Santé globale. Homme, animal, plantes, environnement : pour des approches intégrées de la santé

Loin de prétendre à l'exhaustivité, ce dossier offre un panorama des approches intégrées en santé menées par les équipes scientifiques implantées en Occitanie, et dans les régions d'outre-mer lorsque ces équipes ont une tutelle en Occitanie. Il présente de multiples exemples, illustrant les partenariats mis en oeuvre en France et dans le monde. Sont ici prises en compte également les questions de santé liées à notre alimentation et à notre façon de la produire. Au total, ce ne sont pas moins de 66 unités de recherche auxquelles il est fait référence tout au long de ce dossier, illustrant la diversité, la complémentarité et la portée pour la région et, au-delà, pour le monde des travaux scientifiques originaux développés

Les thèmes nouveaux des publications du Cirad : périodes 2014-2016 et 2017-2018

Dans les 6 506 publications du Cirad parues entre 2014 et 2018 (articles de revues, ouvrages et chapitres d'ouvrages, actes de congrès, brevets, thèses et mémoires HDR), enregistrées dans Agritrop et analysées par la Dist, 65 sujets nouveaux ont été identifiés dans 69 publications distinctes, soit dans 1% des publications du corpus d'étude

Contribution à l'élaboration d'indicateurs et d'informations sur l'évolution des systèmes pastoraux au Sahel : cas du Sénégal

Le projet SIPSA (Système d'information sur le pastoralisme au Sahel) débuté en 2002 constitue un des projets phare de l'initiative LEAD (Livestock, Environment And Development) piloté par la FAO. L'objectif principal est de favoriser la prise en compte des interactions pastoralisme -environnement dans les politiques et les pratiques d'élevage extensif en zone aride sahélienne. Mon stage, qui s'est déroulé au Sénégal auprès du PPZS (Pôle Pastoral Zones Sèches), fait partie de ce projet. L'objectif du stage était de contribuer à l'analyse, à la synthèse et à la validation d'indicateurs et de variables contenus dans la base de données du SIPSA sur la zone sylve-pastorale du Ferla (Sénégal). La création des produits d'information/alerte précoce s'est déroulée en quatre phases : 1) sélection des indicateurs plus adaptés en concertation avec les chercheurs du PPZS et les membres du CNC (Comité National de Coordination). 2) mise à jour des bases de données et adaptation des données aux analyses, 3) élaboration des produits à l'aide d'outils informatiques (en particulier ArcGIS) et 4) validation des produits par les membres du CNC. Neuf produits ont étés élaborés pendant le stage. Il s'agit pour la plupart d'indicateurs spatialisés à l'aide d'un SIG conçus différemment pour trois types de publics : éleveurs et organisations de producteurs (unique produit: carte de fonctionnement des forages), services techniques (ex. de produit: carte d'évolution des superficies emblavées) et administrations (ex. de produit : carte de capacité de charge animale des départements) Les produits élaborés pendant le stage ont été validés par deux réunions du CNC au Sénégal. Cependant un vrai travail de test et de validation reste encore à effectuer auprès des bénéficiaires sur le terrain. Le manque de données socio-économiques pour la zone sylve-pastorale au Sénégal constitue un remarquable point faible du SIPSA. A ce niveau, la collecte d'informations sur les prix du bétail et des céréales sur les principaux marchés s'impose pour assurer l'efficacité du volet " alerte précoce " du SIPSA. Une fois l'élaboration des produits terminée et la méthodologie pour leur création acquise par le CNC, la prochaine étape sera la mise en place des supports d'informations et des organismes chargés de les transmettre. (Résumé d'auteur

Biodiversité. Des sciences pour les humains et la nature

La communauté de Montpellier impliquée dans cette thématique, et plus largement si on y associe la Tour du Valat, Banyuls et Perpignan, constitue un ensemble exceptionnel avec 31 unités de recherche regroupant plus de 1200 scientifiques et 400 doctorants. Les recherches menées en écologie, évolution et sciences sociales, couvrent l'ensemble des domaines des sciences de la biodiversité avec un fort intérêt pour les environnements méditerranéens et tropicaux, qu'ils soient terrestres ou marins. Sommaire : Avant-propos : enjeux, approches et perspectives pour la recherche sur la biodiversité. Origine et évolution de la biodiversité. Biodiversité fonctionnelle. Sociétés et biodiversité. Modéliser, scénariser la biodiversité. La biodiversité, une science citoyenne. Thématiques couvertes pour les équipes de recherche. Les formations à Agropolis International. Liste des acronymes et des abréviation

