맹자의 自取와 정치적 책임론 : 인성론 및 왕도정치론과의 연관

본 논문에서 인용된 ≪孟子集註≫ㆍ≪論語≫ㆍ≪書經≫에 대하여, 간접인용이 필요한 경우 ≪孟子集註≫는 각 장ㆍ절ㆍ단락의 번호를, ≪論語≫는 각 장 명칭의 음독과 절의 번호를 명시하였다. 직접 인용의 경우, ≪孟子集註≫의 인용표기는 상기한 바와 같으며, ≪書經≫의 경우 다른 저서와의 혼동을 피하기 위해 원 저서명과 장의 명칭을 모두 명시하였음을 밝힌다.정치가는 언제나 도덕적인 깨끗함과 현실적인 성취를 동시에 요구받는 위치에 있다. 도덕적으로 깨끗하지 않은(또는 깨끗할 것을 지향하지 않는) 정치가는 민중으로부터 외면받는다. 그러나 다른 한편으로는 정치가는 민중들에게 일정한 현실적 성과를 보이지 않으면 민중으로부터 마찬가지로 외면당할 것이며, 특히 정치형태가 현대의 대의민주주의로 이행되고 정치가의 지위가 단순히 賢人의 수준을 넘어서서 한 지역공동체의 대표로서 새로이 정립됨에 따라 이러한 경향성은 더욱 심해진다. 정치가들은 끊임없이 선택의 기로에 내몰리고, 으레 정치는 도덕적인 이미지와 현실적인 수완 사이의 줄타기가 되는 경우가 흔하다. 이는 정치가 개인이 가치 판단을 내린 결과 도덕이 정치적인 이익을 취함에는 하등 도움이 되지 않는다는 결론이 섰기 때문일 수도 있다. 또 다른 한편으로는 도덕성의 온전한 실현만을 추구했을 때는 자신에게 요구되는 현실적 성취를 달성할 수 없을 것 같기에 어쩔 수 없이 타협한 경우 역시 있을 수 있다. 그러나 어느 쪽의 관점에서 보든, 도덕성보다는 현실적 이익을 정치의 원칙으로 삼은 사실은 변하지 않는다

