서울대학교 학술정보화 백서 2000-2007

연구보고 2007-

서울대학교 학술정보화 백서 2008-2010

연구보고 2011-

HymnTron: A DNN Based Automatic Music Composer

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 자연과학대학 수리과학부, 2019. 2. 강명주.최근의 개발로 인해, 딥 뉴럴 네트워크 (Deep Neural Networks)를 사용하기위한 많은 어플리케이션이 존재한다. 그 중 하나는 음악 작곡이다. 이 논문에서 우리는 인간 작곡과 구별 할 수없는 음악을 작곡하려고 시도한다. 시드 노트로 작곡을 시작한다. 다음으로 LSTM을 사용하여 주어진 시드 노트와 코드 진행에서 수많은 멜로디를 작곡한다. 마지막으로, 우리는 빔 검색 알고리즘을 통해 원하는 수의 컴포지션 만 유지하기 위해 다양한 스코어링 알고리즘 함수를 사용한다. 인간 조사는 품질 테스트를 위해 수행된다.With recent developments, there are many different applications for the use of Deep Neural Networks. One of which is music composition. In this thesis, we attempt to compose music that is indistinguishable from human composition. We initialize the composition with a seed note. Next, we utilize the long-short term memory network to compose numerous melodies from the given seed note and the chord progression. Finally, we use a variety of scoring functions to keep only a desired number of compositions through the beam search algorithm. Human survey is conducted for quality testing.Contents Abstract i 1 Introduction 1 2 Data Processing 3 2.1 Transformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2.2 Quantization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 2.3 Renement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 2.4 Encoding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 3 Model Descriptions 7 3.1 Melody Sequential Model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 3.1.1 Model Architecture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 3.1.2 Loss . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 4 Generation 10 4.1 Beam Search . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 4.2 Temperature . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 4.3 Scoring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 4.4 Constraints . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 5 Experiments 15 5.1 Experiment Premises . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 5.2 Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 6 Conclusion 17 The bibliography 19 Abstract (in Korean) 20Maste

모델 변환 오퍼레이터들을 이용한 설계 모델 변화와 디자인 패턴의 적용

학위논문(석사)--서울대학교 대학원 :전기·컴퓨터공학부,2003.Maste

Fusarium graminearum virus1에 감염된 붉은 곰팡이에서 발현량이 증가하는 유전자들에 관한 기능분석

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 농생명공학부, 2015. 2. 김국형.Fusarium graminearum virus 1(FgV1) is a mycovirus that isolated from Fusarium boothii. It has 6.6kb double stranded RNA as a genome, including putative four open reading frames. Along with FgV1, three other mycoviruses have been reported including FgV2, FgV3, and FgV4. Among four reported viruses, FgV1 and FgV2 infection shows hypovirulence such as a reduction in growth rate, conidiation, and virulence to their host fungi. But infection with the other two viruses, FgV3 and FgV4,makes no dramatic morphological change. Based upon RNA-sequence analyses of the host transcriptome upon combination of those four mycovirus infection, ten genes that might have relationship with mycovirus infection and/or defense responses of the host fungi are selected. These genes were assorted into four groups depending on their changes of expression level upon virus infection. To investigatepossible functional roles of these genes involved inrelationship between host fungi and virus, targetgene deletion mutants were generated. FgV1 infected deletion mutants were constructed using hyphal fusion mediated mycovirus transmission. While deletion mutants did not show significant alterationin colony morphology and radial growth on solid comparing with wild-type strain, viral RNA accumulations in fgsg_05076 and fgsg_10551 deletion mutantswere decreased comparing with those of virus infected wild-type strain. This study can provide experimental support for RNA-sequence analysis and investigation of individual gene functions which related to FgV1 accumulation in host fungi, F. graminearum.ABSTRACT……………………………………………………………………5 CONTENTS……………………………………………………………………7 LIST OF TABLES……………………………………………………………. 9 LIST OF FIGURES……………………………………………………….. 10 I.INTRODUCTION………………………………………………………… 11 II. MATERIALS AND METHODS…………………………………………15 1. Fungal strains and culture condition………………………………………….. 15 2. Computational analysis………………………………………………………15 3. Construction of target gene deletion and complementation mutants…………… 15 4. Fungal transformation……………………………………………………. 18 5. Genomic DNA extraction………………………………………………….. 19 6. Southern blot hybridization ………………………………………………. 19 7. Total RNA extraction…………………………………………………….... 20 8. Semi quantitative RT-PCR.……………………………………………….. 20 III. RESULTS……………………………………………………………. 27 1. Selection of target gene.....................................................................…………27 2. Prediction of gene function using blast tools………………………………… 27 3. Generation of gene deletion mutants………………………………………… 28 4. Generation of complementation mutants……………………………………. 28 5. Colony morphology test……………………………………………………. 35 6. Vegetative growth of deletion mutants……………………………………….. 35 7. Quantification of FgV1 viral RNA accumulation using semi-quantitative RT-PCR……………………………………………………………………… .40 IV.DISCUSSION……………………………………………………………. 42 V.LITERATURE CITED…………………………………………………. 47 VI. ABSTRACT IN KOREAN……………………………………………. 53Maste

