Poros-Tarcali, Eszter

Semmelweis Repository

Új oszcilláló kémiai rendszerek előállítása és vizsgálata Doktori tézisek Poros-Tarcali Eszter Semmelweis Egyetem Gyógyszertudományok Doktori Iskola  Témavezető: Csörgeiné Dr. Kurin Krisztina, Ph.D., egyetemi docens Hivatalos bírálók: Dr. Gáspár Vilmos, D.Sc., egyetemi tanár  Dr. Béni Szabolcs, Ph.D., egyetemi docens Szigorlati bizottság elnöke:  Dr. Zelkó Romána, D.Sc., egyetemi tanár Szigorlati bizottság tagjai: Takácsné Dr. Novák Krisztina, D.Sc., egyetemi tanár Dr. Záray Gyula, D.Sc., egyetemi tanár Budapest 2015 1 I. Bevezetés A periodicitás általánosan előforduló jelenség az élő és élettelen környezetben. Példaként szolgálhat a nappalok és az éjszakák ismétlődése, az évszakok váltakozása, az ár–apály, a glikolízis néhány folyamata, a szívizom sejtek periodikus összehúzódása és elernyedése, a populációs dinamika érvényesülése az állatvilágban, bizonyos fertőző betegségek ciklikus jelentkezése, a biológiai óra működése, az állatok kültakaróján, vagy az ásványok metszetén látható mintázatok. Periodicitás speciális tulajdonságokkal bíró kémiai rendszerekben is kialakulhat. Ilyen esetekben, – függően a reakció kivitelezésének módjától – a köztitermékek, vagy akár a kiindulási anyagok és a végtermékek koncentrációja is periodikusan változhat a reakcióelegyben. A koncentráció-oszcilláció jelentkezhet az időskálán, ekkor beszélünk oszcilláló kémiai reakcióról, vagy a térkoordináták mentén, ami kémiai mintázatképződést eredményez. A periodikus kémiai reakciók vizsgálatával a periodicitás jelenségét az anyagi szerveződés legalacsonyabb szintjén, molekuláris szinten tudjuk tanulmányozni, segítve a természetben bonyolultabb formában megnyilvánuló komplex rendszerek megértését, szabályozását.   2 II. Célkitűzés Doktori munkám fő célja új oszcilláló kémiai rendszerek előállítása: (1) új módszer kidolgozásával; (2) ismert módszer alkalmazásával; (3) új összetételű rendszer létrehozásával. További célom volt az új rendszerek tanulmányozása, dinamikai viselkedésük kísérletes vizsgálata és modellezése. Célkitűzéseim a következőek voltak: (1) Zárt rendszerű pH-oszcillátorok előállítása:  A 25 ma ismert pH-oszcillátor mindegyike áramlásos rendszerben működik. Közülük néhány félig-zárt reaktorban is oszcillál, ezekben a térfogat állandó növekedése és a reaktánsok fogyása, ill. az oldat hígulása miatt az oszcillációk erősen csillapítottak. A pH-oszcillátorok alkalmazásában történt előrelépések (elképzelések „molekuláris motor”, „periodikus gyógyszeradagoló” készítéséről és próbálkozások pH-oszcillátoroknak biomolekulákkal, pl. DNS-sel vagy nanorendszerekkel történő kapcsolására, stb.) szükségessé tették alig csillapodó, nagy amplitúdójú, jól reprodukálható, zárt rendszerben működő pH-oszcillátor kifejlesztését.  (2) Fémionok és aminosavak közötti komplexképződési egyensúly kapcsolása pH-oszcillátorhoz:     A nem-vegyértékváltó ionok koncentrációjának időbeni oszcillációja a  3 kutatócsoportunk által korábban kidolgozott módszerrel, egy redox-alapú oszcillátor és komplex- vagy csapadékképződési egyensúly összekapcsolásával lehetséges. Az oszcillátor az egyensúlyt periodikus változásra kényszeríti, ami a résztvevő komponensek koncentrációjának az oszcillátor frekvenciájával történő oszcillációját eredményezi. Kutatómunkám egyik célja volt a kapcsolt rendszerek számának bővítése. Az eddig használt szervetlen kémiai egyensúlyok helyett a bonyolultabb fémion − aminosav komplexképződést alkalmazva olyan új összetételű rendszerek előállítását terveztem, amelyekben a különböző számú ligandumot tartalmazó aminosav-komplexek