¿Es ITS2 más eficaz en la codificación del ADN de angiospermas que las regiones ITS, ITS1, matK y trnH-psbA? Una revisión

Abstract

The internal transcribed spacer 2 (ITS2) of the ribosomal cistron, functioning as a mini barcode, has proven successful in numerous angiosperm DNA barcoding studies. However, its efficiency has not been thoroughly questioned in the existing literature. This review statistically evaluates 197 angiosperm DNA barcoding studies that utilized the ITS2 mini barcode. The assessment encompasses not only the ease of amplification, sequencing, and species identification success of the ITS2 region but also a comparison with ITS1, the entire ITS region, matK, and trnH-psbA. The results align with the previous conclusion that ITS2 can be effectively utilized for angiosperm identification. While the amplification, sequencing, and identification to the genus level of the ITS2 region were high, the success in species identification was not as prominent. No significant differences were observed among the types of material or the primer pairs used in terms of the success of the region. The utilization of only the ITS2 region performed well in comparison to DNA barcode combinations. However, it is noteworthy that none of the reviewed regions can be considered a universal barcode for angiosperms. The results suggest that the ITS1 and ITS2 are equally effective as mini-DNA barcodes, followed by the entire ITS region, while matK and trnH-psbA should not be the primary choices.El espaciador interno transcrito 2 (ITS2) del cistrón ribosómico, que funciona como un minicódigo de barras, ha demostrado ser eficaz en numerosos estudios de código de barras de ADN de angiospermas. Sin embargo, su eficiencia no se ha cuestionado exhaustivamente en la literatura existente. Esta revisión evalúa estadísticamente 197 estudios de código de barras de ADN de angiospermas que utilizaron el minicódigo de barras ITS2. La evaluación abarca no solo la facilidad de amplificación, secuenciación y éxito en la identificación de especies de la región ITS2, sino también una comparación con ITS1, la región ITS completa, matK y trnH-psbA. Los resultados concuerdan con la conclusión previa de que ITS2 puede utilizarse eficazmente para la identificación de angiospermas. Si bien los niveles de amplificación, secuenciación e identificación a nivel de género usando ITS2 fueron altos, el éxito en la identificación a nivel de especie no fue tan prominente. No se observaron diferencias significativas entre los tipos de material o los pares de cebadores utilizados en relación al éxito de la región. El uso exclusivo de ITS2 tuvo un buen rendimiento en comparación con las combinaciones de códigos de barras de ADN. Sin embargo, ninguna de las regiones analizadas puede considerarse un código de barras universal para las angiospermas. Los resultados sugieren que las subregiones ITS1 e ITS2 son igualmente eficaces, seguidas de la región ITS completa, mientras que matK y trnH-psbA no deberían ser las opciones principales