인간면역결핍 바이러스 감염에 의한 R-루프 구조 생성 및 바이러스 게놈 삽입 위치 조절 연구

학위논문(박사) -- 서울대학교 대학원 : 자연과학대학 생명과학부, 2024. 8. 안광석.Integration of viral DNA into the host genome is a crucial step in the Human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) infection; however, the factors that influence the selection of integration sites are not comprehensively understood. Although HIV-1 integration sites are considered to favor active transcription units in the human genome, high-resolution analysis of individual HIV-1 integration sites have shown that the virus can integrate in a variety of host genomic locations, including non-genic regions, challenging the traditional understanding of HIV-1 integration site selection. Here, I showed that HIV-1 targets R-loops, a genomic structure made up of DNA–RNA hybrids, for integration. HIV-1 initiates the formation of R-loops in both genic and non-genic regions of the host genome and preferentially integrates into regions of HIV-1-induced R-loops. Using a novel cell model that can independently control transcriptional activity and R-loop formation, I demonstrated that the presence of R-loops, regardless of transcriptional activity, directs HIV-1 integration targeting sites. I also found that HIV-1 integrase proteins bind to the R-loops, in vitro and the host genomic R-loops in cells infected with HIV-1. These findings provide fundamental insights into the mechanisms of retroviral integration and the prognosis of antiretroviral therapy.인간면역결핍 바이러스 (HIV-1)는 RNA 게놈을 DNA로 역전사하고 숙주 게놈에 통합함으로써 숙주세포를 감염시킨다. 그러나 HIV-1 게놈이 숙주 게놈에 통합되는 위치를 결정하는 요인은 명확히 밝혀지지 않았다. HIV-1 통합 위치는 인간 게놈에서 유전자가 활발히 전사되는 부위를 선호하는 것으로 간주되었지만, 최근 개별 HIV-1 통합 위치에 대한 고해상도 분석 결과에 따르면 HIV-1 바이러스 게놈은 비유전자 영역을 포함한 다양한 숙주 게놈 영역에 통합될 수 있음이 밝혀졌다. 본 연구에서는 HIV-1이 숙주 게놈의 DNA-RNA 혼합체로 구성된 게놈 구조인 R-루프에 우선적으로 바이러스 게놈을 통합시킨다는 것을 밝혔다. HIV-1 바이러스 감염은 숙주 게놈의 유전자 및 비유전자 영역에서 모두 R-루프 형성을 우도하고, HIV-1 감염에 의해 유도된 R-루프 영역에 바이러스 게놈을 통합시킨다는 것을 발견했다. 특히, 유전자 전사 활동과 R-루프 형성을 독립적으로 제어할 수 있는 새로운 세포 모델을 사용하여, 전사 활동에 관계없이 R-루프의 존재가 HIV-1 통합 위치를 결정하는 주요 요인임을 입증했다. 또한 HIV-1 통합 효소 단백질이 R-루프에 물리적으로 결합한다는 것을 밝혀냄으로써 새로운 레트로바이러스 게놈 통합 기작을 제시하는 것뿐만 아니라 항레트로바이러스 치료제 개발을 위한 통찰력을 제공한다.Acknowledgements VII List of Tables and Figures XII List of Abbreviations XVII Summary XVIII 1. INTRODUCTION 1 1.1. Mechanism of HIV-1 integration site selection and HIV-1 infection 1 1.2. R-loop in cellular genome 7 1.3. Host factor and host genomic R-loops in HIV-1 integration site determination 9 2. MATERIALS AND METHODS 11 2.1. Cell culture 11 2.2. Virus production and infection 11 2.3. Primary cell isolation, culture, T cell activation and infection 12 2.4. DRIPc-seq library construction 13 2.5. Immunofluorescence microscopy 15 2.6. HIV-1 integration site sequencing library construction 16 2.7. pgR-rich and -poor cell line generation with piggyBac transposition 17 2.8. Co-immunoprecipitation of DNA–RNA hybrid 18 2.9. Recombinant Sso7d-IN protein purification 20 2.10. Electrophoretic mobility shift assay for R-loop binding of Sso7d-IN 21 2.11. Proximity Ligation Assay (PLA) 21 2.12. DRIPc-Seq data processing and peak calling 22 2.13. Consensus R-loop peak calling 23 2.14. HIV-1 integration site sequencing data processing 23 2.15. Co-localization analysis of R-loops and integration sites 24 2.16. DNA plasmid construction and transfection 25 2.17. DNA–RNA hybrid dot blotting 25 2.18. DRIP-qPCR 26 2.19. RNA-seq library construction 26 2.20. Luciferase assay 26 2.21. Quantitative real-time PCR (qPCR) 27 2.22. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) of Flag-tagged codon-optimized integrase 27 2.23. Immunoblotting 29 2.24. RNA-seq data processing 30 2.25. Genome annotations 30 2.26. Identification of viral sequencing reads in DRIPc-seq 31 2.27. Code availability 31 3. RESULTS 38 3.1. DRIPc-seq analysis of host genomic R-loops dynamics upon HIV-1 infection 38 3.2. Host cellular R-loops accumulate after HIV-1 infection in HeLa cells 52 3.3. R-loops induced by HIV-1 are widely distributed in both genic and non-genic regions regardless of the expression 58 3.4. Host genomic R-loops regulate HIV-1 integration 71 3.5. HIV-1 integration sites are enriched at systemically induced sequence-specific R-loop regions in cell model 80 3.6. HIV-1 exploits the HIV-1-induced host genomic R-loops for viral DNA integration 95 3.7. HIV-1 integrase physically interacts with R-loops on the host genome 108 4. DISCUSSION 137 5. REFERENCES 143 6. ABSTRACT IN KOREAN 152박

사람 연골세포의 IL-1β 에 의한 염증 반응에서 microRNA-449a 의 역할

Dept. of Medical Science/석사SIRT1 has anti-inflammatory as well as protective effects in chondrocytes. The object of this study was to investigate whether microRNA-449a regulates expression of SIRT1, which inhibits expression of catabolic genes in IL-1β-induced cartilage destruction. MicroRNA-449a expression was determined in OA chondrocytes and IL-1β-induced chondrocytes by real-time PCR. MicroRNA-449a binding sites on the 3'-UTR of SIRT1 mRNA and binding site conservation were examined using microRNA target prediction tools. SIRT1-overexpressing or knockdown chondrocytes were transfected with microRNA-449a mimic or anti-microRNA-449a mimic and stimulated by IL-1β. Expression of catabolic and anabolic genes was examined by real-time PCR and western blotting. Finally, positive effects of anti-microRNA-449a on expression of these genes were confirmed by western analysis of OA chondrocytes. Expression of microRNA-449a was increased in OA chondrocytes and IL-1β-induced chondrocytes. MMP-13 expression was enhanced, whereas type II collagen and SIRT1 expression were decreased in IL-1β-induced chondrocytes. SIRT1 overexpression resulted in decreased expression of catabolic genes, such as MMPs and ADAMTSs in response to IL-1β, but these effects were moderated by microRNA-449a. Suppression of microRNA-449a by anti-microRNA-449a inhibited expression of catabolic genes despite IL-1β stimulation, but these effects were abolished in SIRT1 knockdown chondrocytes. Furthermore, expression of catabolic genes was decreased and expression of type II collagen as well as SIRT1 was restored by anti-microRNA-449a in OA chondrocytes as well as in IL-1β-induced chondrocytes. Taken together, silencing of microRNA-449a had a protective effect, inhibiting catabolic gene expression and restoring anabolic gene expression, by targeting SIRT1 in IL-1β-induced cartilage destructionope