és a központi fémionok koncentrációja is oszcillál. (3) Új összetételű, aminosavat tartalmazó mangán-oszcillátor előállítása, mechanizmusának tanulmányozása: A permanganátionok redukcióján alapuló mangán-oszcillátorokban redukálószerként szervetlen szubsztrátokat használtak. Az aminosavak permanganátionos oxidációjának kinetikáját több kutatócsoport vizsgálta és hét aminosav esetében, semleges pH-n, autokatalitikus reakcióútról számoltak be. Célul tűztem ki a mangán-oszcillátorok olyan új csoportjának létrehozását, amelyben a szervetlen szubsztrát helyett aminosavak szerepelnek.  4 III. Módszerek Nyitott rendszerben működő oszcillátorok vizsgálatánál V=110 cm3 és V=25 cm3 térfogatú, T=25 °C-on és 45 °C-on termosztált áramlásos kevert tankreaktorokat használtam (CSTR). A reaktorba a reagenseket perisztaltikus pumpával (Gilson Minipuls 2), 4 szilikon csövön folyamatosan vezettem be. Az állandó térfogat biztosítása érdekében, egy másik perisztaltikus pumpával folyamatosan elvezettem a termékeket és a reagenseket tartalmazó oldat feleslegét. Az oldat homogenitását mágneses keverővel biztosítottam (Heidolph MR 3000). A rendszer H+ koncentrációjának időbeni változását kombinált üvegelektróddal (Radelkis OP-0823P) követtem. Az elegy redoxpotenciálját Pt elektróddal mértem (referencia elektród: Hg/Hg2SO4/K2SO4). Az elektródokat pH-mérőhöz (Hanna pH-209) csatlakoztattam. Az oszcillációs jeleket két-csatornás analóg rekorder (Kipp & Zonen BD 41) közbeiktatásával számítógépbe helyezett több-csatornás National Instruments 6010PCI digitális/analóg jelfeldolgozó PC-kártya és az ezekhez tartozó szoftver rögzítette. A félig-zárt rendszerben végzett kísérletek során a reaktorba előzetesen betöltöttem a feleslegben lévő komponenseket tartalmazó elegyet. Az oszcillációs ciklusban elfogyó reagenst vékony csövön keresztül, lassú áramlási  5 sebességgel, perisztaltikus pumpa segítségével juttattam be a reakcióedénybe. Az előbb ismertetetteknél sokkal egyszerűbb felépítésű az anyagtanszport szempontjából zárt kísérleti berendezés. Itt az oszcillátor komponenseinek a reaktorba juttatása után további anyagbevitel kívülről nem történik. A zárt rendszerű pH-oszcillátorok előállítását célzó kísérletek kivitelezésekor a főzőpohárba elkészített, nátrium-szulfitot tartalmazó szilikagél rétegeket használtam reagens-forrásként. A többi komponens keverékét termosztáltam, majd a gélre öntöttem. Azért, hogy a gélek esetleges sérülését elkerüljük mágneses teflon keverő helyett az oldatot felülről kevertettem (IKA RW 20 Digital) és alacsony keverési sebességet (100 – 250 rpm) alkalmaztam. A Célkitűzések (2) és (3) pontjában szereplő feladatok megvalósítása érdekében spektrofotometriás méréseket is végeztem. Milton-Roy 3000 típusú (λ =300-800 nm, l =1 cm-es kvarc küvetta, T=25-45 °C), illetve Agilent 8452 típusú (λ =300-800 nm, l =3,27 cm-es termosztált reakcióedény, T=45 °C) diódasoros spektrofotométerrel.  A szimulációkhoz az XPPAUT programot használtuk. A fémion – aminosav komplexképződési reakciók pH-függésével kapcsolatos egyensúlyi számításokat a MEDUSA szoftvercsomaggal végeztük.  