Caracterización fenotípica y molecular de resistencia inducida por aplicaciones de silicio y biochar en etapa vegetativa de tomate (Solanum lycopersicum) haciafusarium oxysporium F. SP. Lycopersici raza 26202

Figuras, tablas, gráficos, imágenes y fotografías.Este proyecto de investigacion fue realizado en las instalaciones del laboratorio IyerPascuzzi, perteneciente al departamento de botanica y fitopatologia de la Universidad de Purdue, West Lafayette. IN. USA. El trabajo busca alternativas de control de la enfermedad del suelo Fusarium oxisporium de tipo organico, practico, a bajo costo y efectivas para ser usadas por campesinos de la region del ariari y asi, brindar viabilidad fitosanitaria al cultivo del tomate a esta region de los Llanos Orientales de Colombia ya que las condiciones de edafoclimaticas son propicias para la proliferacion de esta enfermedad. La investigacion evaluo el efecto de la aplicación de enmiendas de Silicio y Biochar en plantas de tomate en estado vegetativo en el desarrollo de la enfermedad fúngica Fusarium oxysporium f. sp.lycopersici raza 26202. También hubo lugar a diversas pruebas de laboratorio enfocadas hacia el efecto de la aplicación de silicio a nivel fenotípico y molecular, donde se cuantifico y/o evaluó: acumulación de biomasa, acumulación de pigmentos (clorofila y antocianina) usando espectrofotómetro, colonización del patógeno a nivel vascular usando preservación de tejidos por técnica de parafina y posterior corte con micrótomo y expresión del gen de defensa PR-1 por electroforesis en gel.This research project was performed at the Iyer-Pascuzzi lab, which belongs to the botany and plant pathology department of Purdue University, West Lafayette. IN. USA. This research project aimed to use organic, practical, low cost and effective alternative strategies to control the soil borne pathogen Fusarium oxisporium. Thus, allowing farmers from the Ariari river basin cultivate tomato in this specific region of the oriental plains of Colombia which It´s soil/weather conditions allows this pathogen to thrive and spread. This research assessed the effect of Silicon and Biochar amendments on tomato plants in vegetative stage on the development of the soil borne disease Fusarium oxysporium f. sp.lycopersici strain 26202. The research also performed several laboratory trials emphasized on the effect of silicon amendments and It´s effect in a phenotypic and molecular level. Where It was quantified or assessed: biomass accumulation, pigments accumulation (chlorophyll and anthocyanin) using spectrophotometer, vascular colonization by the pathogen by paraffin preservation and later microscope analysis and gel electrophoresis for the defense gene PR-1.Contenido. – Introducción. – Objetivos. -- Objetivo general. -- Objetivos específicos. – Justificación. Planteamiento del problema. -- Revisión de literatura. – Tomate. -- Clasificación taxonómica. -- Origen e historia. -- Descripción botánica. -- Temperatura. -- Humedad. -- Luminosidad. -- Suelo. -- Fusarium oxysporium f. sp. Lycopersici. – Identificación. -- Síntomas. -- Ecología y ciclo biológico. -- Control. -- Rol del silicio en la agricultura. -- Historia. -- Descubrimiento de afectación de silicio en enfermedades de plantas monocotiledóneas. -- Descubrimiento de afectación de silicio en enfermedades de plantas dicotiledóneas. -- Silicio en los suelos. -- Silicio en las plantas. -- Toma de silicio, transporte y deposición en plantas. -- Inducción de mecanismos de defensa por aplicaciones de silicio. -- Fuente de silicio a usar en el experimento. – Biochar. -- Propiedades físicas del biochar. -- Estructura del biochar. -- Pirolisis. -- Densidad del biochar. -- Propiedades micro-químicas. -- Minerales trazas. -- Contenido de nutrientes. -- Propiedades biológicas. -- Estabilidad en el suelo. -- Interacción con minerales. -- Mecanismos de descomposición. -- Efectos en lixiviación de nutrientes. -- Implementación en oxisoles de la orinoquia colombiana. -- Materiales y métodos. – Localización. -- Enmiendas a evaluar. -- Variedades de tomate a evaluar. -- Fase de invernadero. -- Evaluar el efecto de la aplicación de biochar y si en la colonización