Os fungos da ordem Mucorales caracterizam-se por serem predominantemente fungos filamentosos terrestres ubíquos com hifas cenocíticas e reprodução assexuada baseada em estruturas especializadas (esporângios) que contêm de poucos até milhares de esporangiósporos. Alguns destes fungos têm um papel importante na natureza como decompositores. A capacidade destes fungos degradarem compostos xenobióticos e recalcitrantes é uma característica biotecnologicamente importante tornando-os potencialmente úteis para processos de biorremediação. Gongronella sp. e Rhizopus sp. foram isolados do solo de vinhas da região do Alentejo, Portugal. Estes isolados mostraram elevada capacidade de degradarem o fungicida acilalanina metalaxil. No presente estudo, para a identificação polifásica de Gongronella sp. e Rhizopus sp., presuntivamente identificado como R. stolonifer, várias linhagens de referência da ordem Mucorales (Absidia, Circinella, Gongronella e Rhizopus) foram incluídas. A abordagem polifásica combinou a análise das macro- e micromorfologias, a análise da sequência inteira da região ITS ribossomal (i.e., ITS1/5.8S rDNA/ITS2) e ainda o uso da espectrometria de massas por Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time-of-Flight (MALDI-TOF). O isolado Rhizopus sp., presuntivamente identificado como R. stolonifer, foi reidentificado como Rhizopus oryzae devido à sua alta similaridade da região ITS e espetral por MALDI-TOF com as linhagens de referência. Os resultados da macromorfologia obtidos para o isolado Gongronella sp. foram distintos dos obtidos para Gongronella lacrispora. Quando o isolado é comparado com Gongronella butleri a macromorfologia mostra-se também idêntica, contudo a micromorfologia do esporângio é de tamanho menor. Ao nível da forma do esporangiósporo, Gongronella sp. tem forma fusiforme em contraste com a forma ovoide para G. butleri e de lágrima para G. lacrispora. A análise molecular agrupa o isolado Gongronella sp. com G. butleri e G. lacrispora formando um clade bem distinto de outros géneros estudados da ordem Mucorales. No entanto, G. butleri, G. lacrispora e Gongronella sp. estão bem separados dentro do clade o que também é corroborado pela análise espectral por MALDI-TOF. Comparando com a recente nova espécie G. guangdongensis descrita por Liu e colaboradores em 2015 verificamos que não há similaridade nos dados de biologia molecular indicando que o isolado Gongronella sp. pode constituir uma putativa nova espécie para este género
