349 research outputs found

    Trendy v ortografické variaci raně anglických tištěných textů

    Get PDF
    Příchod knihtisku do Anglie se často uvádí jako jedna z hlavních příčin standardizace pravopisu v raně moderní angličtině. Toto tvrzení ale není dostatečně podloženo kvantitativním výzkumem, naopak bylo vyvráceno několika studiemi zaměřenými na zkoumání konzistence pravopisu v textech vydaných jednotlivými tiskaři. Tato práce zkoumá trendy v ortografické variaci v tištěných textech od zavedení knihtisku v Anglii v roce 1476 do konce 17. století, a to jak zkoumáním míry ortografické variace v jednotlivých textech vydaných v tomto období, tak měřením celkové míry ortografické variace ve všech textech tištěných jednotlivými tiskaři a následným porovnáním výsledků s celkovými ortografickými trendy. Materiál použitý pro analýzu pochází z databáze EarlyPrint, která obsahuje jak původní, tak normalizované verze textů dostupných v rámci korpusu Early English Books Online (EEBO). Míra ortografické variace je měřena pomocí vážené entropie a trendy vyplývající z výpočtů jsou následně srovnávány. Výsledné hodnoty ukazují obecně klesající trend v průběhu desetiletí tohoto období, i když pokles není okamžitý. Výsledky této práce naznačují, že variace v ortografii začala rychleji klesat koncem šestnáctého a počátkem sedmnáctého století, nikoli bezprostředně po zavedení knihtisku v Anglii. Klíčová slova:...The introduction of the printing press to England by William Caxton is often mentioned as the main cause of spelling standardisation in Early Modern English. This claim, however, seems to lack sufficient quantitative grounds and is often contradicted by research focusing on examining the consistency of spelling in texts printed by individual printers. This thesis investigates spelling variation trends in printed texts from the introduction of the printing press to England in 1476 to the end of seventeenth century by examining the degree of spelling variation in individual texts published in this period, as well as by measuring the overall degree of spelling variation in all texts printed by individual printers and comparing the results to the overall spelling trends. The material used for the analysis comes from the EarlyPrint database that contains both original and normalised versions of texts available from the Early English Books Online (EEBO) corpus. The levels of spelling variation are calculated using weighted entropy and the trends resulting from the calculations are compared. The results show a generally downward trend throughout the decades, although the decrease is not immediate. The findings of this thesis suggest that spelling variation started to decrease more rapidly in late...Ústav anglického jazyka a didaktikyDepartment of the English Language and ELT MethodologyFilozofická fakultaFaculty of Art

    Adhesion-modified polypropylene composites:a sticky situation

    Get PDF

    Análisis de la metástasis del cáncer colorectal mediante proteómica y microscopía