6 III. Eredmények Doktori munkám 3 témájában elért eredményeim a következők: (1) Elsőként dolgoztam ki módszert, amely alkalmas zárt rendszerben is működő pH-oszcillátorok előállítására. Az áramlásos rendszerben (CSTR) működő pH-oszcillátorok egy-egy oszcillációs ciklusában, az egyik komponens szinte teljes mértékben elfogy, míg a többi általában feleslegben marad. Az oszcillációk fenntartásához a reagens pótlására van szükség. Ha ezt a komponenst a reaktorban elkészített gélből való folyamatos kioldódással pótoljuk, akkor oszcillációk keletkeznek. A javasolt módszer alkalmazásával átalakítottam négy CSTR pH-oszcillátort zárt rendszerűvé. A BrO3− – SO32− – Mn2+, a BrO3− – SO32−– Fe(CN)64−, a IO3− – SO32−– Fe(CN)64−és a BrO3− – SO32−  összetételű zárt rendszerekben alig csillapodó, nagy amplitúdójú hosszan tartó pH-oszcillációkat regisztráltam. Mértem a SO32− gélből való kioldódását, amely több órán keresztül az oszcillációk kialakulásához szükséges sebességgel megy végbe. Mechanizmus vizsgálatokat végeztünk a BrO3− – SO32− félig-zárt és zárt pH-oszcillátor dinamikai viselkedésének leírására.  7 A modellszámítások eredménye jó egyezést mutat a kísérletekkel. (2) Az időbeni koncentráció-oszcillációra kényszeríthető ionok és molekulák számának bővítése érdekében tanulmányoztam a pH-oszcillátor fémion – aminosav komplexekkel történő kapcsolásának lehetőségét. A megfelelő oszcillátor és komplex egyensúly kiválasztásához meghatároztam számos fémion – aminosav komplex specieszeloszlásának, valamint spektrumának pH-függését különböző molarányú elegyekben. Sikeresen kapcsoltam össze a BrO3– – SO32– CSTR pH-oszcillátort a Ni2+ – hisztidin közötti komplexképződési egyensúllyal. A kapcsolt rendszerben a periodikus pH változás a Ni2+, NiHis+ és Ni(His)2 specieszek koncentrációjának oszcillációját eredményezte. Az indukált oszcillációkat a megfelelő hullámhosszaknál mért abszorbanciaértékek változása alapján kísérletileg bizonyítottam. A kapcsolt rendszer leírására kidolgozott modell kvalitatív egyezést mutat a kísérleti eredményeinkkel. Megkíséreltem más fémion – aminosav komplexszel bővíteni a kapcsolt rendszerek számát. A BrO3– – SO32– − Co2+− hisztidin áramlásos rendszerben nagy amplitúdójú oszcillációkat mértem a fény abszorbanciában λ= 418 nm-en.  8 (3) Összetételében új, aminosavak permanganátos oxidációján alapuló oszcilláló kémiai rendszereket állítottam elő. A KMnO4 − glicin − H3PO4 CSTR rendszerben több mint 1 órás periódusidejű, kis amplitúdójú oszcillációkat mértem a Pt elektród potenciáljában, valamint a [Mn(IV)] és a [MnO4–] követésére alkalmas λ= 418 nm-en és λ= 545 nm hullámhosszokon mért abszorbancia értékekben. Modellt javasoltunk a fellépő oszcillációs viselkedés leírására.  A glicin mellett más aminosavak pl., threonin, alanin, fenilalanin, stb. KMnO4-es oxidációjában is autokatalitikus kinetika érvényesül. Az előzőekhez hasonló oszcillációs jeleket ezidáig a KMnO4 − threonin − H2PO4− nyitott rendszerben sikerült előállítanom. 1996-ban egy kínai kutatócsoport kis amplitúdójú (~30 mV), nagyfrekvenciás (1 perc/periódus) potenciál-oszcillációkat talált a KMnO4 − glicin − H3PO4 CSTR rendszerben. Kísérleteiket többszöri próbálkozásaink ellenére sem sikerült reprodukálni. Spektrofotometriás módszerrel követtem a reakció lefolyását a megadott reakciókörülmények mellett és bebizonyítottam, hogy a közölt oszcillációk nem lehetnek kémiai eredetűek. Igazoltam, hogy oszcillációk a korábbitól nagymértékben eltérő reakciókörülmények használata mellett jelentkeznek.   9 V. Következtetések (1) Zárt rendszerű pH-oszcillátorok előállítása: Kísérleti eredményeim bizonyítják, hogy a nyitott rendszerben működő pH-oszcillátorok egy része – megfelelő módszert alkalmazva – átalakítható félig-zárt és zárt rendszerben is oszcilláló változattá. Az átalakítás lényeges eleme az oszcillációs ciklus alatt elfogyó reagens pótlása. Ez történhet külső betáplálással (félig-zárt konfiguráció), vagy az általunk javasolt módszerrel, egy másik fázisból való kioldódással. A zárt rendszerű variánsokban a szulfitiont gél-fázisban tároltam és pH-oszcillációkat mértem a többi