This research directs the total microbiological coliform and Escherichia coli analysis in Anadara tubercullosa and Anadara similis; this research was done in the Archipelago of Jambeli, Province of El Oro. In the development of this study, samples were obtained from four strategic points. These samples were taken in the dry season (November) and in the rainy season (December); Chromocult Agar was used as a culture medium in 240 shells. The results obtained in the culture analysis show total coliform in A. similis. The median for the first sampling was 1.5x10-4 CFU/100g; the second sampling median was 2.0x10-4UFC/100g. For A. tuberculose the first sampling median was 1.7x10-4 CFUs/100g; the second sampling median was 2.4x10-4 CFU/100g. Among the four sampling points, point two was the one with the highest contamination; it had 2.1 x 10.4UFC/100g. The presence of E. coli was not found in either species. It was suggested that the species´ bacterial count level be reduced by means of a purifications system and by cooking the bivalves before eating them. Esta investigación dirige el análisis microbiológico de coliformes totales y Escherichia coli en Anadara Tuberculosa y Anadara Similis en el Archipiélago de Jambelí en la provincia de El Oro en Ecuador. Se obtuvieron muestras de cuatro puntos estratégicos en época seca (noviembre) y lluviosa (diciembre) usando el medio de cultivo Agar Chromocult en 240 conchas. En los resultados obtenidos en los cultivos de análisis, se presenció coliformes totales en Anadora Similis, con una media para el primer muestreo de 1,5x10^4 UFC/100g y segundo muestreo de 2.0x10^4UFC/100g y para Anadora Tuberculosa 1,7x10^4 UFC/100g y 2,4x10^4 UFC/100g. Entre los cuatro puntos de muestreo, el más elevado por contaminación es el punto dos con 2,1 x 10^4UFC/100g, en ambas especies no se observó presencia de Escherichia Coli. Se planteó la reducción del nivel bacteriano en las especies mediante un sistema de depuración y llevar a cocción los bivalvos antes de ingerirlos