del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici) en plantas de tomate (solanum lycopersicon). -- Fase de laboratorio. -- Desarrollo de protocolo de crecimiento de fusarium. -- Desarrollo de protocolo de inoculación con fusarium oxysporium f. sp.lycopersici plantas de tomate (solanum lycopersicon). -- Cuantificación de acumulación de biomasa y altura en plantas de tomate (solanum lycopersicon) en etapa vegetativa. -- Cuantificación del contenido de clorofila en diferentes plantas de tomate (solanum ) con tratamientos +/- si y +/- si+bc después de inocular con el hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici). -- Medir el contenido de antocianina en diferentes plantas de tomate (solanum lycopersicon) con tratamientos +/- si y +/- si+bc después de inocular con el hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici). -- Análisis de colonización del patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en el sistema vascular de diferentes variedades de tomate (solanum lycopersicon) en estado vegetativo mediante técnica de preservación en parafina y seccionamiento de tejido vegetal. -- Evaluación de efecto de si y si+bc en la expresión génica de las plantas con énfasis en genes de defensa (genes pr) mediante técnica pcrsemi-cuantitativo (reacción en cadena de la polimerasa). -- Diseño estadístico. -- Análisis estadístico. – Resultados. -- Cuantificación del efecto de aplicación de silicio en acumulación de biomasa y altura en plantas de tomate (solanum lycopersicon) en etapa vegetativa. -- Efecto de la aplicación de biochar y silicio en la colonización del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (solanum lycopersicon). -- Biochar. -- Silicio. -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio y silicio en dos variedades de tomate eleccionadas como resistente (m82) y susceptible (wv). -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (solanum lycopersicon) variedades m82 y wv. -- Efecto de la aplicación de silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (solanum lycopersicon) variedades m82 y wv. -- Contenido de pigmentos (clorofila y antocianina) en las variedades de tomate m82 y wv tratadas enmiendas de si y si+bc. -- Análisis de colonización del patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en el sistema vascular de variedades de tomate (solanum lycopersicon) m82 y wv tratadas con silicio en estado vegetativo mediante técnica de preservación en parafina y seccionamiento de tejido vegetal. -- Evaluación de efecto de si y si+bc en la expresión génotipica de la variedad wv en el gen de defensa (gene pr-1) mediante técnica pcr semicuantitativo (reacción en cadena de la polimerasa). -- Analisis de resultados. -- Cuantificación del efecto de aplicación de silicio en acumulación de biomasa y altura en plantas de tomate (solanum lycopersicon) en etapa vegetativa. -- Efecto de la aplicación de biochar y silicio en la colonización del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (lycopersicum sculentum). -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio y silicio en dos variedades de tomate seleccionadas como resistente (m82) y susceptible (wv). -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (solanum lycopersicon) variedades m82 y wv. -- Efecto de la aplicación de silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (solanum lycopersicon) variedades m82 y wv. -- Contenido de pigmentos (clorofila y antocianina) en las variedades de tomate m82 y wv tratadas enmiendas de si y si+bc. -- Análisis de colonización del patógeno (fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en el sistema vascular de variedades de tomate (solanum lycopersicon) m82 y wv tratadas con silicio en estado vegetativo mediante técnica de preservación en parafina y seccionamiento de tejido vegetal. -- Evaluación de efecto de si y si+bc en la expresión génotipica de la variedad wv en el gen de defensa (gene pr-1) mediante técnica pcr semicuantitativo (reacción en cadena de la polimerasa). – Concluciones. – Anexos. – Bibliografia.PregradoIngeniero(a) Agrónomo(a)Ingeniería Agronómic