The effect of strategy instruction on promoting analogy use in problem solving settings

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 심리학과, 2015. 2. 박주용.유추는 인간이 가지는 기본적인 추론 방식 중 하나인 동시에, 문제해결이나 의사결정에 도움을 줄 수 있는 인지적 전략이기도 하다. 지금까지 많은 연구들로부터 유추의 사용이 창의적 해결책의 도출, 불확실성의 감소 등의 측면에서 도움을 줄 수 있음이 밝혀져 왔다. 그러나 이러한 이점에도 불구하고, 인간이 실제로 인지적 전략으로서 유추를 잘 사용할 수 있느냐에 대해서는 상반된 결과들이 보고되어 왔다. 이 연구들은 대부분 유추의 사용에 대해 상이한 상황 설정과 평정 기준을 가진 상태에서 진행되었기 때문에, 인간의 유추 사용 능력에 대해 일관된 결론을 내리기에 무리가 있다. 뿐만 아니라 인지적 전략으로서의 유추를 쉽게 사용할 수 있도록 촉발시킬 수 있는지, 그것이 가능하다면 어떤 방법이 효율적인지 등에 대해서는 거의 연구가 이루어지지 않은 상황이다. 따라서 본 연구에서는 인지적 전략으로서의 유추 사용이 지시나 과제에 의해 촉발될 수 있는지에 대해 실험을 진행하였다. 본 연구에서는 대학생 96명을 대상으로 사고 발화(think-aloud) 기법을 이용하여 문제 해결 과정에서의 유추 사용 및 그 특징을 측정하였다. 연구 1에서는 참여자들에게 유추 사용을 권유하는 직접적인 지시를 내렸다. 연구 2에서는 참여자들에게 생성 패러다임(Blanchette & Dunbar, 2000)에 의한 유추 생성 과제를 실시하도록 하였다. 그 결과, 생성 패러다임 조건 및 유추 직접지시 조건의 참가자들은 통제조건의 참여자들에 비해 유추 사용이 촉진되었음을 확인하였다. 단, 유추 사용에 대한 직접 지시는 정구조 문제에 비해 비구조 문제에서는 그 효과가 떨어짐이 드러났다. 또한, 유추 생성 과제를 수행한 조건은 통제조건이나 직접 지시 조건에 비해 원거리 유추를 더 많이 생성하는 것으로 나타났다. 그러나 이러한 유추 촉진 처치의 효과는 명시적인 지시문이나 과제가 제시되지 않으면 사라졌다. 이 결과에 대해, 유추가 암묵적 전략이기 때문에 명시적 지시로는 제대로 학습되지 않을 가능성과 더불어, 유추에 대한 기존의 구조적 정렬 접근 자체가 적절하지 않을 가능성을 검토하였다.Analogy is a cognitive strategy which can improve problem solving or decision making process, as well as one of the fundamental ways of reasoning. Traditional studies have shown that the use of analogy can lead to creative solutions or decreased uncertainty in problem solving. Meanwhile, there has been a controversy about whether human can use analogy as a cognitive strategy proficiently or not. Many studies on analogy use could not make a consensus because they had different task settings and incoherent criteria evaluating generated analogs. Also, it has been rarely researched how to guide analogy use efficiently when it is needed. Therefore, two experiments were conducted to investigate the fundamental abilities of humans to use analogy and the effect of strategy instructions on promoting analogy generation. Ninety-six undergraduate students performed two types of problem-solving tasksone was a well-defined, physics problem used by Clement(1988, 2008), and the other was an ill-defined, social-issue problem. Participants thinking process were obtained using a think-aloud method. Frequency and characteristics of analogy use were measured in the protocol. Two kinds of analogy-promoting treatment were applied in each study. In Study 1, a direct instruction promoting analogy use was used. In Study 2, participants performed the analogy generation task using production paradigm suggested by Blanchette and Dunbar(2000). Both participants in the direct-instruction condition and generation-task condition produced more source analogs than those in the control group. The participants in the generation-task condition produced more fardistance analogs than those in the control or direct-instruction group. However, the effect of direct instruction was limited in the ill-defined problem, which allowed less analogy use than in the well-defined problem. Moreover, the effect of both analogy-promoting treatments decreased when explicit instructions were withdrawn. Two possibilities for these results were discussed. First, the mechanism of analogy might have an implicit feature, so that explicit instructions or tasks cannot help participants use analogy as a cognitive strategy. Second, structural alignment, which is a traditional explanation about the analogy mechanism, might not an appropriate approach to explain or induce analogy generation.제 1 장 서 론 1 제 1 절 연구의 배경 및 목적 1 제 2 절 유추 사용 능력에 대한 연구 개괄 2 제 3 절 문제해결에서의 유추의 역할과 메커니즘 4 제 4 절 문제해결에서의 유추 사용 능력 연구 비판 7 제 2 장 연구 1: 직접 지시에 의한 유추 사용 12 제 1 절 실험 방법 12 제 2 절 분석 15 제 3 절 실험 결과 18 제 4 절 논의 23 제 3 장 연구 2: 생성 패러다임에 의한 유추 사용 24 제 1 절 실험 방법 24 제 2 절 분석 28 제 3 절 실험 결과 1: 처치 효과와 유추 사용의 빈도 29 제 4 절 실험 결과 2: 처치 효과와 유추 사용의 특성 35 제 5 절 실험 결과 3: 유추 사용과 문제 지각 및 해결 37 제 6 절 논의 39 제 4 장 종합 논의 43 제 1 절 연구 요약 43 제 2 절 결과 해석 43 제 3 절 연구 의의와 한계 48 제 4 절 제언 50 참고 문헌 52 Abstract 56 부록 1: 연구 1 자극 58 부록 2: 연구 2 자극 62 부록 3: 비구조 문제 원문 66 부록 4: 유추 예시 67Maste

