Dinámica clínica, sociodemográfica y espacial de la infección por SARS-COV-2 en el departamento de Córdoba

The serological evaluation of SARS-CoV-2 is an alternative that allows knowing the prevalence and dynamics of this infection in populations. Aim. To determine the clinical and socio-demographic dynamics of SARS-CoV-2 infection in a region of the Colombian Caribbean. Methods. Between July and November 2020, a cross-sectional observational study was carried out. The work was carried out in Córdoba, located in the northeast of Colombia in the Caribbean area. Eight municipalities with the largest population were chosen, and 2,564 blood samples were taken. The commercial ELISA was used with the recombinant protein antigen N of SARS-CoV-2. The people included in the study were asked for sociodemographic and clinical data related to pulmonary and extra-pulmonary manifestation of this disease, which were analyzed by statistical methods. Results. A seroposivity of 40.8% was obtained for SARS-CoV-2 in the Cordoba region of the Colombian Caribbean. In the bivariate analysis, no differences were observed in seropositivity against SARS-CoV-2 about gender or age range (P> 0.05). Higher seropositivity was found in low socioeconomic status and symptomatic patients (P <0.0001). 30.7% of the asymptomatic patients were seropositive for SARS-CoV-2, which would be linked to the spread of this infection. In the multivariate analysis, seroconversion was related to poverty and clinical manifestations such as anosmia and ageusia (P <0.05). Conclusions. The high seropositivity in the department of Córdoba would be related to a possible community immunity. Seropositivity would be related to clinical manifestations such as anosmia and ageusia. In addition, the association between seropositivity and socioeconomic level suggests an appropriate context for the transmission of the virus, this being determined by informal economic activities in low-income groups.1. RESUMEN ................................................................................................................................. 82. ABSTRACT ............................................................................................................................... 93. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA .............................................................................. 104. JUSTIFICACIÓN ................................................................................................................... 115. PREGUNTA DE INVESTIGACIÓN .................................................................................... 126. HIPÓTESIS. ............................................................................................................................ 127. OBJETIVOS ............................................................................................................................ 127.1 OBJETIVO GENERAL ................................................................................................. 127.2 OBJETIVOS ESPECIFICOS: ............................................................................................. 128. MARCO TEORICO ............................................................................................................... 138.1 SÍNDROME RESPIRATORIO AGUDO GRAVE DE TIPO 2 (SARS-CoV-2) ................ 138.2 ESTRUCTURA DE LOS CORONAVIRUS ....................................................................... 148.3 EPIDEMIOLOGIA ............................................................................................................... 168.3.1 Factor Ro del SARS – CoV-2 ........................................................................................ 168.3.2 Distribución de casos por edades .................................................................................. 178.3.3 MECANISMOS DE TRANSMISIÓN .......................................................................... 188.4 RESPUESTA INMUNE DE LA INFECCIÓN POR SARS-CoV-2 .................................. 188.5 MANIFESTACIONES Y DATOS CLÍNICOS .................................................................. 208.6 PRUEBAS DIAGNOSTICAS PARA LA INFECCIÓN POR SARS-COV 2 .................. 218.7 VARIANTES GÉNETICAS DEL SARS-CoV-2 ................................................................ 228.8 TRATAMIENTOS CONTRA EL SARS-CoV-2 ................................................................ 239. MÉTODOS. ............................................................................................................................. 259.1 Tipo de estudio ................................................................................................................. 259.2 Cálculo del tamaño de la muestra y distribución. ........................................................ 259.3 Criterios de inclusión y exclusión .................................................................................. 259.4 Recolección de muestras. ................................................................................................ 269.5 Descripción de las variables ................................................................................................. 269.5.1 Diagrama de las variables .............................................................................................. 