Building a Portal for Scientific Collections at the University of Lisbon

Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020As coleções científicas, reunindo uma enorme quantidade e diversidade de objetos e os dados que lhes estão associados, constituem um valioso património histórico, científico e cultural. Estas coleções estão, geralmente, sob a responsabilidade dos museus e dos seus respetivos curadores, sendo importante que exista uma plataforma sobre a qual os responsáveis das mesmas possam efetuar operações de gestão e de manutenção das mesmas. Atendendo a diversidade das coleções, estes dados, pertencentes a diferentes domínios científicos e com propriedades distintas, colocam problemas de integração, disponibilização e manutenção, problemas estes cada vez mais pertinentes numa realidade que vive de dados e da análise e partilha dos mesmos. Este projeto, centrado neste desafio, pretendeu desenvolver, para o Museu Nacional de História Natural e da Ciência da Universidade de Lisboa, uma plataforma que agregasse as variadíssimas coleções desta instituição, tirando partido de uma plataforma open-source base chamada CollectiveAccess. No decorrer do mesmo, foi desenvolvida uma metodologia generalizada para qualquer coleção que cobre os processos desde a aquisição dos dados, o seu processamento e correção ate a sua importação e disponibilização dentro da plataforma. Foram, também, desenvolvidas e implementadas funcionalidades especificas que visaram resolver determinadas características particulares dos diferentes conjuntos de dados como e o caso da implementação de um sistema hierárquico para dados relacionados com taxonomia, sistema de introdução de dados geográficos utilizando uma API externa e desenvolvimento das funcionalidades de pesquisa de modo a satisfazerem as necessidades de cada conjunto de dados. Estas funcionalidades e o desempenho do sistema foram avaliados através de dois questionários de usabilidade (System Usability Scale), atraves de dois Google Form diferentes. Estes questionários foram direcionados para dois tipos principais de utilizadores do sistema: curadores e publico, em geral. Para alem disto, foram pedidos comentários e sugestões de melhorias ou acrescento de funcionalidades. Os resultados dos questionários foram satisfatórios obtendo-se uma classificação de A e B, por parte dos testes do publico e dos curadores respetivamente, na escala de usabilidade. A analise dos comentários e sugestões também permitiu obter uma ideia sobre possíveis melhoramentos e novas funcionalidades a implementar.With scientific collections bringing together a huge number and diversity of objects and the data associated with them, they constitute a valuable historical, scientific and cultural heritage. These collections are generally under the responsibility of museums and their respective curators, and it is important that there is a platform on which those responsible for them can carry out management and maintenance operations. Given the diversity of the collections, these data, belonging to different scientific domains and with different properties, pose problems of integration, availability and maintenance, problems that are increasingly relevant in a data-centric world that relies on the analysis and sharing of the data. This project, focused on this challenge, aimed to develop, for the Museu Nacional de Historia Natural e da Ciência da Universidade de Lisboa, a platform that aggregates the very diverse collections of this institution, taking advantage of an open-source base platform called CollectiveAccess. In the course of the same, a generalized methodology was developed for any collection, covering the processes from the acquisition of the data, its processing and correction to its import and availability within the platform. Specific features were also developed and implemented that aimed at solving certain particular characteristics of different data sets, such as the implementation of a hierarchical system for taxonomyrelated data, geographic data entry system using an external API and development of the base search features, meeting the requirements for each collection. These functionalities and the overall performance of the system were evaluated through two usability questionnaires (System Usability Scale), via two different Google Forms. These questionnaires were aimed at two main types of users of the system: curators and the general public. In addition, comments and suggestions for improvements or addition of features were requested. The results of the questionnaires were satisfactory, obtaining a classification of A and B, by the tests of the public and the curators, respectively, on the usability scale. The analysis of comments and suggestions also provided an idea of possible improvements and new features to be implemented