ORIGIN OF EUCARYOTIC ALGAE

Zemljina atmosfera je plinoviti omotač kojeg pronalazimo oko našega planeta. Bez tog omotača život na Zemlji kakvog danas znamo ne bi bio moguć. Zahvaljujući postupnom razvitku oksigene fotosinteze otvorio se put k razvoju aerobnih organizama, ali konačno i eukariotskih stanica. Evolucija cijanobakterija bila je glavna prekretnica u biogeokemiji Zemlje. Postoji opće uvjerenje da su eukarioti stekli fotosintezu putem endosimbioze što je zapravo rezultiralo zarobljivanjem cijanobakterije kako bi postala plastid. Podrijetlo fotosintetskih organela u eukariota, plastida, zauvijek je promijenilo evolucijsku putanju života na našem planetu. Eukariotske alge koje sadrže primarne plastide su skupine: Glaucophyta, Chlorophyta i Rhodophyta.Earth's atmosphere is the gaseous cover we find around our planet. Without this wrap-around life on Earth we know today would not be possible. Thanks to the gradual development of oxygenous photosynthesis, the pathway to the development of aerobic organisms, but ultimately eukaryotic cells, has also begun. The evolution of cyanobacteria was the main milestone in the Earth's biogeochemistry. There is a general belief that eukaryotes have acquired photosynthesis through endosymbosis, which has resulted in capture of cyanobacteria to become a plastide. The origin of photosynthesis organelles in eukaryotes, plastids, has forever changed the evolutionary path of life on our planet. Eucaryotic algae can now be divided into three groups that contain primary plastids, namely: Glaucophyta, Chlorophyta and Rhodophyta

Determination of essential oil content and composition in cardamom (Elettaria cardamomum (L.) Maton)

Kardamom (Elettaria cardamomum (L.) Maton) je aromatična, zeljasta trajnica koja pripada porodici đumbirovki (Zingiberaceae). Plodovi kardamoma cijenjeni su i naširoko korišteni kao začin i aroma u hrani i napitcima no poznato je i njihovo blagotvorno djelovanje na zdravlje. Ljekarnička droga Cardamomi fructus (Cardamomi semen) ima dugu povijest primjene u Ajurvedi, tradicionalnoj indijskoj medicini, gdje se koristi uglavnom u liječenju gastrointestinalnih i respiratornih tegoba. Ljekovito djelovanje kardamoma temelji se poglavito na sadržaju eteričnog ulja no, s obzirom da se radi o egzotičnoj i relativno skupoj biljnoj drogi te da je njeno farmakološko i kliničko djelovanje još uvijek nedovoljno istraženo, u suvremenoj europskoj fitoterapiji rijetko se koristi. U okviru ovog diplomskog rada provedena je fitokemijska analiza temeljena na određivanju sadržaja i sastava eteričnog ulja u osam komercijalno dostupnih uzoraka kardamomovog ploda s hrvatskog tržišta. Farmakopejskom metodom destilacije pomoću vodene pare utvrđeno je da uzorci biljne droge dostupni u obliku praha sadrže 4-40 mL eteričnog ulja/kg, dok je udio eteričnog ulja u in toto plodovima bio značajno viši i kretao se u rasponu 44-56 mL eteričnog ulja/kg. Analiza provedena metodom plinske kromatografije spregnute s tandemskom spektrometrijom masa (GC-MS/MS) pokazala je da su glavne sastavnice eteričnog ulja kardamoma α-terpinil acetat (35,99-62,28 %) i 1,8-cineol (0,24-30,62 %). Među ostalim manje zastupljenim spojevima ističu se α-terpineol (2,18-16,75 %), linalol (0,81-7,25 %) i sabinen (0-3,76 %). Dobiveni rezultati upućuju na značajne razlike u sadržaju i sastavu eteričnog ulja kao glavog pokazatelja kakvoće kardamomovog ploda i nositelja ljekovitog djelovanja te ističu superiorniju farmaceutsku kakvoću cjelovite droge u odnosu na onu komercijalno dostupnu u obliku praha.Cardamom (Elettaria cardamomum (L.) Maton) is an aromatic, herbaceous perennial, plant belonging to the ginger family (Zingiberaceae). Cardamom fruits are valued and widely used as a spice and aroma in food and beverages, but their beneficial effects on human health are also well-known. The herbal drug Cardamomi fructus (Cardamomi semen) has a long history of usage in Ayurveda, traditional Indian medicine, where it is used mainly in treating gastrointestinal and respiratory ailments. The healing effect of cardamom is based mainly on the content of essential oil, since it is an exotic and relatively expensive herbal drug and its pharmacological and clinical effects are still insufficiently researched, it is rarely used in modern phytotherapy in Europe. As part of this thesis, a phytochemical analysis based on the determination of the content and composition of essential oil in eight commercially available samples of cardamom fruit from the Croatian market was performed. The pharmacopoeial method of steam distillation showed that samples of herbal drugs available in powder form contained 4-40 mL of essential oil/kg, while the content of essential oil in in toto fruits was significantly higher and ranged from 44 to 56 mL essential oil/kg. Analysis by gas chromatography coupled to tandem mass spectrometry (GC-MS/MS) showed that the main components of cardamom essential oil were α-terpinyl acetate (35.99-62.28%) and 1,8-cineole (0.24 -30.62%). Other less common components include α-terpineol (2.18-16.75%), linalool (0.81-7.25%) and sabinene (0-3.76%). The obtained results indicate significant differences in the content and composition of essential oil as the main indicator of the quality of cardamom fruit and basis of medicinal effects and also emphasize the superior pharmaceutical quality of the whole drug compared to commercially available powder