279.6 Técnicas y procedimientos. .................................................................................................. 289.6.1 Recolección de la información. ..................................................................................... 289.7 Fuentes de información. ....................................................................................................... 299.8 Actividades. ............................................................................................................................ 299.8.1 Actividades desarrolladas para dar cumplimiento al objetivo 1: .............................. 299.8.2 Actividades desarrolladas para dar cumplimiento al objetivo 2: .............................. 309.8.3 Actividades desarrolladas para dar cumplimiento al objetivo 3: .............................. 319.8.4 Actividades desarrolladas para dar cumplimiento al objetivo 4: ............................. 319.8.5 Actividades desarrolladas para dar cumplimiento al objetivo 5: .............................. 329.9 Análisis de los datos............................................................................................................... 329.10 Consideraciones éticas ........................................................................................................ 3210. RESULTADOS .................................................................................................................... 3310.1 Características socio-demográficas y clínicas de la población muestreada. .............. 3310.2 Dinámica espacial de la infección por SARS-CoV-2 en los municipios evaluados. ... 3410.3 Relación las características sociodemográficas (rango etario, género, estrato socioeconómico) con la frecuencia de infección por SARS-CoV-2. ........................................ 3810.3 Dinámica clínica y su relación con la seropositividad por SARS-CoV-2. .................. 4010.4 Modelo explicativo para la dinámica en la infección por SARS-CoV-2 en los municipios evaluados en el departamento de Córdoba. .......................................................... 4111. DISCUSIÓN ......................................................................................................................... 4311.1 Dinámica espacial de la infección por SARS-CoV-2 en los municipios evaluados ........ 4311.2 Relación de las características sociodemográficas (rango etario, género, estrato socioeconómico) con la frecuencia de infección por SARS-CoV-2. ........................................ 4511.3 Dinámica clínica y su relación con la seropositividad por SARS-CoV-2. ...................... 4711.4 Modelo explicativo para la dinámica en la infección por SARS-CoV-2 en los municipios evaluados en el departamento de Córdoba. .............................................................................. 4712. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES ................................................................ 4813. LIMITACIONES ................................................................................................................ 4914. BIBLIOGRÁFIA ................................................................................................................. 5015. ANEXOS .............................................................................................................................. 63La evaluación serológica del SARS-CoV-2 es una alternativa que permite conocer la prevalencia y dinámica de esta infección en poblaciones. Objetivo. Determinar la dinámica clínica y sociodemográfica de la infección por SARS-CoV-2 en una región del Caribe colombiano. Métodos. Entre julio y noviembre de 2020 se realizó un estudio observacional transversal. La investigación se llevó a cabo en Córdoba, ubicada en el noreste de Colombia en la zona del Caribe. Se eligieron ocho municipios con mayor población y se tomaron 2.564 muestras de sangre. El ELISA comercial se utilizó con el antígeno de proteína recombinante N de SARS-CoV-2. A las personas incluidas en el estudio se les solicitó datos sociodemográficos y clínicos relacionados a manifestaciones pulmonares y extrapulmonares de esta enfermedad, que fueron analizados por métodos estadísticos. Resultados. Se obtuvo una seropositividad del 40.8% para SARS-CoV-2 en la región de Córdoba del Caribe colombiano. En el análisis bivariado, no se observaron diferencias en la seropositividad frente al SARS-CoV-2 sobre el sexo o el rango de edad (P> 0,05). Se encontró una mayor seropositividad en el nivel socioeconómico bajo y en los pacientes sintomáticos (P <0,0001). El 30,7% de los pacientes asintomáticos fueron seropositivos para SARS-CoV-2, lo que estaría relacionado con la propagación de esta infección. En el análisis multivariado, la seroconversión se relacionó con la pobreza y manifestaciones clínicas como anosmia y ageusia (P <0,05). Conclusiones. La alta seropositividad en el departamento de Córdoba estaría relacionada con una posible inmunidad comunitaria. La seropositividad estaría relacionada con manifestaciones clínicas como anosmia y ageusia. Además, la asociación entre la seropositividad y el nivel socioeconómico permiten sugerir un contexto apropiado para la transmisión del virus, siendo este determinado por las actividades económicas informales en los grupos de bajos ingresos.MaestríaMagíster en Microbiología TropicalTrabajo de Investigación y/o Extensió