Études des mécanismes de régulation du riborégulateur lysine chez Escherichia coli

Abstract

Les riborégulateurs sont un sujet d’étude qui suscite l’intérêt dans la communauté scientifique depuis le début des années 2000. Malgré cet intérêt depuis pratiquement vingt ans, beaucoup de choses sont encore inconnues à propos de riborégulateurs. En effet, certains groupes se sont attardés à découvrir le plus de riborégulateurs possible sans en faire de recherche approfondie à chaque fois. Il est cependant important de comprendre les mécanismes de transcription, le repliement et la régulation des riborégulateurs afin de pouvoir développer des outils de biologie moléculaire ou des antibiotiques par exemple. Dans ce mémoire il sera principalement question de la régulation du riborégulateur chez Escherichia coli ayant pour ligand l’acide aminé lysine (lysC). Une étude des modes de régulations a déjà mis en lumière le mécanisme de régulation de la traduction ainsi que l’implication du dégradosome ARN chez ce riborégulateur. Cependant, certains résultats préliminaires nous laissaient croire que la protéine Rho pouvait être impliquée dans la régulation du niveau d’ARN messager de lysC. Nous avons donc commencé par étudier brièvement la transcription du riborégulateur ainsi que son changement de conformation en réponse au ligand. Ceci nous a permis d’utiliser les bonnes concentrations de ligand pour étudier la régulation de la protéine Rho. Ces différents modes de régulations présents chez un même riborégulateur nous amènent à penser que ce domaine est beaucoup plus complexe que ce que certains groupes pensaient au départ. C’est un domaine d’étude intéressant dans lequel on a découvert que la pointe de l’iceberg

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