    Get PDF
    Tesis inédita de la Universidad Complutense de Madrid, Facultad de Ciencias Químicas, leída el 08-11-2022Cancer is the second most common cause of death, only preceded by cardiovascular diseases. The main reason behind the high mortality rates of cancer is the appearance of metastasis, the dissemination and colonisation of secondary tissues by cells from the primary tumour. In particular, in the case of colorectal cancer (CRC) the survival rates of patients diagnosed, drop drastically if diagnosis happens at later stages when metastasis has occurred. A similar trend can be observed for most of the cancers commonly diagnosed. When metastasis occurs, treatment relies heavily on the use of chemotherapy, even if the original tumour mass is surgically removed, the metastases will still survive. It is thus paramount to find new tools that improve early diagnosis so that detection can occur before the tumour spreads. In this context, the main focus of this thesis has been the understanding and characterisation of CRC metastasis to find new diagnostic markers that can be used in the clinic. We have used isogenic cell lines, that share the same genetic background but have different metastatic capacities, to define the proteome of CRC metastasis in vitro...Tras las enfermedades cardiovasculares, la segunda causa de muerte en países desarrollados es el cáncer. El principal factor detrás de la alta mortalidad del cáncer es la aparición de metástasis, el proceso por el cual células provenientes de la masa tumoral original diseminan y son capaces de colonizar tejidos distantes. En el caso del cáncer colorrectal(CCR), las tasas de supervivencia de los pacientes caen de manera drástica si el diagnóstico de la enfermedad se produce en estadios tardíos en los que ya haya aparecido metástasis. Esta tendencia se puede observar también en la mayoría de los cánceres diagnosticados en la actualidad. Uno de los principales problemas de la metástasis es que una vez aparece, el tratamiento del cáncer se vuelve complejo, siendo la quimioterapia la principal forma de tratamiento ya que, aunque se elimine quirúrgicamente la masa tumoral original, los nichos metastáticos sobrevivirán a la operación. Es por tanto necesario el desarrollo de nuevas técnicas de diagnóstico que permitan mejorar la detección temprana, antes de que el tumor se extienda. En este contexto, el principal objetivo de esta tesis ha sido entender y caracterizar la metástasis del CCR para encontrar marcadores de diagnóstico que puedan trasladarse a la práctica clínica. Para definir el proteoma de la metástasis de CCR hemos empleado una serie de líneas celulares isogénicas, que comparten la misma carga genética, con diferente potencial metastático...Fac. de Ciencias QuímicasTRUEunpu