Analyse, fonction et diversité des génomes viraux des plantes et élaboration de stratégies de lutte

Les travaux de recherche décrits dans ce mémoire ont été réalisés à la station de Pathologie Végétale du centre INRA Bordeaux-Aquitaine d'octobre 1987 à février 1992, dans le cadre de mon DEA et de ma thèse de Doctorat, puis dans celui des postes que j'ai successivement occupés au Queensland Agricultural Biotechnology Centre (QABC) du Queensland Department on Primary Industries (QDPI) de Brisbane (Australie) de mars 1992 à juin 1995, à l'Institute of Molecular Plant Sciences de la Rijksuniversiteit de Leiden (Pays-Bas) d'août 1995 à décembre 1997, au Laboratoire de Biologie Cellulaire du centre INRA de Versailles, de janvier 1998 à mai 2001 et de celui que j'occupe depuis octobre 2001 à la station de Neufchâteau du CIRAD Guadeloupe. Ces travaux ont porté sur l'analyse, la fonction et la diversité des génomes viraux chez les plantes à des fins de mise au point de stratégies de lutte anti-virale. Ils ont eu pour objets des virus appartenant à quatre grandes familles de virus (Potyviridae, Bromoviridae, Flexiviridae et Caulimoviridae) dont les génomes ont des organisations et des stratégies d'expression différentes. Dans le cadre de mes activités de recherche, j'ai déterminé la séquence nucléotidique totale ou partielle de l'ARN génomique de trois potyvirus infectant les arbres fruitiers du genre Prunus (Plum pox virus, PPV) ou l'arachide (Peanut stripe virus, PStV et Peanut mottle virus, PeMoV), ainsi que celle d'un flexivirus infectant le bananier que nous avons identifié (Banana virus X, BVX). Ces travaux avaient pour objectif d'élucider l'organisation du génome de ces virus et d'attribuer, sur la base d'homologies de séquences, des fonctions aux protéines correspondantes. Certaines de ces séquences ont été utilisées pour des études de diversité moléculaire, de même que des séquences partielles d'un autre flexivirus infectant le bananier, le Banana mild mosaic virus (BanMMV). Dans ce dernier cas, nos travaux ont montré que les populations virales étudiées présentent des niveaux de diversité moléculaire parmi les plus importants connus chez les virus de plantes, et que cette diversité résulte pour l'essentiel de l'accumulation de mutations synonymes. Une partie de mes travaux de recherche a également porté sur la mise au point d'un système de réplication chez la levure (Saccharomyces cerevisiae) d'un virus appartenant au genre Bromovirus, l'Alfalfa mosaic virus (AMV). Certaines des séquences nucléotidiques obtenues au cours de mes travaux ont servi à la mise au point d'outils de diagnostic: sondes nucléotidiques pour la détection du PPV ou du PStV par hybridation moléculaire; amorces oligonucléotidiques pour le diagnostic du PPV, du PStV ou du BVX par des techniques basées sur la PCR. Des techniques de détection immuno-moléculaires des espèces Banana streak virus (BSV) et du BanMMV ont par ailleurs été créées ou optimisées afin de les rendre spécifiques, polyvalentes et utilisables pour des diagnostics de routine. Une partie importante de mes recherches a porté sur la création de lignées transgéniques résistantes à certains des virus auxquels je me suis intéressé. Elles ont également porté sur l'étude des risques liés à l'utilisation des plantes transgéniques exprimant des séquences virales, en particulier les risques de recombinaison entre les transcrits des transgènes et le génome de virus hétérologues. Certains de mes travaux ont également concerné l'étude de la stabilité des modifications phénotypiques basées sur l'extinction post transcriptionnelle de gènes (post transcriptional gene silencing, PTGS). Mes recherches actuelles portent sur l'impact de la diversité des populations virales sur le fonctionnement des génomes viraux et sur l'émergence de maladies, et sur l'évaluation et la gestion des risques liés à l'activation de séquences pararetrovirales endogènes (endogenous pararetrovirus, EPRV) de certaines espèces BSV. Elles constituent la base du projet de recherche que je souhaite conduire. (Résumé d'auteur