한국인 유전체 변이 표준 데이터베이스 (KOVA) 구축

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 자연과학대학 생명과학부, 2018. 8. 백대현.Previous efforts in identifying and understanding human genome variations have been systematically preferred towards the populations of Caucasian descendants and have resulted in loss of accuracy and detection power when analyzing genome variations in non-Caucasian populations. To improve accuracy and precision in studying genome variations in the Korean population, we have compiled and curated a large-scale database of coding variants from 1,055 healthy Korean samples. These samples were sequenced to an average depth of 75x with 101 singleton variants per individual. Through analysis of our healthy Korean cohort, we found distinct ethnic group characteristics comparable to that of other ethnic groups in Africa and Europe, indicating that the Korean population are a discrete ethnic group that can benefit from an independent reference database. Through population genetics analyses, we found that our Korean Variant Archive (KOVA) increased variant filtering power when examining Korean exomes in concert with Exome Aggregation Consortium. Interestingly, we provide a cohort of potential germline variants that may be associated with susceptibility to tumorigenesis. These rare germline variants were validated using independent datasets from The Cancer Genome Atlas and 1000 Genome Project. To our knowledge, KOVA represents the first database curated using high quality whole exome sequencing-based variants specifically from Korean individuals that can serve as a valuable resource for future studies in the study of human genome variations in the Korean population.ABSTRACT i CONTENTS iii INTRODUCTION 1 RESULTS 4 Sample preparation, variant calling, and quality control 4 KOVA population genetics and basic statistics 5 Functional analysis of coding variants 7 Potential role of rare germline variants on tumor susceptibility 8 DISCUSSION 11 METHODS 14 FIGURES AND TABLES 19 Figure 1 19 Figure 2 20 Figure 3 21 Figure 4 22 Figure 5 23 Table 1 24 Table 2 25 Table 3 26 Table 4 27 REFERENCES 28 APPENDIX 30 국문 초록 43Maste

Mobile multispectral imaging device, user mobile device connection, image analysis software in a connected server for skin healthcare

피부 헬스케어를 위한 모바일 다중 분광 이미징 디바이스가 제공된다. 본 발명의 실시예에 따른 피부 헬스케어를 위한 모바일 다중 분광 이미징 디바이스는 사용자 단말이 장착되고, 사용자 단말의 광원 및 촬영부를 이용하여 촬영 대상의 피부를 촬영한다. 이러한 휴대용 분광 이미징 디바이스는 사용자 단말이 장착되는 본체, 본체에 장착된 사용자 단말의 광원 및 촬영부에 대응하는 위치에 배치되며, 광원을 촬영 대상의 피부로 조사하고, 촬영 대상의 피부로부터 반사된 광을 수신하여 촬영부로 출력하는 광학계, 다수의 광학 필터를 포함하고, 사용자 단말의 촬영 요청에 따라 하나의 선택된 광원 필터가 광원과 일직선 상에 배치되도록 회전가능한 필터 휠, 사용자 단말로부터의 촬영 요청에 따라 다수의 광학 필터의 각각이 광원과 일직선 상에 위치되도록 촬영부의 촬영 속도에 기반하여 필터 휠을 연속적으로 회전시키는 구동 모터, 사용자 단말로부터 촬영 요청을 수신하도록 통신하는 통신부, 및 광학계에 대응하는 위치에 관통구를 구비한 덮개부를 포함한다.사용자 단말이 장착되고, 상기 사용자 단말의 촬영부를 이용하여 촬영 대상의 피부를 촬영하는 휴대용 분광 이미징 디바이스로서,상기 사용자 단말이 장착되는 본체;소정의 광원 및 상기 촬영부에 대응하는 위치에 배치되며, 상기 광원을 상기 촬영 대상의 피부로 조사하고, 상기 촬영 대상의 피부로부터 반사된 광을 수신하여 상기 촬영부로 출력하는 광학계;상기 광원의 광경로 상에 배치되어 상기 광원으로부터 조사된 광을 다수의 파장 대역으로 필터링하되, 상기 사용자 단말의 촬영 요청에 따라 어느 하나가 상기 광원의 광경로 상에 위치되도록 제어되는 다수의 광학 필터; 및상기 본체를 마감하는 덮개부를 포함하는, 피부 헬스케어를 위한 모바일 다중 분광 이미징 디바이스

