The objectives of this study were: 1) to establish the composition and distribution of fish populations in the upper Segura river basin, and 2) to characterize the conservation status of the sampling sites according to their ichthyofauna. It was detected the occurrence of 13 fish species, 3 native (Luciobarbus sclateri, Salmo trutta and Squalius pyrenaicus), 3 translocated from Iberian basins (Cobitis paludica, Gobio lozanoi and Pseudochondrostoma polylepis) and 7 exotic fish to the Iberian Peninsula (Alburnus alburnus, Cyprinus carpio, Esox lucius, Lepomis gibbosus, Micropterus salmoides, Sander lucioperca and Onchorrhyncus mykiss). Sampling sites were characterized according to the conservation status of their fish communities: Type 1, good condition which are dominated by native fish species; Type 2, intermediate condition which are dominated by non-native fish species but significant populations of native fish species inhabiting in these sectors; Type 3, poor condition where sampling sites were dominated by exotic fish species.Los objetivos principales del fueron: 1) inventariar, en términos de composición y distribución, las poblaciones de peces de la cuenca alta del río Segura; 2) clasificar los distintos tramos fluviales en función del estado de conservación de su ictiofauna. Se ha detectado la presencia de 13 especies, 3 autóctonas (Luciobarbus sclateri, Salmo trutta y Squalius pyrenaicus), 3 translocadas desde otras cuencas pero nativas de la Península Ibérica (Cobitis paludica, Gobio lozanoi y Pseudochondrostoma polylepis) y 7 exóticas a la Península Ibéricas (Alburnus alburnus, Cyprinus carpio, Esox lucius, Lepomis gibbosus, Micropterus salmoides, Sander lucioperca y Onchorrhyncus mykiss). Se han diferenciado 3 tipos de tramos fluviales en función del estado de conservación de las comunidades de peces: Tipo 1, estado bueno con dominio de especies autóctonas; Tipo 2, estado intermedio donde dominan las translocadas pero con importantes poblaciones de especies autóctonas; Tipo 3, estado deficiente con dominio de especies introducidas