    Data-driven microscopy: placing high-fidelity data in a population-wide context

    Get PDF
    Mikroskopi är idag ett fundamentalt verktyg inom forskning, där det tillåter oss att skåda in och utforska våra prover i hög detalj. Mycket utav utvecklingen av nya mikroskopimetoder har strävat efter att öka den detaljnivå vi kan uppnå. Samtidigt har utvecklingen inom hårdvara, med tillgång till bättre och mer kraftfulla instrument, lett till utveckligen av metoder där fokuset är att studera en hel population av celler. Till skillnad från när vi studerar ett fåtal celler i hög detalj, tillåter det oss att sätta perspektiv på det vi ser. Det ger oss en förmåga att säga vad det normala beteendet som man kan förvänta sig är, och vilka celler som sticker ut i en population. Med andra ord, vad som är intressant.Samtidigt finns det ett stort intresse av att veta hur varje individuell cell beter sig. Varje cell är, precis som oss människor, unik. De har olika historia, olika ålder och befinner sig i olika tillstånd. Precis som våra celler i kroppen är unika, är även de cellerna som kan orsaka sjukdom unika. För att förstå varför vissa personer är mer känsliga mot sjukdom, och hur en infektion svarar på våra behandlingar behövs en förståelse och an förmåga att studera celler på individuell nivå, samtidigt som vi bibehåller ett perspektiv utifrån populations-nivå.Denna brist på perspektiv har länge varit ett problem inom mikroskopi. Den vanliga lösningen på detta problem är att vi, som människor, kan tolka en bild och peka på vad det är som är intressant eller inte. Vi är, trots allt, extremt duktiga på att tolka visuell information. Men detta är inte en helt felfri lösning. Som människor kan vi vara relativt okonsekventa, vi tolkar oftast utifrån hur vi vill att datan ser ut. Med andra ord, vi saknar förmågan att vara objektiva i vår metodik för att samla in bilder i hög detalj.Min avhandling har till stor del handlat om att utveckla ett verktyg som tillåter oss att sätta perspektiv på det vi studerar med mikroskopi. Detta har lett till Arbete 1, där vi presenterar en allmän strategi (data-styrd mikroskopi) för hur vi kan arbeta med mikroskopi för att samla in data på en hel population, samtidigt som vi kan samla in data med hög detalj på relevanta fynd i populationen. Vi presenterar även här en teknisk lösning, och utför metoden i tre olika scenarion: ett för att studera en population av celler mer allmänt, ett för att fånga det ögonblick som bakterier infekterar mänskliga celler, och ett där vi studerar och fångar in data på relevanta (från ett populations-kontext) cancerceller och följer dem över tid. Denna metod tillåter oss att samla in data i hög detalj på ett objektivt sätt, och att sätta perspektiv på det vi studerar.I Arbete 2 har vi vidare utvecklat på vår metod, där vi försöker lösa problemet att hitta en och samma cell i flera olika mikroskop. Eftersom vi, genom mikroskopi, jobbar på en så ofantligt liten skala, är det oftast väldigt svårt att orientera sig och hitta rätt inom ett prov. Det är lite som att spela På spåret och gissa vart man är, fast utan alla ledtrådar man får på varje nivå. Eftersom vi har tillgång till data på en hel population, så utgick vi från att det borde finnas samband mellan celler och deras grannar i ett prov som är unika för just dem. Genom att använda sig av dessa unika samband kom vi fram med en lösning där vi snabbt kan kalibrera ett prov på ett nytt mikroskop. Det öppnar dörrarna för oss forskare att återanvända prov, att lättare justera provet med nya markörer (för det vi vill visualisera inom cellerna), och att kunna tolka ett prov med data insamlat från flera system.COVID-19 pandemin var en stor omställning för samhället och vården. Likväl var det en stor omställning för många forskningslabb, där en kapplöpning startade för att så snabbt som möjligt förstå sig på hur viruset fungerar och hur vårt immunförsvar svarar på dess infektion. Det var i detta kontext som mitt tredje arbete utfördes. Genom den erfarenhet jag samlat på mig inom mikroskopi och att analysera bilder på stora dataset, bidrog jag med hjälp för att studera hur framtagna antikroppar kan förhindra bindningen av virus-lika partiklar till celler. Antikroppar är ett protein som immunförsvaret producerar i respons mot en patogen. En bättre förståelse kring hur antikroppar verkar, och vad skillnaden mellan en bra och en dålig antikropp är kan leda till framtagningen av bättre vaccin-program och behandlingar inom sjukvården.I Arbete 4 medverkade jag i ett arbete där bakterien Streptococcus pyogenes var i fokus. S. pyogenes enda värd är människor, och ansvarar för över 600 miljoner infektionsfall per år globalt. På bakteriens yta dominerar ett protein, M-proteinet, ett multi-funktionellt protein som bakterien (bland annat) använder sig för att binda till ytor och förhindra immunförsvarets förmåga att göra sig av med bakterien. I arbetet upptäckte vi att fibronektin binder till bakterien (specifikt M-proteinet) olika mycket beroende på mängden antikroppar som finns i miljön. Fibronektin är ett protein som vi människor producerar, och bidrar (bland annat) till att skapa den miljön som celler befinner sig i. Mängden fibronektin varierar beroende på var i kroppen man kollar. Till exempel, i saliv har du en relativt låg mängd fibronektin jämfört med i blodet. Detta ledde till hypotesen att bakterien är special-anpassad för olika miljöer i dess förmåga att undkomma immunförsvaret. En bättre förståelse kring hur bakterien är anpassad till våra olika miljöer och dess infektionsförlopp kan leda till bättre och mer anpassade behandlingar inom sjukvården

    Zinc-Doped Iron Oxide Nanoparticles as a Proton-Activatable Agent for Dose Range Verification in Proton Therapy

    Get PDF
    Proton therapy allows the treatment of specific areas and avoids the surrounding tissues. However, this technique has uncertainties in terms of the distal dose fall-off. A promising approach to studying the proton range is the use of nanoparticles as proton-activatable agents that produce detectable signals. For this, we developed an iron oxide nanoparticle doped with Zn (IONP@Zn-cit) with a hydrodynamic size of 10 nm and stability in serum. Cytotoxicity, defined as half of the surveillance, was 100 μg Zn/mL in the U251 cell line. The effect on clonogenic cell death was tested after X-ray irradiation, which suggested a radioprotective effect of these nanoparticles at low concentrations (1–10 μg Zn/mL). To evaluate the production of positron emitters and prompt-gamma signals, IONP@Zn-cit was irradiated with protons, obtaining prompt-gamma signals at the lowest measured concentration (10 mg Zn/mL). Finally, 67Ga-IONP@Zn-cit showed accumulation in the liver and spleen and an accumulation in the tumor tissue of 0.95% ID/g in a mouse model of U251 cells. These results suggest the possibility of using Zn nanoparticles as proton-activatable agents to verify the range by prompt gamma detection and face the challenges of prompt gamma detection in a specific biological situation, opening different avenues to go forward in this field