reagenst tartalmazó, géllel érintkező oldatban. A négy kipróbált rendszeren kívül hét másik szulfition tartalmú pH-oszcillátor ismert. Valószínűleg ezek közül számos átalakítható a módszerrel. A korábban bemutatott gyakorlati alkalmazási lehetőségekben használt nagy eszköz- és vegyszerigényű nyitott rendszerű pH-oszcillátorok feltételezhetően helyettesíthetők a lényegesen könnyebben használható zárt rendszerű variánssal. A gélrétegbe egyéb reagens is bevihető, így a módszerrel nemcsak pH-oszcillátorok átalakítása lehetséges. Bíztató előkísérleteim vannak a réz-katalizálta oszcillátorok (pl. H2O2 – S2O32– − Cu2+) zárt rendszerben való működésére.  10 (2) Fémionok és aminosavak közötti komplexképződési egyensúly kapcsolása pH-oszcillátorhoz: Kísérleti eredményeim igazolják, hogy a pH-oszcillátorokkal bonyolultabb komplexképződési folyamatok is periodikusan mozgathatóak. A Ni2+ – hisztidin – BrO3– – SO32– CSTR rendszerben a Ni2+, NiHis+ és Ni(His)2 specieszek koncentrációja oszcillál. Ez alapján következtethető, hogy más oszcillátorok, más fizikai, kémiai, biokémiai egyensúlyokat is képesek periodikusan változtatni. Feltételezhető az is, hogy hasonlóan az egyszerű kémiai rendszerekhez, a bonyolultabb élő szervezetekben is megvalósulhat a nem-redox tulajdonságú elemek (ionok és molekulák) koncentráció-oszcillációja a célelem valamely egyensúlyi reakciójának egy redox alaposzcillátorhoz történő kapcsolásával. Eredményeim igazolják, hogy a komplex rendszerek viselkedése az alrendszerek adatai alapján modellszámításokkal megjósolható. (3) Új összetételű, aminosavat tartalmazó mangán-oszcillátor előállítása, mechanizmusának tanulmányozása: Bizonyítottam, hogy a mangán kémiáján alapuló oszcillátor család szubsztrátjaként nemcsak szervetlen ionok, hanem bonyolultabb szerves vegyületek, pl. aminosavak is szerepelhetnek. A legegyszerűbb aminosav, a glicin, valamint a threonin CSTR-ben kivitelezett permanganátos oxidációjában,  11 közel semleges oldatban, H2PO4− jelenlétében oszcillációk regisztrálhatók. Az oszcillációs viselkedés paramétertartománya azonban jóval szűkebb, mint a KMnO4 – szervetlen szubsztrát – stabilizálószer összetételű oszcillátorokban tapasztalható.  A permanganátion más aminosavakat (például: valin, leucin, izoleucin, stb.) is autokatalitikus reakcióban oxidálja. Feltételezésem szerint, az említett aminosavak közül néhány, esetleg egyszerűbb peptidek is alkalmazhatóak szubsztrátként a mangán-kémián alapuló oszcillátorokban.   12 IV. Saját publikációk jegyzéke 1. Poros E, Horváth V, Kurin-Csörgei K, Epstein IR, Orbán M. (2011) Generation of pH-oscillations in Closed Chemical Systems: Method and  Applications. J. Am. Chem. Soc., 133:7174-7179.   2. Poros E, Kurin-Csörgei K, Szalai I, Orbán M. (2013) Oscillations in the Permanganate Oxidation of Glycine in a Stirred Flow Reactor. J. Phys. Chem. A, 117(37):9023-9027.  3. Poros E, Kurin-Csörgei K, Horváth V, Szalai I, Orbán M. (2014) Periodic Changes in the Distribution of Species Observed in the Ni2+ – Histidine Equilibrium Coupled to the BrO3−–SO32− pH-oscillator. J. Phys. Chem. A, 118(34):6749-6756.  4. Poros E, Kurin-Csörgei K, Szalai I, Rábai Gy, Orbán M. (2015) pH-oscillations in the bromate – sulfite reaction in semibatch and in gel-fed batch reactors. Chaos, 25(6): 064602. DOI:10.1063/1.4921176.  

Új oszcilláló kémiai rendszerek előállítása és vizsgálata

http://repo.lib.semmelweis.hu/bitstream/handle/123456789/3961/porostarcalieszter.m.pdf?sequence=5

Új oszcilláló kémiai rendszerek előállítása és vizsgálata

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

Semmelweis Repository