Methods and new technical solutions for increasement of the productivity in the production cells

Cilj ovoga rada je definirati proizvodnu ćeliju, te dati sažetak metoda i tehničkih rješenja za povećanje produktivnosti. Na primjeru iz prakse analizirati značajke proizvodne ćelije, te mogućnosti primjene određene metode ili tehničkog rješenja u svrhu povećanja produktivnosti. Teorijski dio rada opisuje proizvodnu ćeliju, njezine prednosti pred tradicionalnim sustavima proizvodnje, bitne značajke koje ulaze u njezino dizajniranje i važnost Lean alata koji se koriste kako bi se u njoj postigla bolja proizvodnost i fleksibilnost. Drugi, praktični, dio rada sastoji se od snimanja stanja trenutno postavljenih proizvodnih ćelija u tvrtki Feroimpex d.o.o., analize sustava koje koriste, opisanih prijedloga za razna poboljšanja unutar postojeće ćelije korištenjem Lean alata i ergonomije rada, analize raznih mogućih konfiguracija ljudi i strojeva, te odabir i argumentacija najbolje opcije u vidu sadašnjeg stanja unutar poduzeća.The goal of this thesis is to define the production cell and provide a summary of methods and technical solutions to increase productivity. From a practice example, analyze the features of an existing production cell and the ability to apply a particular method or technical solution to increase its productivity. The theoretical part of the paper describes the production cell, its advantages over traditional production systems, the essential features that come into its design and the importance of Lean tools used to achieve better productivity and more flexibility. The second, practical part of the work, consists of recording the state of the currently placed production cells at Feroimpex d.o.o., analysis of the systems that are being used, the proposed suggestions for various improvements within the existing cell design using Lean tools and ergonomics, study of the various possible design configurations of people and machines, and argumentative choice for the best option in terms of the present state of the company

Peptide self-assembly prediction based on aggregation propensity and sequential properties

Predložen je pristup za rješavanje problema heterogenih podataka iz sekvencijalnih svojstava (SP) i ocjene sklonosti agregaciji (AP) za peptide sastavljene od 1, 2 i 3 aminokiseline uporabom povratnih neuronskih mreža koje obrađuju sekvence promjenjive duljine koristeći svoju unutarnju memoriju. Kako bi se postigao jednak broj AP i SP vrijednosti, t-distribuirano stohastičko ugrađivanje susjeda (t-SNE) primijenjeno je na 94 SP vrijednosti i izdvojene su 3 meta-značajke. Pragovi temeljeni na krivuljama ROC (radna karakteristika prijamnika) i PR (preciznost-odziv) testirani su kako bi se unaprijedila binarna klasifikacija. Visoki rezultati geometrijske sredine (0, 704 za SP model i PR prag) koji su vrlo blizu rezultata točnosti (79, 7% za SP model i PR prag) dokazuju da je predviđanje moguće za pozitivnu i negativnu klasu samosastavljajućih peptida. Neklasificirani heksapeptidi korišteni su za testiranje primjenjivosti modela za predviđanje ocjene AP. Najuspješniji među razvijenim modelima, SP model, nadmašuje ljudska predviđanja i predviđanja najsuvremenijeg modela iz literature na temelju točnosti, F1 rezultata i geometrijske sredine. Modeli bi se mogli koristiti kao dopuna ljudskoj intuiciji u stvaranju novih peptidnih sekvenci s velikom sklonošću samosastavljanju.We propose an approach to tackle the issue of heterogeneous data from sequential properties (SP) and aggregation-propensity (AP) scores for peptides composed of 1, 2, and 3 amino acids by using Recurrent Neural Networks that process sequences of variable length using their internal memory. To achieve an equal number of AP and SP values, t-distributed stochastic neighbour embedding (t-SNE) was applied to the 94 SP values, and 3 meta-features were extracted. Thresholds based on ROC (Receiver Operating Characteristic) and PR (Precision-Recall) curves were tested to advance binary classification. High geometric mean scores (0.704 for the SP model and PR threshold) that are very close to accuracy scores (79.7% for the SP model and PR threshold) prove that prediction is possible both for the positive and negative class of peptides based on self-assembly. Unclassified hexapeptides were used to test whether the model was applicable for predicting AP scores. The most successful of the developed models, the SP model, outperforms human predictions and the predictions of the state-of-the-art model from the literature based on accuracy, F1 score, and geometric mean. The models could complement human intuition in generating novel peptide sequences with a high propensity to self-assemble

