Paléomicrobiologie : utilisation de l'ADN fossile des sites archéologiques du musée de Pointe-à-Callière comme marqueur d'événements historiques

Abstract

Les microorganismes des trois domaines du vivant, Eucaryotes, Bactéries et Archées, sont composés d’ADN, qui porte l’information génétique, et d’ARN (messagers, ribosomiques, etc.…). L’ADN étant plus stable que l’ARN, lorsqu’un microorganisme meurt, l’ARN se lyse alors plus rapidement que l’ADN qui peut quant à lui persister dans l’environnement et, sous certaines conditions, se fossiliser. Nous savons que les microorganismes évoluent et se développent en fonction du milieu dans lequel ils se trouvent, ils peuvent donc nous permettre de retracer l’histoire d’un site archéologique comme celui qui date de la fondation de la ville de Montréal ainsi que les évènements qui l’ont précédé (occupations des peuples autochtones, changements environnementaux, etc…). En récoltant des carottes de sol sur trois sites historiques du musée de Pointe-à-Callière, nous aurons les périodes les plus récentes en surface, tandis que les périodes datant de plusieurs milliers d’années seront retrouvées au plus profond. En étudiant les microorganismes de chaque strate, nous pourrons associer certains taxons aux différentes époques, et donc à différents évènements. Cela nous permettra ensuite de comparer nos résultats avec ceux des historiens quant aux activités associées aux lieux et de voir s’il est possible d'utiliser la paléomicrobiologie comme méthode pour compléter les études archéologiques. _____________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : écologie microbienne, séquençage MiSeq-Illumina, bio-informatique, communautés microbiennes, rétrotranscriptio