    Structural characterisation of the p53 binding domain of RBBP6 and its mechanism of interaction with p53

    Get PDF
    Abstract in English, Afrikaans, ZuluWorldwide, cancer is a major health issue, causing millions of deaths every year. Retinoblastoma binding protein 6 (RBBP6) is thought to facilitate the interaction between p53 and its prototypical negative regulator, MDM2. RBBP6 has been found to be overexpressed in several cancers and its ability to interact with p53 and cause its degradation, makes it a prospective biomarker and drug target in cancer therapy. In order to target this interaction, a better understating of the p53 binding domain of RBBP6 is needed. In this thesis, expression trials were undertaken for the recombinant p53 binding domain of RBBP6 (namely RBBP6 p53BD) under several conditions. These included different bacterial cell lines, inducer concentrations and post-induction growth time, as well as the domain with and without a polyhistidine tag. The best expression conditions found were NiCo21 (DE3) cells, 37 °C, 0.1 M IPTG and 16 hours post-induction growth. A three-step purification protocol is presented for the polyhistidine-tagged RBBP6 p53BD, utilising hydrophobic interaction and nickel IMAC chromatography. RBBP6 p53BD was purified to approximately 95 % homogeneity. The purified recombinant domain was shown to have structure and be functional as it could bind endogenous p53. The domain was characterised using clear native PAGE and far-UV CD and was found to exist in a single monomer form. Its secondary structure was predicted to be largely intrinsically disordered with 59 % random coil, 19 % alpha-helices, 9 % beta-strands, and 13 % turns. The stability of the domain was also investigated using far-UV CD when the protein was exposed to increasing temperature or known denaturants. The spectrum produced by RBBP6 p53BD with increasing temperature showed a gain in secondary structure and high percentage recovery of its native state after returning to starting temperature. Greater structural changes were seen in the presence of denaturants, with the greatest structural change and lowest percentage recovery seen in the presence of guanidinium chloride. High purity and stability are important for future investigations into the structure of RBBP6 p53BD and drug interaction studies. Localisation images produced from immunocytochemistry experiments are presented here that show different subcellular localisation of RBBP6 and p53 in the cancer cell lines A549, MCF7 and MDA-MB-231 and compared to the normal cell line, HEK293 T. With normal cells having the highest localisation of RBBP6 in the nucleus and negligible localisation in the cytoplasm. Cancer cells still showed the high localisation in the nucleus but higher localisation in the cytoplasm than normal cells. Colocalisation images of p53 and RBBP6 in cancer cell lines are also presented, indicating that p53 and RBBP6 localise in similar cell regions. Using the plugin JACoP from ImageJ, the Manders coefficient of p53 to RBBP6 was predicted to be 0.761 in MCF7 cells and 0.784 in A549 cells. The Manders coefficient of RBBP6 to p53 was found to be 0.904 for MCF7 and 0.834 for A549 cells. The Pearson’s coefficient was found