Portable spectral imaging device, user mobile terminal, method and software program for diagnosis and management of skin

피부 진단 및 관리를 위한 휴대용 분광 이미징 디바이스가 제공된다. 본 발명의 실시예에 따른 피부 진단 및 관리를 위한 휴대용 분광 이미징 디바이스는 촬영 기능을 갖는 사용자 단말에 장착되고, 필터 휠에 형성된 다수의 광학 필터를 통하여 상기 사용자 단말의 광원을 촬영 대상의 피부로 조사하며, 상기 촬영 대상의 피부로부터 반사된 광을 수신하여 상기 사용자 단말의 촬영부로 출력하는 광학계; 상기 사용자 단말로부터의 촬영 요청에 따라 상기 다수의 광학 필터의 각각의 광학 필터가 상기 광원과 일직선 상에 위치되도록 상기 촬영부의 촬영 속도에 기반하여 상기 필터 휠을 연속적으로 회전시키는 구동 모터; 및 상기 사용자 단말로부터 상기 촬영 요청을 수신하도록 통신하는 통신부를 포함할 수 있다.촬영 기능을 갖는 사용자 단말에 장착되고, 필터 휠에 형성된 다수의 광학 필터를 통하여 상기 사용자 단말의 광원을 촬영 대상의 피부로 조사하며, 상기 촬영 대상의 피부로부터 반사된 광을 수신하여 상기 사용자 단말의 촬영부로 출력하는 광학계; 상기 사용자 단말로부터의 촬영 요청에 따라 상기 다수의 광학 필터의 각각의 광학 필터가 상기 광원과 일직선 상에 위치되도록 상기 촬영부의 촬영 속도에 기반하여 상기 필터 휠을 연속적으로 회전시키는 구동 모터; 및 상기 사용자 단말로부터 상기 촬영 요청을 수신하도록 통신하는 통신부를 포함하는, 피부 진단 및 관리를 위한 휴대용 분광 이미징 디바이스

MOBILE MULTISPECTRAL IMAGING DEVICE, USER TERMINAL FOR ACQUIRING MULTISPECTRAL IMAGE, SPECTRAL IMAGE ANALYSIS SERVER AND METHOD THEREOF

<p id

Portable spectral imaging device, user mobile terminal, method and software program for diagnosis and management of skin

피부 진단 및 관리를 위한 휴대용 분광 이미징 디바이스가 제공된다. 본 발명의 실시예에 따른 피부 진단 및 관리를 위한 휴대용 분광 이미징 디바이스는 촬영 기능을 갖는 사용자 단말에 장착되고, 소정의 광원으로부터 생성되는 광을 촬영 대상의 피부 측으로 조사하며, 상기 촬영 대상의 피부로부터 반사된 광을 수신하여 상기 사용자 단말의 촬영부로 출력하는 광학계를 포함하고, 상기 광학계는, 상기 광원의 광경로 상에 배치되어 상기 광원으로부터 조사된 광을 다수의 파장 대역으로 필터링 하는 다수의 광학 필터를 포함할 수 있다.촬영 기능을 갖는 사용자 단말에 장착되고, 소정의 광원으로부터 생성되는 광을 촬영 대상의 피부 측으로 조사하며, 상기 촬영 대상의 피부로부터 반사된 광을 수신하여 상기 사용자 단말의 촬영부로 출력하는 광학계;를 포함하고,상기 광학계는, 상기 광원의 광경로 상에 배치되어 상기 광원으로부터 조사된 광을 다수의 파장 대역으로 필터링 하는 다수의 광학 필터;를 포함하는, 피부 진단 및 관리를 위한 휴대용 분광 이미징 디바이스