Development of plasmids to modify the CRISPR - Cas System in Porphyromonas gingivalis W83

Abstract

Celem doświadczenia było opracowanie plazmidów do modyfikacji systemu CRISPR-Cas u bakterii P.gingivalis. System CRISPR-Cas umożliwia bakteriom rozróżnianie między własnym a egzogennym kwasem nukleinowym. Plazmidy skonstruowano w oparciu o wektor pT-COW, wstawiając różne warianty elementu proto-S6 (sztuczne i dzikie). Do namnożenia uzyskanego plazmidu użyto bakterii E.coli (Invitrogen) a wyizolowane plazmidowe DNA zsekwencjonowano. W wyniku klonowania uzyskano oczekiwane konstrukty.The aim of the experiment was to develop the plasmids to modify CRISPR-Cas System in bacteria P.gingivalis. CRISPR-Cas System allows bacteria to distinguish between self and exogenous nucleic acid. The plasmids were constructed based on vector pT-COW inserting different variants of proto-S6 element (artificial and wild). Bacteria E.coli (Invitrogen), was used to amplify the obtained plasmids. Plasmid DNA was isolated and sequenced. As a result of the cloning the expected constructs were received