Thermal and termooxidative degradation of polymer packaging film containing rosemary extract : master thesis

U ovom radu istražen je utjecaj dodatka ekstrakta ružmarina (ER) na toplinsku i termooksidacijsku stabilnost polimerne matrice polietilena (PE) i polipropilena (PP) . Toplinska razgradnja polietilena i polipropilena se odvija kroz jedan stupanj, dok se njihovi kompoziti PE/ER i PP/ER razgrađuju u dva stupnja. Toplinska i termooksidacijska razgradnja ekstrakta ružmarina se odvija kroz tri stupnja. Toplinska postojanost kompozita PE/ER se poboljšava dodatkom ekstrakta, dok u slučaju kompozita PP/ER ekstrakt ne utječe na toplinsku postojanost polimerne matrice polipropilena. U struji kisika čisti polietilen i kompozit PE/ER se razgrađuju u tri područja razgradnje. Termooksidacijska razgradnja čistog polipropilena i kompozita PP/ER se odvija u dva stupnja. Dodatak ekstrakta ružmarina poboljšava termooksidacijsku postojanost obiju istraživanih polimernih matrica, odnosno kompozita, pri čemu je vidljiv značajniji utjecaj na polimernu matricu polietilena.In this work the influence of the addition of rosemary extract (RE) on the thermal and thermooxidative stability of the polymer matrix of polyethylene (PE) and polypropylene (PP) were investigated. Thermal degradation of the polyethylene and polypropylene occurs in a single degradation step while their composites PE/ER and PP/ER decompose in two steps. Thermal and thermooxidative degradation of rosemary extract takes place through three steps. The thermal stability of the PE/ER composite is improved by the addition of the extract, while in the case of the PP/ER composite the extract does not affect the thermal stability of the polypropylene polymer matrix. In the oxygen atmosphere pure polyethylene and PE/ER composite are degraded in three areas of decomposition. Thermooxidative decomposition of pure polypropylene and PP/ER composite takes place in two steps. The addition of rosemary extract improves the thermooxidative stability of both composites, while having a more significant effect on the polyethylene polymer matri

Conceptual project of irrigation system in Zadar County

Navodnjavanje kao melioracijska mjera kojom se primjenom sustava navodnjavanja i aplikacije vode održava vlažnost tla na razini kojom se omogućuje optimalni rast i razvoj usjeva odnosno ostvarenje zadovoljavajućih prinosa. Učestale pojave suša u kombinaciji sa smanjenjem zaliha svježe vode prisiljava države članice EU da definiraju i primjene mjere prilagodbe koje se temelje na uštedi vode i učinkovitom korištenju vode u poljoprivredi. Suše se u Hrvatskoj događaju u prosjeku svake treće do pete godine, a ovisno o intenzitetu i trajanju mogu smanjiti prinose poljoprivrednih kultura od 20 % do 92 %. U radu će se izvršiti analiza dostupnih prostornih podloga korištenjem GIS alata da bi se utvrdili potencijalni izvori vode za navodnjavanje. Odradit će se 30-godišnji niz glavnih meteoroloških parametara (oborine, temperatura, insolacija, vlaga zraka, brzina vjetra) za meteorološku postaju Zadar-aerodrom, koji će biti podloga za definiranje potreba maslina za vodom na lokaciji u općini Pridraga površine 0,49 ha. Na osnovu dobivenih rezultata, odabrat će se odgovarajući sustav navodnjavanja te će se utvrditi potrebne dimenzije odabranog sustava.Irrigation as an ameliorative measure that, through the application of the irrigation system and the application of water, maintains soil moisture at a level that allows optimal growth and development of crops, that is, the achievement of satisfactory yields. The frequent occurrence of droughts, combined with the reduction of freshwater resources, forces EU Member States to define and apply adaptation measures based on water saving and efficient water use in agriculture. Droughts occur in Croatia on average every three to five years, and depending on their intensity and duration, they can reduce agricultural crop yields by 20 % to 92 %. In the paper, the available spatial bases are analyzed using GIS to identify potential water sources for irrigation. A 30-year series of the most important meteorological parameters (precipitation, temperature, solar radiation, humidity, wind speed) is obtained for the meteorological station Zadar-Aerodrom, which will serve as a basis for determining the water requirements of olive trees at a site in the municipality of Pridraga, with an area of 0.49 ha. Based on the obtained results, the appropriate irrigation system will be selected and the required dimensions of the selected system will be determined

