)--아주대학교 교육대학원 :심리치료교육,2016. 8본 연구는 대학생의 내면화된 수치심 및 자기수용이 사회불안에 미치는 영향을 경험적으로 파악해 보고, 내면화된 수치심과 사회불안간의 관계에서 자기수용이 조절효과를 나타내는지 알아보는 데 목적을 둔다. 이를 살펴보기 위해, 다음과 같은 연구문제를 설정하였다. 첫째, 대학생의 내면화된 수치심 및 자기수용, 사회불안의 인구통계학적 변인에 따른 차이는 어떠한가? 둘째, 대학생의 내면화된 수치심 및 자기수용, 사회불안의 상관관계는 어떠한가? 셋째, 대학생의 내면화된 수치심 및 자기수용이 사회불안에 미치는 영향은 어떠한가? 넷째, 대학생의 내면화된 수치심과 사회불안의 관계에서 자기수용은 조절효과를 나타내는가? 이와 같은 연구문제를 검증하기 위하여 경기도 소재 1개 대학 국제캠퍼스에 재학 중인 대학생 550명을 대상으로 설문조사를 하였다. 본 연구에서는 내면화된 수치심 척도, 사회적 회피 및 불안 척도, 자기수용도 검사 척도를 사용하였으며, 이에 대한 자료의 분석은 SPSS 23.0을 활용하여 상관분석, 단순회귀분석, 표준다중회귀분석, 위계적 회귀분석을 실시하였다. 본 연구의 결과는 다음과 같다. 첫째, 대학생의 내면화된 수치심 및 자기수용, 사회불안의 인구통계학적 변인에 따른 차이는 성별, 학년에 있어서는 유의미한 차이를 보이지 않았으며, 전공에 따른 차이는 예체능계열 학생들의 내면화된 수치심과 사회불안이 유의미하게 높게 나타났다. 둘째, 사회불안의 경우 자기수용과 유의미한 부적 상관관계를 보였고, 내면화된 수치심과 사회불안은 유의미한 정적 상관관계를 보였다. 반면, 내면화된 수치심과 자기수용은 부적 상관을 보였다. 셋째, 내면화된 수치심 및 자기수용은 사회불안에 영향을 미치는 변인으로 확인되었다. 즉 내면화된 수치심이 높아질수록, 자기수용은 낮아질수록, 사회불안이 증가하며, 내면화된 수치심과 자기수용 중에서는 자기수용의 예측력이 더 큰 것을 확인하였다. 넷째, 내면화된 수치심과 사회불안의 관계에서 자기수용의 조절효과는 나타나지 않았다. 이러한 연구결과로 내면화된 수치심과 자기수용이 사회불안에 미치는 영향에 대해 구체적으로 살펴 사회불안을 호소하는 학생의 상담을 돕는 데 필요한 정보를 제공하는데 의의가 있다. 끝으로 본 연구의 제한점과 후속연구를 위한 제언에 대해 논의하였다.Ⅰ. 서론 1. 연구의 필요성 및 목적 1 2. 연구문제 4 Ⅱ. 이론적 배경 1. 사회불안 5 2. 내면화된 수치심 7 3. 자기수용 9 4. 각 변인 간 선행 연구 11 Ⅲ. 연구방법 1. 연구대상 14 2. 측정도구 16 3. 자료분석 19 Ⅳ. 연구결과 21 Ⅴ. 요약 및 결론 40 참고문헌 47 부록 54Maste

HREELS Study on Plasmon Excitations of Low-dimensional Systems

DoctorPlasmons, which are collective excitations of charge carriers, have been extensively studied on account of their importance in condensed matter physics and their potential application in the fabrication of enhanced, highly efficientnanoscale devices. With the advance in technology, plasmons could eventually be confined to a small volume of atomic-scale, and they are expected to have unusual physical properties because of their low-dimensional electronic systems.Here, we report our experimental results for electronic excitations measuredfrom two prototypical atomic-scale systems using high-resolution electron energy loss spectroscopy.As a rst system, we have studied several Au-induced facet structures formedon Si(5512) surface, where several quasi-one dimensional plasmon excitationswith signifficantly anisotropic energy-momentum dispersion have been observed. Those dispersions of plasmon excitations appear to be quite similar to each other despite signifficant dierences in the atomic structures of theirsubstrate surfaces. We suggest the spin-orbit interaction as an origin of suchsimilarity in the dispersions but also of the two proximal surface bands nearFermi level (EF ) commonly observed for these Au-induced 1D systems. We also find the interchain interactions between metallic chains minimal.We have also investigated the dispersion of a low-energy intraband π-plasmon arising from Dirac fermions within a partially occupied conductionband of single-layer graphene (SLG). The dispersion from the SLG appears tobe quite distinct from that of normal two dimensional systems or of a few-layergraphene. Discussion of the physical implications of the novel dispersion fromthe SLG refers to a recently developed theory on doped graphene.Finally, we report that the behavior of plasmon excitation in SLG can bemodified by doping external potassium (K) atoms without altering the uniqueplasmonic character of the SLG. This capability should provide a good opportunity in developing noble graphene-based nano-devices with enhanced performance