The small RNA RyhB regulates the expression of the cell division protein ZapB in Escherichia coli

Abstract

RyhB est un petit ARN régulateur régulant plus d’une vingtaine de gènes impliqués dans le métabolisme du fer. Lors d'une carence de fer, RyhB est exprimé et s'apparie avec ses ARNm cibles pour stimuler leur dégradation via le dégradosome ARN. De récentes études ont démontré qu'il peut aussi activer plusieurs gènes en stabilisant les ARNm, augmentant ainsi leur niveau dans la cellule. Cette présente étude a permis de caractériser de nouvelles cibles de RyhB ; ces nouvelles cibles ont été identifiées en couplant des résultats de puces à ADN et de MAPS (MS2 Afiinity Purification – RNA sequencing). Une de ces nouvelles cibles, l'ARNm encodant le facteur de division cellulaire ZapB, est régulée négativement par RyhB. Les résultats in vivo suggèrent que RyhB induit non seulement une dégradation partielle de l’ARNm de zapB, mais il bloquerait aussi sa traduction en s’appariant dans la séquence codante au-delà de la fenêtre des cinq codons. L’utilisation de la cytométrie en flux a permis de mettre en évidence l’influence de RyhB sur la division cellulaire lors d’une carence en fer. La découverte de cette nouvelle cible de RyhB donne une vision plus étendue du targetome de RyhB