L'écosystème a-t-il une mémoire ? Importance de l'histoire sur la résilience fonctionnelle de communautés bactériennes hétérotrophes marines et anaérobies

Abstract

Soutenue le 26 avril. Autre laboratoire d'accueil : Laboratoire d’Océanographie Biologique de Banyuls/mer - INSU UMR7621 CNRS Diplôme : Dr. d'UniversiteOur goal was to determine if the resilience (defined as the return to an initial state after a shock) of complex microbial communities depends on a physiological and/or structural adaptation(s) to biotic and abiotic environmental fluctuations. Using chemostats, we monitored the organic matter mineralisation simultaneously with the community structure by molecular fingerprinting techniques. We found that marine bacterial communities originating from littoral or offshore waters did not have the same functional resilience after a toluene shock. Their resiliences may depend on the physiological properties of a common culture of Alteromonas. In contrast, the environmental fluctuations select anaerobic communities. The dynamic functioning of these communities is ecologically more resilient after an acid shock. However, identical chemostats diverged over the course of incubations. The selection is, therefore, not entirely deterministic.Nous voulons déterminer si la résilience (définie comme retour à l’état initial après un choc) de consortia microbiens complexes dépend d’une adaptation physiologique et/ou structurelle aux fluctuations environnementales biotiques et abiotiques. Nous avons suivi la minéralisation de la matière organique ainsi que la structure des communautés par empreinte moléculaire dans des chemostats. Il en ressort que les consortia de bactéries marines prélevées sur le littoral ou au large n’ont pas la même résilience fonctionnelle après un choc de toluène. La résilience semble dépendre des propriétés physiologique d’une souche d’/Alteromonas/ ubiquiste. D’autre part, les fluctuations environnementales sélectionnent des communautés anaérobies. La fonction de ces communautés est écologiquement plus résiliente après un choc acide. Cependant, des chemostats identiques divergent au cours de l’incubation. La sélection n’est donc pas entièrement déterministe