Reconstruction of Virus Like Particle and Application

摘要本论文围绕着RNA假病毒及探针编码技术展开了研究，研究工作包括His(6)-tag标签在RNA假病毒表面的展示和亲和纯化，RNA假病毒表面巯基化及荧光修饰，RNA假病毒表达载体多克隆位点的构建和包裹外源RNA片段的“扩容”实验，以及用RNA假病毒技术结合探针编码技术对HCV进行基因分型。第一部分，用基因工程的方法把噬菌体MS2衣壳蛋白基因及包裹相关的序列构建到pSE380表达载体中，通过定点突变技术在编码噬菌体MS2的衣壳蛋白基因上N端β-折叠环的中引入唯一的kpnⅠ酶切位点，在该位点插入编码六个组氨酸的核酸序列。实验证明His(6)-tag标签能够展示在假病毒的表面。表面展示有His(6...ABSTRACT This dissertation consists of four parts. The first part is the His-tag peptides displaying on the surface of viral like particles (VLP) and Affinity chromatography purified, the second part is that displayed cysteine residues on viral like particles surface and fluorescent modified, the third part is that MCS introduced into the VLP expression vector and the enlargement of packaging s...学位：理学硕士院系专业：生命科学学院生物学系_生物化学与分子生物学学号：20022606

装载RNA“病毒样”纳米颗粒表面巯基化表达载体的构建及荧光修饰

以本实验室构建的能够装载外源RNA片段的MS2噬菌体“病毒样”颗粒表达载体为基础,利用定点突变技术将衣壳蛋白基因的第15位密码子由编码苏氨酸突变为胱氨酸。表达产物在35%蔗糖密度梯度处有一目的产物,目的产物在透射电镜下呈球形,直径大小约为27nm。用马来酰亚胺5′荧光素对表达产物进行化学修饰,经光谱分析、SDSPAGE分析和MALDITOFMS鉴定,证明巯基在表达产物的外表面,并能与马来酰亚胺5′荧光素进行反应。这种携带外源RNA片段的荧光修饰的天然纳米颗粒为制备各种功能性纳米材料提供了新途径

周期性机械拉伸对表皮干细胞分化及生物学效应的影响

背景:表皮干细胞是创面愈合过程中的重要细胞成分之一,表皮干细胞分布在基底层,约占基底层细胞的1%-10%,对皮肤的张力有较高的感应能力,其细胞表面有高水平的integrin-beta1表达,因而integrin-beta1高表达被认为是KSC分子标志之一,同时也是表皮干细胞对皮肤张力的感应器。。整合素尤其是整

--1H-NMR Spectroscopy-based Metabonomic Research on Serum of Model Rats of Wilson's Disease

目的:以基于核磁共振(nMr)的代谢组学方法对WIlSOn病大鼠模型及正常对照组大鼠血清进行研究,分析血清中小分子代谢物的变化,从小分子代谢物层面上探讨WIlSOn病的内在机制,以更加清楚的认识本病。方法:22只雄性WISTAr大鼠,体重(180±20)g,随机被分为模型组(n=11)和健康对照组(n=11),采用铜负荷法制作WIlSOn病大鼠模型,以核磁共振(nMr)技术对大鼠血清进行检测。采用MESTrE-C 2.3软件及自编软件对谱图进行手动调相、基线校正和谱峰对齐。对样品进行分段积分,将积分数据归一化后构成数据矩阵,并利用PCA方法对数据矩阵进行统计分析。结果:相对于正常对照组,模型组大鼠血清甜菜碱(bETAInE)、氧化三甲胺(TAMO)、低密度脂蛋白(ldl)、极低密度脂蛋白(Vldl)、葡萄糖(gluCOSE)含量有显著降低,胆碱(CHOlInE)、胆碱磷酸(PHOSPHOrylCHOlInE)的含量有所降低,乳酸(lACTATE)、谷氨酰胺(gluTAMInE)、糖蛋白(glyCOPrOTEIn)有显著升高,肌氨酸+肌氨酸酐(CrEATInE+CrEATInInE),精氨酸(ArgInInE)有所升高。这些发生改变的代谢物可以作为Wd的小分子代谢标志物,为进一步研究Wd的内在代谢机制提供参考。Objective:Applying 1H nuclear magnetic resonance(1H-NMR)spectroscopy-based metabonomic approach to investigate the changes of small molecular metabolites in the serum from the rats of the model group of Wilson's disease contrasted with those of the control group.Exploring the pathogenesis of Wilson's disease from small molecular aspect.Methods:22 male Wistar rats[weight=(180±20)g]were divided into two groups randomly,the model group(n=11)and the control group(n=11),with the models established with excessive copper method.The serum was tested with 1H-NMR technology.The spectra were edited with MestRe-C2.3 and self-programmed software and then principal component analysis(PCA)was applied to differentiate the two groups.Results:Choline and phosphorylcholine concentrations were found to be lower and TAMO+betaine,LDL,VLDL and glucose were significantly lower in the serum of the model group.While creatinine and arginine concentrations were found to be higher and lactate,glutamine and glycoprotein were significantly higher in the model group.The small molecular metabolites above may contribute to the discrimination,and serve as references for further research on WD pathogenesis.“十一五”国家科技支撑计划分课题重大疑难疾病中医防治研究项目(2006BA104A02

