Be stars represent about 20 % of the B-type stars in our Galaxy. These stars are surrounded by a circumstellar envelope fed by discrete and recurrent material ejections that come from the star. These stars are also pulsating and rapidly rotating stars. That is why Be stars have specifics pulsational features, that can be studied by the CoRoT satellite, successfully launched on the 27th December 2006. For the first time, CoRoT allows us to systematically study the link between pulsations of Be stars and material outflows that give rise to the circumstellar disk.The purpose of my PhD thesis work is to analyse the CoRoT data of Be stars observed in the first observations runs. Firstly, the data processing required improvements of the frequency searching methods in order to analyse a huge volume of data with high accuracy. Therefore, I developed a data processing tool, called TiSAFT (Time Series Analysis with Fisher's Test of significance), that extracts the frequencies embedded in the CoRoT photometric data. TiSAFT uses a statistical criterium to determine the significance of the results. Secondly, I analysed the photometric data of the Be star HD49330 observed with the CoRoT during 137 days and with ground-based spectroscopy during a total period of 20 nights. HD49330 showed a luminosity burst during the observations that we associated to a material ejection. The amplitudes of the signal associated with the main frequencies HD49330 change all along the light burst and are clearly correlated with the burst. Moreover, concerning the caracteristics of the pulsation modes. HD49330 is an "hybrid" star : we found p modes typical of β Cephei stars and g modes typical stars.Les étoiles Be représentent environ 20% des étoiles B de la Galaxie. Elles possèdent une enveloppe circumstellaire formée par des éjections discrètes et récurrentes de matière provenant de l'étoile. Ce sont aussi des étoiles pulsantes et en rotation rapide. De ce fait les étoiles Be ont des caractéristiques pulsationnelles spécifiques, pouvant être étudiées grâce à CoRot, lancé avec succès le 27 décembre 2006. CoRot permet pour la première fois d'étudier systématiquement le lien entre les pulsations des étoiles Be et les flots de matière alimentant le disque circumstellaire. Ma thèse a pour objectif de traiter les données CoRot d'étoiles Be observées dans les tout premiers runs. Le traitement des données a nécessité au préalable l'amélioration des méthodes de recherche de fréquences afin de traiter un grand volume de données de haute précision. J'ai donc développé un outil de traitement de données TISAFT (Time Series analysis with Fisher's Test), qui extrait les fréquences des données photométriques de CoRot et qui utilise un critère statistique pour déterminer la significativité des résultats. J'ai ensuite étudié les données photométriques de l'étoile Be HD49330 observée avec Corot pendant 137 jours ainsi qu'en spectroscopie au sol pendant 20 nuits cumulées. HD49330 a présenté durant les observations un sursaut de lumière qu'on a associé à une éjection de matière. Les amplitudes du signal associées aux principales fréquences de HD49330 varient tout au long du sursaut de lumière de manière clairement corrélée avec ce dernier. HD49330 est aussi une étoile hybride du point de vue des pulsations : elle possède des modes p typiques des β Cephei et des modes g typiques des SP