Finalization of Syrah and Pinot Noir Wines Using Different Types of Wood Preparations

Zadatak ovog završnog rada je prikazati finalizaciju vina sorte Syrah i Pinot crni pomoću različitih vrsta drvenih pripravaka koje obično nazivamo čips. Na osnovu fizikalno-kemijskih i senzorskih analiza vina s dodatcima različitih vrsta čipsa, analizirane su različite vrste drvenih pripravaka kako utječu na senzorske karakteristike vina. Nakon što su dodaci Sorbet, Opera, Reglissa, Muffins i Vanilla odležali u vinima, vidljive su pozitivne promjene u organoleptičkim svojstvima vina. Kod vina sorte Syrah, dodaci su ostavili bolji dojam, te su se arome više osjetile, najbolju prosječnu ocjenu dobio je dodatak Opera za aromu hrast. Uzorak sorte Pinot crni najbolju je ocjenu dobio za dodatak Sorbet, aromu hrast.The task of this research paper is to show the finalization of wines Syrah and Pinot Noir and using different types of wood preparations commonly called chips. Based on the physico-chemical and sensory analyzes of wines with additional different types of chips, different types of wood preparations were analyzed how they affect the sensory characteristics of the wine. After the additives Sorbet, Opera, Reglissa, Muffins and Vanilla were aged in the wines, positive changes in the organoleptic properties of the wine were visible. In the case of Syrah wine, the additions left a better impression, and the aromas were felt more, the best average rating was given to the Opera supplement for oak aroma. The sample of the Pinot noir received the best mark for the addition of Sorbet, oak aroma

Synthesys of ferrocene amides of mannosylated desmuramyl dipeptide with potential adjuvant activity

U sklopu ovog rada sintetizirana su tri ferocenska amidna derivata manoziliranog desmuramildipeptida s varirajućom duljinom ugljikovodičnog lanca između ferocena i ostatka molekule. Ferocenski amini s tri i četiri metilenske skupine pripravljeni su iz odgovarajućih zaštićenih amina uklanjanjem Boc zaštite dok je ferocenski amin s dvije metilenske skupine pripravljen redukcijom iz ferocenacetonitrila. Kao peptidna podjedinica korišten je Boc-L-Ala-D-isoGln koji je priređen uklanjanjem benzilne zaštitne skupine s odgovarajućeg komercijalno dostupnog dipeptida Boc-L-Ala-D-isoGln(OBn). Manozna podjedinica pripravljena je iz 2,3,4,6-tetra-Oacetil-α-D-manopiranoze reakcijom s tert-butil-bromoacetatom te uklanjanjem tert-butilne zaštitne skupine u kiselim uvjetima. Ferocenski amini najprije su amidnom vezom povezani s desmuramil-dipeptidom preko karboksilne skupine bočnog ogranka isoGln reakcijom kondenzacije uz EDC×HCl kao kondenzacijski reagens, HOBt kao aditiv te TEA kao bazu. Nakon uklanjanja peptidne Boc zaštite, ferocenski amidni derivati desmuramil-dipeptida povezani su s manoznom podjedinicom u istim uvjetima amidacije. Konačni korak u sintezi ciljnih produkata bilo je uklanjanje acetilnih zaštitnih skupina s manozne podjedinice, što je provedeno Zemplénovim postupkom te su uspješno pripravljeni produkti u svrhu ispitivanja adjuvantskog učinka.In this thesis, three ferrocene amide derivatives of mannosylated desmuramyl dipeptide with varying length of the alkyl chain connecting the ferrocene subunit with the rest of the molecule have been synthesized. Ferrocene amines with three and four methylene groups were prepared from the corresponding protected amines by removal of the Boc protective group. Ferrocene amine with two methylene groups has been prepared by reduction of ferroceneacetonitrile. BocL-Ala-D-isoGln was used as the peptide subunit and prepared by removing the benzyl protective group from the corresponding commercially available Boc-L-Ala-D-isoGln(OBn). 2,3,4,6- tetra-O-acetyl-α-D-mannopyranose was used for the preparation of the mannose subunit by its reaction with tert-butyl bromoacetate and subsequent removal of the tert-butyl protective group in acidic condition. Ferrocene amines were connected through an amide bond to desmuramyl dipeptide via the carboxyl group located on the isoGln side chain. For this purpose reaction with EDC×HCl as a condensation reagent, HOBt as an additive and TEA as a base was used. After the removal of the peptide Boc protective group, ferrocene amide derivatives of desmuramyl dipeptide were linked to the mannose subunit in the same amidation reaction conditions. The final step in the synthesis of the target products was the removal of the acetyl protective groups from the mannose subunit, which was achieved by Zemplén's procedure. Thus, the final products were succesfully obtained and will be used for the investigation of their adjuvant activity