대장균에서 발현된 pseudomonas fluorescens esterase Ⅲ의 대량생산 및 순수정제

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 생명과학과, 1994.2, [ vi, 49 p. ]The esterase III encoded by estC gene of Pseudomonas fluorescens was overexpressed in Escherichia coli BL21(DE3) by using the T7 expression system. The open reading frame of estC gene amplified by polymerase chain reaction was subcloned into T7 promoter-containing plasmid, pRSET. The resultant plasmid, pREIII was used for transformation of E. coli cells. The expression level of esteraseIII in E. coli harboring pREIII was 20 times higher than that harboring pUE892 which contains estC under lac promoter. The protein was successfully expressed without forming any inclusion body in side the E. coli cells. The amount of the enzyme was estimated to be 7-14\% of total cellular protein as judged by densitometer after SDS-gel electrophoresis. Following sequential DEAE-Sepharose ion exchange chromatography and Superose 12 gel filtration chromatography, the protein was purified to homogeneity. After purification, activity yield was 34\% and thr specific activity was 107000.한국과학기술원 : 생명과학과

리파제를 이용한 CLA 함유 아스코르브산의 합성

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 생물과학과, 2001.2, [ vi, 35 p. ]The synthesis of conjugated linoleyl ascorbic acid was achieved by lipase-mediated esterification in organic media, using immobilized Candida antartica lipase from Roche. This enzyme was perfectly regioselective. The product was extracted and subjected to HPLC. The yield was greatly influenced by the kinds of solvents, reaction temperature, the initial water activity $(a_w)$ and the molar ratio of L-ascorbic acid to conjugated linoleic acid (CLA). Highest conversion of the esterification was obtained with the initial water activity $(a_w)$ 0.43 after 48 hours at 50℃ in 68mmol of the acetone using 50㎎ of enzyme, when molar ratio of L-ascorbic acid to CLA was 1:11. The selected solvent was both easily eliminated and accepted by European Community for use in the manufacture of foods and/or food additives. At that moment, maximum yield was 64.6%.한국과학기술원 : 생물과학과

In Vivo Cartilage Formation Using Human Bone Marrow-Derived Mesenchymal Stem Cells Mixed with Fibrin Glue

Purpose: To investigate the feasibility of in vivo cartilage formation by direct injection the chondrogenicundifferentiated human bone marrow-derived mesenchymal stem cells (hBMSCs) mixed with fibrin glue including TGF-β3. Materials and Methods: Chondrogenic differentiation induced hBMSCs for 14 days (control group-2) and undifferentiated hBMSCs combined with TGF-β3 mixed (experimental group-3) with fibrin glue and fibrin glue only (control group-1) were injected subcutanteously into the back of nude mouse. For evaluation of the cartilage-like tissue formed after 8 weeks after injection, real time PCR, histological analysis and immunohistochemical analysis were used. Results: Control group-1 did not form any visible mass. Control group-2 as well as experimental group-3 could form new cartilage-like tissue which were demonstrated expression of type II collagen by real-time PCR, histology analysis such as H&E staining, MT staining and type II collagen specific immunohistologic analysis. As results, expression of type II collagen was shown in the both groups. Conclusion: Our study confirmed that cartilage-like tissues could be formed in subcutaneous layer of nude mouse by direct injection mixed with fibrin glue including TGF-β3 without chondrogenic-induction of hBMSCs, suggesting that these model could be suitable for preliminary studies or optimizing experiments to evaluate reconstruction of cartilage.prohibitio