Caracterización fenotípica y molecular de resistencia inducida por aplicaciones de silicio y biochar en etapa vegetativa de tomate (Solanum lycopersicum) Haciafusarium Oxysporium F. SP. Lycopersici raza 26202

Incluye imágenes, tablas, gráficas y anexos.Este proyecto de investigacion fue realizado en las instalaciones del laboratorio IyerPascuzzi, perteneciente al departamento de botanica y fitopatologia de la Universidad de Purdue, West Lafayette. IN. USA. El trabajo busca alternativas de control de la enfermedad del suelo Fusarium oxisporium de tipo organico, practico, a bajo costo y efectivas para ser usadas por campesinos de la region del ariari y asi, brindar viabilidad fitosanitaria al cultivo del tomate a esta region de los Llanos Orientales de Colombia ya que las condiciones de edafoclimaticas son propicias para la proliferacion de esta enfermedad. La investigacion evaluo el efecto de la aplicación de enmiendas de Silicio y Biochar en plantas de tomate en estado vegetativo en el desarrollo de la enfermedad fungica Fusarium oxysporium f. sp.lycopersici raza 26202. También hubo lugar a diversas pruebas de laboratorio enfocadas hacia el efecto de la aplicación de silicio a nivel fenotípico y molecular, donde se cuantifico y/o evaluó: acumulación de biomasa, acumulación de pigmentos (clorofila y antocianina) usando espectrofotómetro, colonización del patógeno a nivel vascular usando preservación de tejidos por técnica de parafina y posterior corte con micrótomo y expresión del gen de defensa PR-1 por electroforesis en gel.This research project was performed at the Iyer-Pascuzzi lab, which belongs to the botany and plant pathology department of Purdue University, West Lafayette. IN. USA. This research project aimed to use organic, practical, low cost and effective alternative strategies to control the soil borne pathogen Fusarium oxisporium. Thus, allowing farmers from the Ariari river basin cultivate tomato in this specific region of the oriental plains of Colombia which It´s soil/weather conditions allows this pathogen to thrive and spread. This research assessed the effect of Silicon and Biochar amendments on tomato plants in vegetative stage on the development of the soil borne disease Fusarium oxysporium f. sp.lycopersici strain 26202. The research also performed several laboratory trials emphasized on the effect of silicon amendments and It´s effect in a phenotypic and molecular level. Where It was quantified or assessed: biomass accumulation, pigments accumulation (chlorophyll and anthocyanin) using spectrophotometer, vascular colonization by the pathogen by paraffin preservation and later microscope analysis and gel electrophoresis for the defense gene PR-1.Contenido. – Introducción. – Objetivos. -- Objetivo general. -- Objetivos específicos. – Justificación. -- Planteamiento del problema. -- Revisión de literatura. – Tomate. -- Clasificación taxonómica. -- Origen e historia. -- Descripción botánica. -- Temperatura. -- Humedad. -- Luminosidad. -- Suelo. -- Fusarium oxysporium f. sp. Lycopersici. – Identificación. -- Síntomas. -- Ecología y ciclo biológico. -- Control. -- Rol del silicio en la agricultura. -- Historia. -- Descubrimiento de afectación de silicio en enfermedades de plantas. -- Monocotiledóneas. -- Descubrimiento de afectación de silicio en enfermedades de plantas. -- dicotiledóneas. -- Silicio en los suelos. -- Silicio en las plantas. -- Toma de silicio, transporte y deposición en plantas. -- Inducción de mecanismos de defensa por aplicaciones de silicio. -- Fuente de silicio a usar en el experimento. – Biochar. -- Propiedades Físicas del biochar. -- Estructura del biochar. -- Pirolisis. -- Densidad del biochar. -- Propiedades micro-químicas. -- Minerales trazas. -- Contenido de nutrientes. -- Propiedades biológicas. -- Estabilidad en el suelo. -- Interacción con minerales. -- Mecanismos de descomposición. -- Efectos en lixiviación de nutrientes. -- Implementación en oxisoles de la Orinoquia Colombiana. -- Materiales y métodos. – Localización. -- Enmiendas a evaluar. -- Variedades de tomate a evaluar. -- Fase de invernadero. -- Evaluar el efecto de la aplicación de biochar y Si en la colonización del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici) en plantas