to be 0.759 for MCF7 and 0.630 for A549 cells. This Indicates positive colocalisation of p53 and RBBP6 in both MCF7 and A549 cells, suggesting that these proteins could interact in vivo. Co-immunoprecipitation assays were performed and showed the ability of endogenous p53, RBBP6 and MDM2 to interact and form a complex in vitro in cancer and normal cell lines. Thus supporting RBBP6 as a facilitator to p53 and MDM2’s interaction in human cells as well as supporting RBBP6 as a potential cancer therapy drug target.Kanker is wêreldwyd 'n groot gesondheidskwessie, wat jaarliks miljoene sterftes veroorsaak. Daar is gevind dat retinoblastoombindende proteïen 6 (RBBP6) ooruitgedruk word in verskeie kankers. Daar word vermoed dat RBBP6 die interaksie tussen p53 en sy belangrikste negatiewe reguleerder, MDM2, fasiliteer. RBBP6 se vermoë om met p53 te reageer en die agteruitgang daarvan te veroorsaak, maak dit 'n voornemende biomerker en geneesmiddelteiken in kankerterapie. Eerstens, in hierdie tesis, is uitdrukkingsproewe onderneem vir die rekombinante p53-bindingsdomein van RBBP6 (naamlik RBBP6 p53BD) onder verskeie toestande. Bevindinge toon dat die beste uitdrukkingstoestande was die domein met 'n polihistidienmerker in NiCo21 (DE3) selle, 37 °C, 0.1 M IPTG en 16 uur na-induksie groei. 'n Drie-stap suiweringsprotokol word aangebied vir die polihistidien-gemerkte RBBP6 p53BD, deur gebruik te maak van hidrofobiese interaksie en nikkel IMAC chromatografie. Daar is getoon dat die gesuiwerde rekombinante domein struktuur het en funksioneel is aangesien dit endogene p53 kon bind. Die domein is gekarakteriseer deur gebruik te maak van clear native-PAGE en ver-UV circular dichroism daar is gevind dat dit in 'n enkele monomeervorm bestaan en 'n groot hoeveelheid intrinsieke versteuring bevat. Die stabiliteit van die domein is ook ondersoek deur gebruik te maak van ver-UV CD wanneer die proteïen aan toenemende temperatuur of bekende denaturante blootgestel is, en daar is gevind dat dit relatief min verandering in struktuur en 'n goeie hoeveelheid herstel onder alle toestande het. Hoë suiwerheid en stabiliteit is belangrik vir toekomstige ondersoeke rondom die struktuur van RBBP6 p53BD en geneesmiddelinteraksiestudies. Tweedens word lokaliseringsbeelde wat uit immunositochemie-eksperimente geproduseer word hier aangebied wat verskillende uitdrukkingsvlakke van RBBP6 en p53 in die kanker- en normale sellyne toon. Wanneer die kolokaliseringsbeelde bestudeer word, het die gegenereerde Manders en Pearson se koëffisiënte gedui op positiewe kolokalisering tussen p53 en RBBP6 in beide MCF7 en A549 selle, wat daarop dui dat hierdie proteïene in vivo interaksie kan hê. Ko-immunopresipitasietoetse is uitgevoer en dit het die vermoë van interaksie tussen endogene p53, RBBP6 en MDM2 getoon en om 'n kompleks in vitro te vorm in kanker en normale sellyne. Dit ondersteun dus RBBP6 as 'n fasiliteerder in p53 en MDM2 se interaksie in menslike selle, asook RBBP6 as 'n potensiële kankerterapie-teiken.Emhlabeni wonke, umdlavuza uyinkinga enkulu yezempilo, ebulala izigidi zabantu minyaka yonke. I-Retinoblastoma ebopha amaprotheni 6 (RBBP6) kutholakale ukuthi iningi kakhulu kumangqamuzana omdlavuza. I-RBBP6 kucatshangwa ukuthi yenza kube