The influence of appearance and arrangement of the store on the purchasing behaviour of the customers in retail

U modernom svijetu u kojem danas živimo puno se više pažnje posvećuje kupovini, što većem i kvalitetnijem izboru proizvoda i proizvođača te analizom ponašanja potrošača s ciljem da se predvide i ostvare sve kupčeve želje i potrebe. Danas kupci velikih samoposlužnih prodavaonica samo u oko 30% slučajeva zna što će kupiti dok u ostalih 70% kupuju impulzivno u trenutku zbog osjećaja koji im izazove sama prodavaonica. Kupovina se može definirati kao proces u kojem potrošač prolazi kroz određene faze dok ne donese odluku o kupovini. Svaki kupac je individua za sebe i iz tog razloga svaki kupac kroz proces kupovine može prolaziti brže ili sporije, a neke faze mogu se i preskočiti. To ovisi o tome kakav je tko kupac. Faze kroz koje kupac prolazi prilikom svake kupovine: spoznaja potrebe, traženje informacija, procjena alternativa, odluka o kupovini i ponašanje nakon kupovine. Svaka zdrava osoba ima na raspolaganju 5 osjetila putem kojih doživljava svijet oko sebe. To su osjetilo vida, sluha, njuha, dodira i okusa. Prodavači koriste osjetilni marketing kako bi podsvjesno kupca „nagovorili“ na kupovinu nekog proizvoda. Obzirom na to, na kupca u prodavaonici djeluju poticaji kao što su: boja zidova prodavaonice, miris prodavaonice, glazba u prodavaonici, raspored artikala po prodavaonici, rasvjetom prodavaonice i promidžbenim repertoarom prodavaonice. Utjecanje na kupca ranije navedenim stvarima naziva se osjetilni marketing. Osjetilni marketing je vrsta marketinga gdje se s potrošačem dolazi u kontakt putem svih ljudskih osjetila da bi se postigao bolji način doživljaja određenog proizvoda. Ova vrsta marketinga koristeći ljudska osjetila povezuje potrošača na emocionalnoj razini na osobniji način u odnosu na masovni marketing

Synthesis, characterization and thermal transformation of new styryl-heterocycles and quantum-chemical study of the reaction mechanism

Cilj ovog rada bio je prirediti nove heterocikličke stilbenske sustave koji će se podvrgnuti termičkim ispitivanjima u pokušaju sinteze indanskih i indenskih derivata. Početni prekursori pripravljeni su Wittigovom reakcijom, pri čemu su dobiveni stilbenski i monosupstituirani sustavi. Termička ispitivanja u kiselom mediju provedena su na pripravljenim stilbenskim sustavima, a prisutnost indanskih i indenskih produkata uočena je samo kod tiofenskih derivata. Kvantno-kemijskim metodama ispitana su sva eksperimentalna zapažanja dobivena u radu.The aim of this work was to prepare heterocyclic stilbene systems that will be subjected to thermal reaction in an attempt to synthesize indane and indene derivatives. The initial precursors were prepared by the Wittig reaction, whereby stilbene and monosubstituted systems were obtained. Thermal reactions in acidic medium were performed on the prepared stilbene systems, and the presence of indane and indene products was observed only in thiophene derivatives. All the experimental observations obtained in the work were examined by quantum-chemical methods