鲑鳟通用型低通量单核苷酸多态性芯片的开发

为开发常见鲑鳟养殖物种通用的遗传分析工具,本研究利用Affymetrix虹鳟（Oncorhynchus mykiss） 57K高通量单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）芯片,对国内代表性鲑鳟养殖群体开展了分型检测,包括山女鳟（Oncorhynchus masou masou）、银鲑（Oncorhynchus kisutch）、美洲红点鲑（Salvelinus fontinalis）、白斑红点鲑（Salvelinus leucomaenis） 4个物种,从57,501个SNP标记中筛选出96个共享多态性标记,应用Fluigidm 96.96动态芯片平台,构建了大麻哈鱼属（Oncorhynchus）和红点鲑属（Salvelinus）通用型低通量SNP芯片。该芯片分型结果准确性较高,与Affymetrix高通量芯片分型一致性达到96.55%。使用该芯片对来自6个家系的48尾银鲑个体及其候选亲本进行检测,应用Cervus 3.0.7软件进行亲权鉴定,结果能够准确重现复杂家系的真实系谱。在用于单亲本亲权鉴定时,第一亲本非排除率（Non-exclusion probability for first parent, NE-1P）为4.120×10–4;用于双亲本亲权鉴定时,双亲非排除率（Non-exclusion probability for parent pair, NE-PP）低至6.219×10–12,表明该芯片在鲑鳟养殖群体系谱鉴定应用中具有较高的准确性。使用该芯片开展4个鲑鳟养殖群体遗传结构分析,样本分群聚类结果与其所属的分类阶元相符,能够准确反映群体遗传组分构成和遗传关系。本研究构建的低通量SNP芯片在常见鲑鳟养殖物种中具有良好的通用性,将其应用于养殖群体遗传分析,能够为鲑鳟制种、育种和引种等科学决策提供基因组信息参考。国家科技支撑计划项目(2015BAD25B01);;中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2015C007)共同资助~

国内虹鳟代表性养殖群体的高通量SNP芯片检测及遗传分析

本研究旨在对国内虹鳟(Oncorhynchus mykiss)代表性养殖群体开展全基因组水平的遗传评估。利用57K单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测了来自不同地域的6个虹鳟养殖群体样本共计48尾,包括黑龙江虹鳟、黑龙江金鳟、四川虹鳟、四川金鳟、北京虹鳟和北京金鳟,共获得有效SNP位点50201个,在中国虹鳟中的多态比例达到97.7%,表明该芯片虽然基于美国和挪威虹鳟群体设计,但对中国群体同样具有良好的适用性。各群体最小等位基因频率均值为0.240~0.267,与国外主流养殖群体相近,黑龙江虹鳟、四川虹鳟和北京虹鳟群体内遗传多样性丰富,多态位点比例为83.6%~84.9%,与国外主流养殖群体相近,而黑龙江金鳟、四川金鳟和北京金鳟,多态位点比例相对较低,在60.2%~76.9%范围内。应用6个中国虹鳟群体和2个美国虹鳟群体数据开展系统发育分析、主成分分析和群体遗传结构STRUCTURE分析,结果显示8个群体可分为3个祖源类群,其中3个金鳟群体为遗传联系较紧密的一个类群,黑龙江虹鳟和北京虹鳟为一个类群,而四川虹鳟与2个美国虹鳟群体为一个类群,部分中国养殖群体中有显著离群个体存在,表明群体遗传背景不均一。本研究表明,高密度SNP芯片在我国虹鳟养殖群体遗传分析中具有广泛的应用前景,能够为种质资源评估、本土化良种培育、制种和引种工作提供基因组水平的参考信息。国家科技支撑计划项目(2015BAD25B01);;中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2015C007

New Constructing Method for WENO Schemes

A new method for constructing weighted essentially non-oscillatory (WENO) scheme is proposed. The idea of this method is to combine Henrick's mapping function and the idea of improving the accuracy of WENO-Z scheme one-by-one order. The particular advantage of the new constructing method is that it can improve the accuracy of WENO scheme near discontinuities. Numerical examples show that the new constructing method is very efficient and robust, and the new WENO scheme is more accurate than the original ones