de tomate (Solanum lycopersicon). -- Fase de laboratorio. -- Desarrollo de protocolo de crecimiento de fusarium. -- Desarrollo de protocolo de inoculación con Fusarium oxysporium f. sp.lycopersici plantas de tomate (Solanum lycopersicon). -- Cuantificación de acumulación de biomasa y altura en plantas de tomate (Solanum lycopersicon) en etapa vegetativa. -- Cuantificación del contenido de clorofila en diferentes plantas de tomate (Solanum ) con tratamientos +/- Si y +/- Si+BC después de inocular con el hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici). -- Medir el contenido de antocianina en diferentes plantas de tomate (Solanum lycopersicon) con tratamientos +/- Si y +/- Si+BC después de inocular con el hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici). -- Análisis de colonización del patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en el sistema vascular de diferentes variedades de tomate (Solanum lycopersicon) en estado vegetativo mediante técnica de preservación en parafina y seccionamiento de tejido vegetal. -- Evaluación de efecto de Si y Si+BC en la expresión génica de las plantas con énfasis en genes de defensa (genes PR) mediante técnica PCRsemi-cuantitativo (Reacción en cadena de la polimerasa). -- Diseño estadístico. -- Análisis estadístico. – Resultados. -- Cuantificación del efecto de aplicación de silicio en acumulación de biomasa y altura en plantas de tomate (Solanum lycopersicon) en etapa vegetativa. -- Efecto de la aplicación de biochar y silicio en la colonización del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. Lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (Solanum lycopersicon). -- Biochar. -- Silicio. -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio y silicio en dos variedades de tomate seleccionadas como resistente (m82) y susceptible (wv). -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (Solanum lycopersicon) variedades M82 y WV. -- Efecto de la aplicación de Silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (Solanum Lycopersicon) variedades M82 y WV. -- Contenido de pigmentos (clorofila y antocianina) en las variedades de tomate m82 y wv tratadas enmiendas de si y si+bc. -- Análisis de colonización del patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en el sistema vascular de variedades de tomate (solanum lycopersicon) m82 y wv tratadas con silicio en estado vegetativo mediante técnica de preservación en parafina y seccionamiento de tejido vegetal. -- Evaluación de efecto de si y si+bc en la expresión génotipica de la variedad wv en el gen de defensa (gene pr-1) mediante técnica PCR semicuantitativo (reacción en cadena de la polimerasa). -- Análisis de resultados. -- Cuantificación del efecto de aplicación de silicio en acumulación de biomasa y altura en plantas de tomate (solanum lycopersicon) en etapa vegetativa. -- Efecto de la aplicación de biochar y silicio en la colonización del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (Lycopersicum sculentum). -- Efecto de la aplicación de biochar+silicio y silicio en dos variedades de tomate seleccionadas como resistente (m82) y susceptible (wv). -- Efecto de la aplicación de Biochar+Silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (Solanum Lycopersicon) variedades M82 y WV. -- Efecto de la aplicación de Silicio en la afectación de área foliar del hongo patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en plantas de tomate (Solanum Lycopersicon) variedades M82 y WV. -- contenido de pigmentos (clorofila y antocianina) en las variedades de tomate m82 y wv tratadas enmiendas de si y si+bc. -- Análisis de colonización del patógeno (Fusarium oxysporium f. sp. lycopersici raza 26202) en el sistema vascular de variedades de tomate (solanum lycopersicon) m82y wv tratadas con silicio en estado vegetativo mediante técnica de preservación en parafina y seccionamiento de tejido vegetal. -- Evaluación de efecto de si y si+bc en la expresión génotipica de la variedad wv en el gen de defensa (gene pr-1) mediante técnica pcr semicuantitativo (reacción en cadena de la polimerasa). – Concluciones. – Anexos. – Bibliografia.PregradoIngeniero(a) Agrónomo(a)Ingeniería Agronómic