Electric-field-induced selective catalysis of single-molecule reaction

随着单分子电学检测技术的迅速发展，分子电子学的研究不再局限于分子电子学器件的构筑及其电学性质的测量，而且扩展到单分子尺度化学反应过程的探索。然而目前相关的研究仍然局限于理论计算方面，在单分子尺度上实时监测和调控化学反应的活性和选择性是化学领域的长期目标和挑战。针对这一挑战，洪文晶教授课题组与程俊教授课题组合作，自主研发了精密科学仪器，将单个有机分子定向连接在两个末端尺寸为原子级的电极之间，解决了化学反应中分子取向控制的问题.理论计算结果证实了定向电场可以有效地稳定化学反应的过渡态，从而降低反应能垒。该研究工作在化学化工学院洪文晶教授、程俊教授、能源材料化学协同创新中心（iChEM）刘俊扬副研究员的共同指导下完成，由硕士研究生黄晓艳、iChEM博士研究生唐淳、博士研究生李洁琼以及兰州大学的陈力川博士作为共同第一作者，化学化工学院师佳副教授、陈招斌高级工程师、夏海平教授和田中群教授，萨本栋微纳研究院杨扬副教授、环境与生态学院白敏冬教授以及兰州大学张浩力教授参与了研究工作的讨论并给予指导，博士后乐家波、博士研究生郑珏婷、张佩（已毕业）、李瑞豪、李晓慧也参与了研究工作。Oriented external electric fields (OEEFs) offer a unique chance to tune catalytic selectivity by orienting the alignment of the electric field along the axis of the activated bond for a specific chemical reaction; however, they remain a key experimental challenge. Here, we experimentally and theoretically investigated the OEEF-induced selective catalysis in a two-step cascade reaction of the Diels-Alder addition followed by an aromatization process. Characterized by the mechanically controllable break junction (MCBJ) technique in the nanogap and confirmed by nuclear magnetic resonance (NMR) in bottles, OEEFs are found to selectively catalyze the aromatization reaction by one order of magnitude owing to the alignment of the electric field on the reaction axis. Meanwhile, the Diels-Alder reaction remained unchanged since its reaction axis is orthogonal to the electric fields. This orientation-selective catalytic effect of OEEFs reveals that chemical reactions can be selectively manipulated through the elegant alignment between the electric fields and the reaction axis.This work was supported by the National Key R&D Program of China (2017YFA0204902), the National Natural Science Foundation of China (21722305, 21703188, 21673195, 21621091, 51733004, 51525303, and 91745103), the China Postdoctoral Science Foundation (2017M622060), and the Young Thousand Talents Project of China. 该工作得到国家自然科学基金委（21722305、21703188、21673195、51733004、51525303、91745103），国家重点研发计划课题（2017YFA0204902），中国博士后面上基金（2017M622060）的资助，以及固体表面物理化学国家重点实验室、醇醚酯化工清洁生产国家工程实验室、能源材料化学协同创新中心的支持

车轮-地面耦合动力学行为的CDEM-DEM分析

越野车辆在软土路面上行驶时，其车轮-地面相互作用的动态力学行为极其复杂，车轮的下陷程度和通行能力均为车辆地面力学研究的重点。为探究车轮在软土路面通行时的动力学性能，本文提出了一种连续-非连续单元法（Continuous-discontinuous Element Method, CDEM）与颗粒离散元法（Discrete Element Method, DEM）相结合的耦合计算方法。该方法中，车轮采用CDEM单元进行描述，软土路面采用DEM颗粒进行描述，CDEM单元与DEM颗粒之间采用罚弹簧进行耦合，通过在车轮上施加动态扭矩，实现了车轮在软土路面上摩擦、滚动及前行过程的精确模拟。借助CDEM与DEM的耦合，探讨了车轮花纹、路障对车辆行驶过程中动力学行为的影响规律。研究结果表明：花纹车轮及光面车轮均在软土路面留下清晰可见的车辙；花纹轮胎较光面轮胎表现出更强的通行能力；花纹车轮转动速度较小，但其车轮平动速度远高于光面车轮，花纹车轮平动与其线速度之比约为12.78%，而光面车轮比值仅为2.80%；车轮在软土路面行驶过程中，相同质量下的光面车轮下陷深度远高于花纹车轮；车辆在含路障路面通行时，地面起伏度与车辆行驶能耗之间密切相关，起伏度越大，所需能量越大

改进的QuEChERS方法用于鱼肉中孔雀石绿、隐色孔雀石绿、结晶紫和隐色结晶紫的快速检测(英文)

改进的QuEChERS方法用于鱼肉中孔雀石绿、隐色孔雀石绿、结晶紫和隐色结晶紫的快速检测(英文

开启中国设计育种新篇章——“分子模块设计育种创新体系”战略性先导科技专项进展

"分子模块设计育种创新体系"战略性先导科技专项以水稻为主,小麦、鲤等为辅,利用野生种、农家品种和主栽(养)优良品种等种质资源,综合运用基因组学、系统生物学、合成生物学等手段,解析高产、稳产、优质、高效等重要农艺(经济)性状的分子模块,揭示水稻复杂性状全基因组编码规律,发展多模块非线性耦合理论和"全基因组导航"分子模块设计育种技术,优化多模块组装的品种设计的最佳策略,建立从"分子模块"到"设计型品种"的现代生物技术育种创新体系,为实现全基因组水平多模块优化组装、培育新一代超级品种提供系统解决方案。文章介绍了该专项的背景、总体目标、研究内容、进展及发展展望