lula ukusebenzisana phakathi kwe-p53 nesilawuli sayo esikhulu i-MDM2. Ikhono le-RBBP6 lokusebenzelana ne-p53 futhi libangele ukuwohloka kwayo liyenza iRBBP6 ibe i-biomarker kanye nokusetshenziswa yemithi ekwelapheni umdlavuza eqondiswe kuyo. Okokuqala, kule thesis, ngiqale ngezivivinyo zokukhiqiza esibophezelayo se-p53 se-RBBP6 (okungukuthi i-RBBP6 p53BD) ngaphansi kwezimo ezimbalwa. Izimo ezinhle kakhulu zokukhiqhiza iRBBP6 p53BD ezitholiwe kwakuyisizinda esinomaka we-polyhistidine kumangqamuzana e-NiCo21 (DE3), ezingeni lokushisa i-37 °C, kanye ne 0.1 M IPTG kumahora angu-16 okukhula kumangqamuzana. Iphrothokholi yokukhishwa kwe-RBBP6 p53BD okulandela ukukhiqhizwa kwayo enezinyathelo ezintathu, kusetshenziswa ukusebenzisana kwe-hydrophobic kanye ne-nickel IMAC chromatography. I-RBBP6 p53BD ekhiqhiziwe ibonakale inesakhiwo futhi siyasebenza njengoba singahlanganisa ne-p53 etholakala kumangqamuzana. Ukuzinza kwe-RBBP6 p53BD ekhiqhiziwe kuphenyisiswe nge-PAGE kanye ne-CD ye-UV ekude futhi kwatholakala ukuthi ikhona kufomu elilodwa le-monomer futhi iqukethe inani elikhulu lokuphazamiseka kwangaphakathi. Ukuzinza kwesizinda (i-RBBP6 p53 BD) kuphinde kwaphenywa kusetshenziswa i-CD ye-UV ekude kwatholakala ukuthi kunoshintsho oluncane kwisakhiwo se-RBBP6 p53BD ezingeni lokushisa elikhulayo noma ama-denaturants aziwayo ahloliwe. Ukuhlanzeka okuphezulu nokuzinza kubalulekile ophenyweni oluzayo mayelana nesakhiwo se-RBBP6 p53BD kanye nezifundo zokusebenzisana nemithi. Okwesibili, izithombe ezibonisa amazinga ahlukene we-RBBP6 kanye ne-p53 kumdlavuza kanye kumangqamuzana avamile zikhiqizwe ekuhlolweni kwe-immunocytochemistry. Lapho utadisha izithombe ze-colocalisation ama-coefficients ka-Manders kanye ne-Pearson akhiqizwa abonisa ukuhlangana okuhle phakathi kwe-p53 ne-RBBP6 kuwo womabili amangqamuzana omdlavuza e-MCF7 kanye ne-A549, okuphakamisa ukuthi lawa maprotheni angasebenzisana emzimbeni. Ukuhlolwa kwe-Co-immunoprecipitation kwenziwa futhi babonisa ikhono le-endogenous p53, i-RBBP6 ne-MDM2 ukusebenzisana nokwenza i-complex kumangqamuzana omdlavuza kanye navamile. Ngakho-ke imiphumela isekela i-RBBP6 njengomgqugquzeli ekusebenzisaneni kwe-p53 ne-MDM2 kumangqamuzana omuntu kanye nokusekela i-RBBP6 njengethagethi yemithi esingaba khona yokwelapha umdlavuza.National Research FoundationLife and Consumer SciencesPhD. (Life Science

    ECOS 2012

    Get PDF
    The 8-volume set contains the Proceedings of the 25th ECOS 2012 International Conference, Perugia, Italy, June 26th to June 29th, 2012. ECOS is an acronym for Efficiency, Cost, Optimization and Simulation (of energy conversion systems and processes), summarizing the topics covered in ECOS: Thermodynamics, Heat and Mass Transfer, Exergy and Second Law Analysis, Process Integration and Heat Exchanger Networks, Fluid Dynamics and Power Plant Components, Fuel Cells, Simulation of Energy Conversion Systems, Renewable Energies, Thermo-Economic Analysis and Optimisation, Combustion, Chemical Reactors, Carbon Capture and Sequestration, Building/Urban/Complex Energy Systems, Water Desalination and Use of Water Resources, Energy Systems- Environmental and Sustainability Issues, System Operation/ Control/Diagnosis and Prognosis, Industrial Ecology
    corecore