烟气自循环燃气旋流燃烧器结构特性数值研究

采用数值模拟对自行设计的烟气自循环燃气燃烧器的结构特性进行了研究,着重考察燃烧器结构参数对烟气自循环的影响。结果表明:增加混合管截面积可以提高该燃烧器的引射烟气性能,增加自循环烟气量;混合管扩张角对引射烟气流量比的影响是与混合管尺寸密切相关,在混合管直径较小时,引射烟气流量比呈现出先增加后减小的趋势;在混合管直径较大时,引射烟气流量比持续降低。总之,圆锥混合管的较佳截面比为6.25~9.00,较合适的扩张角为5.7~14.0°

二次风率对烟气自循环燃气燃烧器性能的影响

分别采用粒子成像测速(PIV)和数值模拟对自行设计的烟气自循环燃气燃烧器的冷态流场结构进行了研究,并模拟了燃烧器的热态燃烧特性。结果表明:二次风率是影响燃烧室内部速度分布及流动特性的一个重要因素,在较小的二次风率时,一次旋流空气旋流作用相对强烈,中心区域的轴向速度和径向速度均较高;燃烧器出口速度随轴向距离的增加逐渐衰减,在下游区域存在一个速度发散区;随着二次风率的增加,烟气的自循环倍率增加,燃烧室内的高温区域变小,NOx的排放量也随之减小;采用烟气自循环使得燃烧器NOx含量显著降低

New Constructing Method for WENO Schemes

A new method for constructing weighted essentially non-oscillatory (WENO) scheme is proposed. The idea of this method is to combine Henrick’s mapping function and the idea of improving the accuracy of WENO-Z scheme one-by-one order. The particular advantage of the new constructing method is that it can improve the accuracy of WENO scheme near discontinuities. Numerical examples show that the new constructing method is very efficient and robust, and the new WENO scheme is more accurate than the original ones

黄河三角洲芦苇湿地生长季净生态系统CO_2交换及其环境调控机制

采用涡度相关法,对2011年生长季的黄河三角洲芦苇湿地净生态系统CO2交换(NEE)进行了观测,研究湿地NEE的变化规律及其影响因子.结果表明:不同月份芦苇湿地的NEE日变化均呈"U"形曲线,CO2最大净吸收率和释放率的日均值分别为(0.44±0.03)和(0.16±0.01)mg CO2·m-2·s-1;芦苇湿地NEE、生态系统呼吸(R eco)、总初级生产力(GPP)的季节变化均呈现生长旺季(7—9月)较高、生长初期(5—6月)和生长末期(10—11月)较低的趋势;R eco和NEE在8月达到峰值,GPP在7月达到峰值.芦苇湿地生态系统的CO2交换受到光合有效辐射(PAR)、土壤温度(T ..

Effects of reclamation on net ecosystem CO2 exchange in wetland in the Yellow River Delta, China

近年来,由于对湿地的不合理利用,自然湿地被大面积地垦殖为农田,导致湿地生态系统碳循环的模式发生改变,从而影响了湿地生态系统碳汇功能。该研究通过涡度相关法,对山东省东营市黄河三角洲芦苇(Phragmites australis)湿地和开垦多年的棉花(Gossypium spp.)农田的净生态系统CO2交换(NEE)进行了对比观测,以探讨该地区典型生态系统NEE的变化规律及其影响因子,揭示开垦对芦苇湿地NEE和碳汇功能的影响。结果表明:在生长季,湿地和农田生态系统NEE的日平均值各月均呈明显的"U"型变化曲线,非生长季NEE的变幅很小。生长季湿地生态系统日最大净吸收值和释放值分别为16.04gCO..

开垦对黄河三角洲湿地净生态系统CO_2交换的影响

近年来,由于对湿地的不合理利用,自然湿地被大面积地垦殖为农田,导致湿地生态系统碳循环的模式发生改变,从而影响了湿地生态系统碳汇功能。该研究通过涡度相关法,对山东省东营市黄河三角洲芦苇(Phragmites australis)湿地和开垦多年的棉花(Gossypium spp.)农田的净生态系统CO2交换(NEE)进行了对比观测,以探讨该地区典型生态系统NEE的变化规律及其影响因子,揭示开垦对芦苇湿地NEE和碳汇功能的影响。结果表明:在生长季,湿地和农田生态系统NEE的日平均值各月均呈明显的"U"型变化曲线,非生长季NEE的变幅很小。生长季湿地生态系统日最大净吸收值和释放值分别为16.04gCO..